Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 282,787 (bp)   Positions: 600
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.0
.001
.775
.016
.006
.005
.903
.003
.002
.039
.0
.005
.0
.0
.001
.001
.0
.001
.001
.001
.0
.016
.003
.086
.001
.0
.0
.006
.002
.004
.001
.001
.188
.021
.0
.0
.053
.002
.0
.001
.0
.003
.001
.0
.005
.005
.006
.003
.001
.001
.009
.0
.007
.002
.429
.0
.0
.0
.124
.006
.003
.0
.006
.0
.0
.002
.001
.031
.0
.004
--
--
.253
.167
.034
.629
.267
.019
.145
.105
.051
.0
.001
.002
.004
.009
.0
.0
.0
.001
.0
.015
.0
.004
.011
.001
.0
.019
.0
.0
.0
.034
.001
.001
.0
.0
.001
.001
.0
.922
.038
.002
.019
.001
.872
.0
.006
.001
.009
.005
.093
.003
.003
.005
.006
.641
.243
.001
.0
.0
.216
.048
.03
.063
.001
.002
.014
.063
.005
.002
.0
.003
.071
.002
.001
.0
.002
.0
.098
.0
.001
.001
.001
.011
.002
.002
.0
.0
.004
.0
.0
.0
.153
.002
.0
.0
.027
.002
.0
.008
.03
.0
.0
.002
.004
.003
.012
.017
.6
.0
.003
.0
.001
.988
1.0
.0
.0
.0
.0
.025
.026
.003
.042
.047
.01
.004
.023
--
.0
.048
.08
.032
.0
.004
.011
.422
.011
.002
.001
.002
.013
.001
.0
.0
.0
.014
.0
.002
.0
.025
.004
.002
.0
.0
.0
.019
.003
.0
.001
.012
.002
.003
.001
.001
.007
.003
.029
.112
.001
--
--
--
.666
.0
.0
.401
.0
--
--
.001
.003
.001
.002
.0
.002
.001
.002
.001
.012
.044
.062
.0
.013
.0
.197
.172
.034
.064
.007
.07
.013
.001
.032
.008
.027
.0
.0
.0
.001
.001
.001
.0
.022
.0
.0
.0
.817
.007
.05
.002
.092
.0
.013
.007
.0
.055
.0
.0
.033
.009
.015
.001
.0
.011
.0
.007
.0
.003
.012
.001
.0
.0
.0
.001
.225
.0
.0
.0
.0
.086
.024
.0
.0
.0
.001
.0
.0
.006
.129
.977
.679
.026
.022
.001
.0
.0
.004
.001
.001
.0
.0
.001
.106
.089
.009
.002
.017
.012
.002
.009
.001
.001
.004
.002
.001
.0
.012
.001
.002
.035
.008
.061
.001
.002
.001
.0
.0
.0
.0
.005
.003
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.048
.021
.238
.008
.023
.0
.0
.0
.001
.0
.0
.0
.016
.014
.001
.001
.003
.022
.088
.03
.857
.003
.004
.625
.018
.002
.006
.001
.006
.041
.037
.007
.001
.0
.0
.243
.006
.011
.0
.003
.011
.001
.0
.0
.002
.012
.986
.006
.001
.003
.019
.003
.006
.004
.251
.018
.001
.0
.007
.0
.001
.0
.004
.001
.006
.09
.001
.005
.004
.0
.0
.0
.0
.0
.021
--
.0
.0
.031
.002
.029
.076
.031
.004
.0
.0
.007
.0
.002
.0
.004
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.021
.829
.973
.024
.0
.092
.001
.038
.001
.0
.002
.001
.003
.0
.169
.003
.011
.03
.0
.002
.002
.011
.0
.0
.037
.001
.002
.001
.044
.004
.014
.007
.001
.001
.005
.001
.0
.001
.003
.0
.0
.0
.0
.001
.001
.003
.001
.001
.0
.0
.007
.006
.005
.007
.024
.002
.068
.063
.174
.062
.008
.0
.006
.0
.003
.13
.001
.057
.008
.0
.034
.097
.059
.002
.003
.005
.002
.0
.0
.084
.005
.0
.01
.043
.015
.006
.0
.0
.003
.0
.002
.002
.002
.0
.0
.019
--
--
--
--
--
--
--
.002
.0
.001
.001
.002
.001
.0
.008
.002
.005
.775
.975
.0
.004
.001
.0
.001
.01
.001
.324
.127
.007
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
C
T
A
T
A
G
T
A
C
G
T
A
T
A
C
T
T
G
G
A
A
T
A
T
C
C
C
G
G
A
G
A
G
A
A
T
T
G
T
T
A
C
T
A
A
C
T
C
A
G
T
T
A
G
T
C
G
G
T
T
T
C
G
T
C
C
A
A
G
C
A
T
G
T
A
C
C
C
T
G
C
C
A
G
C
G
G
T
C
A
A
G
G
T
C
A
G
T
C
G
G
C
A
G
A
G
G
C
G
A
C
G
A
A
T
G
G
A
C
A
A
T
C
T
C
A
G
A
G
C
C
C
G
T
A
T
G
T
G
G
G
T
A
G
G
G
C
G
C
A
C
G
T
G
G
T
C
G
T
A
A
T
G
C
T
C
T
A
C
G
T
C
G
G
C
C
C
G
G
A
T
T
G
T
T
C
T
G
A
G
G
C
T
G
T
C
T
T
G
A
A
T
T
T
T
G
A
C
A
T
A
T
G
A
C
C
T
C
A
G
A
G
A
C
G
A
C
A
G
G
A
C
G
T
T
T
T
C
C
G
G
G
C
G
A
T
T
A
G
G
G
C
T
T
G
G
T
A
G
T
C
A
T
G
G
G
T
C
C
A
T
A
A
C
T
A
G
C
A
A
A
T
A
G
C
G
G
C
T
C
C
T
C
G
A
A
C
C
C
C
C
C
C
G
C
A
A
A
A
C
T
T
A
C
C
G
T
C
G
T
G
A
C
C
T
T
A
A
C
G
A
A
G
G
C
G
T
A
C
G
C
C
T
A
G
C
A
G
T
T
A
G
G
C
T
T
T
C
G
T
G
T
T
C
C
C
A
C
T
T
T
A
G
C
A
A
G
G
T
G
T
C
A
A
T
C
T
T
G
C
C
T
C
C
G
A
G
A
A
A
T
A
G
G
C
G
T
C
T
G
T
T
A
A
T
T
A
T
G
G
G
C
G
G
C
A
A
C
C
T
T
T
G
G
T
G
A
G
A
C
T
T
A
A
T
A
C
C
G
C
A
C
C
C
G
C
C
G
G
G
C
G
C
T
C
G
C
A
A
A
T
C
C
C
C
T
G
G
T
A
C
T
C
C
G
C
T
C
A
A
G
G
A
A
T
G
A
A
A
C
C
C
C
G
T
G
G
T
T
T
C
G
C
C
A
G
C
T
C
G
T
G
C
G
G
T
C
C
G
G
A
C
C
C
G
T
G
T
G
C
C
G
T
C
T
C
T
C
C
T
A
A
T
C
C
A
A
T
T
T
G
A
T
T
T
T
C
G
G
C
A
C
T
A
A
A
A
T
C
T
T
G
C
T
G
A
A
A
T
A
T
G
G
A
T
G
C
T
T
C
  135,791,821
  135,792,228
  135,792,620
  135,792,963
  135,793,019
  135,793,030
  135,793,113
  135,793,147
  135,794,127
  135,794,694
  135,795,087
  135,795,242
  135,795,499
  135,795,533
  135,795,617
  135,795,668
  135,795,676
  135,796,019
  135,796,073
  135,796,751
  135,796,822
  135,796,869
  135,798,045
  135,798,383
  135,798,421
  135,799,085
  135,800,705
  135,801,143
  135,802,186
  135,802,252
  135,803,036
  135,803,501
  135,803,760
  135,803,872
  135,803,925
  135,804,079
  135,805,503
  135,805,888
  135,805,925
  135,806,997
  135,807,294
  135,808,211
  135,808,237
  135,808,490
  135,808,626
  135,808,773
  135,810,343
  135,810,621
  135,810,888
  135,811,598
  135,812,683
  135,813,578
  135,815,580
  135,815,583
  135,815,672
  135,815,837
  135,818,611
  135,819,363
  135,819,628
  135,819,834
  135,819,863
  135,821,402
  135,822,189
  135,822,356
  135,822,687
  135,823,482
  135,823,988
  135,824,169
  135,824,814
  135,825,636
  135,825,953
  135,825,974
  135,826,247
  135,826,556
  135,826,943
  135,827,642
  135,828,638
  135,829,110
  135,829,139
  135,829,143
  135,829,196
  135,829,370
  135,829,421
  135,829,447
  135,829,460
  135,829,478
  135,829,573
  135,830,796
  135,830,905
  135,832,759
  135,833,750
  135,833,821
  135,833,864
  135,833,930
  135,833,987
  135,834,037
  135,834,434
  135,834,970
  135,835,034
  135,835,127
  135,835,391
  135,835,415
  135,835,475
  135,835,608
  135,835,657
  135,835,706
  135,835,946
  135,836,002
  135,836,463
  135,836,608
  135,836,629
  135,836,986
  135,837,569
  135,838,025
  135,838,261
  135,838,985
  135,840,479
  135,840,985
  135,841,046
  135,841,075
  135,841,401
  135,841,747
  135,841,970
  135,842,085
  135,842,383
  135,842,505
  135,842,880
  135,843,544
  135,843,711
  135,845,083
  135,848,103
  135,850,200
  135,851,073
  135,851,516
  135,851,522
  135,852,213
  135,854,264
  135,856,102
  135,856,637
  135,857,892
  135,858,687
  135,859,594
  135,860,750
  135,861,708
  135,862,738
  135,863,418
  135,863,490
  135,863,633
  135,863,676
  135,863,709
  135,863,917
  135,863,981
  135,863,998
  135,864,272
  135,864,489
  135,865,103
  135,865,861
  135,866,076
  135,866,374
  135,866,634
  135,866,774
  135,866,785
  135,866,903
  135,866,932
  135,867,271
  135,867,534
  135,867,637
  135,867,661
  135,867,805
  135,867,873
  135,867,875
  135,868,389
  135,868,589
  135,868,757
  135,868,839
  135,869,250
  135,869,812
  135,871,578
  135,872,499
  135,873,653
  135,873,767
  135,874,351
  135,874,383
  135,874,450
  135,874,454
  135,874,684
  135,874,892
  135,875,071
  135,875,226
  135,875,742
  135,876,024
  135,876,478
  135,876,637
  135,877,292
  135,877,631
  135,878,378
  135,878,763
  135,879,114
  135,880,032
  135,880,247
  135,881,056
  135,881,175
  135,881,558
  135,881,904
  135,882,658
  135,882,852
  135,883,405
  135,883,499
  135,883,541
  135,884,059
  135,884,342
  135,884,868
  135,884,968
  135,885,027
  135,885,462
  135,885,521
  135,885,573
  135,885,827
  135,885,911
  135,885,973
  135,886,008
  135,886,014
  135,886,236
  135,886,277
  135,886,483
  135,886,713
  135,886,908
  135,886,977
  135,887,219
  135,887,664
  135,888,717
  135,888,881
  135,888,895
  135,889,478
  135,890,355
  135,894,055
  135,896,480
  135,897,147
  135,897,510
  135,898,049
  135,898,143
  135,898,183
  135,901,984
  135,903,110
  135,903,889
  135,907,011
  135,908,519
  135,911,475
  135,911,500
  135,913,459
  135,913,629
  135,916,232
  135,916,468
  135,916,762
  135,916,775
  135,916,795
  135,916,843
  135,917,247
  135,917,348
  135,917,974
  135,918,138
  135,919,247
  135,919,325
  135,919,416
  135,919,496
  135,919,529
  135,920,319
  135,920,902
  135,922,110
  135,922,228
  135,922,300
  135,922,539
  135,922,900
  135,922,948
  135,923,064
  135,923,427
  135,924,689
  135,925,022
  135,925,179
  135,925,209
  135,925,216
  135,925,314
  135,925,544
  135,925,618
  135,925,751
  135,926,262
  135,927,096
  135,927,118
  135,927,149
  135,927,432
  135,927,457
  135,927,848
  135,927,963
  135,928,401
  135,928,456
  135,928,472
  135,928,512
  135,928,656
  135,929,397
  135,929,439
  135,929,456
  135,930,074
  135,930,114
  135,930,499
  135,930,727
  135,930,916
  135,931,033
  135,931,478
  135,931,612
  135,932,677
  135,932,800
  135,932,861
  135,933,469
  135,934,094
  135,934,177
  135,934,520
  135,934,534
  135,934,706
  135,934,935
  135,936,034
  135,936,467
  135,936,637
  135,936,847
  135,937,252
  135,937,657
  135,938,780
  135,941,571
  135,942,245
  135,942,431
  135,942,714
  135,942,726
  135,943,371
  135,943,560
  135,946,248
  135,947,984
  135,948,032
  135,948,122
  135,948,221
  135,948,300
  135,948,444
  135,948,449
  135,948,510
  135,948,541
  135,948,624
  135,948,717
  135,948,817
  135,948,819
  135,948,930
  135,948,931
  135,948,978
  135,949,102
  135,949,116
  135,949,135
  135,949,201
  135,949,287
  135,949,342
  135,949,450
  135,949,475
  135,949,488
  135,949,649
  135,949,688
  135,949,723
  135,949,941
  135,950,721
  135,950,837
  135,950,866
  135,951,031
  135,951,035
  135,951,274
  135,951,477
  135,951,485
  135,951,682
  135,951,809
  135,951,896
  135,952,436
  135,952,795
  135,952,907
  135,953,003
  135,953,438
  135,954,194
  135,954,592
  135,954,754
  135,954,958
  135,955,096
  135,955,167
  135,955,290
  135,955,294
  135,955,406
  135,955,408
  135,955,466
  135,955,470
  135,955,501
  135,956,668
  135,957,038
  135,957,355
  135,957,471
  135,957,579
  135,957,784
  135,957,873
  135,957,940
  135,958,181
  135,958,382
  135,959,344
  135,959,770
  135,961,808
  135,961,939
  135,962,004
  135,962,014
  135,962,059
  135,962,063
  135,962,588
  135,964,348
  135,965,091
  135,965,249
  135,967,603
  135,967,916
  135,968,800
  135,969,016
  135,969,466
  135,969,493
  135,969,607
  135,969,703
  135,970,029
  135,970,178
  135,970,612
  135,971,553
  135,971,695
  135,972,578
  135,976,482
  135,978,542
  135,978,682
  135,978,838
  135,979,431
  135,980,310
  135,980,752
  135,981,058
  135,981,154
  135,981,757
  135,983,052
  135,983,981
  135,985,216
  135,985,499
  135,985,627
  135,986,951
  135,987,329
  135,987,472
  135,987,495
  135,987,502
  135,987,552
  135,987,821
  135,988,673
  135,989,416
  135,992,863
  135,995,260
  135,995,625
  135,995,709
  135,995,742
  135,996,442
  135,996,602
  135,996,604
  135,996,644
  135,996,747
  135,996,875
  135,997,062
  135,997,139
  135,997,281
  135,998,533
  135,999,962
  136,000,099
  136,001,178
  136,001,455
  136,001,670
  136,002,108
  136,002,476
  136,002,479
  136,004,357
  136,006,946
  136,006,966
  136,007,631
  136,009,707
  136,011,553
  136,011,708
  136,012,376
  136,013,147
  136,013,482
  136,014,645
  136,017,676
  136,019,325
  136,020,130
  136,020,914
  136,024,505
  136,026,511
  136,028,454
  136,030,809
  136,030,842
  136,030,857
  136,031,222
  136,031,329
  136,033,210
  136,033,387
  136,033,469
  136,033,753
  136,034,004
  136,034,751
  136,035,875
  136,035,893
  136,036,349
  136,036,508
  136,045,539
  136,046,292
  136,049,062
  136,049,064
  136,049,475
  136,049,820
  136,049,822
  136,050,413
  136,050,839
  136,051,574
  136,052,123
  136,054,986
  136,055,274
  136,055,282
  136,055,400
  136,055,419
  136,056,212
  136,056,538
  136,056,541
  136,056,588
  136,056,615
  136,057,145
  136,057,211
  136,057,239
  136,057,243
  136,057,252
  136,057,292
  136,057,453
  136,057,595
  136,057,637
  136,057,800
  136,058,175
  136,058,456
  136,058,828
  136,059,319
  136,059,341
  136,059,861
  136,060,757
  136,060,784
  136,060,798
  136,060,845
  136,061,049
  136,061,138
  136,061,144
  136,061,544
  136,062,492
  136,062,497
  136,062,907
  136,063,113
  136,064,234
  136,064,336
  136,064,509
  136,064,539
  136,064,701
  136,064,706
  136,064,737
  136,065,028
  136,065,231
  136,065,959
  136,066,038
  136,066,165
  136,066,228
  136,066,449
  136,066,759
  136,066,761
  136,066,783
  136,067,110
  136,067,150
  136,067,207
  136,067,246
  136,067,351
  136,067,621
  136,067,976
  136,068,195
  136,068,545
  136,068,599
  136,069,317
  136,069,357
  136,069,771
  136,070,016
  136,070,293
  136,070,414
  136,070,621
  136,070,624
  136,070,842
  136,071,098
  136,071,161
  136,071,382
  136,071,853
  136,072,173
  136,072,286
  136,073,026
T
C
C
C
C
T
C
G
T
A
C
G
C
G
T
G
C
C
A
G
T
C
G
G
G
T
T
A
C
G
A
G
A
G
G
A
C
A
C
C
G
T
C
G
G
T
C
T
G
A
C
C
G
A
C
T
A
T
C
C
C
A
A
C
T
T
G
G
C
T
G
A
A
C
G
A
T
T
C
T
T
G
G
A
T
T
A
C
T
G
G
A
A
C
T
G
A
A
T
A
A
A
G
A
G
A
T
A
A
G
C/T
A
G
C
G
A
A
G
T
C
G
C
T
G
T
T
A
G
A
T
T
T
A
C
C
C
T
T/A
A
A
A
G
G
A
A
A
T
T
G
G
T
A
C
A
T
G
T
C
A
G
G
C
T
T
C
A
T/C
A/C
T
T
C
T
A
T
T
T
A
T
G/T
T
C
C
C
T/A
T/A
T
C
A
G
A
A
T
C
T
G
A
C
C
A
C
T
C
C
C
C
C
G
A
C
C
G
C
A
G
G
T
A
T
G
A
G
A
G
T
T
G
T
G
A
A
C
A
C
C
T/C
C
C
T
T
G/C
G/T
G/C
T
T
G
C
G
T
A
A
A
T
G
C
T
T
C
G
A
C
T
G
C
T
A
T
C
T
T
G
C
C
G
T
A
G
A
T
G
G
G
C
G
A
T
A
A
G
A
T
T
C
T
T
T
G
T
G
C/T
C/T
T
T
T
T
T
G
T
G
G
T
C
C
G
T
T
A
C
A
A
C
A
G
A
T
C
C
G
G
T
A
G
T
A
A
T
A
G
G
T
A
T
T
C
C
A
T
G
A
C
G
G
A
A
A
C
C
G
G
A
G
A
A
C
T
T
T
G
T
C
C
A
T
A
T
G
G
A
A
C
A
C
T
G
T
C
T
C
C
A
C/G
C/G
T/C
T
T
A
G
A
G
G
G
C
G
A
A
T
C
G
T
G
C
C
G
G
G
C
C
G
C
C
T
G/A
C/G
T
A
T
G
G
T
A
C
C
A
A
C
C
T
C
A
G
A
G
C
T
G
C
G
A
A
T
T
T
T
T
T
A
T
T
T
T
T
A
T
A
G
A
T
T
T
G
G
C
A
A
T
T
G
A
A
C
T
T
C
T
T
A
T
G
T
G
G
A
A
G
G
G
T
C
T
T
A
A
A
A
A
C
T
G/C
A
C
C
T
T
T
T
G
A
T
G
T
A
A
A
T
A
T
C
T
T
A
A
T
T
T
T
A
C
A
A
A
T
T
A
C
G
C
T
C
T
T
G
G
G
C
A
A
T
C
C
C
A
T
G
C
C
C
C
T
A
A
T
G
T
C
C
C
C
C
C
A
C
C
G/A
T
C
T
C
A/G
T
C
A/G
C
A
A
G
C
A
T
C
C
T