Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 294,575 (bp)   Positions: 447
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.003
.002
.0
.0
.042
.0
.0
.0
.522
.084
.008
.0
.0
.001
.388
.001
.0
.0
.0
.013
.017
.0
.179
.19
.0
.001
.0
.0
.0
.061
.198
.0
--
.004
.005
.026
.0
.002
.016
.0
.005
.771
.957
.998
.929
.0
.001
.914
.355
.069
.04
.05
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.0
.043
.014
.017
.078
.001
.043
.006
.032
.85
.005
.001
.009
.02
.001
.008
.0
.0
.001
.0
.0
.077
.003
--
--
.0
.001
.001
.001
.001
.001
.003
.0
.002
.001
.0
.06
.0
.0
.316
.401
.0
.001
.661
.0
.001
.0
.0
.005
.008
.008
.0
.002
.082
.008
.021
.036
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.896
1.0
--
--
--
--
--
.041
.004
.371
--
.488
.019
.0
.006
.0
.0
.091
.0
.002
.744
.027
.0
.0
.007
.015
--
--
.0
--
.005
.003
.001
.0
.001
.0
.009
.003
.004
.009
.047
.026
.002
.0
.001
.005
.002
.001
.028
.015
.004
.281
.0
.035
.337
.0
.002
.0
.001
.002
.038
.119
.282
.0
.003
.001
.005
.003
.163
.0
.003
.65
.245
.036
.0
.01
.13
.023
.004
.0
.0
.0
.008
.0
.013
.959
.072
.056
.009
.032
.239
.115
.0
.0
.028
.025
.001
.07
--
.0
--
--
--
.001
.026
.661
.024
.008
.001
.0
.085
.019
.0
.0
.007
.006
.025
.033
.243
.008
.003
.0
.002
.0
.0
.0
.013
.008
.058
.236
.047
.006
.01
.0
.0
.002
.034
.714
.279
.006
.001
.001
.009
.008
.002
.033
.0
.001
.0
.002
.0
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
.0
.001
.001
.032
.012
.003
.886
.0
.003
.001
.114
.789
.024
.036
.192
.027
.031
.055
.247
.016
.003
.011
.025
.002
.0
.001
.004
.001
.06
.011
.006
.001
.997
.932
.003
.014
.383
.0
.0
.028
.002
.0
.005
.025
.0
.076
.0
.0
.096
.001
.0
.327
.003
.001
.001
.0
.006
.03
.0
.0
.006
.065
.158
.008
.099
.0
.001
.001
.006
.001
.019
.129
.002
.008
.252
.021
.16
.028
.0
.001
.0
.01
.0
.003
.001
.0
.148
.001
.505
.005
.125
.004
.001
.0
.006
.0
.012
.007
.006
.004
.0
.261
.001
.0
.007
.0
.001
.0
.302
.011
.128
.0
.018
.0
.753
.001
.007
.001
.0
.0
.032
.0
.0
.002
.019
.025
.0
.613
.061
.005
.031
.189
--
.0
.0
.0
.032
.0
.005
.0
.0
.065
.0
.004
.121
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
LOC108351929
LOC108351929
LOC108351929
LOC108351929
LOC108351929
LOC108351929
LOC108351929
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Tmeff2
Tmeff2
Tmeff2
Tmeff2
Tmeff2
Tmeff2
Tmeff2
Tmeff2
Tmeff2
Tmeff2
Tmeff2
Tmeff2
Tmeff2
Tmeff2
Tmeff2
Tmeff2
Tmeff2
Tmeff2
Tmeff2
Tmeff2
Tmeff2
Tmeff2
Tmeff2
Tmeff2
Tmeff2
Tmeff2
Tmeff2
Tmeff2
Tmeff2
Tmeff2
Tmeff2
Tmeff2
Tmeff2
Tmeff2
Tmeff2
Tmeff2
Tmeff2
Tmeff2
Tmeff2
Tmeff2
Tmeff2
Tmeff2
Tmeff2
Tmeff2
Tmeff2
C
G
T
T
T
T
A
T
C
C
T
C
C
A
A
T
A
A
G
G
G
A
A
G
T
C
A
T
T
G
G
G
C
G
C
C
C
A
G
T
T
G
T
A
G
C
G
A
G
G
C
A
A
T
G
T
G
G
C
A
G
T
G
T
A
T
A
G
T
T
G
C
T
A
T
G
C
A
G
T
G
A
C
C
C
A
T
G
C
T
G
T
G
G
C
C
T
T
C
C
G
T
A
T
A
T
T
T
C
A
C
C
A
T
G
G
T
A
G
A
G
T
G
G
G
G
T
T
A
T
G
T
A
G
T
T
T
T
G
A
A
A
T
C
G
G
A
A
T
C
T
G
C
T
T
G
G
A
A
C
T
C
T
A
A
A
C
G
C
T
A
C
G
A
G
C
A
G
A
T
C
A
A
C
T
A
T
T
C
T
A
G
C
G
C
A
T
C
C
T
C
A
G
A
T
T
G
G
G
A
A
G
T
C
T
G
C
A
T
A
G
T
C
C
T
T
T
C
A
G
T
C
T
A
C
T
C
A
T
C
A
C
A
A
G
A
T
T
T
T
G
A
G
G
A
G
C
T
T
G
A
G
C
C
T
T
A
C
G
T
T
T
G
T
T
T
C
T
A
A
T
G
C
C
G
G
A
C
T
G
G
C
G
A
T
A
C
G
C
A
A
A
T
T
T
A
T
T
A
A
G
T
T
C
A
A
T
T
T
T
T
G
A
T
G
C
C
C
A
C
A
G
T
C
A
T
T
G
C
G
A
G
G
T
A
T
G
C
G
C
T
T
G
C
A
C
T
A
A
G
C
A
C
G
C
G
G
T
T
A
A
C
T
A
A
T
T
T
A
G
A
T
T
C
C
T
G
A
G
T
G
T
G
A
G
A
G
T
C
A
T
A
A
T
C
A
T
G
C
A
T
T
A
C
G
C
C
T
T
C
A
T
G
C
G
G
T
G
T
A
T
T
G
A
C
G
T
T
A
T
A
G
A
T
C
C
G
  55,379,400
  55,379,420
  55,381,112
  55,381,182
  55,383,027
  55,383,974
  55,384,006
  55,384,071
  55,386,466
  55,386,809
  55,387,176
  55,387,800
  55,388,004
  55,388,361
  55,388,471
  55,388,573
  55,388,596
  55,388,880
  55,389,088
  55,389,782
  55,389,813
  55,390,065
  55,390,120
  55,390,177
  55,390,247
  55,390,339
  55,390,618
  55,390,627
  55,390,662
  55,391,101
  55,391,289
  55,391,503
  55,393,340
  55,393,968
  55,394,046
  55,394,128
  55,394,231
  55,394,256
  55,394,566
  55,394,876
  55,394,903
  55,395,072
  55,395,227
  55,395,283
  55,395,506
  55,396,016
  55,396,233
  55,396,463
  55,396,475
  55,396,859
  55,396,892
  55,397,382
  55,398,029
  55,399,213
  55,399,600
  55,399,682
  55,399,913
  55,400,141
  55,400,376
  55,400,953
  55,401,154
  55,401,210
  55,401,709
  55,402,198
  55,402,781
  55,403,639
  55,405,100
  55,407,215
  55,407,223
  55,407,226
  55,407,252
  55,407,698
  55,408,686
  55,411,643
  55,415,640
  55,415,738
  55,416,763
  55,417,062
  55,417,411
  55,417,723
  55,418,011
  55,418,151
  55,418,475
  55,418,530
  55,420,861
  55,420,906
  55,420,929
  55,421,279
  55,421,324
  55,421,359
  55,422,464
  55,422,830
  55,422,831
  55,423,037
  55,423,114
  55,423,277
  55,423,649
  55,424,143
  55,426,780
  55,433,778
  55,434,514
  55,457,952
  55,476,052
  55,484,735
  55,484,768
  55,484,816
  55,484,817
  55,492,865
  55,493,237
  55,493,518
  55,494,063
  55,495,331
  55,495,415
  55,495,986
  55,496,274
  55,496,386
  55,496,893
  55,497,080
  55,497,426
  55,497,610
  55,497,909
  55,498,444
  55,498,780
  55,499,920
  55,500,628
  55,500,793
  55,501,189
  55,501,534
  55,501,690
  55,502,341
  55,502,788
  55,502,939
  55,502,940
  55,503,169
  55,503,699
  55,504,332
  55,504,490
  55,504,570
  55,504,928
  55,505,718
  55,505,834
  55,505,844
  55,505,934
  55,506,111
  55,506,648
  55,507,240
  55,507,619
  55,508,082
  55,508,958
  55,509,059
  55,509,155
  55,510,878
  55,510,946
  55,511,392
  55,511,824
  55,512,263
  55,513,385
  55,514,250
  55,514,521
  55,514,768
  55,514,794
  55,515,789
  55,516,814
  55,516,915
  55,519,329
  55,519,330
  55,520,688
  55,522,150
  55,523,710
  55,523,903
  55,524,537
  55,524,979
  55,525,467
  55,525,570
  55,525,831
  55,526,379
  55,526,425
  55,526,518
  55,526,584
  55,526,721
  55,526,771
  55,526,828
  55,526,829
  55,526,990
  55,527,322
  55,527,329
  55,527,420
  55,527,423
  55,527,474
  55,534,106
  55,534,264
  55,534,266
  55,534,910
  55,535,220
  55,535,469
  55,536,353
  55,536,470
  55,536,556
  55,536,768
  55,536,858
  55,537,218
  55,537,257
  55,537,704
  55,538,003
  55,538,318
  55,538,517
  55,538,729
  55,539,580
  55,540,012
  55,540,032
  55,540,054
  55,540,528
  55,540,603
  55,540,736
  55,541,184
  55,541,526
  55,541,607
  55,541,669
  55,541,875
  55,542,135
  55,543,358
  55,543,650
  55,544,515
  55,546,122
  55,548,693
  55,550,562
  55,551,772
  55,554,356
  55,557,581
  55,561,760
  55,562,296
  55,562,924
  55,563,745
  55,563,899
  55,566,890
  55,567,493
  55,567,652
  55,568,670
  55,570,364
  55,572,207
  55,573,338
  55,576,367
  55,576,756
  55,576,811
  55,577,595
  55,577,598
  55,577,743
  55,577,969
  55,578,055
  55,578,310
  55,578,602
  55,578,612
  55,578,812
  55,578,879
  55,579,032
  55,579,038
  55,579,310
  55,579,770
  55,580,096
  55,580,231
  55,580,234
  55,581,180
  55,581,471
  55,581,499
  55,582,050
  55,582,125
  55,582,205
  55,582,319
  55,582,371
  55,582,933
  55,583,094
  55,583,629
  55,583,763
  55,583,964
  55,584,646
  55,584,664
  55,584,878
  55,585,194
  55,585,564
  55,585,863
  55,585,880
  55,586,198
  55,587,056
  55,587,630
  55,587,823
  55,587,999
  55,589,035
  55,589,113
  55,589,120
  55,589,720
  55,590,940
  55,591,038
  55,591,115
  55,591,620
  55,592,852
  55,593,106
  55,593,229
  55,593,453
  55,593,464
  55,593,465
  55,593,535
  55,593,976
  55,594,359
  55,594,621
  55,594,723
  55,594,897
  55,595,348
  55,595,619
  55,595,939
  55,595,975
  55,596,334
  55,596,636
  55,597,263
  55,597,316
  55,597,691
  55,598,680
  55,598,825
  55,599,787
  55,599,811
  55,600,340
  55,601,482
  55,601,586
  55,601,724
  55,601,806
  55,601,927
  55,601,964
  55,602,161
  55,602,688
  55,603,193
  55,603,280
  55,603,755
  55,603,846
  55,604,037
  55,604,136
  55,604,213
  55,604,399
  55,604,475
  55,604,652
  55,605,053
  55,605,450
  55,605,551
  55,606,299
  55,606,721
  55,607,093
  55,607,964
  55,608,023
  55,608,059
  55,608,367
  55,608,518
  55,608,993
  55,609,249
  55,611,055
  55,611,591
  55,611,906
  55,615,180
  55,617,605
  55,617,657
  55,620,119
  55,620,268
  55,620,300
  55,621,062
  55,623,393
  55,624,330
  55,625,237
  55,625,551
  55,625,883
  55,626,583
  55,628,428
  55,628,795
  55,629,705
  55,631,410
  55,631,480
  55,632,240
  55,633,167
  55,633,368
  55,633,632
  55,634,355
  55,634,544
  55,634,586
  55,634,644
  55,635,266
  55,636,108
  55,636,552
  55,637,146
  55,637,192
  55,638,212
  55,638,330
  55,638,473
  55,638,690
  55,638,846
  55,639,390
  55,639,722
  55,639,805
  55,639,932
  55,640,059
  55,640,164
  55,640,480
  55,640,952
  55,642,382
  55,643,059
  55,643,158
  55,643,653
  55,644,777
  55,645,493
  55,645,572
  55,645,744
  55,645,867
  55,646,237
  55,646,310
  55,646,430
  55,647,544
  55,647,679
  55,647,735
  55,648,878
  55,649,032
  55,649,070
  55,649,902
  55,652,113
  55,652,524
  55,653,272
  55,655,045
  55,655,265
  55,658,640
  55,659,341
  55,660,164
  55,660,693
  55,661,216
  55,661,580
  55,661,723
  55,662,097
  55,662,116
  55,662,281
  55,662,782
  55,664,797
  55,665,229
  55,666,886
  55,667,217
  55,667,503
  55,667,989
  55,668,379
  55,668,573
  55,668,703
  55,669,473
  55,669,910
  55,670,077
  55,670,929
  55,671,264
G
A
C
A
C
C
G
G
T
T
A
T
T
T
G
C
G
T
A
A
A
C
C
T
C
G
C
A
C
T
A
A
T
A
T
T
T
G
C
C
C
A
C
G
A
T
A
G
A
A
A
C
G
G
A
A
C
T
G
G
T
C
C
C
T
A
G
A
A
C
C
A
C
G
C
A
T
G
T
A
A
G
T
A
A
G
C
T
A
C
A
C
A
C
T
T
G
C
T
A
A
C
G
C
T
G
A
A
T
T
T
T
G
C
T
C
G
T
A
C
A
G
C
A
A
T
C
C
G
C
C
G
G
A
G
A
C
C
A
G
T
C
C
T
C
A
G
G
C
A
C
A
T
A
A
A
A
G
C
T
C
T
C
G
G
G
A
A
T
A
C
T
A
G
A
T
C
C
G
C
T
C
T
T
C
G
G
C
A
C
C
T
G
T
T
G
C
T
T
A
T
G
A
G
C
C
A
A
A
G
G
A
C
G
A
A
T
C
C
G
T
C
T
G
C
C
C
G
G
A
A
G
C
T
T
C
T
C
C
T
G
T
G
T
A
G
A
A
C
C
A
C
T
A
G
T
T
C
C
T
C
T
G
G
C
G
C
T
A
C
C
C
A
A
C
C
T
A
C
G
A
A
T
G
T
T
G
A
C
A
A
A
C
G
C
C
T
A
T
C
G
C
C
C
A
G
A
C
G
C
A
C
A
G
G
G
C
C
C
G
C
A
T
G
A
T
T
T
C
A
G
T
A
T
C
C
G
C
T
A
G
T
A
G
G
C
A
G
A
T
C
C
A
A
G
T
C
T
G
A
A
G
T
A
G
C
T
C
C
G
G
T
C
G
C
C
G
G
C
A
C
C
C
T
T
C
T
G
A
C
A
C
A
T
C
G
A
G
T
G
G
G
G
A
T
G
G
A
T
T
C
C
C
T
T
A
T
C
C
T
G
C
T
G
A
C
C
A
C
T
A
C
T
G
T
A
C
C
C
A
G
C
G
A
T
T
A