Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 56,770 (bp)   Positions: 249
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.127
.018
.013
.049
.04
.054
.013
.055
.052
.043
.008
.184
.558
.081
.033
.051
.001
.007
.036
.005
.007
.01
.007
.002
.004
.002
.034
.038
.059
.09
.007
.002
.018
.004
.011
.001
.001
.003
.039
.001
.003
.024
.021
.003
.0
.005
.001
.002
.001
.052
.024
.254
.631
.014
.146
.002
.002
.02
.351
.003
.001
.004
.002
.01
.0
.047
.025
.001
.117
.0
.0
.0
.0
.0
.001
.009
.0
.001
.001
.0
.019
.004
.002
.005
.001
.011
.012
.002
.001
.002
1.0
1.0
.0
.0
.033
.754
1.0
1.0
1.0
1.0
.996
1.0
1.0
1.0
1.0
1.0
.998
.999
.004
.447
.002
.989
.971
.034
.104
.056
.051
.049
.04
.469
1.0
1.0
1.0
1.0
1.0
1.0
.831
.044
.985
.002
.998
1.0
1.0
.998
.998
1.0
.001
.001
.049
.015
.001
.0
.001
.002
.002
.011
.013
.0
.0
.004
.128
.206
1.0
1.0
.999
1.0
1.0
1.0
.999
.99
1.0
1.0
1.0
.999
1.0
1.0
.367
.006
.001
1.0
1.0
1.0
.993
1.0
.003
.335
.001
.004
.008
.016
.044
.587
.001
.004
.003
.0
.003
.037
.001
.004
.018
.021
.014
.034
.04
.036
.0
.001
.001
.002
.002
.001
.002
.001
.003
.005
.017
.01
.011
.002
.002
.0
.001
.036
.041
.032
.009
.003
.003
.002
.001
.004
.004
.007
.006
.022
.01
.075
.002
.003
.027
.001
.021
.077
.138
.12
.017
.017
.0
.002
.001
.0
.0
.001
.003
.003
.001
.001
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Top2b
Top2b
Top2b
Top2b
Top2b
Top2b
Top2b
Top2b
Top2b
Top2b
Top2b
Top2b
Top2b
Top2b
Top2b
Top2b
Top2b
Top2b
Top2b
Top2b
Top2b
Top2b
Top2b
Top2b
Top2b
G
-
-
-
-
A
T
T
A
-
-
A
G
C
-
A
G
C
C
T
-
-
C
T
C
G
C
-
A
2
C
G
G
C
G
C
T
C
-
-
-
C
-
T
2
-
-
-
A
T
G
C
C
C
A
G
2
A
-
T
A
T
C
-
G
-
-
C
3
A
C
C
G
-
2
A
2
T
G
C
G
C
C
C
C
2
C
C
G
A
-
T
C
C
T
-
A
A
-
-
T
C
C
C
T
2
A
-
C
-
G
G
G
-
A
T
-
-
G
-
A
-
C
C
G
-
C
C
C
G
C
G
-
2
T
T
G
G
-
T
2
-
A
-
-
-
-
T
C
-
C
C
-
A
8
-
3
T
4
7
-
T
G
-
3
3
-
-
G
-
C
-
-
C
-
-
T
G
-
-
-
A
G
T
A
G
-
-
G
T
A
-
2
-
-
-
-
A
G
A
T
C
A
G
-
-
A
A
G
T
2
-
T
-
2
-
C
A
T
-
-
-
A
C
G
-
A
-
-
-
A
A
2
-
A
44
-
2
C
C
C
-
-
-
-
G
C
-
C
  10,276,336
  10,276,349
  10,276,359
  10,276,396
  10,276,400
  10,276,413
  10,276,445
  10,276,473
  10,276,474
  10,276,489
  10,276,601
  10,276,619
  10,276,636
  10,276,649
  10,276,660
  10,276,699
  10,276,709
  10,276,754
  10,276,767
  10,276,771
  10,276,776
  10,276,779
  10,276,799
  10,276,807
  10,276,821
  10,276,827
  10,276,829
  10,276,839
  10,276,959
  10,276,980
  10,276,984
  10,276,989
  10,276,994
  10,277,009
  10,277,019
  10,277,025
  10,277,026
  10,277,031
  10,277,050
  10,277,056
  10,277,062
  10,277,073
  10,277,084
  10,277,141
  10,277,178
  10,277,193
  10,277,203
  10,277,209
  10,277,219
  10,277,231
  10,277,260
  10,277,271
  10,277,288
  10,277,296
  10,277,325
  10,277,336
  10,277,338
  10,277,343
  10,277,362
  10,277,378
  10,277,394
  10,277,395
  10,277,399
  10,277,408
  10,277,410
  10,277,424
  10,277,426
  10,277,629
  10,277,643
  10,277,660
  10,277,668
  10,277,672
  10,277,674
  10,277,679
  10,277,692
  10,277,697
  10,277,701
  10,277,708
  10,277,731
  10,277,742
  10,277,753
  10,277,768
  10,277,774
  10,277,777
  10,277,784
  10,277,788
  10,277,792
  10,277,803
  10,277,806
  10,277,815
  10,277,927
  10,277,942
  10,278,025
  10,278,031
  10,278,033
  10,278,073
  10,278,146
  10,278,244
  10,278,256
  10,278,260
  10,278,266
  10,278,269
  10,278,272
  10,278,278
  10,278,281
  10,278,308
  10,278,316
  10,278,344
  10,278,363
  10,283,409
  10,283,427
  10,283,493
  10,283,539
  10,283,646
  10,283,836
  10,283,926
  10,285,961
  10,285,988
  10,286,014
  10,286,040
  10,286,120
  10,286,129
  10,286,157
  10,286,161
  10,286,163
  10,286,173
  10,286,195
  10,286,198
  10,286,202
  10,286,224
  10,286,267
  10,286,307
  10,286,346
  10,286,354
  10,286,377
  10,286,389
  10,286,460
  10,286,468
  10,286,503
  10,286,529
  10,286,542
  10,286,576
  10,286,589
  10,286,593
  10,286,598
  10,286,650
  10,286,652
  10,286,656
  10,286,657
  10,286,669
  10,289,061
  10,289,079
  10,291,644
  10,291,647
  10,291,651
  10,291,661
  10,291,663
  10,291,670
  10,291,673
  10,291,680
  10,291,689
  10,291,694
  10,291,696
  10,291,699
  10,291,702
  10,291,708
  10,291,713
  10,291,740
  10,291,755
  10,291,786
  10,291,812
  10,291,859
  10,291,876
  10,291,886
  10,291,899
  10,291,915
  10,292,025
  10,292,086
  10,292,101
  10,292,108
  10,292,111
  10,308,959
  10,311,689
  10,311,698
  10,311,705
  10,311,708
  10,311,714
  10,311,772
  10,311,794
  10,311,795
  10,311,801
  10,311,804
  10,311,815
  10,311,826
  10,311,828
  10,311,833
  10,311,847
  10,311,850
  10,311,858
  10,312,058
  10,312,059
  10,312,062
  10,312,065
  10,312,077
  10,312,086
  10,312,088
  10,312,092
  10,312,097
  10,312,117
  10,312,127
  10,312,129
  10,312,137
  10,312,151
  10,312,167
  10,312,179
  10,312,184
  10,312,188
  10,312,191
  10,312,201
  10,312,220
  10,312,228
  10,312,231
  10,312,283
  10,312,308
  10,312,310
  10,312,348
  10,312,366
  10,312,400
  10,312,423
  10,312,446
  10,312,460
  10,312,485
  10,312,491
  10,312,565
  10,312,576
  10,312,580
  10,312,639
  10,312,643
  10,312,649
  10,312,656
  10,312,661
  10,312,668
  10,312,673
  10,312,676
  10,312,681
  10,312,683
  10,312,684
  10,312,688
  10,312,697
-
A
C
A
A
T
-
A
T
G
C
-
-
A
A
-
-
-
-
-
C
T
-
A
T
T
G
A
-
-
G
A
-
-
-
T
A
A
A
C
A
A
C
-
-
A
2
T
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
A
-
-
C
-
C
T
T
C
-
-
-
-
-
-
G
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
2
-
A
-
-
C
-
G
G
T
-
G
-
-
-
-
-
T
A
A
-
-
-
A
-
-
A
T
-
T
-
G
-
C/T
G/T
G
C/A
-
C/T
G/-
-
-
T
-
-
-
-
-
T
G
-
T
-
T
2
T
2
-
G
T
T
G
7
G
8/-
-/5
3/-
T/A
4/-
7/-
-/T
T/C
G/C
-/5
3/-
3/-
-/5
A
-
C
-
C
C
-
G
A
-
-
T
A
A
-
-
-
-
-
C
T
T
G
T
2
-
G
C
T
G
T
-
C
A
G
T
-
T
G
-
C
-
G
-
G
-
T
-
T
A
-
A
T
G
C
-
-
-
T
-
A
T
T
-
-
-
C
-
-
T
-
-
-
-
T
T
T
G
C
T
T
-