Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 283,579 (bp)   Positions: 447
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.725
.585
.844
.833
.91
.976
.878
.842
.274
.39
.503
.058
.033
.026
.059
.242
.33
.065
.079
.038
.011
.014
.002
.011
.057
.047
.033
.003
.001
.004
.017
.026
.022
.062
.034
.025
.024
.007
.032
.042
.031
.017
.0
.042
.02
.015
.002
.001
.007
.001
.007
.592
.994
.968
.398
.006
--
.034
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.105
.022
.078
.004
.001
.049
.153
.073
.078
.012
.013
.001
.006
--
--
.0
.019
.001
.002
.006
.005
.0
.0
.036
.18
.002
.003
.044
.16
.009
.0
.0
.053
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.923
.038
.0
.016
.001
.009
.023
.012
.0
.265
.018
.003
.001
.002
.007
.013
.335
.192
.005
.0
.001
.116
.06
.204
.029
.009
.121
.018
.086
.003
.004
.005
.003
.005
.001
.4
1.0
1.0
1.0
.769
.021
.0
.001
.313
.002
.041
.57
.0
.0
.007
.021
.34
.0
.007
.0
.013
.009
.009
.001
.003
.005
.012
.133
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.051
.15
.156
.103
.013
.008
.234
.33
.018
.045
.035
.002
.141
.024
.04
.029
.108
.411
--
.042
.038
.215
.003
.035
.12
.01
.95
.0
.072
.259
.12
.127
.104
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.015
--
--
--
.039
.031
--
.269
--
--
--
.066
.263
.011
.018
.015
.122
.065
.007
.0
.009
.026
--
--
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.002
.001
.0
.001
.003
.001
.001
.064
.048
.995
.997
1.0
1.0
.999
.987
.999
.999
1.0
1.0
1.0
1.0
.541
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.003
.003
.105
.065
.05
.044
.011
.009
.352
.0
.0
.005
.091
.012
.001
.001
.002
.104
.002
.015
.02
.006
.006
.059
.006
.026
.003
.0
.001
.007
.023
.007
.0
.0
.626
.001
.002
.015
.081
.001
.008
.002
.017
.168
.241
.289
.299
.358
.312
.11
.083
.095
.12
.141
.003
.001
.0
.002
.024
.009
.264
.0
.032
.107
.001
.003
.081
.035
.204
.021
--
--
--
--
--
--
.045
.867
.03
.117
.005
.412
.002
--
.024
.0
.0
.0
.0
.015
.002
.098
.001
.004
.033
--
.044
.018
.003
.0
.722
.037
.104
.011
.028
.0
.0
.004
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Trpc5os
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Trpc5
Trpc5
Trpc5
Trpc5
Trpc5
Trpc5
Trpc5
Trpc5
Trpc5
Trpc5
Trpc5
Trpc5
Trpc5
Trpc5
Trpc5
Trpc5
Trpc5
Trpc5
Trpc5
Trpc5
Trpc5
Trpc5
Trpc5
Trpc5
Trpc5
Trpc5
Trpc5
Trpc5
Trpc5
Trpc5
Trpc5
Trpc5
Trpc5
Trpc5
Trpc5
Trpc5
Trpc5
Trpc5
Trpc5
Trpc5
Trpc5
Trpc5
Trpc5
Trpc5
Trpc5
-
2
-
-
-
-
C
G
A
A
T
-
G
G
-
A
-
-
A
C
A
-
A
2
2
G
C
T
G
-
-
-
G
C
3
A
C
C
-
-
T
T
36
C
C
G
-
G
-
A
A
-
T
C
-
2
G
A
C
C
C
G
A
G
C
T
G
G
G
C
C
G
G
C
C
-
C
A
C
C
G
-
-
-
A
-
G
2
-
-
C
G
G
T
4
G
A
-
G
A
G
T
G
G
T
G
G
G
2
-
-
-
G
A
G
T
G
G
G
G
A
C
G
T
A
T
C
C
C
T
T
G
T
-
A
-
-
-
C
C
C
T
T
A
A
C
-
G
-
C
T
A
G
A
T
-
A
A
C
T
-
A
-
A
T
G
-
T
A
-
-
-
16
-
A
T
G
G
C
A
G
G
A
T
-
C
G
C
-
-
-
T
G
C
T
A
T
C
C
-
G
C
T
-
-
2
T
C
C
-
A
2
2
A
G
-
A
-
2
-
T
A
T
-
A
G
T
9
-
2
A
A
T
-
A
T
-
T
-
T
-
C
G
G
G
G
C
C
A
A
C
G
T
C
C
T
A
T
C
A
T
T
C
G
G
A
A
-
G
7
69
G
A
C
C
G
G
T
A
A
A
T
A
T
T
C
-
C
A
T
C
T
-
A
T
A
-
C
C
T
G
C
A
T
C
A
T
T
T
T
T
T
-
-
-
-
2
-
T
T
A
A
A
T
C
T
A
C
G
T
T
A
T
T
C
C
-
T
T
G
C
A
9
G
G
C
T
C
-
G
G
G
G
A
A
G
-
A
G
T
C
G
G
T
T
A
A
T
C
G
C
C
T
T
C
T
C
C
2
T
-
A
C
A
G
C
G
A
A
T
T
C
C
G
T
A
-
T
G
G
C
T
C
-
T
-
-
A
-
G
6
C
-
A
-
G
T
-
A
2
G
-
T
A
A
A
A
2
T
3
4
T
T
C
-
C
G
T
A
G
C
A
G
C
T
C
T
  115,625,616
  115,639,426
  115,639,493
  115,639,495
  115,639,518
  115,639,545
  115,639,594
  115,639,597
  115,639,628
  115,639,641
  115,639,653
  115,639,691
  115,639,710
  115,639,731
  115,639,742
  115,639,763
  115,639,778
  115,639,814
  115,639,825
  115,639,829
  115,639,851
  115,639,864
  115,639,872
  115,639,875
  115,639,899
  115,639,903
  115,639,922
  115,639,933
  115,639,935
  115,639,940
  115,639,948
  115,639,955
  115,639,964
  115,639,997
  115,640,019
  115,640,025
  115,640,031
  115,640,035
  115,640,042
  115,640,045
  115,640,067
  115,640,075
  115,641,217
  115,641,258
  115,641,264
  115,641,265
  115,641,305
  115,641,310
  115,641,315
  115,641,331
  115,641,333
  115,641,358
  115,641,378
  115,641,393
  115,641,397
  115,642,909
  115,643,675
  115,643,884
  115,654,353
  115,654,602
  115,654,749
  115,654,753
  115,654,760
  115,654,878
  115,654,960
  115,655,029
  115,655,050
  115,655,060
  115,655,094
  115,655,096
  115,655,098
  115,655,102
  115,655,311
  115,655,561
  115,656,059
  115,656,071
  115,656,314
  115,656,576
  115,656,788
  115,657,081
  115,657,437
  115,659,235
  115,659,256
  115,659,263
  115,664,009
  115,664,097
  115,666,106
  115,666,274
  115,666,283
  115,666,285
  115,666,321
  115,666,324
  115,666,331
  115,666,346
  115,668,887
  115,668,938
  115,672,678
  115,672,682
  115,672,705
  115,672,720
  115,672,727
  115,672,728
  115,672,729
  115,672,738
  115,672,741
  115,672,745
  115,672,777
  115,672,783
  115,673,014
  115,673,121
  115,674,365
  115,674,728
  115,689,233
  115,689,364
  115,691,007
  115,691,030
  115,691,166
  115,691,205
  115,691,301
  115,691,302
  115,691,327
  115,691,421
  115,691,724
  115,691,748
  115,691,779
  115,691,807
  115,691,834
  115,691,873
  115,691,964
  115,693,434
  115,693,458
  115,696,805
  115,697,331
  115,705,956
  115,709,372
  115,709,881
  115,711,648
  115,713,149
  115,744,636
  115,744,648
  115,748,901
  115,750,964
  115,752,260
  115,753,067
  115,753,902
  115,753,932
  115,754,080
  115,754,401
  115,754,943
  115,755,729
  115,756,031
  115,757,754
  115,758,122
  115,758,347
  115,758,489
  115,758,724
  115,759,410
  115,761,041
  115,761,143
  115,761,190
  115,761,355
  115,761,377
  115,761,742
  115,761,816
  115,761,817
  115,762,108
  115,762,138
  115,762,189
  115,763,596
  115,764,030
  115,764,057
  115,764,059
  115,764,263
  115,764,339
  115,764,710
  115,764,852
  115,765,086
  115,765,117
  115,765,513
  115,765,610
  115,765,639
  115,766,140
  115,766,180
  115,766,561
  115,767,049
  115,767,146
  115,768,893
  115,769,214
  115,769,287
  115,769,298
  115,769,299
  115,770,699
  115,770,955
  115,771,319
  115,771,322
  115,771,363
  115,771,384
  115,771,406
  115,771,411
  115,771,414
  115,771,421
  115,771,437
  115,771,438
  115,771,444
  115,771,453
  115,771,467
  115,771,473
  115,771,497
  115,771,502
  115,771,511
  115,771,530
  115,771,532
  115,774,475
  115,774,489
  115,774,512
  115,774,527
  115,774,557
  115,774,590
  115,774,597
  115,774,613
  115,774,620
  115,774,645
  115,774,663
  115,774,712
  115,774,738
  115,774,741
  115,774,757
  115,774,782
  115,777,550
  115,777,933
  115,778,917
  115,779,130
  115,779,735
  115,780,082
  115,780,105
  115,780,212
  115,782,425
  115,783,034
  115,783,459
  115,783,582
  115,784,316
  115,785,247
  115,786,612
  115,786,905
  115,786,935
  115,787,184
  115,787,662
  115,787,730
  115,787,757
  115,788,365
  115,789,075
  115,789,576
  115,789,642
  115,789,658
  115,790,165
  115,790,663
  115,791,126
  115,791,157
  115,791,566
  115,791,603
  115,791,911
  115,794,330
  115,794,639
  115,794,744
  115,796,988
  115,797,897
  115,798,265
  115,798,774
  115,799,115
  115,800,148
  115,800,159
  115,800,474
  115,800,703
  115,801,783
  115,803,122
  115,803,200
  115,803,256
  115,803,611
  115,805,505
  115,805,609
  115,805,789
  115,807,054
  115,808,616
  115,808,756
  115,809,366
  115,810,755
  115,810,918
  115,810,954
  115,811,010
  115,811,037
  115,811,041
  115,811,211
  115,811,509
  115,811,792
  115,811,809
  115,812,008
  115,812,132
  115,812,942
  115,813,163
  115,813,179
  115,813,256
  115,813,441
  115,813,493
  115,813,936
  115,816,350
  115,816,351
  115,816,618
  115,816,620
  115,816,622
  115,816,624
  115,816,626
  115,816,645
  115,816,707
  115,816,734
  115,816,759
  115,816,829
  115,816,851
  115,816,875
  115,816,915
  115,817,301
  115,817,350
  115,817,352
  115,817,354
  115,817,355
  115,817,382
  115,817,387
  115,817,397
  115,817,581
  115,817,679
  115,817,682
  115,817,683
  115,817,784
  115,817,788
  115,817,871
  115,818,135
  115,818,196
  115,818,284
  115,818,297
  115,818,344
  115,819,404
  115,820,220
  115,820,267
  115,820,281
  115,821,292
  115,821,299
  115,821,384
  115,821,397
  115,821,466
  115,821,647
  115,821,829
  115,822,332
  115,822,578
  115,822,648
  115,823,119
  115,823,177
  115,823,367
  115,823,530
  115,823,955
  115,824,103
  115,824,209
  115,824,420
  115,824,444
  115,824,786
  115,824,855
  115,824,978
  115,824,982
  115,824,994
  115,825,274
  115,825,402
  115,825,499
  115,825,519
  115,825,552
  115,825,603
  115,825,707
  115,825,797
  115,826,074
  115,826,668
  115,826,918
  115,827,362
  115,827,536
  115,827,597
  115,827,812
  115,828,007
  115,828,034
  115,828,044
  115,828,046
  115,828,058
  115,828,089
  115,828,197
  115,828,207
  115,828,226
  115,828,239
  115,828,253
  115,828,358
  115,828,363
  115,828,453
  115,828,515
  115,828,561
  115,828,751
  115,830,723
  115,833,492
  115,833,803
  115,835,669
  115,837,143
  115,838,735
  115,844,751
  115,845,351
  115,845,495
  115,845,849
  115,847,128
  115,849,080
  115,849,546
  115,850,051
  115,850,077
  115,850,825
  115,853,409
  115,853,448
  115,853,724
  115,854,320
  115,855,029
  115,856,800
  115,857,140
  115,860,566
  115,866,973
  115,866,976
  115,866,979
  115,866,980
  115,869,471
  115,869,952
  115,871,682
  115,876,639
  115,879,367
  115,879,407
  115,880,572
  115,892,074
  115,897,044
  115,897,088
  115,897,876
  115,898,634
  115,898,769
  115,898,908
  115,900,110
  115,902,426
  115,902,846
  115,903,864
  115,904,390
  115,904,412
G
-
G
T
A
A
T
-
-
-
-
T
-
-
3
-
C
A
-
T
C
3
C
-
-
-
-
A
T
A
G
A
-
-
-
-
-
-
A
A
-
G
-
-
-
T
2
-
G
-
T
A
A
G
T
-
A
G
C/G
-
C/T
G/A
-
G/A
C/G
T/C
G/T
G/T
G/T
C/A
C/T
G/C
G/A
C/T
C/A
-/A
C/T
A/G
C/T
T
G/A
2
62
2
-
3
A
-
A
4
-
-
A
-
4/-
T
-
T
T
G
A
C
T
C
C
A
T
T
2/-
-/2
4
2
C
G
G/A
T/A
G/C
G/C
G/C
G/A
A/C
C/A
G/A
T/C
A/G
T/G
C/G
C/A
C/A
T/C
T/G
G/C
T/A
12
G
79
-/T
T
T
-
T
C
A
G
G
T
G
A
A
A
C
-
A
G
-
4
A/G
T
G
-
T
G
A
T
A
A
T
C
G
T
C
C
-
2
C
C
T
A
T
G
A
C
G
C
8
T
A
G
A
A
A
G
A
-
-
-
-
-
A
C
-
T
C
T
C
-
-
-
-
G
-
-
-
-
C
A
-
A
-
G
-
-
-
T
C
-
-
-
4
-
G
G
-
T
G
-
3
C
C
A
2
T
C
G/A
G/A
G/A
C/T
C/G
A/G
A/G
T
G/A
T/C
C/A
C/T
T/C
A/T
T/C
C/G
G
G
G
T
C
A
G
-
2
C
-
-
A
-
T
G
A
T
A
G
G
C
C
G
G
C
T
G
T
G
A
A
C
C
T
C
T
18
T
T
C
T
T
G
C
A
G
A
A
A
A
A
C
52
2
2
4
-
6
-
T/A
A/T
A/T
A/T
T/A
C/A
T/C
A/C
C/G
G/A
T/G
T/G
A/G
T/C
T/G
C/T
C/T
4
A
C
A
T
G
-
T
A
T
G
T
A
C
A
A
T
G
G
A
4
G
T
-
A
A
A
C
C
G
T
G
G
A
A
G
C
C
A
A
A
T
-
C
T
G
T
G
A
A
T
G
T
C
A
T
T
T
C
G
A
A
A
A
T
A
A
T
C
A
A
G
T
A
-
T
T
G
T
C
G
A
C
-
A
A
C
C
G
T
C
-
-
-
-
C
-
T
A
T
C
A
G
A
T
G
C
G
C
A
C