Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 66,977 (bp)   Positions: 319
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.973
.99
.004
.034
.397
.0
.825
.062
.021
.008
.052
.874
.005
.001
.0
.001
.001
.001
.0
.0
.011
.108
.0
.014
.003
.004
.0
.001
.268
.114
.248
.909
.105
.007
.043
.009
.004
.035
.012
.001
.002
.002
.002
.001
.006
.001
.002
.001
.009
.015
.081
.005
.002
.001
.0
.001
.015
.048
.075
.008
.004
.002
.006
.001
.009
.016
.002
.0
.0
.008
.031
.006
.012
.004
.002
.02
.001
.0
.0
.008
.003
.001
.01
.519
.268
.018
.006
.0
.004
.001
.0
.059
.024
.003
.001
.002
.004
.001
.913
.938
.938
.739
.799
.001
.003
.001
.059
.062
.013
.0
.014
.012
.0
.0
.007
.008
.003
.0
.002
.062
.033
.0
.012
.01
.002
.003
.036
.001
.0
.0
.0
.009
.007
.001
.0
.008
.027
.008
.006
.003
.019
.026
.146
.014
.004
.027
.001
.006
.026
.016
.004
.0
.005
.07
.075
.001
.0
.008
.859
.001
.0
.0
.005
.005
.005
.33
.103
.007
.104
.014
.003
.0
.0
.003
.346
.074
.144
.053
.023
.008
.07
.0
.0
.011
.155
.124
.015
.078
.016
.55
.097
.633
.003
.07
.0
.001
.147
.087
.123
.086
.008
.001
.599
.035
.278
.741
.023
.001
.012
.002
.001
.011
.0
.009
.12
.003
.006
.163
.477
.166
.001
.007
.053
.054
.016
.026
.241
.021
.047
.01
.001
.003
.008
.114
.257
.54
.043
.001
.003
.004
.0
.002
.002
.001
.0
.05
.002
.097
.012
.003
.071
.002
.153
.002
.004
.001
.013
.004
.004
.002
.014
.01
.025
.008
.004
.003
.0
.054
.884
.989
.001
.042
.575
.564
.001
.019
.097
.002
.0
.0
.304
.001
.0
.21
.002
--
.001
.72
.036
.001
.569
.916
.007
.019
.021
.001
.452
.014
.193
.01
1.0
.001
.289
.023
.103
.003
.0
.012
.31
.124
1.0
.059
.534
.397
.012
.029
.009
.138
1.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Syt17
Syt17
Syt17
Syt17
Syt17
Syt17
Syt17
Syt17
Syt17
Syt17
Syt17
Syt17
Syt17
Syt17
Syt17
Syt17
Syt17
Syt17
Syt17
Syt17
Syt17
Syt17
Syt17
Syt17
Syt17
Syt17
Syt17
Syt17
Syt17
Syt17
Syt17
Syt17
G
T
C
G
G
C
C
C
T
G
A
T
T
-
C
G
-
C
C
C
-
T
C
C
A
C
G
A
G
C
A
-
-
A
A
A
-
-
T
A
G
-
-
C
G
G
G
A
A
-
C
-
C
T
C
-
G
T
-
T
G
A
4
4
A
12
A
2
C
C
-
T
A
-
C
G
A
G
A
C
-
2
-
-
A
2
G
C
-
A
C
3
T
-
-
2
A
G
-
C
-
C
-
-
C
2
G
C
-
-
A
G
-
-
8
C
-
2
G
-
C
C
-
A
A
T
T
-
T
-
C
-
-
G
-
-
-
-
-
-
A
-
A
T
C
A
A
G
-
A
T
-
-
-
G
T
T
G
C
T
C
A
G
G
C
C
T
G
C
C
A
-
C
T
A
C
-
T
13
T
T
A
C
A
2
-
2
C
G
G
A
G
A
C
T
G
T
-
A
2
G
-
T
-
T
C
G
G
G
C
A
T
C
A
C
A
3
A
C
-
A
A
-
C
A
C
-
A
G
G
A
C
G
A
A
A
A
A
A
G
A
T
G
C
C
G
G
C
C
T
C
A
G
-
G
A
G
G
G
G
-
A
T
-
G
C
G
C
-
C
G
A
A
A
T
C
G
A
A
A
C
A
C
A
A
T
G
C
C
T
G
A
T
T
A
G
-
-
A
G
A
T
G
T
-
G
A
-
C
A
A
G
T
T
T
T
T
G
T
  188,035,129
  188,035,436
  188,035,478
  188,035,523
  188,035,605
  188,035,636
  188,035,819
  188,036,455
  188,036,520
  188,036,631
  188,036,783
  188,037,147
  188,037,221
  188,037,322
  188,037,338
  188,037,433
  188,037,561
  188,037,571
  188,038,308
  188,038,514
  188,038,754
  188,038,810
  188,039,384
  188,039,600
  188,039,693
  188,039,951
  188,040,135
  188,040,554
  188,040,667
  188,040,682
  188,040,876
  188,041,033
  188,041,060
  188,041,313
  188,041,415
  188,041,735
  188,042,130
  188,042,147
  188,042,181
  188,042,216
  188,042,231
  188,042,244
  188,042,261
  188,042,264
  188,042,314
  188,042,349
  188,042,363
  188,042,364
  188,042,409
  188,042,427
  188,042,497
  188,042,531
  188,042,537
  188,042,558
  188,042,566
  188,042,580
  188,042,633
  188,042,647
  188,042,652
  188,042,660
  188,042,668
  188,043,591
  188,043,608
  188,043,621
  188,043,638
  188,043,650
  188,043,672
  188,043,699
  188,043,706
  188,043,711
  188,043,741
  188,043,746
  188,043,754
  188,043,771
  188,043,779
  188,043,786
  188,043,804
  188,043,806
  188,043,808
  188,043,817
  188,043,819
  188,043,838
  188,043,844
  188,043,858
  188,043,866
  188,043,875
  188,043,892
  188,043,908
  188,043,917
  188,043,928
  188,043,932
  188,043,939
  188,043,974
  188,043,979
  188,043,981
  188,043,992
  188,043,998
  188,044,003
  188,044,011
  188,044,012
  188,044,023
  188,044,046
  188,044,076
  188,044,113
  188,044,117
  188,044,138
  188,044,165
  188,044,171
  188,044,181
  188,044,205
  188,044,226
  188,044,228
  188,044,263
  188,044,268
  188,044,272
  188,044,588
  188,045,063
  188,045,067
  188,045,074
  188,045,078
  188,045,089
  188,045,099
  188,045,106
  188,045,108
  188,045,112
  188,045,167
  188,045,181
  188,045,191
  188,045,214
  188,045,224
  188,045,227
  188,045,231
  188,045,237
  188,045,238
  188,045,253
  188,045,265
  188,045,268
  188,045,277
  188,045,284
  188,045,287
  188,045,306
  188,045,766
  188,045,928
  188,046,259
  188,046,343
  188,046,556
  188,048,224
  188,048,934
  188,049,071
  188,049,117
  188,050,831
  188,051,584
  188,055,623
  188,055,945
  188,055,989
  188,056,066
  188,056,185
  188,058,156
  188,059,499
  188,059,626
  188,059,630
  188,059,670
  188,059,979
  188,060,211
  188,060,230
  188,060,329
  188,060,632
  188,060,719
  188,060,844
  188,061,193
  188,061,331
  188,062,120
  188,062,391
  188,063,024
  188,063,231
  188,065,123
  188,065,154
  188,066,164
  188,066,225
  188,066,302
  188,066,450
  188,067,581
  188,068,090
  188,068,312
  188,068,593
  188,068,616
  188,068,637
  188,068,650
  188,068,898
  188,069,071
  188,069,306
  188,069,545
  188,069,819
  188,070,125
  188,070,567
  188,070,617
  188,070,788
  188,070,880
  188,070,983
  188,071,069
  188,071,145
  188,071,384
  188,072,233
  188,072,536
  188,072,839
  188,073,308
  188,073,549
  188,074,205
  188,074,366
  188,075,067
  188,075,075
  188,075,214
  188,075,225
  188,075,433
  188,075,999
  188,076,115
  188,076,303
  188,076,502
  188,076,513
  188,076,946
  188,077,293
  188,077,968
  188,078,116
  188,078,140
  188,079,134
  188,079,144
  188,079,180
  188,079,534
  188,079,666
  188,079,711
  188,079,854
  188,079,960
  188,079,961
  188,080,001
  188,080,008
  188,080,095
  188,080,190
  188,080,522
  188,080,762
  188,080,812
  188,080,831
  188,080,855
  188,080,861
  188,081,016
  188,081,039
  188,081,047
  188,081,418
  188,081,823
  188,082,048
  188,082,098
  188,082,189
  188,082,224
  188,082,689
  188,082,937
  188,083,476
  188,083,723
  188,084,170
  188,084,177
  188,084,179
  188,084,180
  188,084,202
  188,084,213
  188,084,301
  188,084,494
  188,084,518
  188,085,489
  188,085,905
  188,086,139
  188,086,741
  188,086,917
  188,087,485
  188,088,727
  188,089,330
  188,089,332
  188,089,452
  188,089,659
  188,089,895
  188,090,800
  188,091,243
  188,091,426
  188,091,553
  188,091,736
  188,092,545
  188,092,748
  188,093,195
  188,093,691
  188,094,165
  188,094,244
  188,094,320
  188,094,450
  188,094,595
  188,094,627
  188,094,836
  188,095,030
  188,095,292
  188,095,322
  188,096,277
  188,096,424
  188,096,577
  188,096,581
  188,097,010
  188,097,351
  188,097,800
  188,098,797
  188,098,853
  188,099,163
  188,099,208
  188,099,407
  188,100,155
  188,100,666
  188,100,732
  188,101,014
  188,101,080
  188,101,088
  188,101,098
  188,101,130
  188,101,137
  188,101,138
  188,101,166
A
C
A
A
A
T
T
T
C
A
T
C
C
12
A
A
T
A
T
A
A
C
T
T
C
T
A
G
C
T
G
6
A
G
G
G
A
G
-
-
-
G
A
G
-
-
A
G
-
T
-
A
T
A
-
G
-
C
C
-
-
-
-
-
-
12/-
-
-
-
-
G
G
-
A
A
-
G
T
G
G
C
-
C
2
-
-
T
-
A
C
A
-
-
T
G
-
-
-
G
T
G
-
A
A
-
-
-
-
A
C
-
-
C
2
-
T
A
-
T
3
-
T
G
G
T
-
-
T
A
T
T
C
T
T
G
T
A
T
A
G
-
C
G
-
T
G
G
A
2
C
C
A
6
3
C
C
G
T
T
C
T
G
T
C
A
T
C
A
A
A
G
T
T
G
G
T
2
-
-
C
C
G
T
G
-
2
-
T
A
A
G
A
C
T
C
A
C
A
T
-
A
2
G
3
C
G/A
A
T
A
T
G
C
G
G
T
G
-
G
T
T
C
G
T
T
G
G
C
G
A
A
T
G
A
G
G
G
G
G
C
A
C
C
C
A
G
A
T
T
T
C
T
G
A
G
A
G
C
-
T
T
2
G
C
13
A
T
A
T
2
A
T
G
A/T
A/-
C
T
A
G
G
G
A
T
T
G
G
C
A
T
T
C
A
-
A
A
G
A
2
G
G
A
C
C
A
C
10
A
G
2
T
C
G
-
-
-
-
-
-
C
-