Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 142,871 (bp)   Positions: 458
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.0
.048
.068
.321
.005
.073
.02
.027
.0
.001
.972
1.0
.004
.01
.003
.238
.016
1.0
.99
.0
.003
.614
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.04
.002
.21
.251
.042
.001
.104
.002
.02
.002
.006
.003
.013
.006
.012
.015
.003
1.0
.008
.465
.004
.0
.006
.001
.029
.016
.033
.046
.023
.015
.0
.002
.007
.001
.004
--
--
--
--
--
.097
.033
.075
.035
.049
.049
.03
.019
.02
.022
.102
.117
.008
.01
.137
.023
.026
.005
.003
.0
.0
.004
.001
.002
.002
.06
.003
.004
.002
.001
.006
.001
.004
.009
.003
.002
.0
.0
.0
.001
.001
.624
.34
.002
.001
.001
.005
.046
.172
.01
.0
.593
.013
.002
.004
.07
.046
.0
1.0
.0
.0
.007
.017
.013
.034
.255
.82
.454
.502
.564
.004
--
--
--
--
.01
.029
.032
.104
.024
.001
.105
.026
.191
.501
.173
.303
.007
.0
.004
.0
.885
.055
.008
.001
.012
.0
.001
.001
.0
.902
.027
--
--
.247
.548
.752
.342
.028
.041
.018
.018
.009
.003
.005
.0
.002
.009
.065
.007
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.003
.213
.066
.003
.003
.055
.674
--
--
--
--
--
--
--
.096
.045
.001
.022
.035
.033
.043
.007
.012
.018
.01
--
.014
.008
.986
--
--
--
--
.001
.055
.0
.039
.004
.053
.865
.021
.004
.005
.019
.016
.074
.112
.115
.006
.041
--
--
--
--
.133
.354
.214
.024
.007
.001
.007
.045
.017
1.0
.028
.015
.162
.003
.004
.0
.0
.0
.003
.001
.001
.005
.133
.367
.001
.002
.005
.023
.002
.0
.002
.092
.0
.0
.05
.062
.0
.039
.106
--
.007
.0
.122
.038
.088
.001
.013
.0
.0
.781
.016
--
--
.018
.009
.859
.037
.187
.792
.001
.001
.026
.028
.01
.003
.031
.026
.2
.217
.232
.067
.016
.0
.003
.035
.016
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.788
.01
.454
.001
.011
.325
.825
.065
.28
.001
--
.106
.003
.037
.03
.082
.005
.0
.0
.297
.016
.012
.219
.028
.017
.004
.009
.102
.006
.008
.161
.053
.001
.002
.001
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Ybx1-ps8
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Smchd1
Smchd1
Smchd1
Smchd1
Smchd1
Smchd1
Smchd1
Smchd1
Smchd1
Smchd1
Smchd1
Smchd1
Smchd1
Smchd1
Smchd1
Smchd1
Smchd1
Smchd1
Smchd1
Smchd1
Smchd1
Smchd1
Smchd1
Smchd1
Smchd1
Smchd1
Smchd1
Smchd1
Smchd1
Smchd1
Smchd1
Smchd1
Smchd1
Smchd1
Smchd1
Smchd1
Smchd1
Smchd1
Smchd1
Smchd1
Smchd1
Smchd1
Smchd1
Smchd1
Smchd1
Smchd1
G
G
C
A
T
4
A
7
T
-
-
A
G
T
T
C
C
G
G
T
T
G
T
T
A
C
T
-
A
A
T
G
A
A
A
C
T
T
G
-
-
-
A
A
C
-
-
A
C
A
T
-
-
C
C
C
T
-
-
-
2
-
G
T
C
-
G
-
G
C
-
-
T
C
T
-
G
T
-
A
-
-
-
-
T
A
C
G
C
T
G
C
G
T
-
-
C
G
-
T
C
-
-
-
2
-
A
T
T
A
-
A
T
C
C
A
C
3
G
G
A
T
G
C
T
G
A
7
T
A
T
-
-
G
A
G
T
C
T
T
C
G
C
A
A
G
A
T
-
2
2
-
-
G
-
A
T
-
T
A
T
A
A
-
A
T
A
C
T
C
G
G
G
G
A
T
T
A
C
2
G
T
-
G
C
G
C
T
G
-
C
A
T
A
A
C
-
-
G
-
A
T
C
T
A
C
G
A
A
G
G
G
C
T
G
2
G
2
T
A
A
C
T
T
-
G
G
A
-
T
A
T
T
-
C
A
2
-
15
G
A
A
A
G
A
-
C
C
C
G
6
T
A
G
G
G
-
C
A
G
C
C
C
G
G
T
C
T
T
G
T
T
G
C
C
-
C
C
T
T
T
-
A
G
4
G
C
2
G
A
C
T
5
A
G
A
C
16
C
4
T
C
A
-
C
C
G
T
C
T
A
T
T
G
T
-
C
A
C
G
T
A
A
G
T
G
A
G
A
C
40
T
T
-
A
-
G
G
C
C
T
2
-
T
C
A
C
T
G
3
A
A
A
A
A
G
T
-
T
C
C
G
G
T
G
C
T
A
G
T
T
C
C
-
G
A
G
A
G
C
G
G
A
C
C
C
G
-
T
C
A
C
G
-
A
T
A
A
T
A
C
C
G
A
G
T
G
C
A
A
G
T
C
C
T
T
G
G
G
C
G
A
T
C
T
C
C
T
A
A
T
A
C
A
2
G
A
C
T
A
A
A
C
G
2
G
G
C
T
C
4
3
5
T
T
A
T
A
  119,676,703
  119,677,071
  119,677,304
  119,677,500
  119,677,553
  119,677,734
  119,677,812
  119,679,134
  119,679,992
  119,681,259
  119,681,963
  119,682,033
  119,682,450
  119,682,615
  119,684,616
  119,684,638
  119,685,465
  119,686,154
  119,686,917
  119,687,371
  119,687,941
  119,688,073
  119,688,844
  119,689,188
  119,689,202
  119,689,597
  119,689,599
  119,689,865
  119,689,902
  119,690,471
  119,690,630
  119,690,754
  119,690,856
  119,691,208
  119,691,438
  119,691,599
  119,691,604
  119,692,374
  119,692,856
  119,692,867
  119,693,254
  119,693,972
  119,694,812
  119,694,996
  119,695,689
  119,695,967
  119,695,994
  119,696,060
  119,696,093
  119,696,128
  119,696,131
  119,696,182
  119,696,183
  119,696,682
  119,697,170
  119,697,471
  119,697,731
  119,698,633
  119,698,638
  119,698,653
  119,698,657
  119,698,692
  119,698,699
  119,698,746
  119,698,747
  119,698,763
  119,698,766
  119,698,781
  119,698,797
  119,698,800
  119,698,808
  119,698,848
  119,698,853
  119,698,868
  119,698,869
  119,698,874
  119,698,876
  119,698,892
  119,699,034
  119,699,071
  119,699,081
  119,699,084
  119,699,090
  119,699,113
  119,699,117
  119,699,118
  119,699,119
  119,699,132
  119,699,189
  119,699,230
  119,699,231
  119,699,259
  119,699,291
  119,699,295
  119,699,305
  119,699,314
  119,699,317
  119,699,318
  119,699,333
  119,699,336
  119,699,340
  119,699,375
  119,699,393
  119,699,442
  119,699,453
  119,699,460
  119,699,468
  119,699,502
  119,699,506
  119,699,510
  119,699,513
  119,699,735
  119,700,233
  119,701,027
  119,701,176
  119,701,502
  119,702,278
  119,703,226
  119,704,660
  119,705,399
  119,706,499
  119,707,319
  119,707,331
  119,707,659
  119,709,144
  119,710,558
  119,711,785
  119,712,161
  119,712,833
  119,712,897
  119,714,297
  119,714,307
  119,714,326
  119,714,442
  119,714,471
  119,715,055
  119,715,503
  119,716,185
  119,716,544
  119,716,623
  119,717,580
  119,718,056
  119,718,527
  119,718,929
  119,718,961
  119,719,011
  119,719,086
  119,719,363
  119,719,905
  119,719,933
  119,719,947
  119,719,967
  119,721,264
  119,721,706
  119,721,708
  119,722,842
  119,723,847
  119,724,131
  119,725,249
  119,725,717
  119,726,160
  119,726,833
  119,727,192
  119,727,322
  119,728,837
  119,729,163
  119,730,420
  119,730,560
  119,731,620
  119,731,776
  119,731,833
  119,731,868
  119,731,899
  119,731,923
  119,731,930
  119,734,075
  119,734,109
  119,734,676
  119,735,393
  119,736,085
  119,736,339
  119,737,293
  119,737,299
  119,738,902
  119,739,551
  119,739,732
  119,739,888
  119,740,243
  119,740,326
  119,740,342
  119,741,707
  119,741,750
  119,741,815
  119,741,863
  119,742,302
  119,742,393
  119,742,441
  119,742,959
  119,743,006
  119,743,035
  119,743,045
  119,743,046
  119,743,068
  119,743,071
  119,743,075
  119,743,323
  119,743,791
  119,744,278
  119,744,281
  119,744,284
  119,744,286
  119,744,288
  119,744,730
  119,744,755
  119,745,062
  119,745,268
  119,745,429
  119,745,709
  119,746,125
  119,746,171
  119,746,575
  119,747,009
  119,747,235
  119,747,388
  119,747,808
  119,748,048
  119,748,837
  119,749,290
  119,749,372
  119,749,376
  119,749,406
  119,750,982
  119,751,196
  119,751,462
  119,752,252
  119,752,659
  119,752,741
  119,752,951
  119,753,349
  119,753,512
  119,754,535
  119,756,794
  119,757,021
  119,757,898
  119,758,460
  119,759,507
  119,760,168
  119,760,282
  119,760,881
  119,760,961
  119,761,516
  119,762,068
  119,762,387
  119,763,206
  119,763,210
  119,763,281
  119,763,975
  119,764,869
  119,764,874
  119,765,124
  119,765,261
  119,765,479
  119,765,652
  119,765,867
  119,766,570
  119,766,709
  119,766,981
  119,768,613
  119,770,011
  119,770,531
  119,771,357
  119,771,464
  119,772,102
  119,772,136
  119,772,160
  119,772,758
  119,772,946
  119,772,948
  119,773,178
  119,773,326
  119,773,664
  119,774,296
  119,774,382
  119,774,391
  119,774,407
  119,774,471
  119,775,123
  119,775,278
  119,775,613
  119,775,847
  119,776,386
  119,776,504
  119,776,609
  119,776,716
  119,776,946
  119,777,153
  119,777,864
  119,778,295
  119,778,878
  119,779,025
  119,779,966
  119,780,993
  119,782,127
  119,782,291
  119,782,335
  119,782,395
  119,783,338
  119,783,766
  119,783,842
  119,784,084
  119,784,447
  119,784,536
  119,784,816
  119,784,839
  119,786,300
  119,786,591
  119,786,971
  119,787,015
  119,787,042
  119,787,391
  119,787,764
  119,788,385
  119,788,568
  119,789,360
  119,789,657
  119,789,708
  119,790,091
  119,790,211
  119,790,996
  119,791,659
  119,791,859
  119,791,900
  119,791,902
  119,791,904
  119,792,198
  119,792,534
  119,792,685
  119,792,780
  119,793,392
  119,793,503
  119,794,108
  119,794,291
  119,794,453
  119,794,622
  119,794,856
  119,795,470
  119,795,630
  119,795,668
  119,795,705
  119,795,708
  119,795,750
  119,795,938
  119,796,288
  119,796,292
  119,796,296
  119,796,348
  119,796,494
  119,796,538
  119,797,067
  119,797,107
  119,797,271
  119,797,477
  119,797,570
  119,797,596
  119,797,780
  119,797,805
  119,797,867
  119,798,772
  119,798,794
  119,798,813
  119,799,082
  119,799,347
  119,799,377
  119,799,379
  119,799,502
  119,799,523
  119,799,538
  119,799,589
  119,799,693
  119,799,732
  119,800,116
  119,800,255
  119,800,267
  119,800,283
  119,800,780
  119,801,041
  119,801,286
  119,801,409
  119,801,433
  119,801,453
  119,801,547
  119,801,649
  119,801,677
  119,801,830
  119,801,874
  119,802,342
  119,802,348
  119,802,351
  119,802,386
  119,802,388
  119,802,392
  119,802,407
  119,802,415
  119,802,651
  119,802,655
  119,802,663
  119,802,704
  119,802,708
  119,802,750
  119,802,781
  119,802,810
  119,803,153
  119,803,154
  119,803,166
  119,803,178
  119,803,212
  119,803,248
  119,803,430
  119,803,448
  119,803,520
  119,803,720
  119,803,782
  119,803,815
  119,803,866
  119,803,927
  119,804,427
  119,804,643
  119,805,597
  119,805,811
  119,806,006
  119,806,608
  119,806,768
  119,807,811
  119,808,799
  119,808,909
  119,809,817
  119,809,921
  119,810,287
  119,810,648
  119,810,660
  119,810,662
  119,811,750
  119,811,967
  119,812,058
  119,812,380
  119,812,922
  119,815,148
  119,815,592
  119,815,614
  119,815,696
  119,816,594
  119,816,643
  119,816,743
  119,816,815
  119,817,201
  119,817,679
  119,817,798
  119,818,005
A
A
T
C
C
-
G
-
C
2
20
G
A
G
C
T
T
A
A
A
C
A
C
C
G
T
C
3
G
G
C
A
G
G
T
G
C
C
A
A
3
A
G
G
G
18
14
G
G
G
G
3
10
T
T
A
C
2
G
C
-
T
-
C
T
2
-
T
-
-
T
G
-
T
G
A
-
-
C
-
2
A
A
C
A
T
G
-
-
C
T
-
T
-
C
5
G
C
G
-
-
A
C
G
-
C
-
C
A
C
A/C
G
C
T
T
G
-
-
A
T
G
C
A
T
C
A
G
7/-
C
G
-
T
T
A
G
T
C
T
G
C
G
T
T
T
G
C
G
C
2
-
-
8
A
T
13
T
C
A
A
C
-
C
G
A
G
G
G
T
C
G
A
A
A
T
G
C
C
-
A
-
A
C
C
A
T
A
T
C
C
4
T
G
A
G
G
G
T
2
C
A
G
A
A
C
G
T
A
G
C
A
A
A
A
A
T
-
A
-
G
C
C
G
A
C
3
A
A
-
A
C
C
C
-
15
T
G
-
4
-
A
G
G
G
C
G
A
T
T
T
A
-
C
C
C
A
A
T
T
T
A
A
T
T
C
A
C
T
A
A
A
C
A
A
A
A
T
G
T
C
C
A
11
G
A
-
A
A
-
A
-
T
C
-
C
A
T
T
-
T
-
C
T
T
4
T
A
A
A
T
C
G
C
C
A
A
C
A
G
T
A
G
G
G
C
-
A
-
C
G
T
-
G
G
G
G
A
A
A
T
T
C
-
13
-
-
T
T
C
-
-
G
G
G
G
G
C
G
16
C
A
G
T
C
C
A
T
G
A/G
G/C
T/C
T/G
T
C/T
-/C
G/C
A/T
G/T
A/G
A
A
A
C
G
G
T
T
C
-/T
T/A
C/T
G
T
A
4
A/G
T/A
A/G
A/T
T/C
A/C
C/T
C/G
G/A
A/G
G/T
T/G
G/A
C/T
A/G
A/T
G/A
C
G
T
C
T/G
G/T
A
A
T
C
G
C
A
A
T
T
C
C
G
-
G
T
-
-
T
-
T
C
T
C
G
T
T
-
A
A
G
C
T
-
-
-
C
C
G
C
G