Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 218,862 (bp)   Positions: 343
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.007
.001
.005
.0
--
.001
.068
.0
.004
.001
.028
.028
.007
.001
.011
.012
.001
.005
.0
.0
.077
.003
.0
.001
.091
.0
.002
.006
.001
--
.001
.016
.005
.003
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.009
.005
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.016
--
--
--
--
.003
.001
.002
.0
--
--
.003
.0
.002
.031
.004
.0
.0
.006
.02
.029
.013
.01
.184
.069
--
--
.0
.0
.001
.0
.004
.006
.0
.013
.003
.001
.0
.002
--
--
.001
.001
.0
.0
.001
.004
.001
.005
.046
.003
.001
.022
.001
.023
.06
.021
.003
--
--
--
--
1.0
--
--
--
--
--
--
.005
--
--
.002
.008
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.028
--
--
--
.0
.002
.004
.001
.0
.003
.038
.005
.003
.002
.0
.0
.0
.009
.004
.01
.001
.0
.004
.0
.0
--
--
--
.0
.001
.0
.0
--
--
--
.002
.022
.006
.033
.0
.0
.001
.001
.003
.002
.021
.002
.002
.001
.0
.0
.015
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.002
.0
.001
.001
.066
.024
.034
.001
.002
.006
.017
.232
.101
.042
.016
.029
.011
.079
.008
.024
.783
.999
.994
.998
.974
.126
.011
.0
.035
.106
.642
.507
.848
.295
--
.005
.003
--
.008
.005
.046
.002
.002
.005
.002
--
--
--
--
--
--
.006
.003
.037
.002
.011
.004
.002
.003
.006
.016
.002
.008
.003
.0
.188
.008
.004
.002
.044
.029
--
--
--
--
--
--
--
--
.013
.155
.013
.054
.032
.007
.015
.001
.001
.001
.009
.004
.004
--
--
.002
.003
--
--
--
.002
.011
.0
.01
.009
.001
.003
.021
.006
.01
.138
.002
.0
.001
.0
.0
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Smr3b
Smr3b
Smr3b
Smr3b
Smr3b
Smr3b
Smr3b
Smr3b
Smr3b
Smr3b
Smr3b
Smr3b
Smr3b
Smr3b
Smr3b
Smr3b
Smr3b
Smr3b
Smr3b
Smr3b
Smr3b
Smr3b
Smr3b
Smr3b
Smr3b
Smr3b
Smr3b
Smr3b
Smr3b
Smr3b
Smr3b
Smr3b
Smr3b
Smr3b
Smr3b
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
T
T
C
C
T
G
T
G
G
T
T
G
A
G
C
G
C
C
C
A
G
A
G
C
G
G
G
A
T
A
T
G
A
A
T
A
T
G
G
A
T
G
A
A
T
T
C
T
A
C
G
C
G
T
C
C
T
T
G
G
A
G
T
T
G
G
T
A
A
T
A
A
T
C
C
G
T
C
A
C
G
C
T
G
G
G
C
T
G
C
T
T
A
T
A
G
T
A
C
C
C
C
G
G
T
G
G
G
A
C
T
C
A
A
C
G
G
G
T
C
C
T
A
A
G
G
G
G
C
G
T
G
G
T
C
A
G
C
G
T
G
G
A
T
T
T
T
G
T
A
C
G
T
A
A
T
A
T
G
G
T
G
A
A
C
T
G
T
C
C
T
A
G
A
G
A
T
G
G
T
G
G
A
T
T
A
C
C
G
T
G
T
G
C
G
A
G
A
A
C
C
A
T
A
G
C
G
A
C
A
G
G
C
T
C
G
C
T
T
T
C
G
C
G
G
T
A
T
C
T
G
G
G
A
T
A
G
A
T
A
A
A
T
C
A
G
C
C
G
C
G
G
G
T
C
A
T
G
C
C
G
T
A
A
G
A
G
A
C
C
T
G
G
C
C
A
C
G
G
T
T
G
T
A
T
A
C
G
T
A
T
A
G
C
T
T
T
A
A
G
C
C
T
C
C
G
A
T
A
T
G
T
A
A
G
C
C
A
G
T
T
A
G
G
T
C
C
T
G
C
A
A
T
T
C
C
G
G
T
C
C
T
A
  21,490,456
  21,491,329
  21,491,616
  21,492,300
  21,498,629
  21,505,794
  21,505,843
  21,506,436
  21,506,623
  21,506,750
  21,506,787
  21,506,896
  21,507,667
  21,509,693
  21,509,892
  21,509,948
  21,510,082
  21,510,343
  21,510,701
  21,510,745
  21,511,002
  21,511,147
  21,511,224
  21,511,271
  21,511,469
  21,511,537
  21,511,603
  21,511,672
  21,511,695
  21,513,241
  21,515,542
  21,516,343
  21,516,417
  21,516,593
  21,517,579
  21,517,732
  21,517,774
  21,517,834
  21,517,863
  21,519,054
  21,521,497
  21,521,725
  21,522,517
  21,522,669
  21,523,440
  21,524,743
  21,524,833
  21,525,070
  21,525,095
  21,525,189
  21,525,849
  21,525,877
  21,526,568
  21,527,243
  21,528,332
  21,528,457
  21,530,467
  21,530,981
  21,531,224
  21,533,027
  21,533,648
  21,534,361
  21,534,586
  21,538,000
  21,539,553
  21,539,695
  21,540,031
  21,540,227
  21,540,273
  21,540,701
  21,542,011
  21,542,103
  21,542,183
  21,542,344
  21,543,000
  21,543,487
  21,543,654
  21,544,397
  21,544,526
  21,544,893
  21,544,965
  21,545,538
  21,545,658
  21,547,370
  21,549,701
  21,552,481
  21,552,641
  21,552,670
  21,552,680
  21,552,771
  21,553,072
  21,553,619
  21,553,757
  21,553,970
  21,554,408
  21,555,447
  21,555,505
  21,556,198
  21,556,210
  21,556,570
  21,556,603
  21,556,799
  21,556,892
  21,557,355
  21,557,374
  21,557,698
  21,557,748
  21,558,465
  21,558,837
  21,558,856
  21,558,937
  21,558,940
  21,559,586
  21,559,969
  21,560,791
  21,562,014
  21,562,043
  21,562,196
  21,562,621
  21,563,766
  21,563,823
  21,563,833
  21,563,907
  21,564,197
  21,564,804
  21,565,168
  21,565,202
  21,565,428
  21,568,054
  21,568,206
  21,568,546
  21,569,123
  21,569,833
  21,576,946
  21,576,994
  21,580,567
  21,583,829
  21,584,880
  21,585,094
  21,586,333
  21,586,550
  21,588,756
  21,589,126
  21,591,035
  21,591,124
  21,591,333
  21,591,716
  21,592,967
  21,593,478
  21,593,543
  21,593,819
  21,595,939
  21,596,419
  21,596,692
  21,597,346
  21,598,587
  21,599,532
  21,600,026
  21,602,487
  21,602,552
  21,603,159
  21,603,521
  21,603,595
  21,603,665
  21,604,167
  21,605,152
  21,606,126
  21,606,337
  21,606,775
  21,607,193
  21,607,479
  21,607,713
  21,608,352
  21,608,522
  21,608,878
  21,609,073
  21,609,116
  21,609,339
  21,609,423
  21,609,623
  21,609,697
  21,609,833
  21,609,882
  21,609,960
  21,610,124
  21,610,167
  21,610,212
  21,610,259
  21,610,355
  21,610,410
  21,610,902
  21,610,906
  21,611,076
  21,611,193
  21,611,396
  21,611,851
  21,613,055
  21,613,175
  21,613,446
  21,613,559
  21,615,035
  21,615,144
  21,615,337
  21,615,567
  21,615,864
  21,616,057
  21,616,138
  21,616,415
  21,616,570
  21,616,589
  21,616,954
  21,617,287
  21,617,395
  21,617,445
  21,617,626
  21,617,854
  21,618,083
  21,618,229
  21,618,701
  21,619,150
  21,619,295
  21,620,663
  21,620,963
  21,621,198
  21,621,306
  21,622,418
  21,622,645
  21,624,833
  21,625,300
  21,625,371
  21,625,438
  21,625,965
  21,626,025
  21,626,331
  21,626,638
  21,627,226
  21,627,355
  21,627,359
  21,627,507
  21,627,531
  21,627,536
  21,627,544
  21,627,675
  21,627,686
  21,627,728
  21,627,770
  21,627,987
  21,628,156
  21,628,560
  21,628,627
  21,628,683
  21,628,756
  21,628,916
  21,628,961
  21,629,047
  21,629,185
  21,629,206
  21,629,419
  21,629,435
  21,629,564
  21,629,621
  21,629,695
  21,629,937
  21,629,940
  21,630,111
  21,630,197
  21,630,198
  21,630,277
  21,630,305
  21,630,545
  21,630,667
  21,630,808
  21,631,060
  21,631,141
  21,631,244
  21,631,506
  21,632,278
  21,635,056
  21,664,531
  21,664,549
  21,664,661
  21,664,708
  21,665,521
  21,666,160
  21,666,198
  21,666,244
  21,666,380
  21,666,595
  21,666,625
  21,666,952
  21,667,319
  21,667,332
  21,667,365
  21,667,644
  21,668,088
  21,668,226
  21,668,716
  21,671,110
  21,675,553
  21,676,170
  21,676,352
  21,676,536
  21,678,244
  21,678,614
  21,679,907
  21,680,112
  21,681,128
  21,681,584
  21,683,041
  21,683,076
  21,684,513
  21,684,741
  21,684,758
  21,684,997
  21,685,808
  21,685,821
  21,685,916
  21,686,264
  21,686,440
  21,687,835
  21,687,848
  21,690,547
  21,691,911
  21,693,952
  21,695,471
  21,695,526
  21,697,865
  21,698,071
  21,698,508
  21,699,308
  21,702,627
  21,702,872
  21,703,994
  21,704,368
  21,704,895
  21,704,948
  21,705,093
  21,705,174
  21,705,275
  21,705,921
  21,706,409
  21,706,690
  21,708,110
A
T/G
C/T
T
T/C
G/T
T/A
G/C
C
C
C
A
T
A
C/A
A
C/T
C/T
C/T
A/G
G/T
A/G
G/A
C/T
G/T
G/C
G/A
A/G
T/G
G
G
G/C
C
A/C
G
C
C
C
A
G
T/A
A
C
G
C
C
G
C
G
T
G/A
C/T
T
C
T
C/T
C
C
A
A
T
A
G
G
G/T
C
C
C
C
A
C
G
C
T
A
A
C
C/A
G
T
G/A
A
C
G/C
T
G/A
C/A
T/G
G/C
T
T/A
G
G
T/A
G
A
C
A/C
T
T
C/A
T
A
T
C
T
A
C
G
T
C
T
G
G
G
G/T
A
T
C
G
T
C
C
A/T
G/C
T
T
A
T
G/T
G
C
A
C
G
A/T
A
T
A
C
A
G/A
T
A
C
G
T/C
C
C
C
T
T
C
A/G
C
T/C
A/G
C
A
G/A
A
A
T
C
A
C
A
C
G
A
G
G
A
G
A
T
C
G/A
G/T
C
A
C
T
C
C
T
T
T
A
A
C
C
A
T
A
C
T
G
A/G
T
T
C
G
A/G
A
C/T
A
G
T
G
A
A
T
G
T
T
T
C
C
C
T
G/A
G
T
G/T
G
T
T/C
G
T/A
C
T
G/C
A/G
C
G
A
C
C
A/T
A/T
C
T/G
C/G
T
T
T
T
A
T
A
A
A
G
T
G
C
C
T
T
C
A
G
G
A
C
A
G
T
T
G
T
T
T
T
G
T
A
G/A
C
T/A
C
C
A/C
C
A/T
T
G/C
T/C
A/G
T/A
A/G
A
C/T
T/A
T/G
G
G
T
G/A
C/A
C/T
A
C/T
C/T
G/A
C
T/C
A/G
T/C
G/C
C
A/G
A/G
G/A
C/T
C/T
A/G
G/A
T/C
T/C
G
A
A
A
C/A
A
C
A
G
G
G
G
G
A
A
C
T
C
A
G
C
C