Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 384,640 (bp)   Positions: 357
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.402
.0
.0
.752
.029
.047
.0
.001
.09
.003
.008
.022
.001
.001
.003
.004
.0
.014
.301
.23
.178
.397
.003
.118
.927
.005
.009
.027
--
--
--
--
--
.163
.027
--
--
.0
.012
.022
.112
.042
.001
.002
--
--
.05
.006
.154
.023
.019
.651
.01
.0
.0
.04
.257
.005
.021
.031
.075
.314
.034
.153
.019
.001
.008
.003
.016
.222
.096
.204
.122
.297
.46
.055
.005
.005
.071
.439
.227
.018
--
.007
.024
.01
.01
.026
.288
.018
.254
--
--
--
.939
.134
.254
.02
.037
.005
.004
.035
.006
.063
.048
.001
.008
.143
.099
.02
.19
.002
.003
.23
.004
--
.0
.003
.051
.001
.0
.003
.012
.001
.416
.011
.052
.02
.062
.022
--
--
--
--
.421
.006
.041
.154
.029
.001
.005
.004
.014
.005
.047
.006
.023
--
--
.025
--
--
.055
.571
.581
.08
.014
.213
.01
.019
--
.053
--
--
--
--
--
.585
.0
.035
.001
.024
.0
.009
.01
.001
.008
.001
.004
.002
.037
.009
.079
.013
.054
.015
.03
.039
.093
.639
.228
.042
--
--
--
.001
.005
.019
.001
.07
.0
.009
.019
.04
.138
.018
--
.002
.0
.001
.053
.729
.117
.003
--
--
--
--
.022
.106
.007
.394
.012
.133
.001
.012
.0
.014
.0
.572
.072
.014
.028
--
--
--
--
--
--
.041
.014
.313
.003
.007
.006
.073
.005
.002
.225
.012
.127
.019
.041
.03
.013
.082
.162
.112
1.0
--
.009
.015
.0
.0
.055
.022
.005
.009
.301
.25
--
.026
.471
.019
.025
--
.053
.192
.019
.104
--
.158
.015
.008
.028
.046
--
--
.001
.001
.047
.003
.239
.003
.001
.001
--
--
.004
.265
.007
.017
.006
.751
.069
--
.0
.004
.0
.36
.025
--
.001
.001
--
.001
.102
.013
.0
.0
.003
.003
.009
.007
.002
--
--
.206
.004
.016
.017
--
--
.092
.007
.001
.09
.002
--
.023
.001
.004
--
.005
.008
.01
--
.0
.043
.001
.032
.077
.002
.0
.003
--
.001
Stag1
Stag1
Stag1
Stag1
Stag1
Stag1
Stag1
Stag1
Stag1
Stag1
Stag1
Stag1
Stag1
Stag1
Stag1
Stag1
Stag1
Stag1
Stag1
Stag1
Stag1
Stag1
Stag1
Stag1
Stag1
Stag1
Stag1
Stag1
Stag1
Stag1
Stag1
Stag1
Stag1
Stag1
Stag1
Stag1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
A
T
C
C
C
A
C
G
C
T
C
T
A
C
T
T
A
G
G
C
T
G
C
C
C
G
T
A
G
A
C
A
T
C
A
C
T
T
T
C
G
C
G
C
G
G
C
G
G
C
A
C
T
G
T
A
T
T
T
A
A
A
T
T
A
C
A
T
T
G
C
G
T
C
G
C
C
G
A
G
T
C
C
T
G
C
T
C
A
C
T
C
A
T
A
A
C
C
T
A
G
T
C
C
T
G
C
A
A
G
C
G
T
C
C
G
G
G
C
T
T
A
G
G
C
T
A
G
G
T
A
T
C
G
G
T
T
T
T
T
T
A
A
C
T
T
A
G
A
T
T
G
T
G
C
C
C
T
G
G
T
A
T
A
T
T
G
G
C
A
G
C
C
A
C
T
A
G
C
G
G
A
C
G
T
T
A
G
T
T
C
T
A
C
G
A
T
C
T
T
T
T
A
G
G
T
C
C
A
G
C
T
C
A
A
C
C
T
G
G
G
C
A
T
A
A
G
G
G
T
A
C
T
G
T
T
A
A
G
A
T
G
G
G
G
G
G
C
A
T
C
A
A
C
C
G
A
T
T
A
A
G
A
G
C
A
A
T
C
G
G
A
T
G
C
T
C
T
T
A
G
G
A
C
C
C
G
G
T
A
A
C
C
G
A
C
A
T
C
T
G
T
G
G
C
G
C
G
T
A
T
T
G
T
G
A
T
G
A
T
C
T
G
G
C
G
G
C
C
A
T
A
C
A
G
G
A
A
A
T
A
A
A
T
T
T
T
G
G
G
G
G
G
T
G
C
G
  108,959,607
  108,959,808
  108,959,981
  108,960,111
  108,960,657
  108,960,864
  108,961,488
  108,961,505
  108,962,171
  108,963,261
  108,963,543
  108,965,787
  108,966,099
  108,966,551
  108,967,974
  108,968,632
  108,970,446
  108,970,466
  108,974,164
  108,974,183
  108,974,740
  108,974,799
  108,974,894
  108,974,985
  108,975,480
  108,975,896
  108,977,529
  108,977,934
  108,980,513
  108,980,948
  108,981,810
  108,982,011
  108,982,203
  108,982,482
  108,982,732
  108,985,810
  108,985,819
  108,989,339
  108,989,529
  108,989,719
  108,991,269
  108,991,288
  108,993,646
  108,995,613
  108,996,891
  108,996,892
  108,997,042
  108,997,776
  108,998,499
  108,998,556
  108,999,026
  108,999,866
  109,000,635
  109,000,895
  109,001,618
  109,002,034
  109,003,399
  109,004,155
  109,004,239
  109,005,262
  109,005,655
  109,007,392
  109,007,450
  109,007,667
  109,016,810
  109,016,824
  109,016,900
  109,016,937
  109,016,982
  109,017,033
  109,017,160
  109,017,168
  109,017,206
  109,017,465
  109,017,506
  109,017,517
  109,017,680
  109,017,744
  109,018,625
  109,018,968
  109,019,254
  109,020,137
  109,020,963
  109,021,084
  109,021,465
  109,021,540
  109,021,554
  109,021,559
  109,021,893
  109,022,144
  109,022,250
  109,022,813
  109,023,187
  109,025,233
  109,026,577
  109,027,013
  109,027,061
  109,034,723
  109,034,971
  109,035,370
  109,035,380
  109,035,751
  109,035,810
  109,036,965
  109,037,658
  109,037,798
  109,038,692
  109,039,819
  109,040,422
  109,040,455
  109,040,526
  109,040,609
  109,041,492
  109,041,682
  109,042,099
  109,043,061
  109,045,865
  109,046,739
  109,046,903
  109,049,356
  109,049,782
  109,049,813
  109,050,287
  109,051,026
  109,051,589
  109,054,712
  109,056,017
  109,056,855
  109,057,018
  109,057,195
  109,059,509
  109,059,951
  109,060,746
  109,061,589
  109,062,056
  109,062,415
  109,064,217
  109,064,437
  109,064,959
  109,065,265
  109,065,839
  109,067,306
  109,067,395
  109,067,557
  109,068,098
  109,068,313
  109,070,393
  109,070,920
  109,071,434
  109,072,271
  109,072,576
  109,073,115
  109,073,956
  109,074,013
  109,074,014
  109,074,063
  109,074,289
  109,076,186
  109,076,918
  109,076,928
  109,078,384
  109,079,759
  109,079,938
  109,080,622
  109,080,890
  109,081,466
  109,081,709
  109,083,192
  109,084,048
  109,084,819
  109,085,281
  109,085,463
  109,085,596
  109,085,966
  109,086,055
  109,086,922
  109,086,993
  109,087,094
  109,090,149
  109,090,297
  109,092,013
  109,092,830
  109,093,640
  109,093,708
  109,094,473
  109,095,643
  109,095,889
  109,098,645
  109,098,881
  109,099,872
  109,100,326
  109,100,571
  109,100,872
  109,101,078
  109,103,737
  109,105,013
  109,105,674
  109,106,463
  109,107,190
  109,109,452
  109,109,494
  109,109,601
  109,110,429
  109,111,083
  109,111,270
  109,111,462
  109,112,377
  109,112,851
  109,113,852
  109,114,243
  109,114,507
  109,115,623
  109,116,929
  109,117,074
  109,118,205
  109,118,211
  109,119,425
  109,120,219
  109,121,039
  109,122,621
  109,123,020
  109,123,240
  109,123,471
  109,123,536
  109,123,623
  109,123,653
  109,123,922
  109,124,164
  109,124,239
  109,125,385
  109,128,712
  109,129,779
  109,131,387
  109,132,830
  109,133,277
  109,133,279
  109,133,759
  109,133,772
  109,133,777
  109,134,839
  109,135,015
  109,135,049
  109,135,235
  109,135,249
  109,135,744
  109,137,033
  109,137,149
  109,137,458
  109,137,841
  109,137,994
  109,139,595
  109,140,444
  109,141,287
  109,141,504
  109,142,325
  109,142,385
  109,142,411
  109,145,220
  109,145,454
  109,147,425
  109,149,752
  109,149,985
  109,150,014
  109,151,552
  109,152,904
  109,155,629
  109,158,846
  109,159,006
  109,159,651
  109,159,659
  109,161,229
  109,162,063
  109,163,535
  109,164,003
  109,164,853
  109,171,545
  109,171,679
  109,171,696
  109,171,773
  109,172,026
  109,173,818
  109,174,562
  109,176,452
  109,177,284
  109,181,972
  109,183,973
  109,185,213
  109,186,300
  109,189,136
  109,189,837
  109,190,407
  109,190,455
  109,190,538
  109,190,947
  109,193,478
  109,193,479
  109,196,886
  109,198,713
  109,199,106
  109,200,097
  109,202,188
  109,202,995
  109,203,613
  109,205,176
  109,206,100
  109,206,875
  109,208,980
  109,209,606
  109,213,823
  109,216,085
  109,216,107
  109,222,625
  109,227,668
  109,231,724
  109,233,744
  109,235,034
  109,236,976
  109,237,738
  109,238,757
  109,243,013
  109,247,896
  109,252,111
  109,253,759
  109,264,143
  109,264,658
  109,273,898
  109,282,856
  109,283,461
  109,284,237
  109,284,541
  109,284,780
  109,296,963
  109,300,275
  109,301,441
  109,304,807
  109,305,825
  109,307,469
  109,307,527
  109,311,687
  109,314,297
  109,316,320
  109,317,004
  109,320,776
  109,322,464
  109,322,466
  109,322,468
  109,324,099
  109,325,774
  109,326,209
  109,326,242
  109,326,261
  109,328,394
  109,331,300
  109,331,403
  109,331,431
  109,333,007
  109,339,135
T
C
T
A
T
G
T
A
T
C
T
C
G
T
C
C
G
A
A
G
G
A
T
T
T
A
C
G
A
T
T
G
A
T
T
T
C
C
C
G
A
A
A
T
A
A
T
A
A
T
T
A
C
A
C
G
A
C
C
T
G
G
G
A
C
T
C
A
C
T
T
T
A
A
A
A
T
C
C
A
C
A
T
A
T
G
C
A
G
T
C
T
G
A
C
G
T
T
C
G
C
C
T
A
C
A
G
C
T
A
G
C
C
T
T
A
C
A
T
C
C
G
A
A
G
C
G
T
T
C
G
A
T
C
A
C
G
C
C
C
C
G
T
T
G
A
G
T
G
C
C
C
C
T
T
T
T
C
A
C
A
T
C
T
A
C
A
C
T
C
A
A
A
G
T
C
G
A
A
A
A
G
T
A
A
A
G
A
A
C
T
G
G
T
A
G
A
T
G
C
A
G
G
A
A
C
T
T
G
A
T
G
T
C
G
G
T
C
A
T
A
A
C
G
C
G
T
A
C
C
C
T
C
A
G
G
C
T
A
T
A
A
C
A
T
T
A
A
G
A
T
T
G
A
T
A
C
C
C
G
G
T
T
T
A
G
C
C
T
A
T
G
C
C
T
A
T
A
C
G
T
A
G
G
T
T
A
A
C
G
T
T
A
T
T
T
G
C
A
C
T
C
T
A
T
C
T
A
C
C
G
C
A
A
T
G
C
A
T
C
G
C
T
T
T
A
A
G
T
C
A
C
G
C
A
A
T
T
G
C
G
G
G
C
C
C
A
C
A
C
A
A
A
C
A
G
C