Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 163,807 (bp)   Positions: 373
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.027
.033
.742
.734
.171
.062
.085
.028
.011
.852
.012
.0
.907
.014
.01
.004
.05
.0
.003
.001
.02
.169
.006
.0
.003
.004
.001
.001
.033
.008
.011
.001
.003
.0
.0
.0
.007
.0
.318
.001
.0
--
.004
.0
.004
.008
.004
.002
.025
.015
.002
.0
.0
.0
.0
.0
.972
.005
.015
.0
.001
.0
.001
.001
.0
.009
.0
.001
.075
.896
.001
.06
.0
.002
.011
.004
.02
.004
.001
.0
.001
.003
.016
.036
.047
.0
.014
.012
.014
.0
.001
.001
.004
.007
.045
.7
.116
.692
.016
.67
.004
.0
.049
.001
.005
.131
.006
.002
.159
.0
.0
.005
.001
.017
.0
.0
.001
.0
.003
.165
.521
.044
.051
.002
.0
.005
.0
.156
.175
.08
.984
.003
1.0
.033
.028
.707
.021
.018
.002
.009
--
--
.034
.23
.148
.015
.476
.714
.03
--
.001
.014
.016
.197
.198
--
--
.042
.946
.007
.107
.002
.001
--
--
--
--
--
.0
.06
.001
.256
.002
.193
.0
.031
.013
.01
.006
.0
.003
.012
.0
.377
.052
.0
.068
.003
.001
.0
.046
.964
.993
.035
.027
.002
.303
.291
.021
.158
.006
.041
.015
.265
.018
.0
.001
.211
.002
.003
.004
.001
.005
.003
.306
.0
.016
.182
.208
.036
.09
.02
.022
.146
.003
.001
.0
.004
.02
.005
--
.168
.011
.0
.039
--
--
--
--
--
--
--
.012
--
--
--
--
.002
.014
.015
.012
.012
.018
.006
.535
.0
.02
.003
.319
.032
.013
.019
.003
.008
.0
.001
.0
.001
.004
.0
.004
.0
.004
.002
.001
.0
.001
.0
.0
1.0
.003
.001
.001
.024
.335
.001
.185
.006
.153
.04
.71
.467
.097
.0
.067
.968
.961
.413
.02
.002
.014
.103
.157
.0
.011
.0
.016
.058
.031
.001
.002
.009
.003
.133
.0
.0
.575
.392
.0
.005
.187
.032
.0
.032
--
.001
.003
.004
.001
.007
.007
.007
.005
.967
.0
.522
.001
.008
.002
.0
.994
.0
.0
.005
--
.0
.007
.003
.001
.037
.004
.0
.0
.001
.007
.002
.001
.469
.0
.033
.004
.0
.009
.018
.559
.0
.084
.075
.179
.941
1.0
.992
.0
Sh3d19
Sh3d19
Sh3d19
Sh3d19
Sh3d19
Sh3d19
Sh3d19
Sh3d19
Sh3d19
Sh3d19
Sh3d19
Sh3d19
Sh3d19
Sh3d19
Sh3d19
Sh3d19
Sh3d19
Sh3d19
Sh3d19
Sh3d19
Sh3d19
Sh3d19
Sh3d19
Sh3d19
Sh3d19
Sh3d19
Sh3d19
Sh3d19
Sh3d19
Sh3d19
Sh3d19
Sh3d19
Sh3d19
Sh3d19
Sh3d19
Sh3d19
Sh3d19
Sh3d19
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Prss48
Prss48
Prss48
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
G
A
C
A
C
C
A
T
C
A
G
T
G
T
G
A
C
C
T
G
T
A
A
C
T
G
T
A
T
T
C
G
T
C
A
G
T
A
T
C
G
G
C
G
C
C
G
A
G
G
A
C
C
T
C
T
T
G
A
A
G
C
C
C
C
C
A
G
G
G
A
G
G
G
G
G
A
A
T
C
T
G
G
G
C
T
C
A
G
C
T
G
G
G
T
T
A
A
G
A
A
C
G
G
A
A
T
G
T
T
T
C
C
A
C
A
T
T
C
G
T
G
C
T
A
T
G
T
C
C
C
G
T
T
C
A
G
C
A
T
G
G
G
T
G
G
G
A
G
G
T
C
G
G
T
G
A
G
C
T
A
T
A
A
G
T
G
G
A
A
G
T
G
A
T
T
C
C
C
C
C
T
A
C
G
C
G
G
C
T
G
A
A
G
T
T
C
G
T
G
T
C
G
A
T
C
C
A
C
C
A
G
C
G
A
G
A
T
A
T
G
C
G
T
G
C
T
C
A
C
G
C
G
C
C
A
T
G
G
C
G
C
T
A
T
T
A
T
A
C
C
C
A
C
C
T
C
T
T
T
A
A
T
T
T
C
C
C
T
C
T
A
T
C
C
C
T
C
C
C
C
T
G
G
G
A
T
T
G
A
G
C
C
A
A
A
A
G
A
T
G
T
C
G
G
G
G
G
G
A
C
G
C
C
T
A
G
G
A
G
A
G
T
T
T
A
A
T
T
T
A
G
T
A
C
T
A
C
G
T
G
A
G
C
G
T
C
G
G
T
A
G
A
A
C
C
A
C
A
A
A
G
C
A
G
C
A
T
A
A
A
C
C
  185,269,896
  185,272,251
  185,272,648
  185,272,649
  185,272,882
  185,276,058
  185,276,204
  185,276,480
  185,277,097
  185,278,547
  185,279,445
  185,280,481
  185,282,349
  185,282,517
  185,283,136
  185,284,251
  185,288,007
  185,288,085
  185,288,086
  185,288,134
  185,288,390
  185,288,559
  185,288,667
  185,288,751
  185,288,939
  185,292,995
  185,299,206
  185,299,606
  185,299,622
  185,299,624
  185,299,809
  185,299,938
  185,300,173
  185,300,866
  185,301,121
  185,301,474
  185,301,750
  185,304,440
  185,305,067
  185,306,031
  185,307,373
  185,308,052
  185,308,769
  185,310,005
  185,310,074
  185,310,893
  185,311,063
  185,311,206
  185,311,329
  185,311,384
  185,311,416
  185,311,820
  185,311,848
  185,311,868
  185,311,938
  185,312,432
  185,312,490
  185,312,795
  185,312,823
  185,313,268
  185,313,279
  185,313,800
  185,313,823
  185,314,043
  185,314,102
  185,314,259
  185,314,455
  185,314,542
  185,314,590
  185,314,807
  185,314,936
  185,315,493
  185,315,937
  185,316,125
  185,316,651
  185,316,711
  185,317,003
  185,317,378
  185,317,649
  185,317,934
  185,317,963
  185,317,977
  185,318,040
  185,318,077
  185,318,142
  185,318,227
  185,318,434
  185,318,536
  185,318,802
  185,318,854
  185,318,983
  185,319,155
  185,319,293
  185,321,471
  185,322,470
  185,323,838
  185,323,898
  185,324,335
  185,324,973
  185,325,810
  185,326,310
  185,326,551
  185,328,173
  185,328,266
  185,328,317
  185,331,654
  185,332,931
  185,332,941
  185,333,490
  185,333,507
  185,334,172
  185,335,153
  185,335,301
  185,335,450
  185,335,522
  185,335,605
  185,335,607
  185,335,802
  185,335,941
  185,336,014
  185,336,033
  185,336,661
  185,337,020
  185,337,418
  185,337,662
  185,338,753
  185,339,301
  185,339,390
  185,339,980
  185,340,034
  185,341,349
  185,343,053
  185,343,648
  185,344,447
  185,344,633
  185,344,654
  185,345,352
  185,346,102
  185,346,120
  185,346,379
  185,347,006
  185,347,026
  185,348,435
  185,348,939
  185,349,712
  185,350,163
  185,350,295
  185,351,268
  185,352,048
  185,352,129
  185,352,393
  185,352,684
  185,353,098
  185,353,199
  185,353,210
  185,353,629
  185,353,959
  185,355,720
  185,356,279
  185,357,186
  185,357,761
  185,359,291
  185,359,322
  185,359,557
  185,360,013
  185,360,300
  185,360,413
  185,360,418
  185,360,964
  185,361,241
  185,361,713
  185,361,833
  185,362,218
  185,362,239
  185,362,607
  185,362,627
  185,362,813
  185,362,814
  185,363,333
  185,363,500
  185,363,868
  185,363,926
  185,365,477
  185,365,674
  185,366,422
  185,367,263
  185,367,333
  185,367,354
  185,367,544
  185,367,547
  185,369,067
  185,369,277
  185,369,346
  185,369,864
  185,369,955
  185,371,088
  185,371,975
  185,372,861
  185,373,055
  185,373,152
  185,373,833
  185,374,194
  185,374,246
  185,374,454
  185,374,663
  185,374,900
  185,374,906
  185,375,288
  185,375,895
  185,375,976
  185,375,977
  185,376,363
  185,376,845
  185,376,904
  185,377,185
  185,377,732
  185,377,741
  185,377,901
  185,378,138
  185,378,870
  185,379,524
  185,379,540
  185,379,543
  185,379,715
  185,379,770
  185,379,792
  185,379,812
  185,379,976
  185,380,027
  185,380,157
  185,380,510
  185,380,708
  185,380,825
  185,381,751
  185,381,981
  185,382,322
  185,382,323
  185,382,698
  185,382,834
  185,382,850
  185,382,903
  185,382,915
  185,382,965
  185,383,248
  185,383,269
  185,383,284
  185,383,304
  185,383,496
  185,383,536
  185,383,546
  185,383,547
  185,383,548
  185,383,549
  185,383,896
  185,384,430
  185,384,559
  185,384,621
  185,385,470
  185,386,123
  185,387,113
  185,387,287
  185,387,486
  185,388,684
  185,389,122
  185,389,677
  185,389,948
  185,389,949
  185,390,002
  185,390,543
  185,390,547
  185,390,829
  185,391,443
  185,391,842
  185,392,200
  185,392,225
  185,392,724
  185,392,984
  185,393,109
  185,393,188
  185,393,851
  185,394,018
  185,394,439
  185,394,498
  185,395,035
  185,395,068
  185,395,339
  185,395,435
  185,395,568
  185,395,760
  185,395,967
  185,395,989
  185,396,155
  185,396,182
  185,397,041
  185,397,058
  185,397,782
  185,397,783
  185,398,027
  185,398,031
  185,398,133
  185,398,151
  185,398,206
  185,398,321
  185,398,427
  185,398,441
  185,398,470
  185,398,553
  185,398,773
  185,398,980
  185,400,102
  185,400,790
  185,400,876
  185,401,157
  185,401,395
  185,401,408
  185,401,447
  185,401,801
  185,401,828
  185,402,938
  185,403,000
  185,403,081
  185,403,580
  185,404,004
  185,405,992
  185,407,050
  185,407,536
  185,407,877
  185,407,878
  185,408,689
  185,408,776
  185,408,777
  185,408,808
  185,408,824
  185,409,177
  185,409,650
  185,411,804
  185,412,344
  185,413,515
  185,413,600
  185,413,915
  185,414,205
  185,414,393
  185,414,600
  185,414,847
  185,415,112
  185,415,329
  185,415,475
  185,415,776
  185,415,842
  185,417,211
  185,418,656
  185,418,927
  185,418,973
  185,419,091
  185,419,735
  185,420,001
  185,420,009
  185,420,077
  185,420,292
  185,422,426
  185,422,622
  185,423,225
  185,424,074
  185,424,134
  185,424,283
  185,425,239
  185,427,767
  185,428,766
  185,428,841
  185,429,727
  185,430,256
  185,430,397
  185,430,926
A
T
A
T
T
T
G
C
T
G
A
C
T
C
A
G
T
G
A
A
C
C
G
T
C
A
A
A/G
A
A
T
G/T
C
T
C
A
C
G
C
T
A
A
A
A
G
G
A
G
T
C
G
T
T
G
C/T
C
C
A
C
G
T
T
T
G
T
T
G
A
T
T
C
A
A
A
A
A
T
T
A
T
G
A
T
A
T
C
T
T
A
T
C
C
A
A
C
G
G
G
A
C
C
T
T
A
G
G
C
A
A
C
A
A
T
G
T
G
G
C
T
A
C
A
T
C
C
G
A
C
T
T
A
A
A
G
T
G
A
T
G
C
A
A
C
C
T
A
T
G
A
T
C
T
A
A
A
A
G
A
T
C
G
A
G
G
A
C
A
A
G
G
A
C
A
G
C
C
T
G
T
G
T
C
C
C/A
A
G
T
A
T
C
G/A
A/C
C
T
C
C
T
C
G
A
A
G
A
G
C
C/T
C/T
A/G
A
C/A
A/T
A
G
A
T
A
G
C
G
C
A
T
A
A
G/A
A
C
T
G
A
T
A
A
G
T
A/G
T/C
G/T
T
G
A
T
C
T
C
C
G
C
C
T
C/T
C/T
G
G
A
G
A
T/A
C
G
G
C
C
A
C
T
T
G
C
T
C
G
C
T
T
T
C
A
T
C/T
A
C
A
A
A
G
A
G
G/C
C
A
T
A
G
C
G
A/G
T
C
G
A
G
G
C
A
C
T
A
A
T
G
A
T
G
G
G
A
A
G
A
G
A
C
C
C
T
G
C
C
C
C
A
C
G
T
A
C
T
A
G
A
G
A
A
T
A
T
A
T
C
G
A
G
C
T
T
G
T
G
G
G
A
T
T
A
T
G
C
G
G
G
T
T