Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 272,871 (bp)   Positions: 438
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.02
.001
.001
.001
.001
.066
.004
.025
.534
.007
.645
.0
.0
.0
.086
.0
.025
.918
.022
.005
--
.001
.315
.003
.018
.013
.0
.007
.001
.018
.001
.005
.305
.008
.097
.001
.001
.002
.003
.0
.002
--
--
--
--
--
--
--
--
.0
.001
.07
.001
.999
.007
.0
.344
.008
.947
--
--
.004
.0
.009
.003
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
.002
.59
.999
.05
.663
1.0
.929
.819
1.0
.995
1.0
.963
.041
.001
.087
.021
.566
.007
.067
.092
--
--
.001
.038
.015
.0
.024
.654
.004
.011
.007
.226
.009
--
.0
.001
.0
.004
.0
.0
.013
.044
.0
.009
.001
.005
.056
.013
.001
.0
.002
.006
.014
.0
.008
.005
.001
.0
.0
.0
.0
.001
.007
.001
.024
.004
.019
.0
.001
.0
.001
.002
.039
.997
.002
.0
.0
.0
.001
.0
.001
.001
.0
.0
.014
.0
.036
.001
.0
.001
.0
.01
.0
.306
.005
.0
.248
.001
.0
.006
.0
.002
.0
.0
.0
.001
.025
.0
.007
.041
.274
.001
.001
.018
.0
.0
.047
.066
.001
.013
.345
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
.002
.0
.0
.0
.003
.0
.0
.0
.486
1.0
.0
.0
.117
.098
.001
.982
.0
.003
.0
.029
.002
.0
.0
.0
.0
.981
.069
.467
.003
.005
.004
.0
--
--
--
.006
.001
.003
.003
.0
.004
.003
.004
.071
.001
.002
.0
.002
.001
.051
.024
.021
.004
.005
.027
.03
.0
.0
.006
.183
.001
.0
.011
.031
.001
.0
.001
.0
.932
.032
.021
--
.081
.604
.003
.027
.009
.001
.003
.003
.341
.33
.394
.022
.01
.007
.002
.0
.0
.012
.012
.0
.006
.0
--
--
--
--
--
--
.001
.171
.001
.006
--
--
--
--
--
--
.0
.0
.001
.012
.004
.004
.001
.6
.009
.002
.002
.0
.002
.001
.0
.003
.0
.0
.007
.0
.0
1.0
.0
.001
.007
.004
.005
.0
.001
.005
.0
.406
.001
.001
.002
.002
.178
.001
.0
.0
.021
.006
.308
.0
.0
.002
.0
.004
.0
.054
.004
.0
.001
.273
.038
.0
.002
.004
.001
.001
.01
.004
.0
.004
.005
.001
.117
.129
.0
.003
.453
.506
.051
.039
.004
.0
.0
.0
.0
.001
.0
.797
.091
.11
.002
.295
.431
.19
.112
.119
.082
.338
.001
.001
.0
.003
.018
.015
.201
.181
.0
.214
.0
.001
.008
.002
.275
.001
.0
.269
.003
.932
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Suclg2
Suclg2
Suclg2
Suclg2
Suclg2
Suclg2
Suclg2
Suclg2
Suclg2
Suclg2
Suclg2
Suclg2
Suclg2
Suclg2
Suclg2
Suclg2
Suclg2
Suclg2
Suclg2
Suclg2
Suclg2
Suclg2
Suclg2
Suclg2
Suclg2
Suclg2
Suclg2
Suclg2
Suclg2
Suclg2
Suclg2
Suclg2
Suclg2
Suclg2
Suclg2
Suclg2
Suclg2
Suclg2
Suclg2
Suclg2
Suclg2
Suclg2
Suclg2
Suclg2
G
A
C
T
G
A
T
C
G
G
A
G
C
T
A
T
G
T
A
T
C
C
T
G
C
T
T
G
T
C
T
T
A
C
T
G
A
C
G
T
C
T
C
G
T
G
T
A
T
C
G
C
C
T
T
A
T
A
C
A
A
G
C
G
G
G
C
G
T
A
G
A
C
C
T
T
G
A
T
C
A
A
T
C
T
T
C
T
C
A
G
A
T
C
T
G
A
A
A
T
T
T
T
A
T
T
G
A
A
T
G
C
A
C
T
T
A
T
T
C
A
T
A
A
T
T
C
C
A
A
A
C
C
A
G
A
G
A
C
A
C
A
G
A
G
C
T
G
G
G
C
C
C
A
C
T
G
T
G
C
C
C
A
G
A
T
T
G
C
T
A
A
G
C
T
G
C
G
T
T
G
T
C
T
G
T
G
T
T
C
G
C
T
A
T
C
A
A
A
A
C
G
C
G
T
A
G
G
G
T
A
C
C
G
T
A
C
T
T
G
T
G
T
T
T
G
A
C
C
C
T
T
C
A
A
T
T
T
C
A
T
A
T
T
A
G
C
C
C
T
A
C
T
G
T
G
T
A
C
T
A
A
T
A
A
T
C
T
C
A
T
T
G
C
G
G
A
A
C
G
A
C
A
G
A
A
A
T
A
A
A
A
A
C
A
C
A
A
A
A
T
T
A
T
G
G
A
C
T
G
T
C
C
G
T
A
G
G
G
T
T
T
T
T
C
A
T
T
G
A
T
T
T
C
A
C
T
A
C
G
A
A
A
G
G
C
C
C
T
A
T
C
C
C
C
G
A
C
C
G
T
C
C
A
T
C
C
T
G
A
C
A
C
A
G
C
G
T
A
T
C
A
C
A
G
C
A
G
G
G
G
C
G
G
T
T
G
T
C
G
T
A
G
T
G
C
T
G
G
C
A
A
G
T
G
A
C
T
G
T
G
A
A
A
A
C
A
A
T
C
G
T
C
A
G
T
A
G
  127,552,529
  127,553,217
  127,553,313
  127,553,322
  127,553,531
  127,553,645
  127,560,758
  127,561,231
  127,561,470
  127,561,627
  127,562,140
  127,562,516
  127,562,644
  127,562,757
  127,562,951
  127,563,603
  127,564,427
  127,564,850
  127,565,812
  127,565,820
  127,565,830
  127,567,733
  127,568,233
  127,568,602
  127,568,706
  127,569,593
  127,571,028
  127,571,914
  127,572,413
  127,573,228
  127,575,089
  127,575,349
  127,575,537
  127,575,630
  127,575,818
  127,576,199
  127,576,529
  127,576,622
  127,577,422
  127,577,936
  127,578,740
  127,581,626
  127,581,859
  127,582,542
  127,582,909
  127,584,770
  127,585,999
  127,586,481
  127,587,076
  127,587,791
  127,587,839
  127,588,401
  127,591,070
  127,592,669
  127,592,822
  127,593,105
  127,595,606
  127,596,287
  127,597,133
  127,598,188
  127,598,373
  127,599,551
  127,599,596
  127,599,688
  127,601,522
  127,602,005
  127,602,078
  127,602,461
  127,602,558
  127,603,221
  127,603,602
  127,603,907
  127,604,223
  127,604,942
  127,605,109
  127,605,571
  127,606,361
  127,606,569
  127,606,572
  127,606,790
  127,606,857
  127,606,893
  127,607,731
  127,608,335
  127,609,147
  127,609,945
  127,610,504
  127,610,546
  127,610,685
  127,610,721
  127,610,737
  127,610,808
  127,610,810
  127,610,963
  127,611,006
  127,611,031
  127,611,241
  127,611,357
  127,611,583
  127,612,234
  127,614,838
  127,614,862
  127,614,892
  127,615,850
  127,615,997
  127,616,223
  127,616,269
  127,618,225
  127,619,757
  127,625,734
  127,632,279
  127,632,741
  127,632,828
  127,633,354
  127,634,015
  127,634,848
  127,635,251
  127,635,933
  127,636,208
  127,636,389
  127,636,625
  127,636,963
  127,637,156
  127,637,354
  127,638,511
  127,638,661
  127,639,480
  127,639,805
  127,639,924
  127,639,968
  127,640,179
  127,640,491
  127,640,618
  127,640,887
  127,641,041
  127,641,183
  127,641,253
  127,641,583
  127,641,663
  127,641,729
  127,642,008
  127,642,033
  127,642,162
  127,642,226
  127,642,319
  127,642,331
  127,642,439
  127,642,976
  127,643,016
  127,643,168
  127,643,389
  127,643,393
  127,643,411
  127,644,050
  127,644,190
  127,644,244
  127,644,309
  127,644,453
  127,644,611
  127,644,749
  127,644,867
  127,644,928
  127,644,929
  127,645,127
  127,645,148
  127,645,513
  127,645,543
  127,645,643
  127,645,775
  127,645,886
  127,645,975
  127,646,015
  127,646,028
  127,646,144
  127,646,267
  127,646,315
  127,646,567
  127,646,646
  127,648,578
  127,649,810
  127,650,162
  127,650,767
  127,651,061
  127,651,309
  127,651,484
  127,653,135
  127,653,434
  127,653,517
  127,654,559
  127,655,686
  127,655,929
  127,656,290
  127,656,574
  127,657,256
  127,657,986
  127,658,189
  127,659,084
  127,660,181
  127,660,633
  127,661,267
  127,662,845
  127,662,961
  127,663,088
  127,664,605
  127,664,694
  127,665,939
  127,666,671
  127,667,025
  127,667,713
  127,668,089
  127,669,134
  127,669,155
  127,670,933
  127,671,106
  127,673,524
  127,673,858
  127,673,988
  127,674,826
  127,675,156
  127,676,403
  127,677,345
  127,677,496
  127,677,722
  127,678,052
  127,678,355
  127,678,760
  127,678,766
  127,678,870
  127,679,646
  127,679,720
  127,679,817
  127,680,284
  127,680,329
  127,680,428
  127,681,315
  127,681,638
  127,682,008
  127,682,115
  127,682,216
  127,682,230
  127,682,358
  127,682,636
  127,682,806
  127,683,331
  127,683,752
  127,683,767
  127,684,012
  127,685,487
  127,685,518
  127,686,777
  127,693,828
  127,694,207
  127,694,266
  127,695,049
  127,695,233
  127,695,291
  127,695,413
  127,695,502
  127,695,902
  127,696,347
  127,696,539
  127,697,064
  127,697,118
  127,697,445
  127,697,841
  127,698,067
  127,698,089
  127,698,097
  127,698,104
  127,698,558
  127,698,588
  127,698,731
  127,698,732
  127,698,755
  127,699,867
  127,699,926
  127,700,072
  127,700,135
  127,700,148
  127,700,236
  127,700,299
  127,700,314
  127,700,679
  127,701,027
  127,701,266
  127,701,270
  127,701,606
  127,701,796
  127,701,914
  127,702,009
  127,702,014
  127,702,019
  127,702,090
  127,702,098
  127,702,374
  127,702,412
  127,702,413
  127,702,711
  127,702,874
  127,703,077
  127,703,125
  127,703,285
  127,703,357
  127,703,360
  127,703,432
  127,703,579
  127,703,792
  127,704,123
  127,704,262
  127,704,598
  127,704,631
  127,704,638
  127,704,639
  127,704,671
  127,704,672
  127,705,088
  127,705,221
  127,705,468
  127,705,939
  127,706,342
  127,706,348
  127,706,366
  127,706,516
  127,706,546
  127,706,547
  127,707,407
  127,707,441
  127,707,610
  127,707,613
  127,707,710
  127,707,755
  127,707,794
  127,707,951
  127,708,249
  127,708,271
  127,708,317
  127,708,345
  127,708,401
  127,708,425
  127,708,583
  127,708,661
  127,708,668
  127,708,748
  127,708,780
  127,708,842
  127,708,843
  127,708,954
  127,709,225
  127,709,329
  127,709,440
  127,710,205
  127,711,011
  127,711,130
  127,711,209
  127,711,265
  127,711,277
  127,711,289
  127,711,571
  127,711,582
  127,711,586
  127,711,676
  127,712,456
  127,712,767
  127,712,839
  127,713,858
  127,714,061
  127,714,504
  127,714,593
  127,714,847
  127,715,075
  127,715,106
  127,715,145
  127,715,564
  127,715,595
  127,715,937
  127,715,991
  127,716,408
  127,716,468
  127,716,778
  127,716,884
  127,717,853
  127,719,707
  127,719,714
  127,719,719
  127,719,747
  127,721,625
  127,722,291
  127,723,362
  127,723,570
  127,724,033
  127,724,265
  127,724,398
  127,724,400
  127,724,888
  127,725,421
  127,725,693
  127,725,706
  127,726,138
  127,726,139
  127,727,178
  127,727,818
  127,727,858
  127,728,409
  127,728,660
  127,728,998
  127,729,373
  127,729,884
  127,730,732
  127,730,860
  127,730,898
  127,731,102
  127,731,117
  127,731,157
  127,731,171
  127,731,177
  127,731,647
  127,732,691
  127,733,095
  127,733,616
  127,733,788
  127,733,899
  127,733,982
  127,733,997
  127,734,033
  127,734,038
  127,734,275
  127,734,501
  127,734,676
  127,735,017
  127,735,058
  127,735,074
  127,735,190
  127,735,384
  127,735,594
  127,735,736
  127,736,574
  127,783,873
  127,823,152
A
G
T
A
C
G
C
G
A
T
T
A
T
C
G
C
A
C
A/G
C
C/T
T
T/G
A
A
C
C
C
C
T
C
C
T
T
C
C
G
T
A
C
T
C
T
A
G
C
C
G
C
T
A
A
T
C
C
C
C
G
G
A/G
A/G
C
T
G/A
A
G/A
C/A
G/T
T/A
A/T
A
A/C
C/T
C/A
C
C
A
A/T
T/C
C/G
A/T
A/T
A
T
C
C
C/T
T/C
C/T
A/T
G/A
A/G
T/C
C/T
T/C
G/A
G
G
G
C
C
C
C
A/G
G
C
C
G
G
C
A
A
C
T
C
C
G
G
C
T
G
G
T
C
C
C
G
T
G
G
T
T
T
T
A
G
A
G
T
T
T
T
A
G
C
T
C
T
C
C
A
T
T
G
G
A
T
C
A
A
A
T
G
C
G
G
C
A
T
C
G
G
C
G
C
C
A
A
C
G
A
C
T
C
T
C
C
G
C
T
C
T
C
C
A
A
G
G
C
T
T
A
G
T
C
G
A
G/A
G/A
T/C
A/G
C/T
C/T
G/A
T/C
T
A
G
G
A
A
T
C
C
A
C
G
T
T
T
G
C
T
C
T
C
C
C
T
G
C
T
C
G
T
A
T
C/T
C/T
T/A
G
T
G
A
C
A
A
G
T
A
G
C
C
G
C
C
T
C
T
G
T/C
C
A
T
A
A
T
G
A
A
G
G
G
A
G
G
T
C
G
A/G
G
A/G
G
A
T
T
G
G
G
C
A
C
G
C
A
C
G
T
C
G/C
G
C/G
C/A
G/A
T/A
G
A
A
A
T/C
T/C
T/C
C
T/C
C/G
C
C
C
A
G
C
G
A
T
T
A
A
G
T
A
G
G
G
A
A
T
T
T
C
G
A
G
G
T
T
A
C
T
A
C
A
T
G
T
G
T
T
C
A
G
A
G
C/T
G
C
T
C
A
G
G
A
C
T
G
A
T
C
A
A
C
A
C/G
G/C
A
G
T/C
G/C
A
G
A
C
G
A
C
A
G
A
A
A
A
A/T
G
G/A
G
G/A
C
T
G
T
A
A
G
G
G
G
T
G
G
G
T
A
C
T
G
A
A
A/G
C