Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 53,239 (bp)   Positions: 249
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.463
.0
.0
.546
.002
.042
.0
.001
.007
.004
.04
.105
.063
.102
.006
.012
.017
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.003
.073
.004
--
--
--
--
.002
.003
.0
.069
.0
.001
.001
.0
.004
.001
.007
.0
.001
.2
.0
.0
.005
.0
.025
.01
.001
.0
.006
.041
.0
.006
.031
.006
.067
.007
.014
.041
.081
.0
.0
.008
.002
.0
.009
.004
.005
.0
.003
.007
.001
.0
.001
.001
.001
.06
.002
.011
.002
.0
.0
.002
.004
.0
.927
.002
--
--
--
--
.181
.067
.012
.0
.13
.0
.015
.0
.001
.0
.001
.0
.003
.011
.031
.004
.0
.0
--
--
--
.013
.0
.0
.0
.806
.701
.006
.001
.001
.001
.03
.0
.036
.045
.003
.474
.002
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.008
.012
.0
.001
.0
.002
1.0
.04
.0
.0
.003
.0
.003
.009
.0
.0
.005
.0
.0
.0
.036
.0
.005
.621
Trpa1
Trpa1
Trpa1
Trpa1
Trpa1
Trpa1
Trpa1
Trpa1
Trpa1
Trpa1
Trpa1
Trpa1
Trpa1
Trpa1
Trpa1
Trpa1
Trpa1
Trpa1
Trpa1
Trpa1
Trpa1
Trpa1
Trpa1
Trpa1
Trpa1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
-
A
C
T
A
G
A
C
C
T
4
C
C
31
C
A
G
G
T
T
T
A
G
G
A
T
G
G
-
C
G
A
C
G
A
A
G
G
G
A
T
C
A
G
A
T
T
G
T
T
T
T
G
G
G
C
A
G
G
T
T
C
-
T
G
G
A
3
G
C
G
C
G
A
G
G
4
18
C
A
A
G
G
C
A
C
T
C
C
2
G
T
G
2
G
A
G
T
A
C
G
C
G
G
C
G
C
G
A
T
G
A
A
A
T
A
-
A
C
C
7
A
T
-
G
T
A
C
A
C
T
T
T
T
T
G
A
A
-
C
T
G
A
A
A
G
T
A
T
A
T
T
T
-
A
T
C
A
G
C
A
A
C
T
T
G
T
G
A
C
-
C
C
G
-
T
C
C
A
C
T
-
T
C
G
T
T
C
C
C
T
-
G
G
T
T
4
T
C
T
A
A
C
T
-
T
A
A
T
C
A
A
T
A
12
A
A
C
A
C
G
T
C
T
T
A
T
C
C
G
A
G
T
29
A
T
T
G
G
T
C
G
G
G
C
T
T
T
T
  3,783,912
  3,784,234
  3,784,636
  3,785,152
  3,785,399
  3,785,475
  3,785,967
  3,786,067
  3,786,147
  3,786,177
  3,786,654
  3,786,749
  3,786,751
  3,786,923
  3,787,267
  3,787,334
  3,787,337
  3,787,496
  3,787,580
  3,787,670
  3,787,762
  3,787,894
  3,787,922
  3,787,970
  3,788,040
  3,788,073
  3,788,077
  3,788,183
  3,788,197
  3,788,237
  3,788,265
  3,788,314
  3,788,375
  3,788,394
  3,788,408
  3,788,409
  3,788,425
  3,788,427
  3,788,436
  3,788,441
  3,788,491
  3,788,582
  3,788,592
  3,788,611
  3,788,620
  3,788,636
  3,788,747
  3,788,837
  3,788,847
  3,788,885
  3,788,891
  3,788,917
  3,789,010
  3,789,011
  3,789,013
  3,789,092
  3,789,123
  3,789,124
  3,789,129
  3,789,154
  3,789,181
  3,789,187
  3,789,243
  3,789,245
  3,789,249
  3,789,256
  3,789,417
  3,789,597
  3,789,706
  3,789,819
  3,789,822
  3,789,829
  3,789,908
  3,790,082
  3,790,094
  3,790,163
  3,790,193
  3,790,206
  3,790,252
  3,790,385
  3,790,395
  3,790,750
  3,790,755
  3,790,836
  3,790,894
  3,790,954
  3,791,017
  3,791,031
  3,791,122
  3,791,154
  3,791,377
  3,791,438
  3,791,487
  3,791,592
  3,791,612
  3,791,654
  3,791,803
  3,791,838
  3,791,877
  3,792,213
  3,792,254
  3,792,304
  3,792,442
  3,792,532
  3,792,669
  3,792,748
  3,793,257
  3,793,540
  3,793,601
  3,793,742
  3,794,127
  3,794,223
  3,794,282
  3,794,304
  3,794,384
  3,794,916
  3,794,972
  3,795,174
  3,795,314
  3,795,519
  3,795,908
  3,796,045
  3,796,251
  3,796,572
  3,796,807
  3,797,814
  3,798,053
  3,798,100
  3,798,130
  3,798,200
  3,798,226
  3,798,347
  3,798,359
  3,798,388
  3,798,478
  3,798,553
  3,798,647
  3,798,697
  3,798,750
  3,799,832
  3,799,845
  3,799,960
  3,800,046
  3,800,406
  3,800,731
  3,800,758
  3,801,065
  3,801,299
  3,801,328
  3,801,429
  3,802,105
  3,802,540
  3,802,678
  3,802,762
  3,802,845
  3,803,020
  3,804,271
  3,804,439
  3,804,477
  3,806,286
  3,806,976
  3,807,311
  3,807,506
  3,807,543
  3,807,738
  3,809,522
  3,810,123
  3,810,485
  3,810,496
  3,810,499
  3,812,041
  3,812,177
  3,812,275
  3,812,515
  3,814,695
  3,816,284
  3,816,889
  3,818,076
  3,819,538
  3,820,570
  3,820,807
  3,821,080
  3,821,538
  3,821,561
  3,821,584
  3,821,680
  3,822,210
  3,822,684
  3,823,231
  3,823,480
  3,823,532
  3,823,621
  3,823,691
  3,824,319
  3,824,325
  3,824,357
  3,824,642
  3,824,930
  3,825,073
  3,825,121
  3,825,455
  3,825,577
  3,826,583
  3,826,761
  3,827,155
  3,827,164
  3,827,316
  3,827,905
  3,828,117
  3,828,132
  3,828,163
  3,828,192
  3,828,217
  3,828,530
  3,828,540
  3,828,569
  3,828,985
  3,828,989
  3,829,002
  3,829,051
  3,829,631
  3,829,830
  3,830,126
  3,831,361
  3,831,482
  3,831,752
  3,831,845
  3,832,235
  3,832,389
  3,833,211
  3,833,703
  3,833,824
  3,834,072
  3,834,129
  3,834,296
  3,834,330
  3,834,471
  3,834,714
  3,834,789
  3,835,074
  3,835,172
  3,835,246
  3,835,264
  3,835,307
  3,835,312
  3,835,328
  3,835,806
  3,835,856
  3,835,890
4
G
T
C
C
A
G
T
G
-
-
-
T
-
T
G
A
G/A
T/C
G
C
A/G
G/A
G/A
G
T/G
G/A
G/A
-/C
C/T
G/A
A/G
C/A
G/T
A/G
C
G/A
G/C
G/A
G
C
C/T
A/G
G/A
A/G
T/A
T/C
G/A
C
T/G
T/C
C
G/A
G/A
G/T
C/A
A/T
G/A
G/A
T/C
T/C
C/T
-/2
T/A
-
A
G
3/-
G/A
C/T
G/T
C/T
G/A
A/G
G/A
G/A
-
18/-
A
A/C
G
G/C
G/-
C/A
A/C
C/T
T/C
C/T
C/T
2/-
G/A
T/C
G/A
-
G/A
A/C
A
G
G
T
T
G
C
T
T
A
T
-
T
C
A
G
G
C
G
G
T
G
T
T
-
G
C
11
A
C
G
T
C
G
A
G
C
C
G
A
G
G
3
G
C
T
G
G
G
A
G
G
C
G
C
C
C
7
G
A
T
T
A
T
G
C
G
A
G
A
G
A
T
G
5
T
A
T
4
G
A
T
G
A
C
7
C
T
C
G
A
T
T
T
-
3
A
A
C
-
-
C
T
C
C
C
T
G
5
C
G
G
G
T
C
G
C
-
-
G
T
T
T
T
A
C
T
C
A
T
-
T
T
A
T
A
C
-
G
C
A
C
A
A
T
A
A
A
G
G
C
C
C