Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 233,781 (bp)   Positions: 365
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.01
.001
.001
.01
.001
.004
.0
.008
.004
.067
.001
.06
.317
--
--
--
--
--
.174
.004
.0
.228
.004
.001
.0
.078
.066
.002
.01
.005
.002
.001
.001
.0
.0
.004
.118
.087
.002
.0
.0
.005
.072
.003
.011
.002
.18
.0
.012
.154
.0
.0
.002
.0
.002
.0
.001
.006
.009
.305
.002
.0
.001
.042
.0
.0
.003
.0
.002
.006
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
.007
.602
.011
.0
.008
.006
.014
.072
.139
.048
.527
.337
.095
.098
.077
.151
.043
.039
.007
.446
.002
.0
.001
.022
.973
.529
.271
.056
.378
.008
.01
.001
.001
.005
--
--
.034
.002
.048
.0
.018
.007
.105
.037
.009
.001
.001
.021
.003
.007
.0
.001
.0
.0
.018
.015
.004
.001
.0
.007
.04
.923
.363
.0
.684
.99
.868
.631
.001
.001
.015
.002
.003
.38
.368
.742
.09
.018
.061
.139
.0
.001
.059
.074
.042
.003
.434
.027
.121
.237
.078
.007
.0
.002
.0
.001
--
--
--
.005
.0
.0
.003
.4
.201
.007
.004
.002
.0
.003
.0
.001
.0
.004
--
--
--
--
--
--
.053
.092
.167
.0
.0
.012
.001
.004
.001
.002
.0
.0
.003
.0
.001
.009
.028
.0
.405
.0
.003
.003
.0
.0
.004
.002
.006
.002
.066
.001
.0
.002
.009
.025
.001
.003
.038
.056
.0
.0
.001
.0
.345
.003
.016
.0
.005
.144
.081
.001
.054
.0
.0
.001
.087
.0
.001
.0
.001
.001
.0
.016
.603
.507
.035
.013
.008
.0
.001
.003
.06
.003
.0
.238
.01
.006
.034
.005
.002
.0
.001
.0
.003
.0
.073
.0
.001
.982
.218
.013
.0
.0
.431
.011
.0
.0
.006
.008
.006
.0
.0
.033
.024
.023
.016
.003
.237
.0
.17
.013
.0
.007
.002
.012
.001
.012
.155
.064
.007
.016
.025
.078
.399
.056
.001
.058
.059
.0
.0
.021
.011
.016
.001
.156
.0
.01
.009
.008
.823
.407
.021
.298
.001
.007
.045
.003
.003
.0
.0
.823
.282
1.0
.007
.002
.0
.004
.0
.002
.001
.018
.017
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
G
G
C
G
A
A
G
A
G
A
A
G
C
T
T
C
C
C
A
A
G
T
G
G
G
A
T
A
A
A
A
A
C
A
G
T
T
A
G
T
T
T
C
G
T
G
G
A
G
A
T
A
A
C
T
C
C
C
T
A
C
A
T
C
G
T
C
G
C
T
G
T
G
C
G
A
G
C
C
T
G
T
G
T
A
T
G
G
C
C
C
A
G
C
A
A
C
T
A
G
C
C
A
T
G
G
A
G
T
A
T
G
T
C
T
C
A
A
C
T
T
G
A
C
A
C
G
T
C
T
C
C
C
G
C
G
A
A
A
G
C
T
C
A
G
G
G
A
G
T
A
G
T
A
C
T
T
C
G
G
A
T
G
T
A
T
C
T
T
T
C
T
A
T
A
C
G
A
A
T
A
A
A
A
G
T
T
T
T
A
A
G
A
C
A
T
T
A
A
C
A
G
A
C
C
C
C
A
C
C
C
C
C
T
A
A
C
C
C
A
A
C
T
C
A
C
C
C
A
T
A
A
G
A
A
A
A
G
A
A
T
C
A
A
G
T
A
C
G
A
A
A
A
G
A
C
T
C
C
G
G
G
T
A
G
G
G
G
C
G
A
A
G
A
T
G
G
C
A
A
A
G
A
A
A
T
T
C
T
C
A
A
G
G
G
C
T
A
A
T
C
C
A
T
G
T
C
C
C
G
C
A
G
C
T
T
T
C
A
A
T
C
C
T
T
A
G
C
A
A
T
G
A
G
G
G
G
T
C
A
A
A
A
G
G
A
T
C
T
T
A
G
A
T
A
T
A
C
T
C
G
A
C
A
G
  129,197,029
  129,197,108
  129,197,530
  129,197,726
  129,197,733
  129,200,596
  129,200,847
  129,201,162
  129,201,166
  129,201,398
  129,202,029
  129,203,171
  129,203,509
  129,204,004
  129,204,708
  129,205,399
  129,205,532
  129,205,608
  129,207,892
  129,211,997
  129,214,316
  129,214,541
  129,216,806
  129,217,309
  129,218,322
  129,218,670
  129,219,232
  129,219,480
  129,219,995
  129,221,923
  129,222,140
  129,222,728
  129,224,667
  129,225,128
  129,225,343
  129,226,648
  129,226,745
  129,226,859
  129,227,093
  129,227,148
  129,227,247
  129,227,292
  129,227,506
  129,227,633
  129,228,201
  129,228,215
  129,228,444
  129,228,649
  129,228,861
  129,228,871
  129,229,211
  129,229,258
  129,229,516
  129,229,616
  129,229,621
  129,229,667
  129,229,752
  129,230,007
  129,230,015
  129,230,047
  129,230,297
  129,231,401
  129,231,439
  129,231,513
  129,232,194
  129,232,355
  129,232,551
  129,232,556
  129,233,053
  129,233,503
  129,234,802
  129,237,302
  129,237,711
  129,237,953
  129,238,875
  129,240,480
  129,241,349
  129,243,098
  129,243,229
  129,243,624
  129,250,531
  129,250,617
  129,250,742
  129,251,029
  129,252,966
  129,253,276
  129,254,098
  129,254,158
  129,255,342
  129,255,684
  129,256,222
  129,256,756
  129,258,047
  129,258,064
  129,258,204
  129,258,249
  129,260,085
  129,260,161
  129,260,197
  129,260,262
  129,261,383
  129,261,584
  129,261,828
  129,261,929
  129,262,184
  129,262,806
  129,266,277
  129,266,959
  129,276,325
  129,276,641
  129,276,860
  129,277,270
  129,277,305
  129,277,638
  129,277,729
  129,277,743
  129,277,856
  129,278,066
  129,278,289
  129,278,429
  129,286,860
  129,286,924
  129,287,002
  129,287,045
  129,287,577
  129,287,867
  129,287,970
  129,288,382
  129,288,386
  129,288,558
  129,288,609
  129,288,903
  129,289,021
  129,289,039
  129,289,199
  129,289,305
  129,289,313
  129,289,381
  129,289,517
  129,289,578
  129,289,592
  129,289,631
  129,289,678
  129,289,722
  129,289,879
  129,290,207
  129,290,399
  129,290,641
  129,291,187
  129,291,316
  129,291,402
  129,291,433
  129,291,533
  129,291,761
  129,291,856
  129,291,865
  129,291,906
  129,292,040
  129,292,058
  129,292,233
  129,292,691
  129,293,222
  129,293,366
  129,293,510
  129,295,510
  129,296,119
  129,296,136
  129,296,654
  129,298,081
  129,301,030
  129,301,377
  129,303,148
  129,303,222
  129,303,717
  129,303,775
  129,304,460
  129,305,324
  129,306,302
  129,306,376
  129,306,629
  129,307,778
  129,307,912
  129,308,110
  129,308,826
  129,308,858
  129,308,967
  129,309,545
  129,309,594
  129,309,621
  129,309,879
  129,310,260
  129,310,386
  129,310,617
  129,312,157
  129,312,437
  129,312,495
  129,312,674
  129,313,359
  129,314,779
  129,315,244
  129,315,405
  129,315,528
  129,316,463
  129,316,734
  129,317,791
  129,317,807
  129,318,357
  129,318,937
  129,318,961
  129,320,136
  129,320,313
  129,320,462
  129,320,693
  129,320,916
  129,320,917
  129,322,140
  129,322,458
  129,323,945
  129,324,893
  129,333,283
  129,333,745
  129,333,867
  129,334,029
  129,334,188
  129,334,442
  129,334,751
  129,334,755
  129,334,772
  129,335,118
  129,335,167
  129,335,263
  129,335,634
  129,335,751
  129,336,925
  129,337,041
  129,338,209
  129,338,312
  129,338,377
  129,339,522
  129,339,538
  129,339,599
  129,339,652
  129,339,863
  129,340,570
  129,340,702
  129,341,037
  129,341,343
  129,341,400
  129,341,472
  129,341,652
  129,341,735
  129,341,870
  129,342,009
  129,342,031
  129,342,357
  129,342,783
  129,342,784
  129,342,970
  129,343,406
  129,343,433
  129,343,742
  129,343,880
  129,343,917
  129,344,174
  129,344,240
  129,344,426
  129,346,739
  129,346,777
  129,347,738
  129,367,402
  129,371,455
  129,372,382
  129,385,917
  129,386,231
  129,386,669
  129,394,724
  129,395,988
  129,399,621
  129,399,770
  129,402,044
  129,402,125
  129,402,250
  129,402,267
  129,402,437
  129,403,154
  129,403,362
  129,403,422
  129,403,810
  129,404,336
  129,404,865
  129,405,061
  129,405,401
  129,405,604
  129,405,608
  129,405,751
  129,405,757
  129,405,817
  129,406,415
  129,406,549
  129,406,599
  129,406,609
  129,406,654
  129,406,759
  129,406,828
  129,406,863
  129,407,543
  129,407,738
  129,407,739
  129,407,851
  129,408,185
  129,409,031
  129,409,764
  129,412,022
  129,413,114
  129,413,209
  129,413,666
  129,413,901
  129,415,645
  129,415,720
  129,415,775
  129,415,805
  129,415,929
  129,416,005
  129,416,039
  129,416,307
  129,416,353
  129,416,559
  129,416,590
  129,416,615
  129,416,768
  129,416,821
  129,416,970
  129,417,097
  129,417,222
  129,417,224
  129,417,229
  129,417,809
  129,417,826
  129,417,852
  129,418,037
  129,418,039
  129,418,041
  129,418,281
  129,418,319
  129,418,743
  129,418,840
  129,419,191
  129,419,242
  129,419,455
  129,419,561
  129,419,600
  129,420,637
  129,420,665
  129,420,939
  129,420,950
  129,421,031
  129,421,116
  129,421,222
  129,421,728
  129,421,909
  129,421,943
  129,423,174
  129,426,141
  129,426,517
  129,429,389
A
A
T
A
G
T
A
C
A
G
G
A
T
C
C
T
T
T
G
C
T
C
A
C
A
G
G
G
G
G
T
T
T
G
A
C
G
T
A
C
C
G
T
A
A
A
A
G
A
G
C
G
G
T
C
T
T
T
C
G
G
G
C
T
T
C
T
C
T
C
A
G
T
T
A
G
C
T
T
G
A
C
A
C
C
C
A
T
T
T
A
G
A
T
G
T
A
C
G
A
T
T
G
C
C
T
T
A
C
G
A
A
G
T
C
A
G
G
G
C
G
C
G
A
G
T
A
C
T
C
A
T
A
C
A
A
C
T
C
T
T
A
T
G
T
A
A
G
A
C
T
A
G
T
T
C
C
T
A
T
T
C
T
G
T
A
A
G
C
C
A
C
G
C
T
T
A
G
T
C
C
G
G
C
A
C
C
G
C
G
C
A
G
A
C
C
C
G
T
T
G
A
G
T
T
A
T
T
T
T
T
G
G
A
C
G
T
T
A
G
G
T
C
A
C
A
T
T
T
C
G
T
A
C
G
G
G
A
G
G
C
T
C
G
A
A
T
G
A
T
G
T
G
A
G
T
G
T
T
C
A
A
G
G
A
A
A
A
T
A
G
G
A
T
G
A
A
T
G
G
G
A
G
G
T
C
A
T
C
A
G
G
A
C
A
T
A
G
G
C
T
A
G
C
A
A
T
T
A
A
T
C
A
T
C
C
C
T
C
G
C
A
T
C
A
G
A
T
G
G
G
A
G
A
A
A
A
C
T
G
G
G
T
A
T
G
C
T
C
C
G
A
T
C
T
C
G
G
C
T
T
G
T
C
T