Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 368,871 (bp)   Positions: 280
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.0
.0
.0
.061
.001
.025
--
.0
.014
.001
.0
.001
.001
.003
.0
.001
.0
.001
.002
.0
.0
.03
.051
.093
.002
.0
.001
.0
.0
.001
.01
.0
.002
.002
.0
.003
.088
.479
.151
.002
.001
.01
.579
--
.099
.003
.047
.167
.012
.246
.779
.005
.044
.017
.002
.013
.001
.028
.001
.001
.001
.022
.001
.0
.002
.001
.418
.0
.687
.0
.0
.002
.0
.0
.001
.473
.0
.0
.0
.053
--
--
--
.093
.013
.076
.112
.03
.065
.119
.011
.007
.006
.0
.118
.004
.038
.008
.002
.005
.0
.001
.026
.001
.0
.606
.002
.0
.001
.012
.0
.0
.0
.012
.116
.001
.018
.345
.299
.036
.02
.001
.002
.096
.013
.057
.013
.008
.003
.002
.293
.002
.011
.011
.0
.053
.005
.067
.006
.006
.0
.004
.099
.014
.015
.003
.04
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.004
.006
.274
.004
.005
.003
.002
.014
.001
.003
.011
.303
.007
.002
.049
.007
.024
.037
.001
.008
.048
.025
.115
.042
.17
.027
.31
.003
.008
.004
.001
.003
.02
.0
.002
.086
.063
.0
.001
.004
.0
.006
.025
.022
.031
.011
.002
.417
.004
.006
.001
.0
.0
.002
.001
.005
.049
.001
.001
.038
.034
.015
.007
.002
.019
.019
--
.054
.0
.044
.0
.002
.0
.005
.0
.0
.001
.001
.001
.074
.152
.082
.02
.497
.001
.002
.005
.501
.003
.001
.001
.002
.007
.001
.0
.001
.39
.003
.001
.041
.003
.001
.003
.007
.0
.95
.003
.001
.002
.003
.002
.002
.046
.005
.002
--
.334
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Tjp1
Tjp1
Tjp1
Tjp1
Tjp1
Tjp1
Tjp1
Tjp1
Tjp1
Tjp1
Tjp1
Tjp1
Tjp1
Tjp1
Tjp1
Tjp1
Tjp1
Tjp1
Tjp1
Tjp1
Tjp1
Tjp1
Tjp1
Tjp1
Tjp1
Tjp1
Tjp1
Tjp1
G
G
C
T
G
A
C
A
A
A
G
T
T
C
G
G
C
G
G
C
G
A
C
G
T
C
T
C
T
T
G
T
T
C
G
G
C
A
G
C
G
A
G
A
A
T
G
C
C
A
C
A
A
T
C
T
G
A
C
T
C
C
T
A
C
G
C
C
A
A
G
A
A
T
A
G
C
C
A
C
T
C
A
A
C
A
C
G
G
G
T
T
G
T
C
T
C
G
A
C
G
G
G
T
A
C
T
G
G
C
C
G
G
C
T
C
C
A
G
C
C
A
T
A
T
A
G
G
G
C
T
G
C
A
G
G
A
A
A
A
G
A
G
T
G
A
G
A
C
A
G
A
G
T
A
C
C
T
G
T
A
G
C
A
C
A
G
T
G
C
T
A
T
G
T
T
G
T
A
C
A
G
C
A
G
T
C
G
C
C
C
T
C
C
C
T
A
C
A
C
C
T
A
G
C
C
A
G
C
C
G
G
G
C
C
C
G
C
C
T
T
T
C
A
C
G
A
G
A
T
A
C
T
T
C
G
T
T
C
G
A
T
A
G
T
C
G
C
G
G
T
G
C
C
T
T
T
C
G
A
T
G
C
G
G
T
G
T
G
A
C
A
A
G
A
C
A
C
G
C
  126,148,726
  126,150,623
  126,155,570
  126,155,852
  126,156,066
  126,156,084
  126,156,113
  126,163,668
  126,167,055
  126,167,105
  126,167,398
  126,169,660
  126,170,364
  126,170,434
  126,170,700
  126,175,067
  126,178,569
  126,178,742
  126,180,134
  126,180,817
  126,181,000
  126,182,246
  126,182,252
  126,183,395
  126,185,871
  126,186,236
  126,186,445
  126,186,446
  126,190,338
  126,191,286
  126,191,787
  126,192,279
  126,193,201
  126,193,392
  126,193,563
  126,195,106
  126,199,914
  126,204,211
  126,204,270
  126,204,379
  126,205,724
  126,205,853
  126,206,761
  126,208,172
  126,208,838
  126,209,529
  126,210,447
  126,210,704
  126,210,718
  126,212,214
  126,212,734
  126,214,308
  126,216,222
  126,216,499
  126,219,037
  126,219,105
  126,220,013
  126,220,919
  126,225,567
  126,225,968
  126,226,812
  126,227,030
  126,229,256
  126,231,353
  126,231,548
  126,236,180
  126,237,558
  126,237,881
  126,237,951
  126,239,378
  126,239,405
  126,239,945
  126,240,601
  126,243,229
  126,243,857
  126,245,739
  126,250,482
  126,251,041
  126,251,042
  126,251,586
  126,251,824
  126,251,983
  126,251,999
  126,252,124
  126,252,173
  126,252,486
  126,252,721
  126,253,017
  126,253,043
  126,253,078
  126,253,102
  126,253,173
  126,253,366
  126,253,688
  126,254,504
  126,254,732
  126,258,056
  126,259,301
  126,262,987
  126,267,038
  126,271,440
  126,279,371
  126,285,887
  126,286,074
  126,286,342
  126,286,390
  126,286,430
  126,286,477
  126,286,528
  126,286,641
  126,286,668
  126,286,822
  126,286,873
  126,286,959
  126,287,000
  126,287,028
  126,287,035
  126,287,212
  126,287,444
  126,287,493
  126,287,503
  126,287,564
  126,287,568
  126,287,768
  126,287,864
  126,287,907
  126,288,201
  126,288,330
  126,288,342
  126,288,374
  126,288,394
  126,288,441
  126,288,472
  126,288,473
  126,288,484
  126,288,559
  126,288,629
  126,289,012
  126,289,267
  126,289,273
  126,289,442
  126,289,648
  126,289,671
  126,289,815
  126,289,818
  126,289,826
  126,289,918
  126,290,063
  126,290,175
  126,290,511
  126,290,823
  126,290,950
  126,291,194
  126,291,303
  126,291,403
  126,291,422
  126,291,423
  126,291,452
  126,291,690
  126,291,744
  126,291,746
  126,291,748
  126,291,842
  126,292,193
  126,292,474
  126,292,983
  126,308,900
  126,309,049
  126,309,050
  126,310,787
  126,310,923
  126,311,359
  126,311,383
  126,312,277
  126,312,773
  126,312,956
  126,313,249
  126,313,684
  126,313,701
  126,314,430
  126,314,640
  126,317,667
  126,318,288
  126,319,273
  126,324,019
  126,325,988
  126,327,005
  126,327,263
  126,329,074
  126,329,161
  126,329,944
  126,330,009
  126,331,072
  126,331,912
  126,332,866
  126,336,733
  126,336,748
  126,337,885
  126,340,475
  126,342,826
  126,342,901
  126,343,350
  126,346,070
  126,349,583
  126,350,212
  126,350,665
  126,350,946
  126,351,703
  126,351,924
  126,352,304
  126,354,957
  126,355,793
  126,356,075
  126,356,131
  126,356,545
  126,356,636
  126,356,830
  126,356,967
  126,357,140
  126,357,513
  126,357,563
  126,357,935
  126,358,214
  126,358,233
  126,358,271
  126,358,441
  126,358,672
  126,359,364
  126,363,819
  126,364,260
  126,365,390
  126,367,526
  126,375,376
  126,381,977
  126,387,925
  126,388,234
  126,388,298
  126,388,393
  126,388,486
  126,388,641
  126,388,881
  126,389,156
  126,389,324
  126,389,330
  126,389,430
  126,389,459
  126,390,037
  126,390,052
  126,391,299
  126,392,127
  126,392,565
  126,392,665
  126,393,580
  126,393,690
  126,393,736
  126,394,789
  126,395,115
  126,395,278
  126,395,432
  126,395,454
  126,395,573
  126,395,604
  126,395,931
  126,395,951
  126,396,326
  126,396,350
  126,397,393
  126,398,323
  126,398,702
  126,398,748
  126,399,033
  126,400,050
  126,400,051
  126,400,106
  126,400,158
  126,403,778
  126,403,796
  126,403,846
  126,451,547
  126,454,833
C
C
G
C
A
T
T
G
G
G
C
C
C
G
T
A
T
A
A
A
A
G
A
A
G
A
A
A
C
C
T
C
C
T
A
A
A
A/G
A
T
A
G
A
G
G
C
A
A
T
T
A
T
C
A
T
C
A
G
A
G
T
T
C
G
T
T
T
T
G
G
A
G
A/G
C
T
A
T
T
A/G
T
C
T
C
G
T
T
G
A
C
A
C
C
A
C
T
C
T
A
G
T
A
A
C
C
G
T
G
A
C
T
G
C
A
T
A
A
G
G
A
T
A
C
C
G
C
G
T
A
A
T
C
C
G
G
A
A
G
G
G
G
C
G
A
G
C
G
C
G
A
G
T
T
T
G
A/C
T
T
C
C
C
C
C
T
G
G
G
C
C
A
T
C
T
C
A
C
G
A
G
G
G
G
A
A
T
A
C
T
C
G
G
T
C
A
T
G
C
G
T
C
T
T
G
G
A
T
T
G
A
T
T
A
A
A
A
T
T
A
T
T
C
C
C
T
G
G
C
G
C
C
A
G
T
G
C
T
A
C
C
T
T
A/G
A
T
A
A
A
A
T
A
A
C
T
A
T
C
C
C
A
A
C
G
T
T
T
T
A
A
C
A
C
T
G
G
T
G
T
T
T
G/A
A