Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 167,606 (bp)   Positions: 430
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.0
.001
.001
.037
.002
.005
.001
.004
.017
.011
.304
.418
.002
.018
.014
.101
.013
.088
.241
.237
.195
.002
.602
.005
.001
.042
.004
.003
.001
.077
.076
.001
.003
.001
.001
.001
.007
.005
.005
.001
.003
.001
.0
.012
.011
.032
.171
.003
.065
.277
.264
.008
.005
.001
.012
.0
.0
.003
.042
.011
.08
.006
.008
.311
.003
.001
.041
.0
.005
.012
.016
.0
.0
.002
.0
.003
.003
.089
.005
.003
.005
.002
.005
.001
.172
.18
.003
.019
.001
.101
.073
.005
.006
.002
.0
.0
.002
.0
.006
.013
.313
.004
.023
.0
.004
.015
.035
.117
.264
.0
.034
.0
.263
.183
.0
.001
.032
.032
.077
.005
.073
.0
.004
.002
.0
.004
.0
.0
.0
.601
.003
.014
.003
.025
.009
.0
.007
.001
.001
.021
.023
.005
.007
.0
.0
.006
.0
.0
.001
.0
.024
.006
.014
.015
.001
.001
.006
.386
.146
.183
.001
.227
.218
.0
.0
.001
.0
.0
.0
.0
.013
.001
.003
.021
.279
.002
.826
.002
.009
.008
.014
.001
.0
.009
.0
.0
.0
.0
.352
.015
.041
.002
.0
.025
.144
.003
.005
.001
.003
.982
.0
.0
.008
.026
.0
.004
.011
.05
.0
.0
.0
.0
.002
.011
.005
.003
.037
.03
.092
.007
.113
.104
.188
.134
.003
.009
.001
.193
.192
.003
.014
.074
.0
.047
.004
.027
.0
.047
.057
.0
.0
.001
.005
.033
.011
.064
--
.085
.237
.043
.062
.0
.001
.0
.004
.001
.009
.001
--
--
--
--
--
.006
.0
.0
.005
.001
.0
.0
.247
.001
.012
.367
.009
.038
.04
--
--
--
--
.033
.097
--
--
--
--
.008
.01
.025
.002
.008
.012
.001
.001
.002
.032
.019
.113
.05
.007
.001
.001
.001
.088
.099
.001
.002
.0
.001
.002
.003
.024
.004
--
--
--
--
.005
.015
.001
.0
.001
.0
.004
.001
.0
.005
.009
.031
.043
.025
.0
.02
.146
.001
.009
.052
.003
.006
.103
.03
.068
.004
.027
.002
.002
.389
.255
.0
.002
.043
.215
.221
.131
.024
.026
.01
.121
.003
.002
.0
.007
.007
.085
.002
.01
.264
.078
.002
.002
.065
.549
.058
.022
.034
.204
.202
.004
.0
.0
.336
--
.0
.004
.0
.0
.475
.255
.028
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.001
.001
.001
.0
.021
.0
.0
.031
.0
.002
.0
.0
.002
.0
.0
.0
.186
.004
--
--
.006
.009
.023
.274
.177
.167
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.003
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
LOC102549458
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Tcf7l1
Tcf7l1
Tcf7l1
Tcf7l1
Tcf7l1
Tcf7l1
Tcf7l1
Tcf7l1
Tcf7l1
Tcf7l1
Tcf7l1
Tcf7l1
Tcf7l1
Tcf7l1
Tcf7l1
Tcf7l1
Tcf7l1
Tcf7l1
Tcf7l1
Tcf7l1
Tcf7l1
Tcf7l1
Tcf7l1
Tcf7l1
Tcf7l1
Tcf7l1
Tcf7l1
Tcf7l1
Tcf7l1
Tcf7l1
Tcf7l1
Tcf7l1
Tcf7l1
Tcf7l1
Tcf7l1
Tcf7l1
Tcf7l1
Tcf7l1
Tcf7l1
Tcf7l1
Tcf7l1
Tcf7l1
Tcf7l1
-
C
A
C
T
C
T
C
C
6
T
C
A
-
A
T
G
-
C
A
C
G
T
G
T
G
C
-
A
-
T
C
T
T
T
G
8
C
C
T
T
A
C
A
T
A
G
G
A
G
2
T
C
C
C
T
A
T
A
A
C
T
T
C
A
C
A
A
C
T
G
A
G
T
A
C
G
G
G
G
-
T
A
C
-
T
T
A
A
-
4
-
G
G
-
C
A
A
G
2
C
C
T
T
A
A
G
C
-
A
G
T
C
C
C
C
A
A
A
-
C
G
-
C
T
G
T
C
G
A
A
C
-
T
T
G
T
G
2
A
A
2
C
C
T
G
C
C
C
C
C
5
A
G
T
A
A
C
-
A
T
T
G
T
T
G
A
A
T
T
G
-
T
T
-
A
C
T
C
G
G
G
G
C
C
A
G
G
C
T
-
C
T
G
G
2
T
A
C
A
C
G
G
G
T
T
G
A
C
G
T
C
C
A
A
T
A
A
C
A
T
C
-
G
T
T
C
3
3
T
-
C
A
G
C
C
T
A
C
-
G
G
T
A
A
T
-
-
A
C
G
G
A
C
G
C
A
A
G
-
-
A
-
A
-
C
C
C
A
A
T
T
G
C
G
T
A
C
2
-
-
-
C
4
G
2
4
-
G
G
A
-
A
C
C
G
G
T
C
T
G
A
T
G
-
G
2
C
C
C
C
C
A
G
A
T
T
-
T
T
G
T
T
T
-
T
-
C
G
A
C
-
T
C
C
T
T
A
-
T
12
8
T
C
A
C
G
G
-
A
C
C
-
-
G
4
A
G
A
T
4
T
-
-
C
G
T
15
-
G
T
T
C
A
T
A
C
-
19
G
T
C
T
A
T
T
G
A
G
T
C
2
-
G
T
G
C
C
C
C
A
A
G
A
C
A
-
C
C
T
G
A
G
A
-
T
T
T
G
A
C
A
C
9
-
-
-
T
A
A
  100,500,151
  100,500,671
  100,501,073
  100,501,090
  100,501,664
  100,501,721
  100,501,771
  100,501,876
  100,502,351
  100,502,542
  100,502,942
  100,503,319
  100,503,379
  100,504,305
  100,504,306
  100,504,388
  100,504,490
  100,504,711
  100,504,930
  100,505,001
  100,505,048
  100,505,626
  100,506,126
  100,506,371
  100,506,626
  100,506,762
  100,506,768
  100,507,030
  100,507,040
  100,507,224
  100,507,226
  100,507,399
  100,507,444
  100,507,476
  100,507,620
  100,507,778
  100,507,831
  100,507,864
  100,507,868
  100,507,898
  100,507,913
  100,507,992
  100,508,050
  100,508,134
  100,508,406
  100,508,559
  100,508,815
  100,509,095
  100,509,283
  100,509,647
  100,509,905
  100,509,918
  100,509,960
  100,509,995
  100,510,059
  100,510,128
  100,510,205
  100,510,495
  100,510,521
  100,510,582
  100,510,619
  100,510,676
  100,510,696
  100,511,324
  100,511,864
  100,514,645
  100,515,175
  100,516,049
  100,516,490
  100,516,537
  100,516,545
  100,516,622
  100,517,232
  100,517,680
  100,518,132
  100,519,807
  100,520,213
  100,521,025
  100,521,418
  100,521,569
  100,521,785
  100,521,789
  100,521,797
  100,523,873
  100,523,940
  100,523,989
  100,524,184
  100,524,480
  100,524,489
  100,525,184
  100,525,187
  100,525,193
  100,525,197
  100,525,199
  100,525,203
  100,525,774
  100,525,863
  100,525,865
  100,525,890
  100,526,489
  100,527,430
  100,527,561
  100,527,584
  100,527,600
  100,528,606
  100,528,617
  100,528,667
  100,528,711
  100,528,730
  100,530,061
  100,530,523
  100,530,972
  100,531,191
  100,531,299
  100,531,752
  100,531,859
  100,532,062
  100,532,065
  100,532,163
  100,532,373
  100,532,544
  100,532,593
  100,533,978
  100,533,982
  100,534,011
  100,534,059
  100,534,117
  100,534,619
  100,534,768
  100,535,019
  100,535,060
  100,535,188
  100,535,447
  100,536,061
  100,536,122
  100,536,459
  100,536,582
  100,536,641
  100,536,842
  100,536,851
  100,536,853
  100,536,857
  100,537,036
  100,537,466
  100,537,500
  100,537,511
  100,537,583
  100,537,645
  100,537,894
  100,538,262
  100,538,382
  100,538,624
  100,538,659
  100,538,829
  100,539,029
  100,539,071
  100,539,083
  100,539,114
  100,540,481
  100,540,496
  100,542,466
  100,542,514
  100,542,516
  100,542,788
  100,542,807
  100,543,029
  100,543,414
  100,543,478
  100,544,268
  100,544,271
  100,544,333
  100,544,446
  100,544,703
  100,549,806
  100,550,480
  100,551,394
  100,553,160
  100,553,721
  100,553,923
  100,554,310
  100,554,510
  100,554,595
  100,555,090
  100,555,102
  100,555,183
  100,556,036
  100,557,577
  100,557,825
  100,558,429
  100,558,663
  100,559,001
  100,559,607
  100,559,804
  100,559,929
  100,559,996
  100,560,575
  100,560,577
  100,561,256
  100,561,309
  100,562,114
  100,562,260
  100,562,396
  100,562,449
  100,562,620
  100,562,678
  100,562,690
  100,562,997
  100,563,402
  100,563,506
  100,563,663
  100,563,777
  100,563,866
  100,564,693
  100,564,773
  100,565,240
  100,565,253
  100,565,668
  100,565,740
  100,565,913
  100,566,342
  100,566,503
  100,566,657
  100,566,739
  100,566,778
  100,566,810
  100,566,988
  100,567,071
  100,567,576
  100,567,581
  100,567,636
  100,567,648
  100,567,729
  100,568,160
  100,568,645
  100,570,159
  100,570,200
  100,570,302
  100,570,785
  100,573,218
  100,573,974
  100,574,193
  100,574,443
  100,576,604
  100,579,854
  100,580,844
  100,582,408
  100,582,563
  100,584,271
  100,584,282
  100,584,304
  100,584,341
  100,584,490
  100,584,694
  100,584,724
  100,584,793
  100,584,966
  100,585,340
  100,585,665
  100,587,374
  100,587,411
  100,587,567
  100,587,572
  100,587,575
  100,587,841
  100,588,765
  100,588,929
  100,590,799
  100,591,657
  100,591,842
  100,592,823
  100,592,843
  100,593,945
  100,594,196
  100,594,382
  100,594,446
  100,595,057
  100,595,445
  100,595,617
  100,595,620
  100,595,626
  100,595,640
  100,596,342
  100,596,564
  100,597,094
  100,597,121
  100,597,139
  100,597,145
  100,597,440
  100,597,442
  100,597,446
  100,598,199
  100,598,221
  100,598,516
  100,599,117
  100,599,802
  100,600,001
  100,600,105
  100,600,375
  100,600,617
  100,601,072
  100,601,275
  100,602,890
  100,602,928
  100,602,939
  100,603,418
  100,603,649
  100,603,836
  100,603,841
  100,603,845
  100,603,849
  100,603,853
  100,603,857
  100,604,121
  100,604,177
  100,604,709
  100,604,815
  100,604,816
  100,605,334
  100,606,263
  100,606,533
  100,606,847
  100,607,045
  100,607,159
  100,607,335
  100,607,511
  100,608,822
  100,608,868
  100,610,147
  100,611,290
  100,611,691
  100,612,803
  100,613,793
  100,613,817
  100,614,204
  100,614,224
  100,614,347
  100,614,663
  100,615,090
  100,615,293
  100,615,972
  100,616,129
  100,616,163
  100,616,277
  100,616,809
  100,616,827
  100,616,942
  100,616,950
  100,617,352
  100,617,388
  100,617,598
  100,617,770
  100,617,991
  100,618,076
  100,618,078
  100,618,713
  100,618,967
  100,618,972
  100,619,138
  100,619,394
  100,619,758
  100,619,943
  100,619,980
  100,620,289
  100,620,290
  100,620,293
  100,620,414
  100,620,642
  100,620,791
  100,621,158
  100,621,732
  100,622,990
  100,622,993
  100,622,997
  100,623,002
  100,624,481
  100,624,604
  100,625,590
  100,625,596
  100,627,524
  100,627,590
  100,627,732
  100,630,859
  100,630,918
  100,632,396
  100,634,611
  100,634,864
  100,635,159
  100,635,357
  100,636,155
  100,637,198
  100,637,299
  100,637,437
  100,637,592
  100,638,018
  100,638,637
  100,638,763
  100,638,813
  100,639,172
  100,639,394
  100,639,398
  100,639,541
  100,639,551
  100,639,610
  100,639,645
  100,639,701
  100,640,040
  100,640,775
  100,641,886
  100,643,822
  100,644,430
  100,644,725
  100,644,726
  100,645,866
  100,646,165
  100,646,235
  100,646,260
  100,646,541
  100,647,118
  100,648,015
  100,649,499
  100,649,509
  100,654,649
  100,656,005
  100,656,007
  100,656,020
  100,656,037
  100,656,039
  100,657,872
  100,658,529
  100,660,350
2
T
-
A
C
-
C
T
T
-
C
T
G
4
C
C
A
G
T
-
T
A
C
T
C
T
T
21
C
A
C
A
G
C
C
T
-
-
C/-
C
C
G
T
T
G
C
T
A
-
A
-
C
T
T
T
C
G
C
G
G
T
C
C
T
C
T
G
T
T
C
C
G
-
C
G
T
A
C
-
A
C
C
G
A
-/A
C
C
G
G
A
-
G
T
T
G
T
G
G
A
-
T
T
-
C
C
G
A
A
3
G
A
C
T
T
T
A
T
G
C
A
G
A
C
A
C
C
C
T
C
G
T
T
7
A
C
C
C
A
-
A/G
A/G
2/-
T
T
G
A
-
A
A
T
T
-
G
A
C
G
G
A
3
C
G
G
T
C
C
A
G
C
-
C
-
2
A
C
14
C
T
A
A
A
A
T
-
C/G
-
C
A
A
G
C
3
T
G
T
-
-
C
G
T
G
T
A
T
A
C
C
A
G
G
A
C
T
T
G
G
C
G
G
T
G
A
T
2
G/T
G
C
T
-
-
-
3
T
G
A
T
T
A
G
T
2
A
T
G
T
G
C
A
T
T
-
-
A
G
T
A
T
G
C
C
G
C
-
C
G
4
T
T
T
-
G
C
C
A
T
A
-
-
-
-
T
G
A
T
4/-
G/A
2/-
4/-
8/A
A/6
A
G
3
T
G
T
A
A
A
T
G
C
G
-
A
8
A
2/-
G
G
G
G
C/G
T
A
-
A
A
-/T
C
C
T
C
C
C
G
A
10
T
T
G
T
8
C
T
T
G
C
T
C
C
-
-
C
G
T
G
A
C
5
G
T
T
2
6
C
-
G
A
G
C
-
C
2
3
-
A
-
-
C
A
T/C
T/C
C/A
A/G
C
G
T
T
-
A
C
T
C
G
A
C
A
G
A
A
T
-
4
A
C
A
T
T
T
A
G
C
C
C
G
T
2
T
T
C
T
G
-
C
4
C
C
C
C
T
A
G
G
-
-/9
-/18
-/15
C
G
G