Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 363,599 (bp)   Positions: 388
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.031
.006
.992
.049
.002
.214
.948
.005
.012
.0
.001
.066
.004
.003
.001
.014
.003
.004
.298
.0
.014
.037
.005
.074
.005
.0
.021
.0
.41
.995
.999
1.0
1.0
.0
.001
.992
.032
.522
.013
.616
--
.038
.335
.289
--
.004
.003
.001
.016
.055
--
.0
--
--
.001
.003
.002
.001
--
.009
.0
.0
.004
.188
.218
.219
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.016
.005
.048
.064
.076
.072
.017
.005
.005
.22
.335
.903
.597
.783
1.0
1.0
.954
.258
.26
.272
.282
.204
.001
.001
.0
.471
.0
.955
.996
.001
.001
.035
.238
1.0
.996
.983
.01
.0
.002
.027
.006
.132
.386
.0
.062
.004
.028
.01
.575
.063
.06
--
--
.035
.129
.194
.009
.021
.027
.122
.125
.11
.008
.003
.002
.049
.005
.005
.108
.394
.002
.001
.022
.101
.024
.094
.001
.018
.014
.001
.003
.001
.002
.022
.003
.13
.303
.637
--
--
--
--
--
.0
.004
.002
.009
.008
.074
--
--
--
.007
.012
.077
.076
.011
.002
.086
.01
.012
.222
.339
.303
.029
.009
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.117
.154
.939
.007
.04
.034
.0
.0
.031
.111
.004
.022
.003
.0
.001
.008
.002
.001
.009
.61
.462
.317
--
.008
.0
.002
.072
.297
.006
.035
.243
.0
.007
.085
.041
.054
.001
.002
.014
.015
.004
.004
.006
--
.02
.0
.0
.008
.394
.0
.001
.008
.005
.008
.021
.029
.143
.338
.406
.105
.041
.01
.005
.002
.001
.02
.004
.003
.001
.001
.025
.002
.004
.171
.113
.012
.036
.045
.001
.002
.024
.046
.017
.009
.021
.034
.056
.061
.037
.035
.0
.01
.002
.001
.003
.199
.052
.001
.002
.006
.0
.011
.016
.003
.001
.046
.036
.006
.0
.006
.002
.0
.0
.001
.024
.027
.138
.115
.001
.001
.002
.018
.034
.037
.037
.082
.171
.165
.006
.078
.3
.346
.334
.193
.135
.144
.009
.366
.005
--
.06
.148
.176
.099
.001
.001
.052
.008
.002
.065
.071
.075
.075
.072
.059
.021
.02
.076
.028
.002
.012
.008
.12
.102
.281
.022
.016
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Tlk1
Tlk1
Tlk1
Tlk1
Tlk1
Tlk1
Tlk1
Tlk1
Tlk1
Tlk1
Tlk1
Tlk1
Tlk1
Tlk1
Tlk1
Tlk1
Tlk1
Tlk1
Tlk1
Tlk1
Tlk1
Tlk1
Tlk1
Tlk1
Tlk1
Tlk1
Tlk1
Tlk1
Tlk1
Tlk1
Tlk1
Tlk1
Tlk1
Tlk1
Tlk1
Tlk1
Tlk1
Tlk1
Tlk1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
T
T
2
C
G
T
G
C
T
G
A
C
C
C
A
C
G
T
T
9
G
-
C
G
G
T
C
A
A
T
A
C
T
-
T
G
G
T
G
C
T
T
T
T
-
4
C
C
G
T
A
T
T
A
C
T
T
A
A
-
C
G
G
T
C
T
A
C
C
T
A
T
C
C
C
-
G
A
T
T
A
T
A
A
C
C
C
A
A
2
G
C
-
A
A
T
C
2
4
8
A
2
T
-
C
A
A
G
T
G
T
T
G
-
T
3
-
G
A
A
T
C
-
A
T
G
-
C
C
A
A
G
A
G
G
39
G
G
2
2
-
-
-
-
-
T
C
G
C
G
T
C
T
G
T
A
T
C
G
C
G
G
C
T
12
T
G
-
A
G
A
G
A
G
A
C
-
-
8
A
7
G
-
G
-
G
G
A
C
-
G
2
-
C
C
2
-
G
C
A
T
T
T
G
5
-
2
2
-
G
-
G
G
T
G
-
T
C
C
C
C
T
A
-
T
8
G
G
C
C
T
C
A
A
A
G
A
C
C
T
G
-
G
T
T
C
T
C
A
A
T
2
G
A
3
A
4
-
2
T
3
G
-
G
T
G
T
A
T
G
A
-
G
A
T
-
-
G
-
A
T
A
-
4
-
-
-
C
T
-
G
C
T
-
A
-
-
A
C
-
A
T
-
G
-
-
T
4
C
A
-
T
5
2
T
-
C
-
T
C
A
T
C
C
G
-
C
G
G
2
-
A
G
C
A
-
A
-
T
A
T
-
C
T
A
T
-
A
A
A
G
-
T
A
A
-
-
T
A
108
-
C
-
G
-
-
G
G
-
-
G
T
A
C
4
A
A
T
A
A
A
A
G
A
G
-
A
-
  57,065,543
  57,066,031
  57,105,862
  57,106,179
  57,111,011
  57,114,061
  57,119,031
  57,119,649
  57,119,972
  57,120,406
  57,120,554
  57,126,924
  57,130,620
  57,135,144
  57,138,818
  57,139,264
  57,140,147
  57,140,886
  57,140,989
  57,141,512
  57,142,164
  57,142,281
  57,145,378
  57,146,016
  57,146,239
  57,146,356
  57,147,812
  57,148,614
  57,149,162
  57,151,148
  57,151,222
  57,151,475
  57,151,672
  57,152,307
  57,152,671
  57,152,923
  57,154,353
  57,154,514
  57,154,991
  57,155,289
  57,155,447
  57,158,062
  57,158,670
  57,158,972
  57,159,516
  57,159,680
  57,160,509
  57,161,664
  57,162,134
  57,162,183
  57,162,984
  57,164,188
  57,164,568
  57,164,711
  57,166,117
  57,166,642
  57,166,699
  57,167,785
  57,169,036
  57,170,833
  57,171,149
  57,172,152
  57,172,357
  57,174,163
  57,174,289
  57,174,290
  57,174,807
  57,176,327
  57,176,348
  57,176,352
  57,176,359
  57,176,364
  57,176,377
  57,176,380
  57,176,389
  57,176,837
  57,176,838
  57,176,876
  57,177,520
  57,177,536
  57,177,538
  57,179,279
  57,179,624
  57,179,649
  57,179,939
  57,180,334
  57,180,390
  57,180,727
  57,180,805
  57,181,143
  57,181,613
  57,181,869
  57,182,004
  57,182,062
  57,182,067
  57,182,209
  57,182,270
  57,182,416
  57,182,435
  57,182,459
  57,182,473
  57,182,477
  57,182,517
  57,183,693
  57,183,718
  57,184,090
  57,185,626
  57,185,795
  57,186,223
  57,186,242
  57,187,328
  57,188,213
  57,188,581
  57,189,215
  57,191,853
  57,192,136
  57,192,141
  57,192,489
  57,193,132
  57,193,177
  57,193,480
  57,193,519
  57,194,095
  57,195,118
  57,195,657
  57,196,659
  57,196,667
  57,197,663
  57,198,044
  57,198,773
  57,199,056
  57,199,193
  57,200,529
  57,201,355
  57,203,753
  57,205,107
  57,205,300
  57,205,971
  57,205,976
  57,205,980
  57,205,995
  57,205,999
  57,206,014
  57,206,050
  57,206,052
  57,206,055
  57,206,078
  57,206,102
  57,206,107
  57,206,645
  57,206,816
  57,207,424
  57,208,683
  57,208,694
  57,208,861
  57,208,909
  57,209,199
  57,210,140
  57,211,594
  57,211,595
  57,212,399
  57,212,447
  57,212,542
  57,212,643
  57,212,661
  57,213,787
  57,215,052
  57,215,320
  57,215,345
  57,215,844
  57,215,845
  57,217,511
  57,217,551
  57,217,569
  57,217,859
  57,218,842
  57,219,625
  57,220,278
  57,222,031
  57,222,665
  57,223,169
  57,223,187
  57,223,193
  57,223,211
  57,223,217
  57,223,233
  57,223,238
  57,223,245
  57,223,249
  57,223,263
  57,223,287
  57,223,300
  57,223,323
  57,223,344
  57,223,351
  57,223,379
  57,223,384
  57,223,393
  57,223,397
  57,223,410
  57,223,425
  57,223,456
  57,223,463
  57,223,474
  57,223,477
  57,223,488
  57,223,502
  57,223,511
  57,223,539
  57,223,546
  57,223,549
  57,223,562
  57,223,564
  57,223,574
  57,223,598
  57,223,615
  57,223,618
  57,223,641
  57,223,645
  57,223,646
  57,223,650
  57,224,323
  57,224,326
  57,225,602
  57,226,041
  57,226,368
  57,226,743
  57,226,901
  57,227,530
  57,227,738
  57,228,764
  57,229,846
  57,230,159
  57,231,121
  57,231,291
  57,231,600
  57,231,794
  57,232,599
  57,234,429
  57,236,312
  57,237,109
  57,237,113
  57,237,115
  57,237,714
  57,237,738
  57,240,103
  57,240,545
  57,240,699
  57,240,927
  57,241,022
  57,241,030
  57,241,260
  57,242,803
  57,243,102
  57,244,200
  57,245,167
  57,245,484
  57,246,230
  57,246,237
  57,246,244
  57,246,260
  57,246,264
  57,246,267
  57,246,272
  57,247,249
  57,247,505
  57,248,743
  57,249,697
  57,251,115
  57,251,725
  57,258,973
  57,260,452
  57,260,464
  57,260,467
  57,260,470
  57,260,472
  57,260,474
  57,260,482
  57,260,486
  57,260,488
  57,260,503
  57,260,504
  57,260,510
  57,260,513
  57,260,522
  57,260,532
  57,260,544
  57,260,554
  57,260,555
  57,260,562
  57,260,570
  57,260,587
  57,260,594
  57,260,599
  57,260,628
  57,260,637
  57,260,640
  57,260,659
  57,260,680
  57,260,707
  57,260,708
  57,260,713
  57,260,723
  57,260,729
  57,260,731
  57,260,738
  57,260,748
  57,260,752
  57,260,757
  57,260,788
  57,260,790
  57,260,807
  57,260,813
  57,260,827
  57,260,837
  57,262,699
  57,262,716
  57,262,725
  57,262,732
  57,262,742
  57,262,744
  57,262,748
  57,262,761
  57,262,773
  57,262,776
  57,262,808
  57,262,814
  57,262,821
  57,262,836
  57,262,856
  57,262,859
  57,262,873
  57,262,891
  57,262,903
  57,262,907
  57,262,913
  57,262,918
  57,262,927
  57,262,953
  57,262,970
  57,262,981
  57,262,986
  57,263,006
  57,263,017
  57,263,030
  57,263,038
  57,263,052
  57,263,066
  57,263,088
  57,263,097
  57,263,124
  57,263,132
  57,263,136
  57,263,147
  57,263,157
  57,263,164
  57,263,166
  57,263,177
  57,263,200
  57,266,256
  57,268,226
  57,268,296
  57,268,318
  57,268,344
  57,268,369
  57,268,422
  57,268,492
  57,268,557
  57,268,560
  57,268,564
  57,272,518
  57,272,521
  57,272,527
  57,272,529
  57,272,532
  57,272,538
  57,272,623
  57,272,624
  57,272,633
  57,272,664
  57,272,683
  57,272,690
  57,272,705
  57,272,737
  57,272,759
  57,272,772
  57,272,788
  57,272,797
-
C
-
T
A
A
A
C/A
C
A
C
-
A
T
G
A
A
G
C
-
A
A
A
A
A
G
T
G
T
G
G
T
C
2
C
A
A
C
A
T
C
C
A
C
48
-
T
T
A
C
G
C
C
G
A
C
C
G
C
3
T
A
A
G
A
C
G
-
A
-
-
C
A
A
A
A
A
-
G
A
T
C
C
G
T
T
T
-
G
-
A
T
G
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
T
A
C
G
C
C
A
G
-
A
A
C
-
2
A
G
T
C
T
A
G
C
A
2
T
T
-
T
-
G
A
A
-
C
T
-
-
3
C
2
A
C
-
-
-
-
A
C
T
C
A
A
G
G
G
A
A
A
A
A
C
-
C
A
4
G
T
T
C
-
A
T
T
C
14
-
G
-
-
T
T
T
-
-
-
G
T
-
-
T
-
G
-
T
-
-
C
-
-
G
-
-
T
-
-
T
T
T
-
-
-
T
4
C
T
-
T
T
C
G
T
C
-
A
T
T
-
C
T
T
G
-
A
G
T
T
A
-
A/A
T
G
A
T
G
T
T
G
C
-
A
G
-
C
-
A
-
C
-
A
G
-
-
A
C
T
C
T
G
G/T
A
-
G
A
G
T
2
-
A
C
3
-
G/G
G
T
G
C
A
-
-
-
A
-
C
C
-
-
T
T
-
A
-
2
C
-
-
G
-
2
-
-
-
-
A
-
A
-
A
G
-
A
A
-
C
-
-
-
-
3
-
A
-
-
T
G
T
-
-
-
A
-
G
-
-
A
-
-
G
-
T
-
-
-
T
A
-
-
108/-
-/2
A
T
-
C
T
-
T
2
G
-
-
C
-
-
-
T
C
-
-
C
-
-
-
C
3
-
C