Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 87,298 (bp)   Positions: 285
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.0
.0
.085
.012
.056
.016
.004
.004
.0
.001
.981
.003
.992
.022
.0
.004
.0
.0
.027
.001
.041
.001
.002
.112
.012
.0
.0
.004
.002
.004
.041
.0
.001
--
--
--
--
.003
.027
.191
.005
.015
.023
.0
.0
.001
.035
.001
.0
.096
.079
.004
.0
.084
.068
.003
.001
.998
.0
.0
.0
.022
.0
.004
.001
.004
.002
.022
.058
.004
.004
.013
.232
.023
.001
.0
.011
.0
.0
.0
.0
.0
.106
.031
.009
--
.029
.843
.081
.001
.0
.031
.002
.007
.003
.002
.001
.008
.001
.001
.001
.002
.278
.007
.091
.002
.003
.069
.002
.188
.122
.002
.0
.0
.0
.003
.0
.007
.0
--
--
--
.02
.742
.032
.015
.019
.019
.218
.002
.008
.004
.001
.0
.991
.001
.082
.0
.001
.002
.0
.0
.036
.0
.018
.002
.004
.0
.069
.071
.359
.151
.001
.001
.023
.003
.058
.016
.2
.187
.157
.02
.0
.002
.0
.001
.0
.084
.008
.002
.095
.072
.064
.01
.008
.421
.037
.076
.022
.015
.001
.002
.0
.005
.002
.002
.002
.004
.02
.011
.006
.0
.001
.0
.004
.0
.999
.001
.004
.0
.004
.001
.009
.128
.013
.013
.004
.012
.01
.0
.011
.73
.003
.0
--
.001
.002
.003
.0
.299
.011
.005
.0
.0
.001
.001
.001
.0
.0
.0
.0
.0
.001
.0
.0
.0
.0
.0
.001
.0
.616
.037
.001
.0
.009
.326
.092
.055
.0
.0
.0
.0
.0
1.0
.0
.199
.933
.0
.0
.002
.004
.022
.0
.001
.039
.0
.0
.0
.007
.0
.002
.0
.0
.003
.0
.0
.0
.011
.001
.001
.001
.02
.0
.0
1.0
Sh3pxd2b
Sh3pxd2b
Sh3pxd2b
Sh3pxd2b
Sh3pxd2b
Sh3pxd2b
Sh3pxd2b
Sh3pxd2b
Sh3pxd2b
Sh3pxd2b
Sh3pxd2b
Sh3pxd2b
Sh3pxd2b
Sh3pxd2b
Sh3pxd2b
Sh3pxd2b
Sh3pxd2b
Sh3pxd2b
Sh3pxd2b
Sh3pxd2b
Sh3pxd2b
Sh3pxd2b
Sh3pxd2b
Sh3pxd2b
Sh3pxd2b
Sh3pxd2b
Sh3pxd2b
Sh3pxd2b
Sh3pxd2b
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
C
G
-
A
A
C
G
G
T
C
-
G
T
T
G
G
T
T
A
C
G
A
A
C
C
C
T
-
3
G
6
A
T
T
T
C
G
A
T
-
A
G
T
C
A
T
C
T
G
T
G
C
A
T
A
T
C
-
T
T
C
3
A
G
C
T
C
G
G
A
A
A
C
G
C
C
G
-
-
-
T
G
G
-
C
T
C
-
-
G
T
A
G
A
A
A
G
A
A
C
G
G
C
-
G
A
3
C
T
C
C
C
G
A
G
T
C
G
A
G
G
G
G
T
T
G
C
G
A
A
A
T
T
T
C
A
3
C
A
A
A
A
C
C
A
C
G
-
C
C
A
A
-
G
C
G
-
A
A
-
-
A
C
A
A
-
A
C
C
C
A
A
G
T
T
A
T
G
G
T
A
G
T
T
-
-
-
T
-
-
-
C
C
T
G
G
G
T
G
G
A
T
G
G
A
-
C
C
G
G
C
T
9
G
C
-
C
C
A
2
-
C
A
T
T
T
2
T
C
G
C
C
C
C
-
G
G
-
-
-
A
A
15
C
C
2
A
C
G
C
A
A
C
C
G
G
T
-
A
C
G
T
G
G
T
G
T
T
G
A
G
T
T
G
G
T
-
-
A
G
T
T
T
G
T
  17,209,344
  17,209,345
  17,209,594
  17,209,598
  17,209,633
  17,209,713
  17,209,834
  17,209,855
  17,209,993
  17,209,994
  17,210,066
  17,210,154
  17,210,308
  17,210,604
  17,210,686
  17,210,791
  17,210,871
  17,211,004
  17,211,208
  17,211,377
  17,211,457
  17,211,558
  17,211,692
  17,211,753
  17,211,790
  17,212,038
  17,212,169
  17,212,201
  17,212,209
  17,212,242
  17,212,265
  17,212,297
  17,212,514
  17,213,039
  17,213,041
  17,213,184
  17,213,187
  17,213,359
  17,213,383
  17,213,536
  17,213,654
  17,213,774
  17,213,977
  17,214,084
  17,214,085
  17,214,091
  17,214,263
  17,214,283
  17,214,284
  17,214,362
  17,214,363
  17,214,442
  17,214,539
  17,214,546
  17,214,761
  17,214,888
  17,215,447
  17,216,374
  17,216,526
  17,216,896
  17,217,800
  17,219,978
  17,220,191
  17,220,394
  17,220,631
  17,220,692
  17,220,905
  17,221,771
  17,223,562
  17,223,650
  17,223,764
  17,223,873
  17,223,993
  17,224,424
  17,225,136
  17,225,258
  17,226,241
  17,226,453
  17,226,470
  17,226,488
  17,226,735
  17,226,832
  17,230,858
  17,232,569
  17,232,646
  17,232,957
  17,234,071
  17,235,304
  17,235,806
  17,237,474
  17,238,865
  17,239,276
  17,240,082
  17,241,785
  17,242,094
  17,242,405
  17,242,526
  17,242,538
  17,242,566
  17,242,579
  17,242,671
  17,242,673
  17,242,740
  17,242,810
  17,242,909
  17,243,091
  17,243,095
  17,243,171
  17,243,213
  17,243,247
  17,243,300
  17,243,343
  17,243,546
  17,243,655
  17,243,957
  17,244,121
  17,244,309
  17,244,365
  17,244,382
  17,244,805
  17,244,807
  17,244,825
  17,244,925
  17,245,620
  17,245,776
  17,245,846
  17,245,884
  17,247,895
  17,248,125
  17,248,791
  17,248,868
  17,249,047
  17,249,054
  17,249,059
  17,249,368
  17,249,445
  17,249,865
  17,250,507
  17,250,522
  17,250,525
  17,250,543
  17,250,752
  17,250,972
  17,250,979
  17,251,214
  17,251,238
  17,251,332
  17,253,353
  17,253,386
  17,253,552
  17,253,710
  17,253,739
  17,254,089
  17,254,426
  17,254,477
  17,254,819
  17,255,101
  17,255,360
  17,255,731
  17,255,739
  17,255,864
  17,255,877
  17,256,107
  17,257,745
  17,257,971
  17,260,269
  17,260,686
  17,260,745
  17,264,917
  17,264,923
  17,265,040
  17,265,041
  17,265,657
  17,265,804
  17,265,994
  17,266,159
  17,266,295
  17,266,314
  17,266,481
  17,267,123
  17,267,134
  17,267,531
  17,267,563
  17,267,635
  17,267,648
  17,267,649
  17,267,655
  17,267,656
  17,267,660
  17,267,665
  17,267,667
  17,267,941
  17,268,212
  17,268,703
  17,268,827
  17,268,917
  17,269,063
  17,269,358
  17,269,779
  17,270,282
  17,270,550
  17,270,794
  17,271,365
  17,271,577
  17,271,822
  17,271,950
  17,272,121
  17,272,641
  17,273,202
  17,273,407
  17,273,595
  17,273,633
  17,273,744
  17,273,993
  17,274,520
  17,274,604
  17,274,924
  17,275,451
  17,276,208
  17,277,224
  17,277,251
  17,282,544
  17,283,089
  17,283,111
  17,283,118
  17,283,120
  17,283,124
  17,283,136
  17,283,144
  17,283,149
  17,283,157
  17,283,168
  17,283,170
  17,283,175
  17,283,180
  17,283,181
  17,283,183
  17,283,187
  17,283,189
  17,283,192
  17,283,498
  17,283,618
  17,284,009
  17,284,657
  17,284,855
  17,285,704
  17,285,747
  17,286,469
  17,287,282
  17,287,444
  17,289,406
  17,289,703
  17,290,243
  17,290,364
  17,290,529
  17,291,509
  17,291,819
  17,291,880
  17,292,104
  17,292,300
  17,292,477
  17,292,576
  17,293,007
  17,293,073
  17,293,112
  17,293,186
  17,293,240
  17,293,661
  17,293,685
  17,293,690
  17,293,713
  17,293,760
  17,293,820
  17,294,248
  17,294,353
  17,294,379
  17,294,456
  17,294,540
  17,294,955
  17,294,956
  17,295,799
  17,296,021
  17,296,156
  17,296,349
  17,296,406
A
A
G
G
G
-
A
C
C
G
A
T
A
C
A
A
C
C
G
A
A
G
G
G
T
T
C
G
-
A
-
G
C
A
A
T
A
G
C
T
T
A
C
T
G
C
T
C
A
C
A
T
C
C
T
C
T
T
C
G
T
3/-
G
A
A
A
G
T
A
G
T
G
G
T
A
T
C
G
A
A
C
A
T
4
T
G
G
5
T
A
C
G
C
G
C
T
A
G
G
T
A
A
T
C
T
-
-
T
C
A
T
A
A
G
A
C
T
T
G
C
G/C
A
T
-
G
A
T
T
T
G
-
C
T/A
T/A
T
C
3/-
G
C
G
T
G
T
G
G
T
A
2
T
T
-
C
T
A
A
A
C
C
T
A
-/A
-
T
G
G
5
C
T
T
T
-
G
T
G
G
G
C
A
A
C
C
T
-
C
A
C
6
C
C
2
4
T
T
C
A
A
A
C
A
A
G
G
C
A
G
20
G
T
C
A
T
G
-
A
T
-/24
T
T
C
-
2
T
-
-
-
-
-
A
-
T
T
-
-
-
25
C
A
19
3
17
T
T
-
T
T
-
G
T
A
T
G
T
T
T
A
A
C
C
G
T
A
C
A
A
C
A
G
G
-
C
A
C
C
A
A
C
G
2
G
A
C
A
C
A
A