Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 85,747 (bp)   Positions: 463
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.315
.252
.0
.0
.0
.994
.99
.945
.099
.003
.0
.001
.0
.185
.09
.042
.796
.044
.283
.0
.0
.002
.022
.01
.004
.0
.001
.029
.028
.0
.03
.332
.694
.019
.072
.0
.001
.178
--
--
.006
.018
.021
.004
.199
.049
.005
.479
.603
.0
.0
.002
.033
.212
.093
.004
.078
.026
.03
.002
.001
.0
.001
.007
.017
.027
.063
.079
.344
.027
.028
.005
.693
.661
.483
.285
.446
.47
.074
.472
.0
.0
.203
.011
.0
.0
.828
.001
.001
.002
.004
.005
.106
.017
.159
.985
.854
1.0
.997
.981
.005
.998
.995
.959
.126
.0
.173
.999
.001
.011
.006
.008
.001
.0
.0
.001
.009
.558
.022
.001
.063
.049
.004
.001
.003
.165
.057
.022
.005
.245
.289
.104
.028
.005
.128
.033
.001
.001
.112
.001
.003
.021
.0
.0
.0
.999
.033
.023
.001
.001
.004
.177
.376
.104
.28
.001
.016
.195
.112
.248
.009
.0
.001
.005
.001
.016
.02
.719
.168
.0
.868
.068
.1
.72
.006
.241
.01
.001
.001
.022
.001
.0
.004
.009
.009
.004
.0
.008
.001
.053
.008
.008
.007
.016
.012
.0
.002
.443
.006
.002
.959
.974
.996
.0
.0
.0
.0
.001
.507
.004
.004
.025
.0
.006
.003
.218
.0
.558
.997
.971
.031
.409
.053
.123
.024
.008
.015
.002
.0
.0
.01
.067
.046
.315
.128
.04
.001
.001
.527
.061
.001
.005
.015
.004
.001
.002
.0
.001
.001
.001
.067
.004
.35
.151
.016
.246
.061
.026
.025
.13
.008
.042
.004
.006
.002
.005
.027
.041
.007
.004
.0
.016
.004
.002
.002
.018
.012
.003
.001
.002
.001
.0
.0
.007
.001
.002
.013
.0
.006
.002
.074
.002
.108
.179
.587
.005
.003
.014
.418
.062
.058
.04
.008
.036
.009
.243
.039
.0
.004
.0
.0
.004
.984
.995
.868
.027
.525
.006
.592
.072
.0
.002
.004
.004
.004
.0
.0
.002
.005
.062
.0
.005
.001
.0
.021
.026
.123
.544
.323
.134
.009
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.002
.012
.003
.017
.001
.0
.0
.057
.51
.003
.009
.001
.0
.022
.021
.004
.108
.0
.514
.016
.044
.002
.0
.003
.024
.055
.005
.003
.01
.024
.004
.008
.013
.002
.022
.322
.341
.08
.404
.03
.041
.015
.014
.178
.151
.318
.135
.017
.819
.004
.014
.141
.0
.001
.018
.027
.007
.006
.002
.003
.0
.313
.016
.0
.004
.011
.001
.162
.234
.078
.039
.006
.0
.002
.0
.005
.044
.003
.001
.004
.001
.004
.0
.003
.001
.001
.0
.0
.001
.006
.004
.005
.0
.002
.0
.005
.001
.0
.004
.002
.001
.002
.0
.001
.002
.02
.018
.0
.005
.017
.0
.989
.977
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
LOC108351781
LOC108351781
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
G
C
T
T
G
T
T
T
G
A
T
T
G
T
A
A
G
G
C
C
G
G
A
T
A
C
A
A
G
A
T
T
T
T
G
G
C
T
T
C
C
T
A
A
T
T
A
A
A
T
A
T
T
G
T
G
G
C
A
G
C
A
G
A
T
C
A
C
T
A
A
T
A
T
T
A
T
T
G
A
A
G
T
T
T
A
A
C
A
T
C
A
C
A
G
T
C
C
G
C
A
G
C
T
G
A
T
A
G
T
G
A
G
T
G
T
A
G
T
T
C
A
A
T
G
G
G
C
G
C
G
A
T
T
C
T
T
A
G
G
C
G
T
C
G
T
T
A
T
T
C
G
T
G
C
T
A
C
A
G
C
C
G
G
T
G
T
C
A
T
A
G
G
G
T
A
G
G
T
C
C
A
G
T
A
A
T
C
G
C
G
C
C
A
A
G
G
C
A
G
A
G
A
A
C
C
A
C
T
G
A
T
C
G
T
G
A
T
C
T
G
C
G
T
T
T
C
G
C
A
T
A
A
T
A
G
T
C
G
T
G
G
T
A
A
G
A
G
G
T
C
A
A
C
G
T
A
T
G
G
A
T
A
T
T
T
G
G
G
G
T
G
T
A
G
G
G
G
C
C
T
C
C
C
G
C
C
A
G
A
T
A
A
A
T
A
T
T
C
A
A
T
C
A
A
A
G
C
T
T
T
C
C
T
A
G
G
A
A
T
C
A
G
T
A
G
C
G
A
C
T
C
A
C
G
G
A
A
A
A
T
G
T
G
C
C
G
C
G
C
G
G
C
G
T
C
T
A
T
C
C
G
A
G
C
T
C
A
G
G
G
A
G
G
G
G
C
C
C
C
G
C
A
G
A
T
A
C
A
C
T
A
G
T
A
T
G
C
T
G
T
C
A
T
G
G
A
T
C
G
G
T
C
G
C
C
A
A
T
C
C
A
T
C
C
A
C
A
A
A
T
A
A
C
G
C
C
G
G
T
C
A
C
A
C
A
C
A
G
C
G
T
C
T
A
A
T
G
G
G
C
G
A
  118,802,703
  118,802,704
  118,802,853
  118,802,859
  118,802,861
  118,803,235
  118,803,258
  118,803,372
  118,803,523
  118,804,228
  118,804,249
  118,804,342
  118,804,346
  118,804,982
  118,805,122
  118,805,252
  118,805,346
  118,805,385
  118,805,609
  118,805,800
  118,805,806
  118,805,823
  118,806,274
  118,806,826
  118,806,917
  118,807,020
  118,807,022
  118,807,178
  118,807,895
  118,808,019
  118,808,107
  118,808,169
  118,808,849
  118,808,914
  118,809,374
  118,810,067
  118,810,295
  118,811,040
  118,811,274
  118,811,275
  118,811,818
  118,811,843
  118,811,844
  118,812,003
  118,812,238
  118,812,283
  118,812,303
  118,812,358
  118,812,381
  118,813,776
  118,813,792
  118,813,817
  118,814,173
  118,814,934
  118,815,010
  118,815,707
  118,815,713
  118,815,823
  118,815,854
  118,815,892
  118,815,960
  118,816,106
  118,816,187
  118,816,372
  118,816,524
  118,816,603
  118,816,796
  118,816,810
  118,817,231
  118,817,268
  118,817,269
  118,817,556
  118,817,793
  118,817,875
  118,817,937
  118,818,024
  118,818,142
  118,818,249
  118,818,269
  118,818,432
  118,818,491
  118,818,792
  118,818,803
  118,818,838
  118,818,909
  118,818,914
  118,819,110
  118,819,191
  118,819,475
  118,819,553
  118,819,766
  118,820,428
  118,820,881
  118,821,509
  118,822,136
  118,822,162
  118,822,165
  118,822,211
  118,822,217
  118,822,336
  118,822,364
  118,824,083
  118,824,380
  118,824,618
  118,825,098
  118,825,125
  118,825,138
  118,825,244
  118,826,020
  118,826,433
  118,826,550
  118,826,604
  118,826,614
  118,826,687
  118,826,752
  118,826,962
  118,826,975
  118,827,109
  118,827,124
  118,827,363
  118,827,618
  118,828,073
  118,828,212
  118,828,441
  118,828,633
  118,828,815
  118,829,238
  118,829,310
  118,829,316
  118,829,624
  118,829,645
  118,830,887
  118,832,120
  118,832,617
  118,832,793
  118,833,096
  118,833,125
  118,833,499
  118,833,708
  118,833,947
  118,834,055
  118,834,151
  118,834,239
  118,834,291
  118,834,293
  118,834,393
  118,834,682
  118,834,699
  118,834,787
  118,835,046
  118,835,430
  118,836,357
  118,836,479
  118,836,626
  118,836,741
  118,836,796
  118,836,848
  118,837,183
  118,837,219
  118,838,050
  118,838,156
  118,838,341
  118,838,399
  118,838,745
  118,839,024
  118,839,411
  118,839,418
  118,839,451
  118,839,517
  118,839,765
  118,839,879
  118,839,987
  118,840,118
  118,840,695
  118,840,796
  118,841,023
  118,841,182
  118,841,360
  118,841,490
  118,841,509
  118,841,561
  118,841,975
  118,842,204
  118,842,417
  118,842,569
  118,842,576
  118,842,582
  118,842,642
  118,842,885
  118,843,189
  118,843,508
  118,843,530
  118,843,575
  118,843,661
  118,843,694
  118,843,702
  118,843,726
  118,843,811
  118,843,863
  118,844,258
  118,844,541
  118,844,625
  118,844,835
  118,845,010
  118,845,336
  118,845,413
  118,845,456
  118,845,525
  118,846,051
  118,846,113
  118,846,129
  118,846,310
  118,846,484
  118,846,586
  118,846,600
  118,846,824
  118,847,115
  118,847,445
  118,847,740
  118,848,330
  118,848,519
  118,848,790
  118,849,450
  118,849,548
  118,849,642
  118,849,777
  118,849,936
  118,849,986
  118,850,196
  118,850,351
  118,850,441
  118,850,650
  118,850,738
  118,850,957
  118,851,220
  118,851,308
  118,851,880
  118,852,116
  118,852,745
  118,852,895
  118,852,931
  118,853,230
  118,853,383
  118,853,455
  118,853,456
  118,853,571
  118,853,943
  118,854,030
  118,854,441
  118,854,493
  118,855,007
  118,855,150
  118,855,225
  118,855,373
  118,855,463
  118,855,509
  118,855,711
  118,855,905
  118,855,915
  118,855,935
  118,856,011
  118,856,029
  118,856,056
  118,856,057
  118,856,169
  118,856,210
  118,856,583
  118,856,777
  118,856,813
  118,857,114
  118,857,391
  118,857,964
  118,857,985
  118,858,523
  118,858,527
  118,858,900
  118,858,901
  118,859,008
  118,859,068
  118,859,123
  118,859,264
  118,859,431
  118,859,451
  118,859,463
  118,859,482
  118,859,507
  118,859,592
  118,859,802
  118,859,843
  118,860,196
  118,860,385
  118,860,432
  118,860,466
  118,860,528
  118,860,534
  118,860,648
  118,860,698
  118,860,917
  118,860,962
  118,861,905
  118,861,906
  118,861,948
  118,862,059
  118,862,065
  118,862,166
  118,862,587
  118,862,602
  118,862,775
  118,862,825
  118,863,154
  118,863,215
  118,863,239
  118,864,000
  118,864,216
  118,864,275
  118,864,493
  118,864,627
  118,864,654
  118,865,197
  118,865,307
  118,865,409
  118,865,449
  118,865,774
  118,865,878
  118,866,249
  118,866,626
  118,866,719
  118,867,062
  118,867,356
  118,867,432
  118,867,701
  118,867,938
  118,867,941
  118,868,063
  118,868,332
  118,868,493
  118,868,597
  118,868,610
  118,868,704
  118,869,271
  118,869,496
  118,869,718
  118,869,894
  118,869,918
  118,869,966
  118,869,974
  118,869,983
  118,869,985
  118,869,992
  118,870,051
  118,870,225
  118,870,310
  118,870,606
  118,870,660
  118,870,819
  118,870,943
  118,870,950
  118,871,556
  118,872,364
  118,872,531
  118,872,568
  118,872,662
  118,872,809
  118,872,991
  118,873,480
  118,873,572
  118,873,580
  118,873,656
  118,873,904
  118,873,927
  118,874,195
  118,874,262
  118,874,346
  118,874,386
  118,875,325
  118,875,453
  118,875,466
  118,875,495
  118,875,618
  118,875,722
  118,875,781
  118,875,836
  118,875,850
  118,875,902
  118,876,002
  118,876,108
  118,876,114
  118,876,138
  118,876,291
  118,876,329
  118,876,332
  118,876,370
  118,876,481
  118,876,633
  118,876,642
  118,876,663
  118,876,842
  118,876,944
  118,877,218
  118,877,324
  118,877,380
  118,877,623
  118,877,856
  118,878,206
  118,879,021
  118,879,097
  118,879,116
  118,879,258
  118,879,496
  118,879,618
  118,879,938
  118,880,421
  118,880,437
  118,880,453
  118,880,663
  118,881,336
  118,881,404
  118,881,775
  118,881,808
  118,882,457
  118,882,535
  118,882,734
  118,882,862
  118,882,867
  118,883,205
  118,883,434
  118,883,760
  118,883,888
  118,883,892
  118,883,896
  118,884,064
  118,884,131
  118,884,489
  118,884,508
  118,884,527
  118,884,558
  118,884,565
  118,884,632
  118,884,698
  118,884,752
  118,884,787
  118,884,788
  118,884,824
  118,884,906
  118,884,942
  118,885,359
  118,885,436
  118,885,489
  118,885,581
  118,885,626
  118,885,819
  118,886,075
  118,886,137
  118,886,351
  118,886,524
  118,886,634
  118,886,635
  118,886,823
  118,887,316
  118,887,661
  118,887,689
  118,887,962
  118,888,089
C
T
C
G
T
C
A
G
T
G
C
C
A
C
G
G
C
A
T
T
A
A
G
A
C
A
G
T
T
G
C
A
C
A
A
A
T
C
A
A
T
C
T
C
C
C
G
G
T
C
C
C
C
A
A
G/T
G/T
T
T
T
T
G
A
G
C
T
G
G
C
G
T
C
G
C
C
G
G
C
C
G
G
C
A
C
C
G
T
T
G
C
T
G
T
G
C
C
T
A
T
T
G
A
T
C
C
G
C
C
C
G
T
G
A
C
C
G
C
A
C
C
T
T
G
A
T
A
A
T
A
G
A
G
C
C
T
C
C
G
A
A
T
C
C
T
T
C
C
G
C
C
T
A
C
A
T
G
G
A
G
C
T
T
A
T
C
A
G
T
G
C
G
T
A
A
C
G
A
C
C
T
T
G
A
C
C
G
G
G
C
T
A
T
A
G
G
A
A
T
T
A
T
T
G
G
T
T
T
G
C
A
G
C
T
A
C
A
G
G
T
G
C
T
T
C
C
C
T
A
T
C
C
G
T
A
C
A
G
T
A
C
A
A
C
T
T
A
G
A
A
C
G
G
G
A
A
C
T
C
A
T
G
A
T
A
C
A
A
T
A
A
C
C
C
G
A
A
T
A
T
T
C
A
T
T
T
T
G
C
A
G
C
C
C
G
G
G
C
G
G
G
G
G
T
C
C
G
C
T
C
G
G
A
T
C
G
T
A
G
G
A
T
G
A
G
T
A
T
A
G
T
C
T
G
A
A
T
G
T
C
G
C
A
A
A
G
G
T
G
A
T
A
A
A
A
C
T
G
T
C
T
T
A
G
A
C/A
C
T
C
A
C
A
G
T
A
A
A
T
T
T
G
A
A
T
A
C
C
G
T
G
A
C
G
A
G
G
A
A
T
A
A
C
T
G
C
C
A
G
G
T
A
T
C
A
A
T
T
T
G
C
T
G
G
C
T
T
G
T
G
A/G
A/G
G
G
G
T
T
T
T
A
A
C
T
G
G
T
T
G
T
G
A
T
A
C
T
C
G
G
C
A
A
A
T
T
G