Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 47,665 (bp)   Positions: 544
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.0
.013
.003
.0
.003
.004
.001
.0
.009
.293
.022
.012
.045
.038
.002
.004
.01
.475
.428
.009
.012
.017
.0
.002
.151
.002
.05
.029
.013
.001
.089
.158
.022
.03
.399
.006
.383
.729
.007
.019
.132
.281
.26
.164
.053
.018
.096
.372
.129
.116
.098
.129
.121
.105
.037
.031
.032
.031
.057
.047
.041
.003
.007
.056
.074
.037
.036
.013
.013
.042
.032
.148
.092
.065
.075
.094
.21
.017
.001
.003
.097
.034
.033
.002
.006
.009
.037
.026
.073
.062
.152
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.546
.587
.951
.992
.102
.012
.202
.001
.844
.848
.072
.781
.106
.009
1.0
.99
1.0
.089
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.002
.009
.002
.003
.01
.006
.028
.037
.811
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.004
.015
.001
.001
.027
.085
.095
.143
.439
.998
1.0
.017
.002
.003
.246
.12
.033
.015
.073
.093
.071
.109
.018
.009
.008
.014
.004
.018
--
--
--
--
--
--
--
.016
.065
.096
.146
.374
.41
.357
.123
.067
.615
.042
.047
.467
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.008
.003
.012
.019
.014
.097
.006
.029
--
--
--
.583
.039
--
.012
.007
.055
.111
1.0
.009
.018
--
--
.009
.0
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
Tmlhe
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
G
C
T
C
A
G
3
C
G
A
T
G
A
C
A
A
A
C
T
A
4
T
C
T
G
A
A
G
G
G
A
A
G
C
C
A
C
G
-
C
A
T
T
T
C
T
T
A
A
C
G
A
A
G
C
T
G
C
T
G
A
C
T
C
G
T
T
T
G
G
T
3
T
T
C
T
C
T
A
T
T
C
A
T
-
G
A
T
T
C
A
C
G
G
G
C
A
-
C
A
G
C
A
G
C
-
T
A
A
T
T
G
G
T
G
G
C
T
A
-
A
G
T
G
A
C
C
T
A
C
T
G
G
C
G
-
C
A
C
A
G
T
G
G
C
3
A
T
T
C
T
A
A
G
T
T
C
T
G
T
C
C
A
T
A
T
A
T
G
T
C
T
A
C
C
A
G
T
C
C
G
C
G
A
G
A
G
G
T
G
G
A
A
9
A
A
T
T
A
G
C
A
C
18
A
A
G
T
29
3
G
C
C
-
T
C
C
C
T
C
T
C
C
G
C
C
C
C
A
G
C
C
C
G
C
G
T
2
2
T
C
C
A
A
T
C
-
G
A
G
G
A
-
G
C
A
A
G
T
G
C
C
3
A
A
-
A
C
C
C
G
T
A
8
A
C
G
A
T
C
C
A
A
A
12
A
G
T
T
T
G
A
-
G
A
G
T
G
T
G
T
-
T
G
G
C
T
C
G
A
-
C
-
G
A
C
C
C
-
G
G
G
T
C
G
G
T
C
A
G
T
A
G
C
G
G
T
T
C
G
T
G
T
T
G
T
T
G
G
A
C
T
A
A
C
T
A
C
C
-
A
G
T
A
-
T
C
C
T
C
G
A
G
C
C
C
C
G
C
T
A
C
C
T
G
C
C
C
C
G
A
T
C
T
C
G
A
G
G
C
C
C
C
G
T
T
G
A
T
C
T
C
T
T
G
T
4
5
-
T
G
G
C
A
C
-
G
A
A
A
-
C
T
C
G
A
C
A
-
C
G
G
-
C
C
G
-
C
C
C
A
C
G
T
A
A
C
G
G
T
T
C
C
A
A
A
C
C
G
A
A
T
G
T
G
G
-
G
G
G
-
C
A
A
A
A
T
T
A
-
G
T
T
T
G
T
A
G
-
43
A
C
C
G
C
2
G
C
A
A
T
T
T
C
G
G
G
G
T
C
G
T
10
A
C
A
G
C
G
T
A
A
-
A
T
T
G
A
A
T
T
C
A
T
  237,529
  237,535
  237,613
  237,697
  237,707
  237,716
  237,767
  237,893
  237,928
  238,009
  238,132
  238,137
  238,155
  238,231
  238,341
  238,344
  238,348
  238,466
  238,467
  238,546
  238,554
  238,570
  238,645
  238,798
  238,931
  238,981
  239,003
  239,005
  239,025
  239,117
  239,131
  239,139
  239,161
  239,165
  239,243
  239,270
  239,328
  239,335
  239,390
  239,415
  239,454
  239,479
  239,527
  239,531
  239,543
  239,551
  239,596
  239,632
  239,661
  239,670
  239,726
  239,738
  239,785
  239,795
  239,886
  239,905
  239,906
  239,934
  239,980
  239,982
  239,992
  240,059
  240,062
  240,083
  240,140
  240,144
  240,150
  240,187
  240,189
  240,226
  240,228
  240,237
  240,263
  240,272
  240,283
  240,291
  240,317
  240,393
  240,452
  240,514
  240,551
  240,615
  240,626
  240,636
  240,642
  240,643
  240,651
  240,657
  240,731
  240,732
  240,764
  240,803
  240,832
  240,854
  240,868
  240,876
  240,884
  240,887
  240,953
  241,088
  241,130
  241,220
  241,243
  241,260
  241,308
  241,359
  241,382
  241,383
  241,394
  241,416
  241,433
  241,437
  241,445
  241,485
  241,494
  241,495
  241,502
  241,611
  241,625
  241,632
  241,669
  241,777
  241,827
  241,914
  242,037
  242,063
  242,067
  242,069
  242,116
  242,128
  242,133
  242,135
  242,151
  242,161
  242,192
  242,207
  242,219
  242,220
  242,226
  242,232
  242,233
  242,235
  242,238
  242,239
  242,243
  242,246
  242,392
  242,408
  242,436
  242,444
  242,449
  242,477
  242,478
  242,528
  242,541
  242,556
  242,650
  242,673
  242,739
  242,761
  242,804
  242,821
  242,830
  242,867
  242,876
  243,002
  243,016
  243,026
  243,037
  243,046
  243,047
  243,073
  243,099
  243,102
  243,108
  243,132
  243,272
  243,335
  243,441
  243,453
  243,475
  243,489
  243,490
  243,620
  243,767
  243,779
  243,782
  243,823
  243,826
  243,833
  243,841
  243,843
  243,845
  243,869
  243,894
  243,898
  243,965
  244,003
  244,019
  244,052
  244,056
  244,088
  244,253
  244,259
  244,285
  244,292
  244,304
  244,385
  244,479
  244,512
  244,556
  244,620
  244,629
  244,645
  244,652
  244,785
  244,790
  244,878
  244,892
  244,977
  245,028
  245,044
  245,124
  245,169
  245,172
  245,278
  245,305
  245,404
  245,460
  245,701
  245,743
  245,790
  245,872
  245,997
  246,091
  246,120
  246,128
  246,178
  246,188
  246,213
  246,229
  246,235
  246,250
  246,253
  246,263
  246,305
  246,327
  246,345
  246,364
  246,376
  246,380
  246,458
  246,501
  246,518
  246,548
  246,741
  246,772
  246,782
  246,813
  246,860
  246,862
  246,879
  246,939
  246,945
  247,063
  247,070
  247,121
  247,149
  247,271
  247,274
  247,293
  247,356
  247,363
  247,397
  247,416
  247,423
  247,784
  247,820
  247,840
  247,853
  247,863
  247,867
  247,895
  247,945
  248,178
  248,436
  248,523
  248,659
  248,679
  248,747
  248,752
  248,928
  248,947
  248,979
  248,990
  248,991
  249,015
  249,138
  249,141
  249,147
  249,163
  249,243
  249,245
  249,307
  249,381
  249,421
  249,455
  249,484
  249,809
  249,810
  249,822
  249,832
  249,834
  249,863
  249,869
  249,892
  249,929
  249,948
  249,962
  249,971
  249,999
  250,022
  250,025
  250,063
  250,152
  250,185
  250,203
  250,225
  250,248
  250,251
  250,363
  250,421
  250,451
  250,471
  250,532
  250,534
  250,539
  250,545
  250,552
  250,627
  250,662
  250,715
  250,799
  250,838
  250,877
  250,949
  251,026
  251,095
  251,123
  251,294
  251,382
  251,406
  251,607
  251,653
  251,674
  251,703
  251,725
  251,750
  252,029
  252,162
  252,181
  252,207
  252,212
  252,214
  252,304
  252,372
  252,453
  252,473
  252,561
  252,610
  252,620
  252,768
  252,854
  252,927
  253,077
  253,091
  253,109
  253,156
  253,159
  253,229
  253,333
  253,335
  253,342
  253,346
  253,351
  253,353
  253,403
  253,414
  253,611
  253,662
  253,711
  253,751
  253,768
  253,811
  253,856
  253,896
  253,930
  253,932
  254,002
  254,035
  254,061
  254,071
  254,101
  254,104
  254,113
  254,117
  254,118
  254,121
  254,139
  254,222
  254,267
  254,543
  254,595
  254,599
  254,610
  254,628
  254,637
  254,643
  254,655
  254,662
  254,873
  255,070
  255,187
  255,383
  255,746
  255,760
  255,839
  255,956
  255,973
  256,061
  256,096
  256,228
  256,341
  256,365
  256,371
  256,419
  256,427
  256,496
  256,658
  256,712
  256,715
  256,741
  256,801
  256,852
  257,141
  257,247
  257,255
  257,327
  257,525
  257,546
  257,598
  258,004
  258,052
  258,054
  258,072
  258,112
  258,114
  258,300
  258,314
  258,355
  258,430
  258,545
  258,587
  258,651
  258,654
  258,660
  258,669
  258,700
  258,762
  258,946
  258,957
  258,965
  258,973
  258,977
  258,982
  259,009
  259,051
  259,074
  259,219
  259,355
  259,415
  259,441
  259,465
  259,510
  259,569
  259,615
  259,643
  259,692
  259,709
  259,731
  259,733
  259,753
  259,792
  259,803
  259,812
  259,969
  259,981
  259,984
  259,992
  259,998
  260,127
  260,136
  260,146
  260,148
  260,150
  260,186
  260,232
  260,240
  260,274
  260,284
  260,534
  260,544
  260,550
  260,559
  260,621
  260,766
  260,842
  260,885
  260,923
  262,319
  262,329
  262,543
  262,603
  262,744
  262,777
  262,852
  262,880
  263,131
  263,376
  263,378
  263,724
  264,423
  269,582
  270,659
  275,894
  277,223
  277,301
  278,278
  278,802
  278,830
  280,457
  281,094
  282,341
  284,465
A
T
G
G
G
C
-
G
-
T
C
A
-
T
G
G
-
T
G
G
-
A
T
C
A
G
G
C
T
A
G
T
A
-
T
T
T
A
2
T
G
C
A
C
T
C
C
G
G
T
A
G
G
T
T
C
T
A
C
C
G
-
G
T
A
C
-
C
A
T
C
-
C
A
G
C
G
C
G
C
G
T
G
G
C
T
G
A
C
T
C
G
A
T
T
T
-
29
A
G
T
A
-
A
T
G
G
C
-
C
G
A
C
C
C
A
A
C
C
C
C
A
C
T
G
G
T
C
G
T
C
A
A
T
-
G
A
G
T
C
A
A
A
T
T
-
T
C
C
A
C
G
G
A
C
C
A
G
T
C
T
T
G
C
G
-
T
G
A
A
A
G
G
A
T
G
C
C
T
G
A
T
C
A/G
A
T
A
C
C
A
A
G
G
-
G
G
C
C
G
A
T
T
T
-
G
G
A
A
29/-
3/-
A
G
T
2
C
T
T
-
C
T
C
T
T
A
T
T
G
T
C
A
A
A
A
A
T
C
G
-
-
C
T
A
C
G
G
T
2
A
-
A
A
G
11
A
T
G
-
A
A
A
T
A
-
-
G
4
C
G
T
A
A
-
G
-
G
A
A
G
C
T
T
G
C
T
-
C
A
-
A
C
A
-
T
T
C
A
A
C
C
A
C
A
C
A
A
T
C
G
T
G
7
T
4
T
G
G
T
G
3
C
T
A
C
T
A
A
C
T
G
T
C
C
A
A
A
A
C
A
T
A
A
A
C
C
-
C
C
T
A
T
A
A
T
G
T
C
G
T
A
G
G
T/C
A
G
A
C
T
A
A
G
A
G
T
-
G
A
T
A
T
C
G
T
T
A
A
T
T
T
G
A
T
G
T
A
T
A
G
C
C
T
G
T
A
C
G
C
A
G
C
T
C
T
A
C
-
G
-
-
G
G
A
-
T
G
T
C
A
G
G
-
2
T
G
T
C
G
T
G
2
G
A
A
7
T
T
A
T
T
G
T
-
T
A
C
G
G
T
A
A
C
C
T
T
C
T
T
T
T
A
G
G
C
A
G
A
A
3/T
A
A
A
G
T
G
T
T
G
C
A
G
8
A
C
A
C
C
C
G
T
2
-
G
T
T
T
T
-
A
A
G
G
C
A
C
T
A
A
A
T
C
G
A
C
-
G
T
G
A
T
C
G
G
G
2
G
C
C
T
G
C
A
-
T
G
A