Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 187,382 (bp)   Positions: 497
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.0
.006
.0
.378
.985
.0
.0
.004
.004
.0
.003
.127
.18
.068
.011
.005
.006
.013
.039
.135
.007
.002
.002
.001
.004
.009
.009
.0
.042
.977
.0
.0
.002
.994
.557
.0
.815
.0
1.0
1.0
1.0
.002
.021
.0
.002
.0
.0
.001
.007
.002
.002
.0
.0
.001
.0
.408
.0
--
.0
.001
.0
.0
.0
.0
.039
.219
.0
.0
.001
.232
.221
.0
.126
.004
.038
.018
.001
.022
.011
.018
.084
.446
.001
.0
.0
.03
.418
.713
.052
.004
.004
.039
.0
.062
.077
.008
.001
.0
.0
.994
--
.003
.004
.001
.0
.079
1.0
.877
.002
.008
.002
.673
.018
.007
.004
.143
.0
.001
.012
.001
.161
.994
.0
.0
.0
.0
.026
.0
.011
.001
.0
.0
.0
.0
.003
.982
1.0
.0
.002
.0
.0
.0
.0
.025
.982
.14
.007
.0
.0
.003
.0
.0
.006
.0
.0
.023
.002
.001
.0
.015
.0
.001
.444
.141
.055
.017
.0
.275
.0
.0
.003
.0
.001
.01
.009
.0
.002
.0
.004
.002
.0
.001
.001
.0
.0
.003
.003
.0
.965
.696
.052
.0
--
--
--
.061
.005
.0
.015
.0
.362
.37
.376
.26
.066
.0
.0
.005
.0
.197
.0
.004
.0
.766
.977
.009
.0
.0
.001
.0
.006
.525
.0
.0
.001
.101
.0
.005
.193
.002
.0
.0
.012
.114
.008
.002
.042
.108
.998
.995
.963
.773
.775
1.0
.056
.0
.001
.002
.018
.993
.028
.015
.015
.002
.163
.004
.0
.0
.0
.0
.006
.004
.015
.003
.004
.001
.072
.112
.007
.0
.008
.01
.0
.088
.0
.079
.005
.004
.0
.929
.079
.013
.0
.001
.0
.001
.001
.015
.004
.001
.016
.009
.012
.013
.9
.01
.015
.005
.015
.003
.0
.011
.102
.003
.001
.0
.004
.001
.0
.002
.082
.001
.028
.023
.01
.063
.01
.004
.003
.067
.012
.0
.04
.001
.002
.418
.001
.0
.006
.175
.019
.001
.201
.002
.167
--
--
--
--
--
.051
.0
.0
.022
.0
.0
.506
.127
.0
.0
.227
.0
.01
.019
.251
.004
.34
.037
.378
.297
.037
.001
.129
.004
.011
.001
.001
.006
.0
.145
.0
.0
.023
.0
.0
.0
.18
.001
.008
.0
.002
--
.013
.011
.943
.998
.14
.999
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.143
.023
--
.004
.02
.02
.021
.158
.141
.023
.04
.002
.672
.053
.069
.014
.862
.779
.028
.005
.001
.001
.309
.093
.669
.879
.876
.813
.002
.201
.008
.12
.05
.031
.173
.082
.012
.003
.076
.114
.213
.145
.0
.079
.0
.95
--
.0
.115
.067
.033
.998
.009
.006
.0
.0
.002
.002
.033
.02
.005
.1
.0
.002
.001
.019
.009
.002
.468
.852
.0
.004
.027
.522
.0
.001
.011
.033
.004
.0
.001
.001
.018
.0
.0
.87
.109
.073
.004
.001
.065
.004
.006
.009
.17
.086
.0
.015
.142
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Sulf1
Sulf1
Sulf1
Sulf1
Sulf1
Sulf1
Sulf1
Sulf1
Sulf1
Sulf1
Sulf1
Sulf1
Sulf1
Sulf1
Sulf1
Sulf1
Sulf1
Sulf1
Sulf1
Sulf1
Sulf1
Sulf1
Sulf1
Sulf1
Sulf1
Sulf1
Sulf1
Sulf1
Sulf1
Sulf1
Sulf1
Sulf1
Sulf1
Sulf1
Sulf1
Sulf1
Sulf1
Sulf1
Sulf1
Sulf1
Sulf1
Sulf1
Sulf1
Sulf1
Sulf1
Sulf1
Sulf1
Sulf1
Sulf1
Sulf1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
A
T
C
C
A
T
G
A
C
A
C
T
C
C
T
G
A
G
G
C
G
G
C
G
G
T
G
C
C
T
G
C
C
G
G
C
T
G
T
A
A
C
A
C
A
G
T
G
A
T
G
C
A
A
G
C
C
C
T
A
T
T
A
T
T
A
C
A
A
T
G
T
G
C
C
G
G
C
C
T
T
T
A
T
G
C
G
A
C
A
T
G
C
A
T
C
A
T
C
C
A
T
G
C
G
C
C
G
C
G
A
C
C
C
A
A
A
G
G
T
A
G
C
T
G
T
T
T
A
T
T
A
T
C
T
A
C
G
A
G
G
G
T
C
A
T
A
A
C
G
A
T
T
G
A
C
T
C
A
T
G
C
G
C
C
C
A
T
G
T
A
G
T
C
G
A
T
T
A
T
G
G
C
T
G
A
C
C
C
G
G
A
T
G
G
G
C
A
T
C
A
C
A
C
A
A
A
T
C
A
A
G
G
C
A
A
T
T
A
A
G
G
T
G
G
T
C
A
A
T
C
T
T
A
T
A
G
G
G
G
G
T
A
G
C
T
G
T
G
T
C
A
G
C
A
A
T
G
A
G
C
G
C
G
A
T
T
T
A
T
T
G
G
G
C
A
C
G
C
G
G
A
C
C
A
T
G
G
G
G
C
C
C
C
T
G
C
T
C
G
A
A
T
C
T
T
T
A
C
C
A
T
A
T
A
C
C
C
G
A
A
T
G
C
C
A
C
T
A
C
G
C
A
C
G
T
G
T
A
A
A
G
A
T
C
T
C
T
A
T
G
A
C
T
C
C
C
C
C
C
T
C
T
C
A
T
T
T
C
C
G
C
T
A
A
G
A
C
T
T
T
A
C
G
C
A
A
T
T
T
T
A
C
G
A
G
G
T
T
G
C
A
G
T
A
A
C
G
G
A
G
G
C
T
G
T
T
A
C
C
T
G
C
A
T
C
C
C
C
A
C
C
A
C
T
C
C
G
A
C
T
A
A
G
G
G
G
G
T
C
A
A
T
G
G
C
A
A
G
C
A
C
A
A
A
A
A
A
G
G
A
T
G
G
T
T
C
C
T
A
T
A
G
T
G
A
T
C
G
A
T
T
G
T
G
T
G
  6,000,120
  6,000,122
  6,001,611
  6,001,752
  6,001,762
  6,002,092
  6,003,528
  6,003,768
  6,003,818
  6,004,043
  6,004,498
  6,004,541
  6,004,554
  6,004,736
  6,004,941
  6,004,943
  6,004,979
  6,005,340
  6,005,834
  6,005,958
  6,006,042
  6,006,063
  6,006,134
  6,006,268
  6,006,731
  6,008,026
  6,008,436
  6,008,610
  6,008,997
  6,009,684
  6,010,038
  6,010,296
  6,010,545
  6,011,014
  6,011,229
  6,012,182
  6,012,696
  6,012,724
  6,012,822
  6,012,867
  6,012,888
  6,019,284
  6,021,341
  6,021,850
  6,022,352
  6,024,706
  6,025,070
  6,026,094
  6,026,304
  6,027,086
  6,027,130
  6,027,932
  6,028,149
  6,028,196
  6,028,223
  6,028,278
  6,028,432
  6,028,553
  6,028,641
  6,028,649
  6,029,055
  6,029,160
  6,029,162
  6,029,513
  6,029,547
  6,029,577
  6,029,614
  6,029,646
  6,029,729
  6,030,364
  6,030,370
  6,030,855
  6,031,788
  6,032,279
  6,032,581
  6,032,682
  6,032,692
  6,032,719
  6,032,720
  6,032,753
  6,032,790
  6,032,824
  6,033,226
  6,033,445
  6,033,526
  6,033,615
  6,033,694
  6,033,725
  6,034,710
  6,034,940
  6,035,193
  6,035,401
  6,035,464
  6,035,598
  6,035,600
  6,035,741
  6,035,790
  6,036,087
  6,036,265
  6,036,387
  6,036,800
  6,036,998
  6,037,157
  6,037,281
  6,037,929
  6,037,949
  6,037,981
  6,038,050
  6,038,302
  6,038,397
  6,038,670
  6,038,773
  6,038,866
  6,038,957
  6,039,195
  6,039,557
  6,039,599
  6,039,724
  6,039,818
  6,039,859
  6,039,945
  6,039,960
  6,040,151
  6,040,618
  6,040,742
  6,041,017
  6,041,085
  6,041,441
  6,041,596
  6,041,740
  6,042,463
  6,042,481
  6,042,593
  6,042,991
  6,043,075
  6,043,551
  6,044,069
  6,044,215
  6,044,321
  6,044,683
  6,044,698
  6,044,884
  6,044,887
  6,045,150
  6,045,241
  6,045,285
  6,045,349
  6,045,565
  6,045,613
  6,045,830
  6,045,948
  6,048,224
  6,048,986
  6,049,082
  6,049,337
  6,050,455
  6,050,939
  6,051,246
  6,051,426
  6,053,081
  6,053,104
  6,053,108
  6,053,506
  6,053,595
  6,053,914
  6,054,118
  6,054,337
  6,054,817
  6,054,975
  6,054,989
  6,055,247
  6,055,768
  6,056,227
  6,056,289
  6,056,543
  6,056,682
  6,056,954
  6,057,033
  6,057,135
  6,057,192
  6,058,546
  6,058,572
  6,058,573
  6,058,799
  6,058,830
  6,058,889
  6,058,975
  6,059,015
  6,059,167
  6,059,178
  6,059,204
  6,059,231
  6,071,166
  6,071,436
  6,071,505
  6,071,569
  6,071,611
  6,072,035
  6,072,064
  6,072,628
  6,073,256
  6,073,262
  6,073,287
  6,073,396
  6,073,487
  6,073,554
  6,073,672
  6,073,754
  6,074,223
  6,074,435
  6,074,576
  6,074,615
  6,074,623
  6,075,076
  6,075,177
  6,075,422
  6,075,709
  6,075,721
  6,076,478
  6,076,907
  6,077,016
  6,077,963
  6,078,650
  6,078,733
  6,078,833
  6,079,031
  6,079,062
  6,079,287
  6,079,610
  6,079,852
  6,080,108
  6,080,389
  6,080,465
  6,080,563
  6,080,925
  6,080,940
  6,082,200
  6,082,206
  6,082,236
  6,082,242
  6,082,248
  6,082,255
  6,082,319
  6,082,484
  6,082,642
  6,082,662
  6,082,869
  6,083,376
  6,083,378
  6,083,440
  6,083,492
  6,083,736
  6,084,247
  6,084,306
  6,084,460
  6,084,816
  6,085,248
  6,085,257
  6,086,444
  6,086,550
  6,086,595
  6,087,253
  6,087,407
  6,087,540
  6,087,779
  6,087,800
  6,088,492
  6,088,550
  6,088,836
  6,089,129
  6,089,271
  6,089,836
  6,089,869
  6,090,082
  6,090,149
  6,090,778
  6,090,840
  6,091,017
  6,092,718
  6,093,427
  6,093,462
  6,094,153
  6,095,237
  6,099,054
  6,100,382
  6,101,314
  6,103,003
  6,103,015
  6,103,034
  6,103,037
  6,105,142
  6,105,193
  6,105,686
  6,106,070
  6,106,203
  6,106,389
  6,107,041
  6,107,051
  6,107,056
  6,108,051
  6,108,272
  6,108,482
  6,108,648
  6,108,736
  6,109,196
  6,109,320
  6,109,464
  6,109,577
  6,109,643
  6,109,814
  6,109,890
  6,110,034
  6,110,692
  6,110,991
  6,112,168
  6,113,006
  6,113,539
  6,113,928
  6,115,034
  6,115,155
  6,115,519
  6,115,710
  6,116,136
  6,116,830
  6,119,221
  6,119,315
  6,119,720
  6,119,907
  6,119,979
  6,120,346
  6,121,072
  6,122,895
  6,123,524
  6,123,540
  6,123,634
  6,124,095
  6,124,251
  6,124,258
  6,124,269
  6,124,271
  6,124,988
  6,125,128
  6,127,555
  6,127,655
  6,127,702
  6,128,085
  6,128,392
  6,128,728
  6,128,857
  6,129,685
  6,130,288
  6,130,431
  6,130,543
  6,130,786
  6,130,913
  6,131,094
  6,131,331
  6,131,374
  6,131,890
  6,131,918
  6,132,133
  6,132,457
  6,132,551
  6,132,803
  6,132,912
  6,133,088
  6,133,424
  6,133,472
  6,133,490
  6,133,541
  6,133,873
  6,133,932
  6,134,035
  6,134,195
  6,134,317
  6,134,420
  6,134,897
  6,135,045
  6,135,131
  6,135,786
  6,136,023
  6,136,120
  6,136,164
  6,136,363
  6,136,675
  6,136,686
  6,136,835
  6,136,886
  6,137,425
  6,137,478
  6,137,512
  6,137,524
  6,137,525
  6,137,527
  6,137,578
  6,137,841
  6,138,003
  6,138,133
  6,138,554
  6,138,923
  6,139,526
  6,139,551
  6,139,688
  6,139,730
  6,139,801
  6,140,133
  6,140,172
  6,140,257
  6,140,328
  6,140,619
  6,140,994
  6,141,076
  6,141,540
  6,141,668
  6,142,988
  6,143,164
  6,143,304
  6,143,366
  6,144,232
  6,144,242
  6,144,444
  6,144,688
  6,144,857
  6,144,884
  6,144,887
  6,144,891
  6,144,941
  6,144,959
  6,144,975
  6,144,986
  6,144,993
  6,145,009
  6,145,020
  6,145,027
  6,145,057
  6,145,061
  6,145,077
  6,145,088
  6,145,122
  6,145,125
  6,145,551
  6,146,397
  6,146,708
  6,147,287
  6,149,294
  6,149,973
  6,150,135
  6,150,352
  6,150,951
  6,151,610
  6,152,658
  6,152,725
  6,153,150
  6,153,156
  6,153,446
  6,154,150
  6,154,520
  6,154,557
  6,154,574
  6,154,739
  6,154,994
  6,155,260
  6,155,707
  6,155,726
  6,155,931
  6,155,986
  6,156,208
  6,156,283
  6,156,564
  6,156,574
  6,158,098
  6,158,806
  6,164,024
  6,165,359
  6,165,601
  6,166,772
  6,167,641
  6,167,651
  6,168,045
  6,168,136
  6,169,672
  6,170,392
  6,170,485
  6,171,519
  6,171,750
  6,172,615
  6,173,009
  6,174,531
  6,175,463
  6,175,725
  6,176,203
  6,176,226
  6,176,309
  6,176,318
  6,176,432
  6,176,516
  6,176,615
G
A
T
T
G
C
A
G
A
G
T
A
T
T
C
A
G
T
A
T
A
C
T
A
A
G
A
T
T
G
A
A
T
A
G/A
T
C
A
C
G
G
T
G
G
C
A
C
A
T
C
C
T
G
G
A
T
T
C/T
G
T
C
C
G
C
C
G
T
G
C
T/G
G/A
C
A
G
T
G/A
G/T
C/A
C/G
A
T/C
T/C
G
C
A
T
T
T
T
T
C
T
T
C
C
T
T
C
G
T
A/G
C
A
T
A
T
T
A
G
A
G
A
T
T
G
G
C
C
A
C
G
C
T
A
T
G
G
C
G
C
C
G
C
T
A
C
T
T
T
T
A
T
G
T
T
G
G
G
T
A
T
C
C
A
C
A
C
G
G
T/C
G/C
C/G
A
T
T
T
C
C
A
C
G
A
C
T
T
G
C
G
G
C
T
T
G
C
C
G
A
A
T
T
T
G
C
A
T
A
T
G
C
A
G
T
C
T
G
G
G
C
T
G
G
A
C
T
G
G
C
C
G
G
A
A
C
A
A
C
A
G
G
C
T
C
C
G
G
G
A
A
G/A
G/A
G/A
T/C
G
A
T
C
C
G
T
C
A
G
A
T
G
G
C
A
G
T
G
A
T
A
G
C
C
C
G
C
C
A
A
A
A
G
T
T
T
A
T
C
T
T
G
C
G/A
G/A
A
A
A
G
A
A
C
T
C/T
T/C
T
C
G
C
C
T
C
C
C
G
A
T
G
G
C
A
G
G
T
G
A
G
C
C
T
T
A
G
T
C
G
G
A
T
G
T
A
C
G/A
T/A
A/T
A/G
T
G/A
G
C
T
A
T
C
G
C
A
G
T
C
T
T
T
T
C/T
A
C
A
C
T
C
G
C
C
T
T
C
T
G
G
T
A
G
G
C
C
A
G
T
A
G
G
G
C
C
T/C
T/A
A/T
C/T
G/T
A/C
G/T
G/C
G
C
A
T
C
A
C
C
G
T
A
A
G
A
A
T
C
C
C
C
G
A
T
C
A
C/T
A/G
T/C
C/T
C/T
C/T
C/T
A/G
C/T
C/T
A/G
C/T
T/C
C/T
C/T
G/A
A/G
C/T
C
G
G
A
A
A
A
A
C
T
G
G
C
T
A
T
G
G
C
T
G
T
C
G
C
G
C
G
A
A
T
C
A
T
G
C
T
T
C
G
C
C
A
C
A
C
C
G
T
C
C
C
T
A
A
G
A