Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 187,382 (bp)   Positions: 389
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.985
.003
.0
.13
.001
.004
.009
.003
.013
.429
.042
.003
.0
.002
.002
.815
.0
1.0
1.0
.024
.001
.001
.027
.0
.0
.001
.002
.0
.002
.0
.001
.0
.408
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.219
.0
.0
.001
.008
.758
.221
.0
.0
.927
.001
.004
.001
.0
.03
.418
.713
.004
.004
.062
.077
.008
.001
.002
.0
.0
.994
.004
.001
.0
1.0
.877
.002
.008
.002
.673
.004
.143
.0
.001
.012
.001
.161
.994
.0
.0
.0
.005
.0
.026
.001
.0
.011
.001
.0
.0
.0
.0
.003
.0
.0
.0
.0
.0
.025
.982
.14
.007
.001
.003
.0
.0
.0
.0
.001
.0
.029
.056
.0
.0
.0
.0
.882
.0
.0
.0
.0
.002
1.0
.001
.0
.008
.018
.998
.992
.055
.275
.026
.0
.003
.001
.001
.275
.0
.002
.0
.0
.001
.001
.003
.989
--
.487
--
.061
.005
.015
.702
.992
.0
.26
.256
.066
.0
.0
.005
.005
.0
.0
.0
.004
.0
.015
.004
.0
.0
.257
.977
.009
.004
.0
.0
.0
.002
.028
.072
.068
.058
.013
.975
.0
.001
.101
.0
.005
.193
.0
.0
.0
.012
.008
.002
.011
.001
.015
.056
.0
.001
.001
.002
.015
.015
.002
.163
.004
.001
.048
.0
.0
.0
.041
.004
.015
.004
.001
.0
.072
.112
.007
.0
.01
.008
.01
.0
.0
.53
.004
.104
.001
.0
.0
.0
.001
.0
.009
.001
.064
.009
.997
.0
.01
--
.003
.001
.004
.012
.067
.001
.0
.0
.006
.006
.054
.019
.0
.086
.757
.036
.003
.004
.201
--
.005
.001
.04
.0
.0
.127
.0
.0
.107
.13
.019
.251
.004
.377
.037
.108
.001
.129
.004
.003
.011
.001
.001
.006
.0
.001
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.998
.18
.008
.001
.0
--
.013
.011
.943
.998
.14
.999
.143
.025
.022
.022
.023
--
.003
.02
.02
.021
.158
.141
.04
.002
.053
.095
.069
.014
.118
.019
.779
.927
.925
.005
.001
.001
.005
.093
.0
.0
.001
.001
.002
--
.316
.467
.998
.006
.0
.002
.001
.033
.02
.005
.198
.0
.001
.001
.019
.002
.468
.135
.522
.0
.001
.011
.033
.493
.0
.001
.001
.018
.0
.0
.0
.416
.87
.004
.02
.001
.065
.004
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Sulf1
Sulf1
Sulf1
Sulf1
Sulf1
Sulf1
Sulf1
Sulf1
Sulf1
Sulf1
Sulf1
Sulf1
Sulf1
Sulf1
Sulf1
Sulf1
Sulf1
Sulf1
Sulf1
Sulf1
Sulf1
Sulf1
Sulf1
Sulf1
Sulf1
Sulf1
Sulf1
Sulf1
Sulf1
Sulf1
Sulf1
Sulf1
Sulf1
Sulf1
Sulf1
Sulf1
Sulf1
Sulf1
Sulf1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
A
A
G
C
C
G
T
A
C
A
C
G
C
C
A
T
G
A
A
T
C
C
A
C
T
G
G
C
G
A
A
G
C
C
T
T
A
G
T
A
C
A
A
G
T
G
G
T
G
C
C
A
T
C
G
A
C
T
A
T
C
A
C
T
C
C
G
C
G
C
G
C
G
A
C
A
A
A
G
G
T
A
G
T
G
A
G
T
T
T
T
A
T
G
T
A
T
T
G
G
G
G
T
C
A
T
A
G
G
A
C
A
G
T
T
T
C
C
G
T
T
G
C
A
T
G
G
C
C
A
G
G
A
A
C
T
G
T
A
A
T
C
A
T
T
G
G
C
A
G
C
G
C
G
C
T
T
A
C
C
G
A
A
A
T
C
C
A
C
A
A
C
G
G
C
C
A
A
T
C
T
T
T
T
C
A
C
G
T
T
G
T
C
A
A
C
T
T
T
T
A
A
C
A
C
T
G
G
C
A
G
C
A
A
G
C
T
A
G
G
G
C
A
T
A
T
T
A
T
G
T
G
G
C
G
G
C
T
G
C
G
C
A
C
T
G
C
T
T
G
C
C
A
G
C
A
C
A
T
A
A
T
G
G
G
A
C
C
C
A
T
C
C
T
G
T
T
A
T
T
A
T
C
C
A
C
G
C
T
C
G
A
T
T
T
C
C
G
G
C
C
A
G
A
G
A
T
G
T
A
C
G
C
A
A
T
T
T
T
T
G
C
C
G
T
A
A
C
G
A
G
G
C
T
G
T
T
G
A
A
C
C
T
G
C
T
A
G
C
G
C
T
C
A
T
G
T
A
A
G
G
A
T
A
A
A
A
A
T
G
G
T
T
T
C
T
A
T
A
A
G
A
T
T
C
C
G
A
G
  6,001,762
  6,003,388
  6,003,408
  6,006,477
  6,006,709
  6,006,731
  6,008,026
  6,008,343
  6,008,435
  6,008,785
  6,008,997
  6,009,622
  6,010,296
  6,010,545
  6,011,529
  6,012,696
  6,012,724
  6,012,867
  6,012,888
  6,013,695
  6,018,772
  6,019,193
  6,024,005
  6,024,029
  6,025,070
  6,026,094
  6,027,130
  6,027,932
  6,028,085
  6,028,149
  6,028,196
  6,028,223
  6,028,278
  6,028,432
  6,029,055
  6,029,160
  6,029,162
  6,029,459
  6,029,513
  6,029,577
  6,029,614
  6,029,646
  6,029,729
  6,029,919
  6,030,313
  6,030,370
  6,030,738
  6,030,855
  6,031,981
  6,032,229
  6,032,279
  6,033,226
  6,033,445
  6,033,615
  6,033,694
  6,033,725
  6,033,938
  6,035,193
  6,035,598
  6,035,600
  6,035,741
  6,035,790
  6,036,059
  6,036,087
  6,036,265
  6,036,387
  6,037,157
  6,037,281
  6,037,929
  6,037,981
  6,038,050
  6,038,302
  6,038,397
  6,038,670
  6,038,773
  6,039,195
  6,039,557
  6,039,599
  6,039,724
  6,039,818
  6,039,859
  6,039,945
  6,039,960
  6,040,618
  6,040,742
  6,040,743
  6,040,751
  6,041,017
  6,041,085
  6,041,329
  6,041,441
  6,041,596
  6,041,740
  6,041,809
  6,042,463
  6,042,481
  6,042,593
  6,043,075
  6,044,215
  6,044,683
  6,044,698
  6,044,884
  6,044,887
  6,045,150
  6,045,241
  6,045,285
  6,045,349
  6,045,687
  6,045,830
  6,045,948
  6,046,166
  6,046,338
  6,046,627
  6,046,929
  6,047,382
  6,047,522
  6,047,830
  6,047,920
  6,048,067
  6,048,224
  6,048,368
  6,048,701
  6,049,087
  6,049,337
  6,049,354
  6,049,355
  6,049,663
  6,050,515
  6,051,246
  6,051,426
  6,051,434
  6,051,577
  6,052,017
  6,052,079
  6,053,914
  6,054,817
  6,054,832
  6,054,989
  6,055,247
  6,055,657
  6,056,227
  6,056,582
  6,056,682
  6,056,954
  6,057,033
  6,058,546
  6,058,572
  6,058,573
  6,058,889
  6,070,950
  6,070,978
  6,070,983
  6,071,444
  6,071,569
  6,071,611
  6,072,064
  6,072,153
  6,072,184
  6,072,221
  6,073,396
  6,073,432
  6,073,487
  6,073,554
  6,073,672
  6,073,754
  6,073,802
  6,073,842
  6,073,862
  6,074,223
  6,074,547
  6,074,576
  6,074,585
  6,074,615
  6,074,623
  6,074,673
  6,074,794
  6,075,177
  6,075,422
  6,075,650
  6,075,657
  6,075,709
  6,075,721
  6,076,491
  6,076,619
  6,076,873
  6,076,899
  6,076,901
  6,078,187
  6,078,545
  6,078,650
  6,078,833
  6,079,031
  6,079,062
  6,079,287
  6,079,610
  6,080,108
  6,080,365
  6,080,389
  6,080,465
  6,080,925
  6,080,940
  6,081,886
  6,081,970
  6,082,018
  6,082,642
  6,082,662
  6,082,869
  6,083,161
  6,083,163
  6,083,736
  6,084,247
  6,084,306
  6,084,460
  6,084,816
  6,084,832
  6,085,018
  6,085,248
  6,086,444
  6,086,550
  6,086,875
  6,087,253
  6,087,407
  6,087,779
  6,087,800
  6,088,276
  6,088,492
  6,088,550
  6,088,836
  6,089,129
  6,089,269
  6,089,271
  6,089,836
  6,089,869
  6,090,149
  6,090,992
  6,091,017
  6,091,263
  6,092,727
  6,094,283
  6,095,237
  6,095,339
  6,099,054
  6,100,382
  6,100,928
  6,101,314
  6,102,523
  6,105,193
  6,106,179
  6,106,320
  6,106,389
  6,107,548
  6,108,327
  6,109,577
  6,109,655
  6,109,793
  6,115,155
  6,117,751
  6,119,083
  6,119,907
  6,119,979
  6,120,130
  6,120,499
  6,121,072
  6,121,134
  6,121,177
  6,122,427
  6,122,512
  6,123,307
  6,123,502
  6,123,524
  6,124,095
  6,125,439
  6,126,082
  6,126,435
  6,127,545
  6,128,085
  6,128,728
  6,128,857
  6,129,685
  6,130,295
  6,130,601
  6,130,786
  6,130,913
  6,131,094
  6,131,315
  6,131,374
  6,132,004
  6,132,457
  6,132,551
  6,132,803
  6,132,819
  6,132,912
  6,133,088
  6,133,424
  6,133,472
  6,133,490
  6,133,623
  6,133,666
  6,133,873
  6,133,932
  6,133,939
  6,134,195
  6,134,251
  6,134,317
  6,134,859
  6,134,897
  6,135,131
  6,135,648
  6,135,786
  6,136,120
  6,136,164
  6,136,363
  6,136,675
  6,136,686
  6,136,835
  6,136,886
  6,138,554
  6,138,770
  6,138,772
  6,138,773
  6,138,923
  6,139,526
  6,139,560
  6,139,688
  6,139,730
  6,139,801
  6,140,133
  6,140,172
  6,140,328
  6,140,619
  6,141,076
  6,141,177
  6,141,540
  6,141,668
  6,141,699
  6,142,069
  6,143,164
  6,143,238
  6,143,239
  6,143,366
  6,144,232
  6,144,242
  6,144,278
  6,144,688
  6,145,280
  6,145,551
  6,145,611
  6,147,002
  6,148,193
  6,149,294
  6,150,271
  6,150,402
  6,151,610
  6,152,725
  6,153,150
  6,153,446
  6,153,695
  6,154,520
  6,154,557
  6,154,574
  6,154,862
  6,154,994
  6,154,995
  6,155,707
  6,155,726
  6,155,986
  6,156,208
  6,157,911
  6,158,806
  6,164,024
  6,165,359
  6,165,601
  6,166,772
  6,167,207
  6,167,651
  6,168,045
  6,168,136
  6,169,672
  6,170,392
  6,170,471
  6,170,485
  6,171,090
  6,171,519
  6,173,009
  6,173,352
  6,174,531
  6,175,463
  6,175,725
  6,176,432
G
G
A
T
A
A
G
C
T
G
T
A
A
T
G
C
A
G
G
C
T
A
G
A
C
A
C
T
C
G
G
A
T
T
C
C
G
T
C
G
T
G
C
A
C
A
A
C
A
T
G
G
C
T
T
T
G
C
C
C
T
T
T
C
G
T
A
T
A
T
A
G
A
G
A
G
G
C
C
A
C
G
C
A
T
G
T
G
G
G
C
G
C
A
C
G
C
A
T
T
A
T
G
T
T
G
G
A
A
T
A
G
A
C
C
C
T
T
A
C
C
A
A
C
C
A
A
G
G
G
T
A
T
G
T
C
C
C
G
G
C
T
G
C
G
T
T
G
G
A
A
A
T
A
T
C
A
C
T
T
T
G
G
G
C
T
T
G
T
G
G
T
A
C
T
T
G
G
C
T
C
C
C
C
T
T
T
A
C
C
A
C
A
G
G
T
C
C
C
G
G
G
T
T
T
C
C
T
T
G
A
T
G
G
A
A
C
G
T
A
A
T
G
C
G
C
C
G
C
T
C
A
A
A
A
T
A
C
A
T
C
T
G
T
C
A
G
C
C
T
T
A
G
A
G
G
G
C
C
G
G
C
A
C
A
G
G
G
G
G
C
G
A
C
A
A
C
G
C
C
G
C
T
T
G
T
A
A
C
T
A
C
G
C
C
T
T
A
C
T
A
G
A
T
A
G
C
A
C
G
T
A
G
G
G
C
C
A
A
A
A
T
T
A
C
C
G
T
A
G
A
A
T
C
A
A
C
A
G
G
A
T
A
A
G
C
T
A
T
A
T
C
T
G
C
A
A
G
G
C
C
G
A
C
G
G
C
G
C
A
T
G
C
A
T
C
G
C
C
T
A
G
C
C
G
G
T
C
A