Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 47,665 (bp)   Positions: 445
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.0
.0
.003
.004
.0
.293
.022
.012
.038
.002
.004
.166
.016
.647
.0
.002
.151
.022
.918
.399
.006
.383
.729
.005
.019
.132
.281
.26
.164
.053
.018
.096
.372
.129
.116
.098
.129
.121
.105
.037
.031
.057
.047
.041
.007
.074
.037
.013
.013
.042
.032
.092
.065
.075
.094
.21
.017
.001
.013
.003
.097
.034
.033
.002
.037
.026
.073
.152
.077
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
--
--
--
.102
.012
.072
.781
.106
.009
1.0
.996
.988
.99
.984
.019
.207
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.021
.048
.015
.003
.001
.0
.972
.002
.01
.004
.028
.037
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.015
.001
.001
.027
.085
.143
.439
.998
1.0
.017
.002
.003
.095
.071
.009
.008
.013
.357
.004
.018
--
--
--
--
--
--
.016
.065
.096
.374
.41
.357
.067
.615
.443
.042
.467
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
.049
.004
.753
.076
.086
.002
.001
.05
--
--
--
--
--
--
--
--
.008
.003
.014
.078
--
--
--
--
.956
.001
--
--
.012
--
.007
.055
.191
1.0
.009
.018
.178
--
--
--
.009
.0
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
G
G
A
G
C
A
T
G
C
A
A
G
T
C
C
T
G
G
C
C
A
C
G
A
C
A
T
T
T
C
T
T
A
A
C
G
A
A
G
C
C
T
G
A
T
G
T
T
G
G
T
T
T
C
T
C
T
A
C
T
T
C
A
T
A
T
T
A
A
C
G
G
G
C
C
A
G
C
G
C
T
A
T
T
G
G
T
G
G
C
T
A
A
G
T
G
A
C
A
C
T
G
G
C
A
G
A
T
T
C
T
A
A
G
T
T
C
T
G
T
C
A
C
A
T
A
A
T
G
T
C
T
A
C
C
T
T
G
C
T
G
A
C
A
A
G
G
C
C
C
C
T
T
G
A
G
G
T
G
A
A
A
A
G
A
C
A
A
C
G
G
C
T
G
C
T
C
C
C
A
G
C
G
C
C
C
T
G
C
G
T
T
T
C
C
A
A
T
C
G
G
G
A
C
A
T
A
T
G
T
C
C
G
C
C
A
A
C
T
C
C
G
C
T
C
T
A
A
G
T
C
C
A
G
C
C
C
G
A
T
G
G
T
G
T
G
T
G
G
C
T
C
C
C
T
G
C
C
C
C
T
G
A
G
T
C
A
G
C
T
C
C
G
G
T
T
T
T
T
C
G
T
G
G
C
C
T
A
A
C
C
T
G
C
T
C
C
T
C
G
G
C
C
T
C
G
C
G
G
G
C
C
C
G
T
T
A
T
C
T
C
T
T
T
G
A
C
T
C
G
A
A
C
C
T
C
G
A
C
A
C
G
G
C
C
G
G
C
C
C
A
G
C
C
G
A
A
A
C
C
G
A
A
T
G
T
G
G
G
G
G
C
A
A
A
T
A
A
T
T
C
T
A
C
A
C
G
C
G
C
T
A
A
C
G
C
T
T
T
C
G
A
A
G
C
C
G
C
G
C
C
C
A
T
T
T
T
C
T
C
G
A
A
G
T
C
G
C
G
G
C
A
A
T
T
T
A
A
T
T
G
G
C
A
T
  237,524
  237,529
  237,707
  237,716
  237,893
  238,009
  238,132
  238,137
  238,231
  238,341
  238,344
  238,370
  238,555
  238,624
  238,645
  238,798
  238,931
  239,161
  239,207
  239,243
  239,270
  239,328
  239,335
  239,400
  239,415
  239,454
  239,479
  239,527
  239,531
  239,543
  239,551
  239,596
  239,632
  239,661
  239,670
  239,726
  239,738
  239,785
  239,795
  239,886
  239,934
  239,980
  239,982
  239,992
  240,062
  240,140
  240,144
  240,187
  240,189
  240,226
  240,228
  240,263
  240,272
  240,283
  240,291
  240,317
  240,393
  240,452
  240,511
  240,514
  240,551
  240,615
  240,626
  240,636
  240,651
  240,657
  240,731
  240,764
  240,775
  240,803
  240,832
  240,854
  240,868
  240,876
  240,953
  241,088
  241,130
  241,220
  241,260
  241,308
  241,382
  241,383
  241,416
  241,433
  241,437
  241,445
  241,485
  241,494
  241,495
  241,502
  241,611
  241,625
  241,669
  241,777
  241,827
  242,029
  242,037
  242,063
  242,116
  242,128
  242,133
  242,135
  242,151
  242,161
  242,350
  242,354
  242,392
  242,408
  242,436
  242,444
  242,449
  242,477
  242,478
  242,528
  242,541
  242,556
  242,650
  242,673
  242,739
  242,761
  242,804
  242,810
  242,821
  242,830
  242,867
  242,876
  243,016
  243,026
  243,037
  243,046
  243,047
  243,073
  243,099
  243,102
  243,108
  243,179
  243,209
  243,210
  243,259
  243,266
  243,272
  243,280
  243,312
  243,315
  243,354
  243,365
  243,381
  243,396
  243,412
  243,441
  243,453
  243,696
  243,704
  243,767
  243,779
  243,782
  243,823
  243,826
  243,833
  243,845
  243,894
  243,898
  243,977
  244,052
  244,088
  244,276
  244,285
  244,461
  244,574
  244,594
  244,617
  244,620
  244,653
  244,679
  244,977
  245,028
  245,278
  245,305
  245,404
  245,460
  245,701
  245,803
  245,807
  245,811
  245,823
  245,897
  245,954
  245,997
  246,091
  246,120
  246,128
  246,153
  246,213
  246,229
  246,235
  246,250
  246,253
  246,263
  246,322
  246,376
  246,380
  246,432
  246,436
  246,450
  246,520
  246,691
  246,712
  246,728
  246,782
  246,813
  246,862
  246,879
  246,940
  246,950
  246,962
  247,063
  247,121
  247,149
  247,165
  247,271
  247,274
  247,293
  247,423
  247,455
  247,463
  247,840
  247,867
  247,895
  247,909
  248,010
  248,026
  248,035
  248,049
  248,333
  248,352
  248,419
  248,433
  248,497
  248,687
  248,747
  248,752
  248,979
  249,015
  249,138
  249,141
  249,147
  249,163
  249,307
  249,381
  249,421
  249,455
  249,484
  249,532
  249,741
  249,800
  249,823
  249,898
  249,929
  249,948
  250,184
  250,203
  250,205
  250,248
  250,251
  250,363
  250,416
  250,421
  250,451
  250,471
  250,545
  250,552
  250,611
  250,627
  250,715
  250,799
  250,838
  250,883
  250,949
  250,953
  250,980
  251,002
  251,026
  251,095
  251,123
  251,215
  251,382
  251,406
  251,573
  251,607
  251,640
  251,674
  251,833
  251,940
  252,244
  252,372
  252,437
  252,473
  252,561
  252,610
  252,620
  252,845
  252,956
  253,091
  253,099
  253,109
  253,156
  253,159
  253,896
  253,932
  254,002
  254,035
  254,071
  254,101
  254,104
  254,113
  254,117
  254,121
  254,139
  254,222
  254,267
  254,543
  254,595
  254,599
  254,661
  254,873
  255,383
  255,746
  255,756
  255,810
  255,839
  255,956
  255,973
  256,077
  256,228
  256,341
  256,365
  256,371
  256,419
  256,427
  256,496
  256,712
  256,715
  256,741
  256,852
  257,141
  257,159
  257,247
  257,327
  257,525
  257,651
  257,968
  258,005
  258,024
  258,248
  258,319
  258,521
  258,651
  258,660
  258,669
  258,700
  258,762
  258,946
  258,957
  258,965
  258,973
  258,977
  258,982
  259,009
  259,074
  259,225
  259,355
  259,441
  259,465
  259,510
  259,569
  259,643
  259,655
  259,709
  259,753
  259,803
  259,963
  259,969
  259,981
  260,122
  260,127
  260,146
  260,148
  260,150
  260,232
  260,240
  260,267
  260,274
  260,284
  260,288
  260,504
  260,525
  260,534
  260,544
  260,550
  260,559
  260,621
  260,647
  260,932
  260,974
  261,026
  261,069
  261,113
  261,178
  261,242
  261,245
  261,349
  261,361
  261,425
  261,605
  261,609
  261,613
  261,643
  261,958
  262,088
  262,319
  262,329
  262,744
  262,791
  263,266
  263,378
  263,396
  263,535
  263,988
  267,375
  268,347
  270,036
  270,659
  271,739
  275,894
  277,223
  278,084
  278,278
  278,802
  278,830
  278,997
  281,042
  281,044
  281,094
  282,341
  284,465
A
A
G
C
G
T
C
A
T
G
G
A
A
T
T
C
A
A
T
T
T
T
A
T
T
G
C
A
C
T
C
C
G
G
T
A
G
G
T
T
A
C
C
G
G
A
C
C
A
T
C
C
A
G
C
G
C
G
T
C
G
T
G
G
G
A
C
C
G
G
A
T
T
T
A
G
T
A
A
T
G
C
C
G
A
C
C
C
A
A
C
C
C
A
C
A
G
G
G
T
C
A
A
T
T
A
T
C
C
A
C
G
G
A
C
C
A
G
T
C
T
G
T
G
C
G
T
G
A
A
A
G
G
A
T
T/A
T/C
G/A
C/T
T/G
G/C
A/T
C/A
A/G
A/C
G/T
G/A
C/A
C/T
C/T
G
T/A
T/C
G/A
T
A
C
C
A
G
G
G
G
A
T
T
G
G
T
A
A
G
A
A
T
C
T
G
T
C
A
T
A
T
G
T
C
A
T
C
G
G
C
T
A
C
G
G
T
A
A
A
G
T
G
C
G
C
A
A
T
A
A
T
T
G
C
G
C
T
A
A
A
C
T
C
G
C
A
A
A
G
G
A
T
T
G
A
G
C
A
T
A
C
C
A
C
A
A
T
C
G
T
T
A
A
T
T
G
T
C
A
G
T
C
T
C
A
A
A
T
A
A
A
C
C
G
C
A
T
T
C
T
A
G
A
A
C
T
T
T
T/C
A
C/T
C
T
A
A
G
A
C
T
A
C
T
G/A
C/T
A
C
C
T
T
A
C
G
C
G
C
T
C
T
A
C
G
A
G
T
G
G
A
G
G
T
T
G
T
C
G
T
G
G
A
A
T
T
C
A
T
G
T
G
A
T
T
A
G
C
T
T
T
A
G
G
C
A
G
A
A
A
T
A
T
G
T
T
C
G
G
C
C
T
C
G
T
G
T
T
T
A
A
A
G
G
T
A
G
C
A
C
T
A
G
G
A
T
A
A
T
A
T
C/A
G
C
C
C
C
C
T
T/C
G
A
G
C
A
G
T
A
T
A
G/A
T
G
A/C
C
C
C
G
C
A
C
G/A
G/A
T
G
A