Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 228,826 (bp)   Positions: 474
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.001
.004
.0
.0
1.0
.062
.0
.0
.0
.001
.002
.208
.0
.01
.001
.009
.009
.066
.001
.02
.001
.001
.0
.001
.024
.003
.085
.264
.986
.715
.002
.0
.004
.0
.005
.0
.0
.002
.342
.049
.005
.0
.003
.002
.007
.092
.328
.001
.008
.035
.024
.0
.009
.0
.026
.043
.006
.065
.001
.01
.002
.001
.0
.004
.018
.0
.0
.0
.011
.072
.001
.0
.0
.403
.01
.002
.008
.007
.01
.005
.19
.736
.006
.0
.0
.0
.001
.0
.001
.104
.01
.021
.008
.045
.066
.053
.244
.001
.038
.006
.08
.0
.002
.01
.007
.009
.0
.001
.001
.004
.107
.0
.012
.0
.002
.596
.005
.003
.0
.001
.002
.0
.0
.001
.0
.006
.0
.028
.161
.147
.009
.038
.838
.175
.948
.84
.006
.0
.001
.0
.0
.002
.003
.001
.185
.034
.131
.134
.015
.003
.001
.002
.001
.003
.11
.001
.003
.001
.007
.048
.065
.0
.004
.044
.003
.003
.237
.001
.503
.0
.003
.002
.0
.011
.0
1.0
.001
.027
.001
.002
.002
.001
.057
.254
.009
.002
.006
.001
.001
.001
.001
.034
.001
.0
.0
.073
--
.234
.261
.0
.001
.053
.057
.0
.007
.063
.006
.01
.0
.001
.0
.0
.001
.0
.001
.002
.023
.003
.002
.138
.001
.001
.041
.006
.0
.004
.001
.002
.23
.015
.004
.022
.016
.003
.043
.208
.0
.001
.002
.0
.0
.0
.014
.002
.001
.001
.004
.001
.001
.0
.308
.0
.477
.004
.022
.03
.003
.03
.009
.131
.855
.014
.001
.0
.0
.014
.844
.001
.046
.006
.001
.001
.001
.001
.0
.131
.001
.001
.008
.002
.0
.072
.002
.002
.003
.007
.003
.0
.001
.01
.0
.002
.042
.001
.001
.009
.005
.024
.013
.0
.002
.0
.003
.0
.03
.0
.0
.002
.005
.001
.0
.001
.004
.274
.002
.002
.0
.025
.128
.109
.0
.001
.01
.0
.0
.0
.001
.001
.0
.002
.0
.003
.564
.01
.022
.002
.015
.009
.021
.008
.036
.001
.001
.001
.001
.011
.001
.002
.0
.003
.001
.008
.0
.0
.0
.001
.967
.0
.017
.195
.015
.226
.212
.029
.007
.001
.0
.004
.007
.0
.372
.205
.001
.008
.001
.029
.0
.844
.001
.0
.0
.004
.0
.047
.0
.008
.006
.0
.001
.0
.0
.006
.013
.006
.027
.001
.151
.115
.041
.002
.0
.114
.013
.008
.0
.0
.004
.003
.014
.005
.001
.0
.0
.003
.005
.0
.013
.013
.011
.0
.001
.0
.027
.004
.002
.594
.002
.004
.011
.523
.061
.0
.01
.017
.131
.002
.006
.01
.003
.054
.051
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.018
.094
.085
.026
.887
.755
.746
.127
.001
.004
.001
.001
.005
.002
.158
.0
.003
.001
.002
.018
.002
.0
.003
Tafa5
Tafa5
Tafa5
Tafa5
Tafa5
Tafa5
Tafa5
Tafa5
Tafa5
Tafa5
Tafa5
Tafa5
Tafa5
Tafa5
Tafa5
Tafa5
Tafa5
Tafa5
Tafa5
Tafa5
Tafa5
Tafa5
Tafa5
Tafa5
Tafa5
Tafa5
Tafa5
Tafa5
Tafa5
Tafa5
Tafa5
Tafa5
Tafa5
Tafa5
Tafa5
Tafa5
Tafa5
Tafa5
Tafa5
Tafa5
Tafa5
Tafa5
Tafa5
Tafa5
Tafa5
Tafa5
Tafa5
Tafa5
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
A
C
A
T
C
C
A
T
A
G
G
A
A
G
T
A
G
T
A
T
T
T
C
C
T
G
A
T
A
G
T
A
G
A
C
G
A
T
A
T
G
T
A
C
G
G
A
G
A
C
A
A
T
C
C
C
T
A
T
A
T
A
C
A
C
T
G
A
G
T
T
G
T
G
T
C
G
A
C
C
T
T
A
T
T
A
C
A
T
C
A
G
G
T
G
T
A
G
C
A
G
T
C
G
C
A
T
G
G
C
G
C
C
C
A
C
T
G
T
C
C
T
G
T
T
C
A
T
T
G
A
T
A
C
T
T
G
C
T
T
T
G
T
T
C
T
G
A
A
A
T
T
T
T
G
G
T
G
G
C
A
A
C
A
C
T
G
G
C
G
G
G
C
A
A
C
C
T
G
C
G
T
A
G
C
T
T
A
T
G
A
C
G
G
G
C
A
A
T
C
T
T
G
C
A
T
A
A
T
G
C
C
C
C
G
C
C
C
A
G
C
A
C
G
C
G
A
G
A
A
G
C
T
C
T
T
A
T
G
T
T
A
T
T
G
G
G
G
C
C
G
C
C
T
A
C
T
A
A
C
G
T
T
G
A
T
G
C
G
G
A
G
G
A
G
A
A
G
G
C
A
T
A
C
G
C
G
G
A
C
T
G
C
C
T
G
T
G
G
G
G
C
G
G
C
G
C
G
C
C
A
C
G
G
G
C
T
T
C
T
A
G
A
G
G
T
T
A
C
C
A
A
T
C
C
T
T
G
G
C
C
A
C
G
G
G
A
T
C
C
G
A
T
G
A
G
C
G
G
C
T
A
A
G
T
G
T
C
C
A
C
T
T
C
C
T
A
C
T
A
T
G
T
G
A
A
C
A
G
A
C
C
A
T
T
C
T
T
C
T
T
C
G
A
C
A
T
T
G
A
G
T
T
A
T
T
A
G
C
G
G
C
T
G
A
A
C
A
C
A
C
A
A
G
C
T
C
A
T
G
A
A
G
A
G
C
G
T
A
G
G
A
A
C
A
C
G
G
T
G
T
G
G
G
G
C
T
C
A
A
C
G
T
G
  128,501,688
  128,503,650
  128,503,769
  128,504,015
  128,504,256
  128,509,176
  128,510,083
  128,510,087
  128,510,126
  128,510,133
  128,510,418
  128,512,077
  128,512,745
  128,512,823
  128,513,329
  128,513,567
  128,513,568
  128,513,871
  128,514,914
  128,516,634
  128,516,830
  128,517,342
  128,519,220
  128,519,339
  128,519,664
  128,519,934
  128,520,799
  128,520,823
  128,521,311
  128,522,259
  128,522,640
  128,523,159
  128,523,318
  128,524,145
  128,524,567
  128,525,313
  128,525,460
  128,525,839
  128,526,273
  128,530,645
  128,531,926
  128,532,220
  128,532,387
  128,533,163
  128,533,856
  128,534,079
  128,534,388
  128,534,654
  128,534,957
  128,535,678
  128,535,712
  128,537,280
  128,538,765
  128,539,008
  128,539,375
  128,539,647
  128,539,690
  128,539,808
  128,541,306
  128,542,324
  128,544,045
  128,544,226
  128,544,662
  128,544,828
  128,545,382
  128,545,570
  128,547,351
  128,547,727
  128,548,363
  128,548,523
  128,548,896
  128,549,050
  128,549,365
  128,550,694
  128,550,827
  128,551,071
  128,551,363
  128,551,949
  128,552,314
  128,552,589
  128,552,762
  128,552,873
  128,553,025
  128,553,220
  128,553,223
  128,553,292
  128,553,371
  128,553,487
  128,553,548
  128,553,667
  128,553,697
  128,553,708
  128,553,714
  128,553,777
  128,554,113
  128,554,121
  128,554,462
  128,554,869
  128,555,063
  128,555,186
  128,555,238
  128,555,559
  128,555,570
  128,555,603
  128,555,642
  128,555,648
  128,555,789
  128,555,872
  128,555,928
  128,556,101
  128,556,127
  128,556,269
  128,556,289
  128,556,332
  128,556,586
  128,556,984
  128,557,392
  128,557,400
  128,557,410
  128,557,415
  128,557,436
  128,557,642
  128,557,664
  128,564,367
  128,564,392
  128,564,413
  128,564,773
  128,564,941
  128,565,902
  128,565,912
  128,566,099
  128,566,189
  128,567,968
  128,567,999
  128,568,389
  128,568,398
  128,569,295
  128,569,586
  128,570,524
  128,570,673
  128,570,806
  128,570,996
  128,571,245
  128,571,423
  128,571,764
  128,571,830
  128,572,097
  128,572,099
  128,572,166
  128,575,348
  128,575,386
  128,575,406
  128,575,419
  128,575,432
  128,575,523
  128,575,667
  128,575,769
  128,575,973
  128,576,114
  128,576,165
  128,576,464
  128,577,753
  128,578,624
  128,581,738
  128,582,333
  128,582,336
  128,582,861
  128,583,349
  128,583,482
  128,584,569
  128,584,923
  128,585,345
  128,585,549
  128,586,063
  128,586,259
  128,588,685
  128,593,234
  128,593,276
  128,594,229
  128,596,664
  128,596,993
  128,597,279
  128,597,301
  128,597,418
  128,598,241
  128,598,963
  128,600,252
  128,601,214
  128,604,657
  128,604,658
  128,606,802
  128,607,396
  128,607,621
  128,607,708
  128,609,932
  128,612,137
  128,612,599
  128,612,864
  128,612,865
  128,612,969
  128,613,166
  128,613,189
  128,613,190
  128,613,253
  128,616,108
  128,616,134
  128,616,247
  128,618,162
  128,619,481
  128,620,789
  128,622,030
  128,622,083
  128,622,086
  128,622,095
  128,622,098
  128,622,121
  128,622,148
  128,623,003
  128,623,129
  128,623,328
  128,624,086
  128,624,233
  128,624,269
  128,624,833
  128,625,207
  128,625,342
  128,625,512
  128,625,727
  128,626,590
  128,626,603
  128,627,144
  128,627,338
  128,628,399
  128,628,848
  128,628,992
  128,629,376
  128,629,680
  128,629,976
  128,630,444
  128,630,512
  128,630,547
  128,630,739
  128,630,879
  128,631,148
  128,631,248
  128,632,179
  128,633,661
  128,633,809
  128,634,125
  128,634,140
  128,634,745
  128,634,969
  128,635,301
  128,636,008
  128,636,067
  128,636,232
  128,637,446
  128,638,265
  128,639,063
  128,639,721
  128,639,923
  128,640,904
  128,640,982
  128,641,082
  128,641,242
  128,641,474
  128,641,695
  128,642,056
  128,642,523
  128,642,783
  128,643,622
  128,643,730
  128,643,781
  128,643,928
  128,643,976
  128,644,055
  128,644,147
  128,644,454
  128,644,539
  128,644,717
  128,644,720
  128,644,767
  128,644,814
  128,644,906
  128,645,128
  128,645,358
  128,645,471
  128,645,886
  128,646,331
  128,646,910
  128,648,868
  128,649,261
  128,649,366
  128,650,002
  128,650,999
  128,652,026
  128,652,075
  128,652,167
  128,652,654
  128,652,742
  128,653,091
  128,653,205
  128,655,026
  128,655,379
  128,657,305
  128,658,195
  128,658,571
  128,658,634
  128,658,658
  128,660,213
  128,660,395
  128,660,411
  128,660,549
  128,661,043
  128,661,300
  128,662,091
  128,662,141
  128,662,622
  128,662,684
  128,662,686
  128,662,959
  128,663,498
  128,663,897
  128,666,324
  128,667,170
  128,667,180
  128,667,932
  128,668,292
  128,669,022
  128,669,260
  128,669,358
  128,669,497
  128,670,918
  128,670,974
  128,671,061
  128,672,361
  128,672,539
  128,673,147
  128,673,993
  128,674,888
  128,676,057
  128,677,369
  128,677,545
  128,678,032
  128,678,181
  128,678,383
  128,678,718
  128,678,838
  128,680,558
  128,680,962
  128,681,121
  128,681,137
  128,681,159
  128,681,231
  128,681,255
  128,681,319
  128,681,827
  128,681,884
  128,682,054
  128,682,363
  128,682,722
  128,682,778
  128,682,779
  128,682,841
  128,683,048
  128,683,415
  128,683,880
  128,684,418
  128,685,801
  128,686,042
  128,686,743
  128,686,745
  128,688,036
  128,689,285
  128,689,335
  128,692,533
  128,693,115
  128,693,238
  128,693,844
  128,693,893
  128,694,038
  128,694,628
  128,694,700
  128,694,727
  128,695,268
  128,695,859
  128,696,081
  128,696,163
  128,697,155
  128,697,236
  128,699,040
  128,699,063
  128,699,070
  128,699,280
  128,699,354
  128,699,561
  128,699,661
  128,699,680
  128,699,691
  128,699,713
  128,700,728
  128,701,846
  128,701,942
  128,704,583
  128,704,828
  128,704,897
  128,705,332
  128,705,587
  128,705,655
  128,705,804
  128,705,809
  128,705,825
  128,705,832
  128,705,841
  128,705,953
  128,706,076
  128,706,117
  128,706,119
  128,706,121
  128,706,235
  128,706,578
  128,706,868
  128,707,133
  128,707,140
  128,707,157
  128,707,262
  128,707,840
  128,708,251
  128,708,601
  128,708,685
  128,709,170
  128,710,049
  128,710,252
  128,710,920
  128,712,908
  128,713,279
  128,713,369
  128,713,391
  128,715,164
  128,716,337
  128,716,781
  128,717,005
  128,719,172
  128,719,621
  128,720,557
  128,720,854
  128,721,971
  128,721,986
  128,722,036
  128,722,626
  128,722,788
  128,723,038
  128,723,175
  128,723,684
  128,724,093
  128,724,260
  128,724,290
  128,724,294
  128,724,329
  128,724,719
  128,724,799
  128,724,973
  128,725,021
  128,725,459
  128,725,637
  128,725,696
  128,726,696
  128,726,851
  128,727,099
  128,727,257
  128,727,358
  128,727,986
  128,728,520
  128,728,561
G
T
G
C
T
G
C
C
C
T
T
T
T
C
C
G
A
C
C
C
G
C
G
G
G
T
G
A
T
C
C
G
A
G
A
C
G
G
C
C
A
C
C
T
T
A
G
C
C
T
G
G
C
T
G
T
C
G
A
G
A
G
T
C
T
C
C
G
A
G
A
A
C
T
A
T
A
C
T
T
A
C
G
C
C
C
T
C
C
T
G
T
A
A
A
C
G
C
T
G
T
C
T
A
T
C
G
A
C
T
A
T
T
A
C
T
C
A
A
T
T
C
C
C
C
C/T
G
C
C
A
G
A
G
T
C
C
T
T
C
C
C
A
C
A
T
A
A
C
G
G
C
G
C
C
A
T
A
A
T
T
G
G
T
G
T
C
C
G/T
T
A
A
A
A
G
G
T
T
C
T
T
A
A
G
A
G
C
C
G
G
A
C
T
A
A
A
A
C
G
A
T
G
G
T
T
G
C
G
G
C
A
T
G
T
T
A
T
T
T
G
A
T
G
T
A
T
A
G
C
G
G
T
A
C
T
G
C
G
C
A
C
C
G
C
A
A
A
A
A
T
T
A
T
T
C
G
T
C
G
T
T
A
C
C
A
C
C
A
T
C
A
G
T
T
G
A
G
G
A
A
G
C
G
G
A
A
T
A
T
G
A
C
A
T
T
G
A
C
A
A
T
A
T
A
A
T
A
A
A
T
A
G
A
A
A
A
T
C
C
T
C
G
A
G
A
A
C
C
G
T
A
G
G
C
T
T
C
C
A
A
T
T
C
T
C
C
A
G
C
T
G
C
G
C
A
G
T
T
C
A
T
C
T
G
T
C
C
C
T
T
G
T
A
C
T
T
C
G
T
C
G
C
A
C
A
G
C
T
G
A
G
T
T
G
G
C
T
C
A
T
G
A
G
C
G
T
G
C
C
A
G
A
C
C
G
C
C
G
A
T
A
A
T
T/G
C
G
G
T
G
T
T
G
G
T
A
T
C
A
G
G
A
G
G
A
G
A
T
T
C
C
T
A
G
G
T
G
T
C
C
A
A
G
A
C
A
A
T
C
T
G
G
G
A
C
A