Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 161,209 (bp)   Positions: 401
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.005
.0
.001
.095
.065
.019
.832
.182
.153
.001
.001
.746
.015
.0
.007
.0
.15
.025
.004
.66
.002
.037
.001
.0
--
.008
.001
.002
.002
.002
.222
.051
.006
.013
.015
.0
.268
.316
.0
.002
.033
.386
.003
.0
.0
.001
.063
.001
.0
.003
--
--
--
--
--
--
.119
.055
.027
.02
.033
.025
.152
.0
.006
.007
.001
.017
.006
.0
.034
.003
.009
.005
.003
.0
.019
.003
.002
.092
.112
.407
.0
.029
.326
.035
.01
.817
.039
.034
.066
.013
.187
.155
.001
.016
.006
.018
.023
.009
.014
.0
.006
.001
.0
.0
.001
.033
.002
.041
.137
.023
.006
.009
.0
.0
.001
.0
.001
.0
.072
.411
.003
.0
.025
.022
.0
.0
.001
.001
.0
.116
.0
.0
.374
.0
.146
.0
.001
.004
.002
.006
.001
.001
.004
.003
.007
.001
.012
.003
.002
.042
.0
.003
.187
.001
.229
.005
.003
.019
.003
.003
.047
.03
.001
.002
.269
--
.241
.664
.076
.107
.039
.038
.055
.001
.001
.002
.008
.002
.014
.0
.001
.005
.005
.0
.033
.0
.0
.001
.001
.016
.001
.0
.0
.0
.988
.0
.0
.005
.001
.037
.005
.007
.012
.003
.0
.0
.037
.026
.0
.0
.009
.006
.003
.002
.002
.063
1.0
.0
.001
.0
.0
.003
.009
.0
.0
.067
.0
.023
.003
.04
.0
.0
.0
.001
.0
.0
.002
.003
.475
.0
.166
.944
.001
.008
.862
.0
.0
.001
.0
.0
.001
.002
.0
.0
.0
.006
.004
.001
.007
.034
.0
.009
.0
.967
.006
.362
.003
.15
.479
.095
.0
.0
.007
.001
.005
.0
.002
.001
.0
.005
.002
.019
.002
.004
.005
.0
.127
.005
.028
.001
.0
--
--
.0
.004
.0
.0
.004
.0
.0
.001
.041
.003
.0
.001
.001
.0
.0
.966
.375
.426
.001
.001
.004
.001
.001
.02
.005
.0
.013
.001
.183
.0
.001
.001
.001
.0
.057
.001
.0
.0
.0
.003
.0
.032
.069
.335
.15
.092
.319
.0
.0
.007
.0
.001
.001
.005
.902
.0
.003
.0
.0
.029
.83
.0
.0
.0
.002
.0
.001
.003
.016
.529
.0
.0
.009
.19
.001
.052
.001
.025
.001
.0
.001
.141
.001
.0
.013
.0
.0
.0
.001
.007
.025
.011
.001
.003
.0
.0
.0
.009
.001
.004
.004
.001
.0
.0
.0
.009
Smoc1
Smoc1
Smoc1
Smoc1
Smoc1
Smoc1
Smoc1
Smoc1
Smoc1
Smoc1
Smoc1
Smoc1
Smoc1
Smoc1
Smoc1
Smoc1
Smoc1
Smoc1
Smoc1
Smoc1
Smoc1
Smoc1
Smoc1
Smoc1
Smoc1
Smoc1
Smoc1
Smoc1
Smoc1
Smoc1
Smoc1
Smoc1
Smoc1
Smoc1
Smoc1
Smoc1
Smoc1
Smoc1
Smoc1
Smoc1
Smoc1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
2
G
T
G
A
A
-
G
G
T
A
C
G
C
A
A
-
G
G
A
T
T
T
C
2
-
G
G
C
G
T
-
T
T
C
-
A
3
A
9
T
A
G
A
T
T
G
T
C
A
-
C
C
A
C
-
C
C
C
9
C
C
G
T
T
G
G
C
T
G
G
-
T
T
G
T
A
A
C
T
2
C
A
C
G
A
C
T
C
C
C
T
G
G
A
T
T
C
T
A
A
A
G
T
A
C
G
A
T
C
-
T
T
G
C
A
-
G
C
T
A
T
T
G
-
-
T
C
A
T
A
A
-
G
C
T
A
-
-
G
G
C
T
A
C
G
G
T
C
-
C
A
C
T
A
C
G
C
C
C
C
G
10
C
T
T
A
G
T
C
T
A
T
T
A
T
C
C
C
G
G
G
A
T
-
C
-
C
-
A
8
G
C
C
A
C
T
10
8
T
T
T
C
C
C
T
T
G
T
T
A
G
G
G
A
C
T
C
G
G
T
A
C
-
A
G
C
G
C
G
T
19
13
T
T
C
C
C
C
T
T
T
T
A
-
T
-
T
T
C
C
G
G
T
G
G
A
T
G
A
G
G
A
T
T
G
-
A
G
C
A
T
G
C
2
T
G
G
G
G
C
T
C
C
A
C
A
G
T
T
A
G
G
C
-
T
T
G
G
C
A
-
-
G
T
A
T
T
G
A
T
-
C
T
-
8
C
T
A
T
T
A
G
G
A
G
A
A
C
T
A
A
G
T
A
-
C
G
T
G
G
G
A
G
G
T
C
A
-
A
T
T
G
T
3
T
G
121
C
G
T
G
A
A
A
T
C
A
C
C
C
A
T
G
A
A
G
G
T
-
G
G
G
C
C
G
T
A
-
T
T
2
C
A
A
G
G
A
-
G
-
  104,722,726
  104,727,221
  104,727,680
  104,727,748
  104,727,751
  104,727,865
  104,728,066
  104,728,100
  104,728,102
  104,728,496
  104,728,895
  104,729,045
  104,729,208
  104,729,550
  104,729,742
  104,729,753
  104,730,198
  104,730,636
  104,730,686
  104,730,974
  104,733,329
  104,733,949
  104,734,589
  104,735,089
  104,735,368
  104,737,261
  104,737,519
  104,737,815
  104,738,240
  104,738,614
  104,738,874
  104,739,631
  104,739,704
  104,739,830
  104,739,831
  104,740,129
  104,740,337
  104,740,344
  104,741,377
  104,741,476
  104,741,795
  104,743,630
  104,743,782
  104,743,839
  104,743,946
  104,744,094
  104,744,229
  104,744,831
  104,746,132
  104,746,903
  104,748,128
  104,748,295
  104,748,764
  104,748,892
  104,749,932
  104,750,593
  104,751,282
  104,751,286
  104,751,290
  104,751,293
  104,751,305
  104,751,309
  104,751,531
  104,751,724
  104,753,014
  104,754,224
  104,754,323
  104,754,654
  104,754,796
  104,756,183
  104,756,191
  104,756,234
  104,756,250
  104,756,556
  104,756,815
  104,757,002
  104,757,654
  104,758,188
  104,758,442
  104,758,461
  104,758,769
  104,758,834
  104,759,256
  104,759,367
  104,759,769
  104,759,842
  104,760,000
  104,760,462
  104,761,241
  104,761,900
  104,761,974
  104,762,147
  104,762,196
  104,762,283
  104,762,456
  104,762,751
  104,763,260
  104,763,537
  104,763,824
  104,764,374
  104,764,387
  104,764,475
  104,765,190
  104,765,590
  104,767,122
  104,768,411
  104,770,015
  104,772,514
  104,772,944
  104,774,845
  104,774,917
  104,774,964
  104,774,985
  104,776,731
  104,777,819
  104,778,477
  104,779,165
  104,779,752
  104,780,643
  104,780,942
  104,782,952
  104,783,064
  104,786,673
  104,787,297
  104,787,567
  104,787,568
  104,787,701
  104,788,182
  104,788,671
  104,788,753
  104,789,300
  104,789,789
  104,789,877
  104,790,109
  104,793,901
  104,794,511
  104,794,598
  104,794,757
  104,795,800
  104,795,862
  104,795,885
  104,796,264
  104,799,965
  104,800,946
  104,801,163
  104,802,174
  104,802,399
  104,803,617
  104,803,620
  104,804,285
  104,804,294
  104,804,423
  104,804,629
  104,804,706
  104,804,718
  104,804,762
  104,805,010
  104,805,050
  104,805,176
  104,805,274
  104,805,398
  104,805,399
  104,805,626
  104,805,668
  104,806,300
  104,808,457
  104,808,694
  104,808,909
  104,809,313
  104,809,336
  104,810,610
  104,812,058
  104,813,079
  104,813,854
  104,814,603
  104,815,226
  104,815,257
  104,816,239
  104,817,568
  104,817,893
  104,818,211
  104,819,384
  104,819,893
  104,819,899
  104,820,053
  104,820,347
  104,820,365
  104,820,672
  104,820,857
  104,823,798
  104,823,839
  104,823,852
  104,823,871
  104,823,872
  104,823,946
  104,824,146
  104,824,387
  104,824,558
  104,824,707
  104,825,346
  104,825,578
  104,825,782
  104,825,922
  104,825,923
  104,826,388
  104,826,940
  104,826,944
  104,827,322
  104,827,408
  104,827,417
  104,827,436
  104,827,562
  104,827,763
  104,827,786
  104,827,795
  104,827,840
  104,828,084
  104,828,861
  104,828,897
  104,829,377
  104,829,393
  104,829,485
  104,829,911
  104,829,995
  104,830,117
  104,830,335
  104,830,698
  104,830,863
  104,831,816
  104,832,018
  104,832,213
  104,832,495
  104,832,516
  104,832,530
  104,832,647
  104,832,764
  104,832,784
  104,832,785
  104,832,889
  104,833,270
  104,833,645
  104,833,864
  104,833,924
  104,833,945
  104,834,119
  104,834,180
  104,834,504
  104,834,590
  104,834,930
  104,834,995
  104,835,120
  104,835,411
  104,835,427
  104,835,446
  104,835,733
  104,835,893
  104,836,066
  104,836,830
  104,836,869
  104,838,766
  104,839,099
  104,839,812
  104,840,729
  104,840,976
  104,841,761
  104,842,096
  104,842,382
  104,842,746
  104,843,752
  104,843,954
  104,844,354
  104,844,690
  104,845,903
  104,845,909
  104,846,376
  104,847,032
  104,848,394
  104,848,966
  104,848,988
  104,849,324
  104,849,327
  104,849,348
  104,849,356
  104,849,567
  104,849,582
  104,849,763
  104,850,554
  104,850,597
  104,850,736
  104,851,591
  104,852,091
  104,852,315
  104,852,335
  104,852,418
  104,852,975
  104,853,171
  104,856,036
  104,857,596
  104,857,899
  104,858,158
  104,858,249
  104,858,668
  104,858,924
  104,859,062
  104,859,463
  104,859,568
  104,860,071
  104,860,143
  104,860,269
  104,860,639
  104,861,085
  104,861,327
  104,861,337
  104,861,377
  104,861,501
  104,861,505
  104,861,930
  104,862,849
  104,862,985
  104,862,989
  104,863,159
  104,863,317
  104,863,431
  104,863,799
  104,863,889
  104,863,937
  104,864,589
  104,864,733
  104,865,124
  104,865,404
  104,865,630
  104,865,652
  104,866,092
  104,866,158
  104,866,214
  104,866,358
  104,866,376
  104,866,428
  104,866,559
  104,866,634
  104,866,675
  104,866,693
  104,866,882
  104,866,992
  104,868,072
  104,868,179
  104,868,211
  104,868,387
  104,868,644
  104,868,670
  104,869,763
  104,869,908
  104,870,196
  104,870,216
  104,870,277
  104,870,375
  104,870,621
  104,871,035
  104,871,237
  104,871,816
  104,871,855
  104,872,129
  104,872,182
  104,872,397
  104,872,465
  104,872,572
  104,872,682
  104,872,856
  104,872,877
  104,873,157
  104,873,320
  104,873,483
  104,873,534
  104,873,743
  104,873,754
  104,873,829
  104,874,081
  104,874,156
  104,874,219
  104,874,713
  104,874,882
  104,874,918
  104,875,171
  104,875,225
  104,875,343
  104,875,364
  104,875,370
  104,875,412
  104,875,474
  104,876,018
  104,876,140
  104,876,259
  104,876,501
  104,876,916
  104,877,044
  104,877,063
  104,877,166
  104,877,408
  104,878,444
  104,878,680
  104,879,110
-
A
G
C
T
G
T
C
A
A
T
T
A
T
-
G
C
C
A
G
C
C
C
T
-
G
C
A
T
A
C
A
A
A
A
3
G
-
G
-
C
G
A
G
C
G
A
G
A
G
8
-
T
C
T
T
T
T
T
-
T
T
A
C
C
A
A
T
G
A
A
G
C
-
A
C
G
G
A
C
-
T
G
T
A
C
T
-
G
T
T
C
T
A
C
C
-
A
C
G
C
C
T
C
G
G
T
G
C
A
C
C
-
A
T
G
T
A
T
C
-
C
C
C
-/4
-/3
C
T
G
C
G
C
C
T
T
C
C
A
7
A
A
G
C
G
A
A
C
C
-
A
A
T
T
C
G
T
A
A
T
A
A
A
-
T
G
C
G
A
C
A
C
T
C
-
G
-
T
G
T
A
C
A
G
C
12
G
A
T
T
G
-
A
-
T
G
T
C
-
-
C
C
G
T
T
A
G
C
A
-
C
G
A
A
C
G
T
C
T
A
A
C
G
T
A
G
A
T
A
-
A
-
-
-
G
C
A
T
T
T
C
C
C
C
G
T
C
T
C
C
T
-
A
A
C
T
A
G
C
A
G
T
T
T
A
C
A
2
G
A
A
T
A
A
T
-
C
A
A
A
A
T
C
T
-
-
T
C
A
G
C
G
A
A
A
A
C
G
A
A
T
G
A
9
A
-
C
-
C
A
C
C
3
T
C
3
-
T
C
G
C
C
G
T
A
G
A
C
G
G
C
G
G
A
C
G
A
T
T
C
T
A
T
G
T
A
G
T
G
4
C
C
C
A
G
-
C
A
121/-
T
A
C
A
T
G
G
G
T
G
G
T
T
G
G
T
G
C
A
A
C
6
A
A
T
A
A
T
C
G
23
C
C
-
T
G
G
A
A
G
4
C
T