Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 142,871 (bp)   Positions: 291
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.0
.003
.005
.008
.0
.009
.01
.001
.003
.998
.919
.99
.614
--
--
--
--
--
--
--
.002
.001
.104
.014
.013
.015
.002
.004
.0
.006
.001
.029
.016
.033
.046
.023
.015
.0
.002
.007
.001
.004
--
--
--
--
--
.097
.033
.075
.035
.049
.049
.03
.019
.02
.022
.102
.117
.008
.01
.137
.023
.026
.005
.003
.0
.0
.004
.001
.002
.002
.06
.003
.004
.002
.001
.006
.001
.004
.009
.0
.0
.745
.624
.008
.34
.013
.013
.0
.005
.02
.003
.046
.31
.007
.01
.593
1.0
.0
.0
.002
.004
.07
.006
1.0
.0
.021
.005
.564
.124
.331
.004
.012
--
.001
.105
.01
.007
.028
.0
.001
.004
.0
.885
.055
.001
.012
.0
.883
.0
--
.11
.752
.041
.005
.0
.002
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.003
.213
.001
.001
.674
--
--
--
--
--
--
.096
.998
.022
.035
.12
.033
.007
.01
.0
--
--
--
.112
.055
.019
.031
.004
.001
.013
.865
.032
.041
--
--
--
--
--
--
--
--
.149
.123
.139
.017
.001
.246
1.0
.0
.0
.0
.001
.002
.006
.025
.0
.006
.092
.0
.002
.01
.15
--
.038
.001
.013
.0
.0
.972
.014
.187
.046
.01
.003
.0
.167
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
.001
.003
.166
.189
.037
.526
.28
.016
.007
.032
.017
.014
.001
.048
.036
.001
.0
.0
.005
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Smchd1
Smchd1
Smchd1
Smchd1
Smchd1
Smchd1
Smchd1
Smchd1
Smchd1
Smchd1
Smchd1
Smchd1
Smchd1
Smchd1
Smchd1
Smchd1
Smchd1
Smchd1
Smchd1
Smchd1
Smchd1
Smchd1
Smchd1
Smchd1
Smchd1
Smchd1
Smchd1
Smchd1
Smchd1
Smchd1
G
C
T
C
T
4
T
C
T
C
2
G
G
-
T
A
T
A
A
A
G
A
A
C
C
4
T
-
-
-
2
-
G
T
C
-
G
-
G
C
-
-
T
C
T
-
G
T
-
A
-
-
-
-
T
A
C
G
C
T
G
C
G
T
-
-
C
G
-
T
C
-
-
-
2
-
A
T
T
A
-
C
C
C
G
G
G
3
T
C
C
C
-
T
19
C
A
T
T
G
A
T
-
-
C
G
T
2
C
A
T
A
T
32
-
-
T
-
A
C
T
A
A
C
T
C
G
G
G
52
T
-
-
G
C
A
T
A
T
A
A
G
G
G
T
T
A
A
C
G
A
T
G
A
G
C
C
C
T
A
C
A
G
A
T
A
T
A
A
G
C
A
T
T
T
T
A
-
T
C
A
T
A
C
-
A
C
G
11
6
C
G
C
A
G
A
T
T
T
C
T
T
G
T
C
T
G
-
G
A
-
4
A
2
-
3
A
A
C
A
-
4
T
C
C
A
C
C
T
-
C
A
A
C
6
T
A
40
T
T
-
-
G
-
C
G
3
T
G
C
C
G
T
T
C
G
A
G
T
T
-
C
G
T
C
T
C
C
T
G
2
2
A
2
G
G
G
T
C
C
-
T
G
-
T
C
G
G
A
G
C
  119,676,614
  119,677,552
  119,677,553
  119,677,614
  119,679,992
  119,682,384
  119,682,615
  119,683,131
  119,684,616
  119,685,546
  119,685,554
  119,686,917
  119,688,073
  119,688,592
  119,689,188
  119,690,471
  119,691,113
  119,691,209
  119,691,438
  119,691,500
  119,692,856
  119,694,812
  119,694,996
  119,695,294
  119,696,147
  119,696,193
  119,697,270
  119,698,633
  119,698,638
  119,698,653
  119,698,657
  119,698,692
  119,698,699
  119,698,746
  119,698,747
  119,698,763
  119,698,766
  119,698,781
  119,698,797
  119,698,800
  119,698,808
  119,698,848
  119,698,853
  119,698,868
  119,698,869
  119,698,874
  119,698,876
  119,698,892
  119,699,034
  119,699,071
  119,699,081
  119,699,084
  119,699,090
  119,699,113
  119,699,117
  119,699,118
  119,699,119
  119,699,132
  119,699,189
  119,699,230
  119,699,231
  119,699,259
  119,699,291
  119,699,295
  119,699,305
  119,699,314
  119,699,317
  119,699,318
  119,699,333
  119,699,336
  119,699,340
  119,699,375
  119,699,393
  119,699,442
  119,699,453
  119,699,460
  119,699,468
  119,699,502
  119,699,506
  119,699,510
  119,699,513
  119,701,590
  119,701,944
  119,704,273
  119,704,660
  119,705,311
  119,705,399
  119,706,463
  119,706,744
  119,707,642
  119,707,659
  119,707,843
  119,708,475
  119,709,144
  119,709,645
  119,710,100
  119,711,785
  119,712,833
  119,713,355
  119,714,048
  119,714,082
  119,714,297
  119,714,307
  119,714,326
  119,714,933
  119,715,055
  119,715,503
  119,716,197
  119,718,322
  119,719,086
  119,719,158
  119,719,273
  119,719,363
  119,719,860
  119,719,967
  119,724,131
  119,725,249
  119,725,664
  119,728,837
  119,729,058
  119,729,163
  119,729,347
  119,730,420
  119,730,560
  119,731,620
  119,731,776
  119,731,868
  119,731,899
  119,731,923
  119,733,287
  119,734,109
  119,737,268
  119,737,488
  119,738,902
  119,739,888
  119,741,750
  119,741,815
  119,741,863
  119,743,071
  119,744,278
  119,744,281
  119,744,284
  119,744,286
  119,744,288
  119,744,755
  119,746,125
  119,746,412
  119,746,816
  119,747,009
  119,747,605
  119,748,089
  119,748,095
  119,748,102
  119,748,122
  119,748,154
  119,748,214
  119,748,242
  119,748,245
  119,748,250
  119,748,265
  119,748,518
  119,748,519
  119,748,530
  119,748,537
  119,748,539
  119,748,559
  119,748,570
  119,748,650
  119,748,712
  119,749,086
  119,749,283
  119,749,290
  119,749,299
  119,750,982
  119,751,196
  119,751,562
  119,752,162
  119,752,951
  119,753,961
  119,754,237
  119,754,535
  119,756,852
  119,757,021
  119,758,857
  119,759,507
  119,760,002
  119,760,881
  119,760,961
  119,761,396
  119,761,516
  119,763,040
  119,763,281
  119,765,009
  119,765,514
  119,765,867
  119,766,073
  119,766,551
  119,766,709
  119,767,078
  119,768,893
  119,770,011
  119,770,301
  119,771,076
  119,771,357
  119,772,315
  119,773,664
  119,774,025
  119,774,027
  119,774,082
  119,774,085
  119,774,158
  119,774,217
  119,774,382
  119,774,393
  119,774,748
  119,774,858
  119,775,560
  119,776,716
  119,777,692
  119,778,005
  119,778,276
  119,779,013
  119,779,966
  119,780,993
  119,781,037
  119,784,447
  119,784,845
  119,785,273
  119,786,300
  119,786,373
  119,786,971
  119,787,015
  119,788,179
  119,788,256
  119,789,567
  119,789,657
  119,790,996
  119,791,859
  119,791,900
  119,791,902
  119,791,904
  119,791,999
  119,793,680
  119,794,453
  119,794,816
  119,795,705
  119,795,708
  119,796,903
  119,797,337
  119,797,863
  119,797,959
  119,798,794
  119,799,082
  119,799,114
  119,799,133
  119,799,488
  119,799,523
  119,799,810
  119,800,007
  119,801,652
  119,801,830
  119,802,259
  119,802,261
  119,802,663
  119,802,690
  119,803,153
  119,803,154
  119,803,166
  119,803,178
  119,803,359
  119,803,712
  119,803,900
  119,806,768
  119,808,909
  119,809,020
  119,809,792
  119,809,817
  119,810,448
  119,811,881
  119,811,967
  119,811,990
  119,814,008
  119,815,148
  119,817,194
  119,817,201
  119,817,354
  119,817,355
  119,817,510
  119,818,005
  119,818,363
  119,818,579
A
T
C
T
C
-
G
T
C
G
-
A
A
A
C
G
C
T
T
C
A
G
G
T
T
-
A
2
G
C
-
T
-
C
T
2
-
T
-
-
T
G
-
T
G
A
-
-
C
-
2
A
A
C
A
T
G
-
-
C
T
-
T
-
C
5
G
C
G
-
-
A
C
G
-
C
-
C
A
C
A/C
T
T
T
A
A
T
-
A
T
T
G
A
C
-
T
G
C
C
A
-
-
T
T
T
T
C
-
T
G
G
T
C
-
8
A
A
5
G
T
G
C
G
T
C
G
G/A
G/A
G/T
52/-
C
2
A
A
T
G
A
G
C
G
C
A
A
A
A
G
G
G
G
A
A/T
T/C
G/T
A/C
G/C
C/T
C/T
C/T
T/A
G
C/G
A/G
G/A
A/T
T/C
A/G
T/A
A/G
G
A
A
-
C
C
-
C
T
4
C
T
G
C
G
-
A
G
T
A
-
-
A
A
T
G
C
A/G
G
C
A
T
A
C
A
C
G
A
A
G
A
G
8
-
G
2/-
8
-
T
C
T
-
4
-
C
T
T
G
T
T
A
2
A
G
T
T
-
-
G
-
G
G
G
T
A
13
A
-
-
A
A
T
A
G/C
T/G
T/C
C/G
G/A
A/T
A
C
A
4
T
T
T/G
C/T
C
G
T
C
A
2/-
2/-
G
-
C
A
T
A
T
T
A
C
A
2
C
T
A
T
G
C
T