Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 113,846 (bp)   Positions: 260
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.024
1.0
--
--
--
--
--
--
.233
.0
.008
.966
.015
.0
1.0
.996
.001
.887
.001
.997
.01
.0
.002
.002
.001
.0
.0
.014
.001
.0
.0
.0
.0
.005
.026
--
--
--
--
--
--
--
.099
.003
.006
.001
.002
.046
.034
.003
.0
.001
.008
.0
.001
.0
.0
.001
.0
.0
.001
.011
.035
.041
.229
.016
.027
.104
.296
.505
.07
.0
.008
.089
.001
.005
.003
.097
.013
.0
.0
.003
.0
.131
--
.485
.014
.0
.405
.004
.013
--
--
.002
.002
.001
.005
.007
.02
.012
.0
.009
.112
.001
.182
.003
.034
.016
.001
.001
.023
.0
.001
.002
.0
.001
.003
.924
.188
.161
.262
.836
.001
.002
.001
.001
.003
.082
.017
.006
.999
.004
.024
.007
.004
.0
.029
.0
.031
.04
.031
.002
.003
--
.007
.537
.025
.0
.879
.944
.024
.008
.232
.985
.158
.0
.948
.913
.98
.002
.737
.002
.042
.361
.033
.0
.0
.193
--
--
.0
.005
.046
.013
--
--
--
.001
.001
.003
.004
.001
--
--
.001
.005
.002
--
--
--
.021
.008
.002
.085
.014
.483
.014
.059
.015
.101
.017
.036
.002
.225
.001
.173
--
--
.009
.143
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.101
.068
.995
.802
.001
.974
.065
.112
.28
.854
.314
.849
.524
.01
.828
.09
.002
.728
.28
.991
.598
.771
.828
.35
.0
.001
.006
.033
.019
.217
.004
Tdrd9
Tdrd9
Tdrd9
Tdrd9
Tdrd9
Tdrd9
Tdrd9
Tdrd9
Tdrd9
Tdrd9
Tdrd9
Tdrd9
Tdrd9
Tdrd9
Tdrd9
Tdrd9
Tdrd9
Tdrd9
Tdrd9
Tdrd9
Tdrd9
Tdrd9
Tdrd9
Tdrd9
Tdrd9
Tdrd9
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Atp5mg-ps4
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Rd3l
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
T
G
A
G
G
T
A
G
T
A
G
G
A
T
T
T
C
G
T
A
T
G
G
C
G
T
G
T
T
A
G
C
C
T
T
T
G
G
G
C
G
C
C
T
G
A
T
C
T
A
G
G
A
T
C
T
C
T
A
C
C
T
A
T
G
C
G
G
T
C
C
T
A
T
G
G
C
A
G
G
A
A
C
T
C
G
G
T
T
A
C
G
T
C
C
G
C
A
C
G
C
A
C
G
T
C
A
A
T
A
T
C
C
G
T
T
T
T
A
A
C
T
A
C
C
C
T
A
A
T
A
A
C
G
A
G
C
T
C
C
T
C
T
C
G
T
A
T
G
T
T
T
C
A
A
T
G
G
A
A
G
T
A
A
A
C
C
T
A
T
G
A
C
G
C
T
T
C
T
G
A
C
A
C
T
A
C
T
T
G
T
C
A
C
G
G
C
C
C
C
C
A
T
C
C
A
C
G
T
A
G
C
G
A
C
C
C
T
T
T
C
G
A
C
T
G
T
C
T
T
C
A
G
C
C
G
T
A
C
A
C
A
C
G
G
T
A
A
G
G
A
C
C
C
C
C
C
C
T
C
  136,540,087
  136,541,167
  136,541,577
  136,541,785
  136,541,833
  136,541,836
  136,541,937
  136,542,151
  136,544,610
  136,546,345
  136,546,733
  136,548,735
  136,549,157
  136,549,232
  136,549,381
  136,549,588
  136,550,028
  136,550,054
  136,550,223
  136,550,325
  136,550,571
  136,550,790
  136,550,794
  136,550,901
  136,550,994
  136,551,258
  136,551,259
  136,551,380
  136,552,346
  136,552,400
  136,552,420
  136,552,449
  136,552,760
  136,552,777
  136,552,977
  136,553,091
  136,553,251
  136,553,325
  136,553,844
  136,553,903
  136,554,458
  136,555,069
  136,556,673
  136,557,855
  136,557,978
  136,557,981
  136,559,895
  136,560,103
  136,560,498
  136,560,516
  136,561,253
  136,562,150
  136,563,412
  136,563,933
  136,564,152
  136,564,156
  136,564,481
  136,565,230
  136,565,273
  136,566,283
  136,566,562
  136,566,659
  136,566,883
  136,568,421
  136,568,446
  136,568,669
  136,568,705
  136,568,744
  136,568,765
  136,568,913
  136,568,929
  136,570,081
  136,570,853
  136,571,347
  136,571,761
  136,571,890
  136,572,079
  136,572,229
  136,572,688
  136,573,302
  136,573,335
  136,573,362
  136,573,743
  136,573,880
  136,575,665
  136,576,437
  136,577,622
  136,579,442
  136,580,954
  136,581,138
  136,582,700
  136,584,070
  136,584,411
  136,585,797
  136,585,801
  136,588,160
  136,589,240
  136,589,795
  136,591,087
  136,592,151
  136,594,293
  136,594,401
  136,594,429
  136,594,468
  136,594,852
  136,596,833
  136,597,007
  136,598,317
  136,598,426
  136,598,447
  136,598,728
  136,599,490
  136,600,662
  136,602,498
  136,603,055
  136,603,097
  136,604,729
  136,605,099
  136,605,421
  136,606,079
  136,606,086
  136,606,119
  136,606,423
  136,607,062
  136,607,465
  136,607,469
  136,608,454
  136,608,742
  136,609,078
  136,609,081
  136,609,454
  136,609,879
  136,610,632
  136,611,107
  136,611,114
  136,611,318
  136,611,430
  136,611,673
  136,612,715
  136,613,106
  136,613,208
  136,613,230
  136,613,243
  136,613,943
  136,614,381
  136,614,492
  136,615,122
  136,615,245
  136,616,457
  136,616,462
  136,616,796
  136,617,826
  136,617,832
  136,618,083
  136,618,482
  136,619,281
  136,619,821
  136,619,823
  136,620,036
  136,620,110
  136,620,189
  136,620,366
  136,620,453
  136,622,151
  136,622,783
  136,624,489
  136,624,902
  136,625,033
  136,625,192
  136,625,243
  136,625,674
  136,626,092
  136,626,169
  136,626,295
  136,626,349
  136,627,097
  136,627,204
  136,627,645
  136,628,291
  136,628,306
  136,628,315
  136,628,892
  136,629,122
  136,629,162
  136,629,988
  136,630,021
  136,630,323
  136,630,415
  136,630,438
  136,630,439
  136,630,930
  136,632,123
  136,632,255
  136,632,441
  136,632,654
  136,632,909
  136,633,083
  136,633,159
  136,634,633
  136,634,712
  136,635,068
  136,635,258
  136,636,757
  136,637,257
  136,637,384
  136,637,624
  136,637,851
  136,637,912
  136,638,024
  136,638,040
  136,638,678
  136,639,419
  136,639,568
  136,639,939
  136,640,172
  136,640,636
  136,640,875
  136,640,890
  136,640,899
  136,641,105
  136,641,113
  136,641,120
  136,641,187
  136,642,036
  136,642,039
  136,642,546
  136,642,852
  136,642,983
  136,643,126
  136,643,525
  136,644,321
  136,644,470
  136,644,543
  136,644,952
  136,645,022
  136,645,128
  136,645,136
  136,645,159
  136,645,184
  136,645,191
  136,645,256
  136,645,319
  136,645,496
  136,645,559
  136,645,576
  136,645,602
  136,645,607
  136,645,639
  136,645,666
  136,645,687
  136,646,387
  136,646,567
  136,646,587
  136,646,607
  136,646,613
  136,646,627
  136,648,853
  136,648,954
  136,649,513
  136,649,521
C
A
C
C
G/A
C
A/G
G/T
C
G
A
C
T
C
C
C
T
A
C
C
C
A
A
T
G/C
C
A
C
C
G
A
G
T
C
G
G
C
A
A
T
G/A
T
A
G
A
G
C
T
G
G
C
A
G
C
T
C
T
T/A
A/C
G
T
C
T
T/C
G/A
C/T
G/C
G/T
C
C/G
C/G
C
G
C
A
A
T
T
C
A
G
G
G
C
T
A
A
G
C
C
T
A
C
C/T
C/T
C
T
G
T
A
T
T
T
A
T/C
A
G
T
C
G
C
A
T
A
G
G
C
C
G
G
T
G
G
T
T
A
C
C
G
C
G
C
T
A
C
A
T
C
T
T
C
T
C
A
A
T/C
C
C
G/A
T/C
T/C
T/C
C/T
G
G
C
A
A
A/G
A/G
A
C
G
G
G
T
T
C
G
C
A
G
T
C
A
C
C
T
C
A
G
G
G
C/A
C
G
C/T
C
C
G/A
C
T
G
T
A
A
T
T
T
T
T
C
G
T
T
G
T
A
C
C
A
T
A
G
T
T
C/T
C
C
G
T
A
A/C
T
C
T
C
T
A
C
T
C
T
C/G
T
G/C
T/C
A/G
C/T
A/G
C/G
A/G
C/G
G/A
G/C
T/G
A/G
A/G
T
A
G
T
T
T
T
T
A
T
C
T