Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 294,575 (bp)   Positions: 403
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.003
.002
.0
.012
.108
.002
.002
.0
.042
.005
.0
.001
.013
.001
.0
--
.131
.069
--
--
--
.001
.0
.001
.0
.006
.002
.011
.043
.014
.017
.454
.001
.0
.01
.043
.0
.001
.036
.0
.032
.85
.005
.001
.009
.02
.001
.008
.0
.0
.107
.0
.001
.0
.0
.077
.003
--
--
--
.0
.001
.001
.001
.001
.026
.003
.0
.033
.013
.001
.0
.064
.001
.001
.001
.002
.001
--
.004
.015
.024
.021
.0
.345
.998
.001
--
.051
.057
.058
.056
.05
.042
.021
.002
--
--
.002
.443
.0
.001
.001
.008
.001
.0
.0
.006
.179
.005
.004
.396
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.316
.401
.303
.001
.001
.0
.006
.001
.002
.0
.0
.0
.661
.006
.0
.001
.0
.001
.0
.011
.022
.0
.005
.008
.0
.002
.124
.082
.075
.008
.036
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.896
1.0
--
--
--
--
--
.013
.109
.004
.064
.034
.976
--
.372
.049
.986
.0
.0
.0
.0
.184
.0
.091
.011
.015
.744
.027
.0
.01
.0
.007
.015
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.011
.0
.0
.0
.052
.0
--
--
--
.001
.001
.089
.0
.003
.012
.008
.002
.0
.001
.0
.0
.022
.003
.009
.058
.649
.009
.048
.003
.004
.047
.01
.0
.001
.019
.0
.004
.015
.001
.0
.28
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.0
.005
.0
.001
.002
.001
.0
.0
.002
.0
.0
.001
.0
.119
1.0
.282
.0
.012
.0
.001
.005
.0
.003
.01
.006
.0
.004
.003
.245
.002
.0
.01
.007
.0
.0
.969
.008
.0
.135
.005
.001
--
.026
.185
.266
.026
.036
.091
.197
.232
.085
.008
.031
.009
.006
.831
.007
.055
.129
.002
.026
.001
.003
.036
.007
.006
.004
.022
.0
.0
.0
.128
.013
.0
.0
.753
.999
1.0
.994
.004
.001
.018
.001
.007
.002
.0
.0
.022
.003
.001
.002
.008
.0
.086
.0
.002
.019
.025
.0
.613
.061
.005
.857
.031
.0
.189
--
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.005
.0
.0
.065
.0
.004
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
LOC108351929
LOC108351929
LOC108351929
LOC108351929
LOC108351929
LOC108351929
LOC108351929
LOC108351929
LOC108351929
LOC108351929
LOC108351929
LOC108351929
LOC108351929
LOC108351929
LOC108351929
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Tmeff2
Tmeff2
Tmeff2
Tmeff2
Tmeff2
Tmeff2
Tmeff2
Tmeff2
Tmeff2
Tmeff2
Tmeff2
Tmeff2
Tmeff2
Tmeff2
Tmeff2
Tmeff2
Tmeff2
Tmeff2
Tmeff2
Tmeff2
Tmeff2
Tmeff2
Tmeff2
Tmeff2
Tmeff2
Tmeff2
Tmeff2
Tmeff2
Tmeff2
Tmeff2
Tmeff2
Tmeff2
Tmeff2
Tmeff2
Tmeff2
Tmeff2
Tmeff2
Tmeff2
Tmeff2
Tmeff2
Tmeff2
C
G
T
G
A
C
T
T
T
-
4
G
G
A
T
A
-
G
T
T
7
C
T
2
A
G
A
T
G
T
T
-
C
-
G
T
4
G
A
T
T
G
C
A
G
T
G
A
C
C
-
T
C
A
T
G
C
T
G
A
T
G
G
C
T
7
T
C
G
12
C
C
-
A
G
T
C
G
T
G
T
-
-
T
T
A
A
A
G
A
A
C
A
G
T
C
A
T
A
C
T
G
A
G
G
T
A
C
G
-
A
T
A
A
G
T
T
A
T
T
T
G
C
-
-
T
A
A
C
T
C
A
C
T
2
-
C
A
G
15
T
G
G
A
G
T
A
C
G
G
G
G
G
T
T
A
T
A
G
T
A
A
A
A
-
C
C
G
-
-
T
T
G
C
A
T
G
C
G
5
G
A
T
C
2
T
G
C
C
2
A
G
T
A
T
G
T
T
A
C
T
G
T
T
A
A
G
T
C
G
T
C
A
A
A
G
A
T
G
T
C
T
-
G
C
C
G
3
T
G
G
C
C
A
C
C
T
A
-
T
C
G
A
A
T
24
G
T
C
G
-
C
A
A
4
A
A
2
C
C
T
A
A
G
A
G
G
T
T
C
C
A
C
3
G
T
C
T
G
C
G
G
T
-
T
G
14
C
C
G
T
-
G
C
A
T
C
T
G
C
A
A
G
A
T
C
T
C
G
G
G
G
A
A
T
C
A
T
A
-
G
T
G
C
T
T
A
T
C
G
A
G
T
T
-
T
T
2
A
G
G
-
A
A
A
G
T
A
A
T
A
G
T
A
A
A
G
C
A
C
C
A
G
-
T
G
C
A
A
A
T
A
G
-
A
A
C
A
G
G
T
G
T
A
T
T
5
G
T
A
C
A
T
T
G
T
-
A
G
A
T
C
C
  55,379,400
  55,379,420
  55,379,425
  55,379,445
  55,379,529
  55,380,311
  55,380,454
  55,381,112
  55,383,027
  55,383,455
  55,387,032
  55,387,811
  55,389,782
  55,389,847
  55,390,627
  55,393,495
  55,393,542
  55,396,859
  55,399,682
  55,403,639
  55,403,641
  55,404,035
  55,404,694
  55,405,020
  55,405,100
  55,406,477
  55,406,752
  55,406,828
  55,407,215
  55,407,223
  55,407,226
  55,407,588
  55,407,698
  55,408,016
  55,408,040
  55,408,686
  55,409,967
  55,410,865
  55,411,066
  55,411,709
  55,415,640
  55,415,738
  55,416,763
  55,417,062
  55,417,411
  55,417,723
  55,418,011
  55,418,151
  55,418,475
  55,418,530
  55,418,741
  55,420,618
  55,420,861
  55,420,906
  55,420,929
  55,421,279
  55,421,324
  55,421,359
  55,422,464
  55,422,641
  55,422,830
  55,422,831
  55,423,037
  55,423,114
  55,423,649
  55,424,103
  55,424,143
  55,426,780
  55,427,482
  55,427,696
  55,430,070
  55,430,227
  55,430,396
  55,430,848
  55,432,918
  55,432,943
  55,433,778
  55,434,514
  55,455,524
  55,456,953
  55,456,955
  55,456,959
  55,456,960
  55,457,952
  55,460,461
  55,460,665
  55,462,273
  55,466,689
  55,469,256
  55,469,261
  55,469,263
  55,469,266
  55,469,270
  55,469,273
  55,469,279
  55,469,299
  55,469,308
  55,469,319
  55,469,633
  55,472,525
  55,473,897
  55,474,312
  55,476,545
  55,476,640
  55,476,802
  55,476,978
  55,476,985
  55,477,061
  55,477,557
  55,479,386
  55,479,609
  55,479,731
  55,480,614
  55,480,753
  55,481,011
  55,481,049
  55,481,572
  55,482,324
  55,484,735
  55,484,816
  55,484,817
  55,484,899
  55,488,278
  55,489,011
  55,489,012
  55,492,002
  55,492,182
  55,492,239
  55,492,673
  55,492,865
  55,493,020
  55,493,518
  55,493,838
  55,493,976
  55,494,069
  55,494,072
  55,495,331
  55,495,415
  55,495,502
  55,495,504
  55,495,986
  55,496,274
  55,496,386
  55,497,080
  55,497,426
  55,497,540
  55,497,610
  55,497,793
  55,497,909
  55,498,780
  55,500,628
  55,500,793
  55,501,018
  55,501,189
  55,501,534
  55,501,690
  55,502,341
  55,502,552
  55,502,788
  55,502,939
  55,502,940
  55,503,086
  55,503,566
  55,503,587
  55,503,913
  55,504,051
  55,504,071
  55,504,320
  55,504,438
  55,504,470
  55,504,490
  55,504,570
  55,504,928
  55,505,699
  55,505,844
  55,505,934
  55,505,985
  55,506,311
  55,506,648
  55,507,237
  55,507,246
  55,507,619
  55,507,707
  55,508,136
  55,508,558
  55,508,958
  55,509,053
  55,509,243
  55,509,421
  55,510,045
  55,510,202
  55,510,521
  55,511,392
  55,511,456
  55,511,824
  55,512,263
  55,513,109
  55,513,980
  55,514,521
  55,514,768
  55,514,794
  55,515,155
  55,516,631
  55,516,814
  55,516,915
  55,517,031
  55,517,040
  55,517,119
  55,517,204
  55,517,214
  55,517,216
  55,517,217
  55,517,229
  55,517,304
  55,517,328
  55,517,357
  55,517,653
  55,517,837
  55,518,178
  55,518,475
  55,518,482
  55,518,497
  55,519,469
  55,520,590
  55,520,688
  55,520,906
  55,521,111
  55,521,295
  55,521,643
  55,522,150
  55,522,234
  55,522,407
  55,522,866
  55,522,893
  55,523,115
  55,523,766
  55,523,903
  55,524,576
  55,524,820
  55,525,386
  55,525,429
  55,525,467
  55,525,495
  55,525,570
  55,525,592
  55,525,607
  55,525,831
  55,525,934
  55,526,080
  55,526,118
  55,526,279
  55,526,379
  55,526,425
  55,526,584
  55,526,731
  55,526,828
  55,526,829
  55,527,287
  55,527,315
  55,527,407
  55,527,423
  55,527,432
  55,527,483
  55,527,517
  55,528,237
  55,528,415
  55,528,505
  55,528,506
  55,528,672
  55,528,691
  55,528,692
  55,529,042
  55,530,823
  55,530,842
  55,530,847
  55,531,216
  55,531,222
  55,531,418
  55,531,469
  55,533,069
  55,533,203
  55,533,211
  55,533,455
  55,533,472
  55,534,080
  55,534,096
  55,534,363
  55,534,639
  55,535,469
  55,535,879
  55,535,989
  55,536,026
  55,536,097
  55,536,120
  55,536,353
  55,536,470
  55,536,616
  55,536,858
  55,537,067
  55,537,218
  55,537,257
  55,537,371
  55,537,804
  55,538,003
  55,538,318
  55,538,392
  55,538,517
  55,538,629
  55,539,379
  55,539,580
  55,539,611
  55,540,012
  55,540,054
  55,540,412
  55,540,603
  55,540,736
  55,541,071
  55,541,875
  55,542,135
  55,543,005
  55,543,358
  55,543,650
  55,552,846
  55,553,733
  55,565,468
  55,570,176
  55,576,756
  55,598,205
  55,598,227
  55,598,444
  55,598,680
  55,598,740
  55,598,828
  55,599,154
  55,599,304
  55,599,471
  55,599,811
  55,610,743
  55,610,921
  55,632,723
  55,632,764
  55,633,090
  55,633,167
  55,633,368
  55,633,979
  55,637,649
  55,638,212
  55,642,670
  55,643,059
  55,643,158
  55,643,653
  55,644,017
  55,644,776
  55,644,777
  55,645,744
  55,647,735
  55,648,551
  55,649,070
  55,649,144
  55,649,902
  55,650,053
  55,650,056
  55,650,359
  55,651,412
  55,652,113
  55,653,078
  55,653,272
  55,653,518
  55,653,919
  55,655,045
  55,655,265
  55,655,328
  55,656,318
  55,657,358
  55,657,744
  55,658,633
  55,659,341
  55,659,716
  55,660,164
  55,660,693
  55,661,216
  55,661,580
  55,661,723
  55,662,097
  55,662,116
  55,662,281
  55,662,377
  55,662,782
  55,663,268
  55,664,797
  55,665,229
  55,665,449
  55,667,217
  55,667,503
  55,667,968
  55,668,379
  55,668,502
  55,668,573
  55,668,703
  55,669,473
  55,669,910
  55,670,077
  55,670,929
G
A
G
A
C
T
C
C
C
T
-
A
A
-
A
-
A
A
A
A/AA
-
T
C
-
G
A
-
A
A
A
C
5
A
4
A
C
-
A
C
-
C
A
T
G
T
A
A
G
T
A
2
-
A
G
C
T
A
C
A
-
C
A
C
T
G
-
C
T
A
-
T
T
3
G
A
C
A
A
G
T
C
3
30
C
C
G
G
-
T
T
T
T
T
A
C
T
T
A
G
A
C
A
G
C
A
C
G
G
T
T
T
C
C
G
T
G
C
G
C
G
A
A
T
-/2
-/2
C
G
G
A
A
G
T
A
C
-
2
T
G
-
-
C
T
C
T
A
C
C
T
A
C
A
T
C
C
C
G
C
-
C
G
G
G
T
T
C
T
T
A
A
A
C
C
A
T
C
C
A
T
C
-
T
G
C
T
-
C
A
T
T
-
G
A
A
T
A
A
C
C
C
T
C
A
A
C
G
G
A
G
C/A
G/A
T/C
C/T
A/T
A/T
A/C
G/A
T
T/C
T
G
A
C
A
-
A
T
T
-
C
A
A
T
T
G
T
T
A
-
C
C
G
A
G
G
C
24/-
A
C
T
A
A
T
C
G
-
C
T
-
-
T
C
G
T
A
T
G/-
G/T
T/C
T/G
C/-
C/A
A/T
C/A
3/-
G/-
T/A
C/G
T/A
G/A
T
G/A
G/-
T/A
-/T
G
C
-
T
T
T
C
4
A
A
G
C
-
A
A
T
G
G
A
G
C
T
C
T
A
A
A
A
G
G
C
G
G
C
G
A
T
C
G/C
T
-
C
G
C
A
T
G
C
G
C
A/A
C
C
-
G
G/-
C
T
G
C
G
A
C
G
G
G
G
A
-
G
G
C
A
A
G
T
T
G
T
A
C
C
T
-
T
G
C
G
A
4
G
G
G
C
A
C
C
A
C
T
A
C
-
T
A
G
T
C
C
C
-
A
A
G
C
G
A
T
T