Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 182,226 (bp)   Positions: 591
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.0
.047
.0
.0
.001
.0
.029
.0
.0
.0
.099
.013
.026
.999
.035
.898
.75
.0
.0
.005
.001
.0
.002
.0
.001
.0
.0
.0
.019
.0
.0
.005
.0
.004
.0
.062
.067
.097
.058
.334
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.009
.006
.0
.004
.0
.042
.025
.094
.003
.001
.001
.536
.093
.169
.013
.995
.026
.179
.001
.0
.065
.001
.0
.001
.001
.0
.0
.001
.0
.0
.0
.0
.001
.002
.0
.0
.001
.041
.6
.593
.0
.0
.001
.964
.995
.997
.0
.0
.0
.011
.0
.001
.0
.0
.001
.0
.002
.0
.0
.007
.013
.013
.001
.006
.002
.003
.005
.004
.003
.011
.046
.088
.001
.463
.002
.145
.459
.006
.006
.003
.0
.002
.0
.0
.001
.0
.0
.0
.0
.0
.001
.0
.003
.002
.086
.0
.04
.003
.989
.053
.007
.057
.586
.08
.016
.029
.045
.097
.141
.064
.005
.029
.003
.142
.002
.0
.0
.0
.0
.003
.0
.0
.0
.0
.003
.003
.0
.0
.019
.002
.0
.002
.0
.004
.0
.02
.144
.004
.018
.011
.012
.002
.014
.001
.009
.001
.001
.001
.001
.993
.999
.948
.29
.0
.001
.34
.335
.0
.003
.0
.315
.071
.043
.002
.065
.0
.0
.0
.0
.002
.0
.012
.01
1.0
.0
.0
.0
.0
.0
.893
.936
.004
.001
.009
.02
.001
.0
.089
.002
.0
.026
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.0
.688
.992
.0
1.0
1.0
1.0
.0
.993
.0
.003
.052
.06
.073
.0
.001
.001
.0
.0
.071
.001
.202
.792
.0
.005
.001
.0
.002
.0
.002
.019
.002
.002
.074
.062
.039
.026
.998
.0
.0
.0
.0
.003
.003
.0
.0
.001
.0
.001
.001
.005
.001
.006
.001
.012
.008
.003
.001
.037
.0
.0
.0
.001
.0
.0
.0
.0
.005
.002
.001
.001
.046
.001
.008
.023
.0
.005
.001
.003
.07
.006
.006
.001
.021
.081
.023
.007
.077
.067
.399
.49
--
--
--
.023
.018
.006
.002
.001
.058
.001
.008
.0
.989
.0
.0
.0
.0
.0
.001
.0
.0
.573
.567
.0
.042
.001
.001
.005
.001
.001
.003
.001
.039
.161
.001
.001
.005
.007
.223
.008
.0
.0
.004
.008
.156
.094
.028
.021
.022
.0
.004
.0
.0
.0
.0
.207
.373
.001
.001
.0
.0
.003
.002
.0
.002
.07
.001
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.001
.001
.003
.0
.0
.0
.0
.003
.0
.0
.001
.001
--
.064
.016
.0
.0
.0
.0
.034
.036
.378
.003
.064
.0
.0
.0
.0
.007
.004
.002
.0
.001
.01
.016
.001
.041
.0
.979
.954
.167
.181
.014
.025
.092
.038
.039
.042
.133
.031
.0
.986
.189
.002
.042
.033
.016
.008
.003
.0
.0
.0
.003
--
--
--
.0
.004
.0
.008
.001
.0
.011
1.0
.001
.006
.047
.014
.044
.0
.0
.005
.001
.0
.0
.003
.0
.001
.0
.0
.015
.017
.004
.05
.0
.028
.0
.001
.003
.006
.001
.004
.048
.0
.0
.0
.02
.0
.03
.0
.009
.004
.013
.036
.014
.012
.0
.016
.001
.015
.067
.003
.004
.067
.0
.002
.002
.001
.012
.001
.0
.0
1.0
.002
.0
.0
.0
.012
.003
.034
.0
.809
.005
.0
.0
.017
.007
.0
.027
.47
.038
.044
.081
.014
.004
.013
.125
.002
.0
.001
.006
.354
.253
.003
.002
.024
.147
.057
.077
.021
.001
.08
.001
.001
.001
.031
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Adnp2l1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Stab2
Stab2
Stab2
Stab2
Stab2
Stab2
Stab2
Stab2
Stab2
Stab2
Stab2
Stab2
Stab2
Stab2
Stab2
Stab2
Stab2
Stab2
Stab2
Stab2
Stab2
Stab2
Stab2
Stab2
Stab2
Stab2
Stab2
Stab2
Stab2
Stab2
Stab2
Stab2
Stab2
Stab2
Stab2
Stab2
Stab2
Stab2
Stab2
Stab2
Stab2
Stab2
Stab2
Stab2
Stab2
Stab2
Stab2
Stab2
Stab2
Stab2
Stab2
Stab2
Stab2
Stab2
Stab2
Stab2
Stab2
Stab2
Stab2
Stab2
A
T
T
C
C
G
T
T
C
T
T
C
A
G
A
C
A
T
T
C
C
G
G
T
T
C
A
A
G
T
G
G
T
G
T
A
T
C
G
T
C
G
G
C
C
A
G
A
A
A
G
A
T
G
A
A
T
C
G
A
T
T
C
T
T
A
C
G
A
T
G
G
C
C
A
G
C
G
C
C
T
T
G
A
C
G
C
C
C
C
C
C
G
A
A
C
C
A
T
T
T
A
A
T
C
T
G
G
A
G
A
T
A
C
C
T
T
T
C
T
A
C
C
C
A
T
A
C
T
T
G
C
T
C
T
C
T
T
G
T
G
C
T
A
C
T
G
T
C
T
C
A
C
C
T
T
C
C
C
T
C
T
T
T
T
C
C
T
G
C
C
C
A
C
G
G
C
G
T
G
A
C
G
G
C
A
G
T
T
A
A
A
A
T
G
C
G
A
C
G
C
A
C
A
G
C
A
T
G
T
G
C
G
T
A
A
G
A
C
C
G
A
G
G
T
G
G
A
A
T
T
G
G
G
G
C
C
T
T
A
C
T
C
G
G
A
C
A
T
G
C
A
G
A
T
C
A
C
T
C
C
G
G
A
G
C
G
T
G
C
A
G
G
G
T
A
A
T
A
C
T
T
T
A
A
A
A
A
G
A
G
T
C
C
C
A
G
G
C
C
T
C
C
A
A
C
C
C
T
A
C
T
C
T
G
A
A
T
G
G
T
A
T
C
A
A
G
T
T
C
T
C
C
T
G
A
T
C
G
A
C
T
A
G
A
T
G
A
T
G
T
T
G
A
A
C
A
C
A
A
G
C
T
G
A
A
A
G
C
T
G
C
C
C
G
C
A
G
G
A
A
G
C
A
T
C
C
G
T
T
G
A
A
G
A
G
C
T
T
T
G
G
T
A
G
C
C
G
T
A
T
C
G
T
G
G
G
T
G
C
G
G
G
A
A
T
T
A
A
G
A
T
G
T
A
T
C
A
G
T
G
A
C
C
C
T
T
C
G
G
T
A
T
C
C
T
T
C
A
T
A
C
C
A
A
C
C
C
G
G
G
A
T
A
G
A
G
A
G
C
T
C
A
C
A
A
C
G
T
T
A
T
C
G
C
C
T
G
G
A
T
G
T
C
G
G
T
C
A
T
G
T
G
T
G
A
T
C
G
A
T
G
T
G
T
A
T
C
C
T
T
C
C
A
C
G
T
T
G
T
T
T
T
G
G
C
C
G
G
T
A
A
C
A
T
C
C
A
A
G
A
C
T
A
A
G
G
G
C
T
T
C
C
T
G
T
G
C
C
C
G
A
T
G
C
C
G
A
T
G
T
  27,372,164
  27,372,639
  27,373,150
  27,374,231
  27,374,446
  27,374,874
  27,375,583
  27,375,660
  27,375,685
  27,376,389
  27,377,148
  27,377,215
  27,377,318
  27,380,843
  27,383,068
  27,386,035
  27,386,111
  27,386,166
  27,386,179
  27,386,260
  27,386,706
  27,391,761
  27,392,076
  27,392,937
  27,392,993
  27,393,323
  27,396,458
  27,396,767
  27,396,813
  27,396,862
  27,396,909
  27,396,949
  27,397,006
  27,397,024
  27,397,053
  27,397,068
  27,397,069
  27,397,096
  27,397,230
  27,397,387
  27,397,477
  27,397,707
  27,397,778
  27,398,104
  27,398,122
  27,398,130
  27,398,164
  27,398,227
  27,398,281
  27,398,311
  27,398,501
  27,398,643
  27,398,872
  27,399,155
  27,399,279
  27,399,887
  27,400,166
  27,400,683
  27,405,184
  27,405,272
  27,405,581
  27,407,359
  27,408,954
  27,410,139
  27,410,444
  27,410,866
  27,410,923
  27,410,984
  27,411,040
  27,411,164
  27,411,213
  27,411,236
  27,411,267
  27,411,439
  27,411,527
  27,411,839
  27,411,870
  27,411,872
  27,411,873
  27,411,888
  27,411,922
  27,411,930
  27,411,947
  27,412,001
  27,412,157
  27,412,302
  27,412,309
  27,412,343
  27,412,381
  27,412,392
  27,412,516
  27,412,531
  27,412,543
  27,412,598
  27,412,614
  27,412,666
  27,412,671
  27,412,751
  27,412,817
  27,412,917
  27,412,931
  27,412,950
  27,412,954
  27,413,018
  27,413,023
  27,413,048
  27,413,181
  27,413,184
  27,413,308
  27,413,392
  27,413,416
  27,413,421
  27,413,424
  27,413,437
  27,413,461
  27,413,467
  27,413,542
  27,413,547
  27,413,566
  27,413,595
  27,413,609
  27,413,626
  27,413,658
  27,413,792
  27,413,825
  27,413,846
  27,413,852
  27,413,869
  27,413,876
  27,413,950
  27,413,951
  27,413,954
  27,413,973
  27,414,020
  27,414,050
  27,414,053
  27,414,066
  27,414,073
  27,414,082
  27,414,086
  27,414,228
  27,414,242
  27,414,262
  27,414,476
  27,414,935
  27,415,032
  27,415,099
  27,415,118
  27,415,138
  27,415,223
  27,415,279
  27,415,298
  27,415,300
  27,415,338
  27,415,432
  27,415,460
  27,415,508
  27,415,526
  27,415,597
  27,415,808
  27,415,882
  27,416,028
  27,416,090
  27,416,098
  27,416,276
  27,416,283
  27,416,327
  27,416,579
  27,416,974
  27,417,139
  27,417,180
  27,417,184
  27,417,185
  27,417,192
  27,417,206
  27,417,691
  27,418,335
  27,418,720
  27,418,882
  27,419,114
  27,419,316
  27,419,424
  27,420,905
  27,421,016
  27,421,458
  27,421,541
  27,421,678
  27,421,758
  27,421,917
  27,421,929
  27,422,138
  27,422,192
  27,422,334
  27,422,576
  27,422,582
  27,422,665
  27,422,706
  27,422,709
  27,422,769
  27,422,772
  27,423,085
  27,423,089
  27,423,158
  27,424,258
  27,424,380
  27,424,819
  27,424,845
  27,425,118
  27,425,584
  27,425,934
  27,426,024
  27,426,056
  27,426,325
  27,426,601
  27,426,696
  27,426,929
  27,427,112
  27,427,154
  27,427,223
  27,427,270
  27,427,873
  27,427,965
  27,427,982
  27,427,995
  27,428,153
  27,428,154
  27,428,167
  27,428,169
  27,428,225
  27,428,247
  27,428,551
  27,428,555
  27,428,655
  27,429,014
  27,429,128
  27,429,460
  27,429,594
  27,429,671
  27,429,729
  27,430,183
  27,430,380
  27,430,394
  27,430,656
  27,430,726
  27,431,279
  27,431,387
  27,431,479
  27,431,927
  27,431,956
  27,431,963
  27,433,078
  27,434,094
  27,434,251
  27,434,293
  27,434,387
  27,434,944
  27,435,020
  27,435,849
  27,435,925
  27,435,992
  27,436,098
  27,436,173
  27,436,199
  27,436,211
  27,436,249
  27,436,274
  27,436,340
  27,436,358
  27,436,359
  27,437,136
  27,437,153
  27,439,871
  27,440,518
  27,443,365
  27,444,496
  27,446,738
  27,447,595
  27,447,675
  27,447,869
  27,447,938
  27,449,252
  27,449,432
  27,449,879
  27,449,965
  27,450,491
  27,450,788
  27,450,973
  27,451,203
  27,451,876
  27,452,031
  27,452,041
  27,452,042
  27,452,062
  27,452,124
  27,452,274
  27,452,341
  27,452,482
  27,452,574
  27,452,596
  27,452,676
  27,452,955
  27,453,151
  27,453,176
  27,453,257
  27,453,420
  27,453,740
  27,454,144
  27,455,044
  27,455,358
  27,455,381
  27,455,593
  27,455,905
  27,455,943
  27,456,705
  27,457,125
  27,457,168
  27,457,187
  27,457,352
  27,457,412
  27,459,656
  27,459,799
  27,459,837
  27,460,173
  27,461,772
  27,461,996
  27,462,614
  27,462,640
  27,462,649
  27,462,658
  27,462,673
  27,462,687
  27,462,756
  27,462,815
  27,462,825
  27,462,839
  27,462,880
  27,462,923
  27,462,939
  27,463,014
  27,463,098
  27,463,137
  27,463,160
  27,464,622
  27,464,679
  27,464,697
  27,465,578
  27,465,579
  27,465,582
  27,465,616
  27,465,617
  27,465,707
  27,465,733
  27,465,832
  27,465,892
  27,465,955
  27,466,127
  27,466,128
  27,466,146
  27,466,147
  27,466,181
  27,466,236
  27,466,263
  27,466,377
  27,466,392
  27,466,393
  27,466,404
  27,466,433
  27,466,450
  27,466,580
  27,466,623
  27,466,633
  27,466,648
  27,466,773
  27,466,779
  27,467,014
  27,467,032
  27,467,242
  27,467,290
  27,467,345
  27,467,353
  27,467,604
  27,467,653
  27,467,680
  27,468,105
  27,468,291
  27,468,383
  27,468,673
  27,468,693
  27,468,700
  27,468,722
  27,468,732
  27,468,768
  27,468,813
  27,468,881
  27,468,883
  27,468,910
  27,469,008
  27,469,041
  27,469,051
  27,469,074
  27,469,094
  27,469,156
  27,469,180
  27,469,240
  27,469,260
  27,469,348
  27,469,351
  27,469,779
  27,470,251
  27,470,315
  27,470,359
  27,471,547
  27,471,552
  27,471,553
  27,471,554
  27,471,556
  27,471,595
  27,471,614
  27,471,648
  27,471,654
  27,471,660
  27,472,153
  27,472,322
  27,472,363
  27,472,510
  27,473,408
  27,473,410
  27,474,687
  27,474,871
  27,475,405
  27,476,503
  27,478,756
  27,478,897
  27,479,194
  27,480,159
  27,480,178
  27,480,447
  27,481,321
  27,486,403
  27,486,419
  27,486,499
  27,486,502
  27,486,574
  27,486,608
  27,486,638
  27,486,668
  27,486,787
  27,487,598
  27,487,625
  27,487,642
  27,488,545
  27,488,592
  27,488,657
  27,489,177
  27,489,181
  27,489,531
  27,489,533
  27,489,645
  27,489,747
  27,489,773
  27,489,849
  27,489,850
  27,489,854
  27,489,951
  27,489,966
  27,490,227
  27,490,268
  27,490,397
  27,490,485
  27,490,719
  27,490,895
  27,490,943
  27,491,043
  27,491,057
  27,491,128
  27,491,135
  27,491,187
  27,491,369
  27,492,509
  27,492,603
  27,493,723
  27,494,438
  27,495,017
  27,495,183
  27,495,908
  27,495,923
  27,496,103
  27,496,405
  27,496,583
  27,496,936
  27,497,235
  27,497,577
  27,497,620
  27,497,655
  27,497,793
  27,497,798
  27,497,843
  27,498,046
  27,498,107
  27,498,114
  27,498,175
  27,498,228
  27,498,302
  27,498,965
  27,499,010
  27,499,110
  27,499,115
  27,499,127
  27,499,157
  27,499,271
  27,499,313
  27,499,338
  27,499,366
  27,499,388
  27,499,411
  27,499,412
  27,499,422
  27,499,496
  27,499,538
  27,499,554
  27,499,598
  27,499,765
  27,499,814
  27,499,936
  27,500,065
  27,500,338
  27,500,406
  27,500,428
  27,500,435
  27,500,482
  27,500,483
  27,500,754
  27,500,768
  27,500,807
  27,500,812
  27,500,815
  27,501,010
  27,501,011
  27,501,084
  27,501,378
  27,501,438
  27,501,515
  27,501,525
  27,501,626
  27,501,668
  27,502,927
  27,503,140
  27,503,215
  27,503,278
  27,503,557
  27,503,587
  27,503,603
  27,503,748
  27,504,182
  27,504,296
  27,504,547
  27,505,378
  27,507,664
  27,510,243
  27,512,010
  27,513,443
  27,516,195
  27,516,646
  27,518,524
  27,525,542
  27,525,885
  27,526,270
  27,526,458
  27,526,522
  27,526,569
  27,526,571
  27,526,630
  27,532,431
  27,534,447
  27,535,491
  27,535,634
  27,537,356
  27,537,362
  27,537,865
  27,537,979
  27,538,017
  27,541,339
  27,541,508
  27,541,524
  27,543,577
  27,543,766
  27,544,454
  27,548,177
  27,548,264
  27,548,576
  27,550,522
G
G
C
A
T
A
C
C
T
C
C
A
G
T
G
T
G
C
C
T
A
A
A
C
G
A
G
T
A
C
A
A
C
A
C
G
C
T
A
C
A
C
A
T
A
G
A
G
G
G
A
G
C
A
G
G
C
T
A
C
C
G
A
C
C
G
T
A
G
C
A
A
G
T
G
A
T
A
T
T
C
C
A
G
T
T
T
G
T
T
T
T
A
G
G
T
T
C
C
C
C
G
G
G
A
C
C
T
T
A
G
C
T
T
T
C
C
A
T
C
G
T
T
T
C
C
T
T
C
C
A
T
G
T
C
T
C
C
A
G
A
T
C
G
G
G
A
A
T
C
T
G
T
T
C
C
T
A
T
C
T
C
C
C
C
T
A
G
T
T
G
T
G
T
A
C
T
C
C
A
G
T
A
A
T
G
A
C
C
G
G
G
T
C
C
T
A
G
T
T
A
T
G
G
A
T
G
G
A
C
A
A
A
C
G
G
A
G
A
A
A
G
A
C
C
A
A
G
G
C
G
C
T
A
T
T
T
G
C
G
T
C
T
A
A
C
T
T
A
T
T
G
A
G
G
T
G
A
A
T
T
A
T
G
A
T
A
C
C
T
C
A
T
A
C
G
G
C
G
T
C
G
C
G
G
G
T
G
A
G
A
A
T
T
T
G
A
A
G
A
C
T
G
G
G
T
T
G
C
C
A
C
T
A
A
G
C
C
C
A
C
C
C
T
G
G
A
G
C
T
C
T
T
G
A
T
C
T
A
G
A
C
G
C
G
C
T
G
C
A
C
G
A
G
G
T
G
T
G
C
A
G
A
A
T
G
T
T
T
G
A
T
T
T
A
T
G
A
A
C
G
A
G
G
C
T
T
A
G
C
T
G
G
A
C
T
T
A
C
C
T
A
C
G
A
T
T
C
C
G
C
T
T
C
A
A
A
G
A
T
A
A
T
C
G
G
A
C
C
C
G
C
A
A
G
G
T
G
C
C
A
C
T
G
G
C
A
T
A
A
C
G
C
T
T
C
C
T
T
C
C
T
T
G
G
A
G
G
A
A
A
G
G
G
A
G
A
G
T
T
C
T
G
T
G
G
T
A
C
C
C
C
A
A
T
G
C
T
T
G
C
A
C
T
A
A
C
G
C
C
A
C
C
C
A
G
C
T
A
G
G
A
C
A
C
G
C
T
T
C
C
T
G
T
G
A
C
C
A
C
G
A
C
A
A
T
T
A
C
A
G
G
T
G
A
G
T
G
G
T
G
A
G
G
G
A
A
A
T
A
C
A
T
C
A
C
T
G
A
A
A
T
C
A
T
T
T
G
C
A
G