Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 156,801 (bp)   Positions: 458
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.001
.0
.342
.088
.318
.001
.0
.008
.0
.604
.018
.004
.015
.134
.005
.039
.065
.064
.038
.009
.006
.006
.006
.005
.001
--
.351
.039
.007
--
--
--
--
.014
.054
.302
.245
.332
.029
1.0
.001
.0
.061
.0
.0
.002
.003
.003
.48
.005
.367
.008
.499
.0
.001
.017
.017
.048
.075
.086
--
--
.009
.012
.386
.976
.01
.011
.318
.002
.001
.013
.006
.018
.001
.0
.0
.04
.0
.019
.0
.001
.0
.001
--
--
--
--
.008
.024
.003
.002
.002
.003
.001
.043
.095
.018
.003
.0
.068
.0
.0
.095
.001
.003
.0
.055
.041
.006
.002
.003
.0
.001
.0
.021
.02
.002
.046
.032
.006
.029
.052
.085
.013
.048
.022
.014
.023
.01
.002
.004
.001
.066
.002
.0
.0
.001
.0
.003
.109
.206
.002
.0
.0
.007
.002
.005
.006
.01
.001
.001
.001
.003
.003
.001
.033
.024
.008
.032
.018
.01
.007
.017
.007
.006
.005
.004
.037
.039
.089
.109
.071
.028
.044
.089
.031
.023
.196
.05
.004
.062
.014
.034
.013
.02
.013
.011
.005
.003
.003
.003
.022
.033
.017
.017
.01
.02
.052
.054
.024
.008
.004
.005
.007
.037
.013
.001
.006
.004
.002
.0
.007
.012
.01
.035
.025
.01
.037
.04
.027
.018
.001
.001
.002
.022
.002
.001
.0
.011
.055
.06
.013
.011
.015
.001
.001
.005
.003
.004
.007
.036
.047
.063
.118
.161
.247
.422
.364
.23
.206
.02
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.012
.023
.001
.002
.037
.03
.084
.001
.449
.157
.355
.058
.057
.052
.0
.0
.003
.0
.0
.067
.046
.002
.052
.643
.003
.003
.002
.022
.131
.0
.0
.0
.032
.001
.002
.049
.591
.066
.932
.192
.075
.043
.533
.111
.125
.0
.001
.002
.001
.002
.267
.084
.027
.018
.0
--
--
.015
.045
.199
.189
.001
.002
.001
.0
.001
.001
.001
.0
.001
.153
.23
.099
.393
.235
.04
.065
.257
.156
.042
.002
.002
.0
.019
.016
.023
.132
.002
.064
.003
.0
.0
--
.003
.0
.0
.012
.0
.001
.001
.022
.016
.027
.008
.264
.355
.065
.041
.105
.054
.049
.05
.639
.0
.06
.038
.001
.141
.221
.129
.132
.138
.127
.021
.067
.003
.089
.363
.006
.004
.003
.021
.003
.006
.0
.001
.0
.005
.001
.0
.0
.873
.011
.728
.104
.038
.001
.005
.009
.089
.552
.007
Tbcd
Tbcd
Tbcd
Tbcd
Tbcd
Tbcd
Tbcd
Tbcd
Tbcd
Tbcd
Tbcd
Tbcd
Tbcd
Tbcd
Tbcd
Tbcd
Tbcd
Tbcd
Tbcd
Tbcd
Tbcd
Tbcd
Tbcd
Tbcd
Tbcd
Tbcd
Tbcd
Tbcd
Tbcd
Tbcd
Tbcd
Tbcd
Tbcd
Tbcd
Tbcd
Tbcd
Tbcd
Tbcd
Tbcd
Tbcd
Tbcd
Tbcd
Tbcd
Tbcd
Tbcd
Tbcd
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Znf750
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
T
C
T
T
T
C
C
C
A
-
A
A
T
22
9
10
3
9
-
A
G
A
C
C
A
A
C
G
A
A
A
A
T
A
C
C
G
T
A
C
A
A
C
C
G
A
A
-
A
C
C
A
T
T
-
C
G
4
A
G
A
T
2
A
2
-
-
A
A
A
A
7
-
C
2
T
G
T
A
G
T
A
G
G
-
T
4
2
A
G
T
T
C
T
T
G
T
T
G
C
-
G
T
C
G
T
A
G
T
G
7
-
T
2
C
G
C
A
-
2
-
C
C
2
A
C
C
2
T
C
C
G
T
T
T
-
T
C
G
C
T
T
C
-
T
G
T
C
T
-
-
T
C
2
-
3
T
G
T
T
T
T
G
C
A
2
T
G
A
T
C
G
2
-
-
2
C
G
C
-
A
-
3
C
C
G
C
A
-
2
A
G
-
-
2
T
C
G
-
G
G
A
G
A
C
-
G
C
C
4
A
3
A
A
A
A
A
C
C
G
T
2
C
4
C
-
C
-
A
C
2
G
A
3
G
C
C
2
-
-
2
-
C
-
A
G
A
-
A
A
C
-
-
C
C
-
A
C
-
-
C
C
A
C
-
A
G
-
-
A
2
T
C
-
A
T
C
C
-
A
-
2
C
G
2
2
C
A
A
3
T
-
-
-
T
C
A
A
-
A
-
-
T
A
52
3
-
A
T
C
C
A
C
G
T
G
T
A
C
G
T
C
C
A
T
-
-
-
-
-
T
-
A
T
-
T
A
C
4
G
T
G
A
G
C
8
G
G
-
G
-
A
T
A
G
C
T
-
-
T
C
-
C
T
A
G
A
G
C
T
C
C
C
C
C
-
A
A
C
C
A
A
A
G
A
-
C
G
G
T
G
C
A
-
A
G
T
T
-
G
G
C
C
G
-
G
G
C
A
C
A
6
T
-
-
C
A
A
G
G
G
A
C
A
C
T
C
C
T
56
G
A
2
-
T
C
A
C
A
T
G
-
G
G
4
C
G
-
A
T
C
C
C
T
C
G
-
A
  110,644,271
  110,645,096
  110,646,867
  110,648,573
  110,650,417
  110,650,913
  110,653,035
  110,653,089
  110,654,064
  110,654,159
  110,654,352
  110,654,618
  110,654,842
  110,655,289
  110,655,358
  110,655,369
  110,655,381
  110,655,385
  110,655,397
  110,655,403
  110,655,404
  110,655,731
  110,655,953
  110,657,012
  110,657,267
  110,657,454
  110,658,304
  110,658,768
  110,658,783
  110,658,935
  110,660,054
  110,661,506
  110,662,127
  110,662,627
  110,662,873
  110,663,912
  110,664,101
  110,664,163
  110,664,420
  110,665,549
  110,665,739
  110,665,768
  110,666,878
  110,669,090
  110,669,191
  110,669,660
  110,670,590
  110,671,356
  110,673,071
  110,673,349
  110,673,769
  110,673,986
  110,674,268
  110,675,099
  110,675,522
  110,675,768
  110,675,813
  110,677,168
  110,677,823
  110,678,358
  110,678,964
  110,678,981
  110,679,379
  110,680,201
  110,680,434
  110,680,988
  110,683,021
  110,685,116
  110,685,694
  110,685,752
  110,685,950
  110,686,800
  110,686,814
  110,687,076
  110,687,427
  110,687,933
  110,688,641
  110,689,330
  110,689,425
  110,690,113
  110,690,784
  110,691,086
  110,691,137
  110,691,688
  110,692,326
  110,692,343
  110,692,483
  110,692,488
  110,692,844
  110,692,977
  110,693,976
  110,694,189
  110,694,416
  110,695,404
  110,696,442
  110,696,779
  110,696,859
  110,697,183
  110,697,711
  110,698,397
  110,698,616
  110,699,093
  110,702,561
  110,703,140
  110,703,830
  110,704,760
  110,704,889
  110,709,183
  110,710,467
  110,710,473
  110,710,477
  110,710,493
  110,710,500
  110,710,504
  110,710,511
  110,710,524
  110,710,528
  110,710,535
  110,710,543
  110,710,554
  110,710,561
  110,710,572
  110,710,582
  110,710,592
  110,710,597
  110,710,612
  110,710,617
  110,710,622
  110,710,627
  110,710,632
  110,710,651
  110,710,656
  110,710,663
  110,710,668
  110,710,692
  110,710,696
  110,710,698
  110,710,710
  110,710,714
  110,710,718
  110,710,734
  110,710,745
  110,710,771
  110,710,786
  110,710,788
  110,710,791
  110,710,797
  110,710,801
  110,710,814
  110,710,818
  110,710,835
  110,710,843
  110,710,863
  110,710,866
  110,710,871
  110,710,873
  110,710,896
  110,710,899
  110,710,905
  110,710,919
  110,710,928
  110,710,930
  110,710,936
  110,710,939
  110,710,959
  110,710,977
  110,710,980
  110,710,982
  110,710,992
  110,710,993
  110,710,999
  110,711,004
  110,711,015
  110,711,047
  110,711,055
  110,711,075
  110,711,085
  110,711,086
  110,712,984
  110,712,994
  110,712,998
  110,713,083
  110,713,088
  110,713,107
  110,713,123
  110,713,180
  110,713,181
  110,713,182
  110,713,189
  110,713,194
  110,713,200
  110,713,215
  110,713,221
  110,713,258
  110,713,260
  110,713,269
  110,713,272
  110,713,300
  110,713,315
  110,713,322
  110,713,325
  110,713,359
  110,713,368
  110,713,370
  110,713,376
  110,713,380
  110,713,391
  110,713,394
  110,713,404
  110,713,409
  110,713,418
  110,713,422
  110,713,430
  110,713,440
  110,713,442
  110,713,456
  110,713,463
  110,713,476
  110,713,481
  110,713,483
  110,713,502
  110,713,511
  110,713,521
  110,713,524
  110,713,528
  110,713,530
  110,713,617
  110,713,621
  110,713,622
  110,713,632
  110,713,645
  110,713,648
  110,713,657
  110,713,659
  110,713,666
  110,713,671
  110,713,673
  110,713,681
  110,713,688
  110,713,689
  110,713,698
  110,713,702
  110,713,727
  110,713,736
  110,713,739
  110,713,742
  110,713,745
  110,713,771
  110,713,774
  110,713,781
  110,713,782
  110,713,796
  110,714,135
  110,714,198
  110,714,204
  110,714,218
  110,714,227
  110,714,251
  110,714,256
  110,714,258
  110,714,271
  110,714,280
  110,714,296
  110,714,310
  110,714,316
  110,714,320
  110,714,322
  110,714,337
  110,714,342
  110,714,380
  110,714,387
  110,714,399
  110,714,407
  110,714,413
  110,714,415
  110,714,416
  110,714,426
  110,714,438
  110,714,442
  110,714,470
  110,714,479
  110,714,485
  110,714,491
  110,714,494
  110,714,497
  110,714,502
  110,714,504
  110,714,517
  110,714,530
  110,714,533
  110,714,550
  110,714,555
  110,714,564
  110,714,575
  110,714,583
  110,714,584
  110,714,720
  110,714,742
  110,714,745
  110,714,747
  110,714,783
  110,714,810
  110,714,811
  110,714,821
  110,714,897
  110,714,952
  110,715,788
  110,715,914
  110,716,266
  110,716,319
  110,716,366
  110,716,476
  110,717,515
  110,717,570
  110,717,693
  110,719,613
  110,719,658
  110,720,263
  110,720,901
  110,721,318
  110,722,423
  110,722,756
  110,722,963
  110,723,236
  110,723,243
  110,725,483
  110,725,484
  110,725,508
  110,725,768
  110,726,951
  110,727,139
  110,727,226
  110,728,239
  110,728,585
  110,729,491
  110,731,447
  110,731,814
  110,732,268
  110,732,287
  110,732,573
  110,732,829
  110,733,155
  110,735,681
  110,736,035
  110,736,734
  110,737,473
  110,738,581
  110,738,585
  110,739,332
  110,740,471
  110,740,830
  110,742,064
  110,743,695
  110,744,911
  110,745,018
  110,745,160
  110,745,281
  110,745,300
  110,745,326
  110,745,338
  110,745,382
  110,745,412
  110,745,425
  110,745,448
  110,745,609
  110,745,628
  110,745,631
  110,745,763
  110,745,767
  110,746,855
  110,747,030
  110,748,501
  110,748,502
  110,748,503
  110,748,505
  110,751,087
  110,751,310
  110,753,116
  110,753,156
  110,753,440
  110,753,558
  110,754,226
  110,754,237
  110,755,252
  110,755,810
  110,755,878
  110,756,331
  110,756,338
  110,756,390
  110,756,490
  110,756,588
  110,756,593
  110,757,155
  110,757,913
  110,762,120
  110,763,734
  110,765,360
  110,765,844
  110,767,807
  110,768,168
  110,768,370
  110,768,425
  110,768,443
  110,768,472
  110,768,570
  110,768,839
  110,768,848
  110,770,086
  110,770,096
  110,770,164
  110,771,865
  110,771,867
  110,772,166
  110,772,194
  110,773,241
  110,773,826
  110,773,889
  110,777,208
  110,777,434
  110,782,294
  110,782,578
  110,782,896
  110,784,033
  110,785,677
  110,785,693
  110,786,085
  110,786,086
  110,786,088
  110,786,118
  110,786,134
  110,786,346
  110,786,540
  110,786,757
  110,787,446
  110,787,556
  110,788,143
  110,788,197
  110,788,522
  110,789,220
  110,789,796
  110,789,970
  110,789,972
  110,789,974
  110,789,976
  110,790,921
  110,791,014
  110,791,037
  110,791,249
  110,791,484
  110,792,361
  110,793,124
  110,793,507
  110,794,089
  110,794,533
  110,795,112
  110,796,275
  110,797,597
  110,799,055
T/C
C/T
T/-
T/-
T/C
C/T
C/T
C/T
A/C
-/32
A/C
A/G
T/C
22/-
9/-
10/-
3/-
9/-
-/A
A/G
G/A
A/G
C/G
C/T
A/G
A/T
C/T
G/A
A/G
A/G
A/G
A/G
T/C
A/G
C/T
C/T
G/A
T/C
A/G
C/T
A/G
A/G
C/T
C/T
G/T
A/G
A/G
-/G
A/-
C/T
C/T
A/G
T/-
T/G
-/A
C/T
G/A
4/-
A/-
G/A
A/G
T/A
2/-
A/-
2/-
C
-/T
A/-
A/-
A/G
A/G
7/-
-/2
C/T
2/-
T/G
G/C
T/C
A/G
G/A
T/G
A/G
G/A
G/A
-/G
T/C
4/-
2/-
A/G
G/A
T/C
T/C
C/T
T/A
T/-
G/A
T/C
T/C
G/A
C/G
-/A
G/A
T/A
C/T
G/T
T/C
A/G
G/A
-
-
-
C
-
-
A
-
-
-
C
-
C
-
-
-
C
-
-
-
-
G
A
-
-
-
-
C
-
-
-
-
-
-
-
T
-
-
-
-
G
G
T
-
-
-
A
-
-
-
-
-
G
C
-
-
-
-
G
T
G
A
-
T
-
C
A
-
A
C
T
3
-
C
-
-
-
T
T
C
T
-
-
C
T
T
-
G
T
-
C
-
-
-
-
-
-
A
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
G
-
-
-
-
T
-
G
4
-
A
C
A
-
T
-
-
-
-
-
-
T
G
-
T
-
T
-
-
-
C
-
C
T
A
2
-
-
T
C
-
T
G
-
-
-
-
G
G
A
2
G
T
-
-
-
C
G
A
-
-
T
-
G
-
-
-
-
-
G
C
-
-
-
G
G
T
A
T
-
-
G
T
G
A
T/C
-
52/-
3/-
-/A
A/C
T/C
C/T
C/T
A/G
C/G
G/A
T/A
G/A
T/C
A/G
C/T
G/A
T/C
C/A
C/-
A/C
T/C
-/5
-/C
-/2
-/T
-/2
T/C
-/G
A/T
T/A
-/10
T/C
A/G
C/-
4/-
G/A
T/C
G/T
A/G
G/A
C/T
8/-
A
C
-/8
G/A
-/A
A/G
T/C
A/G
-
A
-
T
C
T/G
C/T
T
C/A
T/C
-
-
-
A
A
T/A
C/T
G
A
T
-
G
A/C
A/G
C/A
C/G
A/G
A/-
A/C
G/A
A/-
-/17
C/T
G/A
G/T
T/A
G/A
C/T
A/C
T
A/C
G/A
T/C
T/C
-/6
G/A
G/C
C/A
C/T
G/A
-/A
G/T
G/A
C/-
A/G
C/G
A/T
6/-
T/C
-/T
-/26
C/T
A/G
A/G
G/C
G/A
G/A
A/G
C/A
A/G
C/G
T/C
C/A
C/T
T/C
56/-
G/A
A/G
2/-
-/G
T/A
C/T
A/G
C/G
A/G
T/C
G/C
-/2
G/C
G/C
4/-
C/T
G/A
-/A
A/G
T/C
C/G
C/T
C/T
T/G
C/T
G/A
-/T
A/G