Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 101,587 (bp)   Positions: 287
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.049
.002
.998
.996
.017
.082
.0
.0
.001
.419
.005
.006
.0
.0
.004
.001
.017
.861
.007
.002
.0
.001
.003
.023
--
--
.004
.001
.011
--
--
--
.0
--
.0
.009
.003
.0
.05
.0
.002
.001
--
.0
.0
.209
.002
1.0
.0
.002
.074
.002
.123
.0
.001
.0
.0
.0
.008
.005
.001
.022
.022
.002
.076
.002
.269
.003
.096
.627
.003
.0
.0
.001
.0
.101
.021
.046
.0
.0
.013
.0
.009
.0
.006
.004
.0
.0
.887
.003
.258
.0
.002
.001
.001
.172
.026
.01
.024
.637
.055
.009
.218
.223
.218
.1
.132
.04
.096
.183
.107
.101
.237
.028
.084
.005
.052
.071
.136
.259
.274
.092
.05
.036
.023
.039
.337
.439
.006
.008
.004
.009
.003
.024
.017
.01
.239
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.004
.02
.002
.02
.009
.026
.291
.002
.029
.008
.002
.001
.011
.018
.007
.002
--
.976
.032
.999
--
.001
--
.025
.016
--
--
--
--
.009
.001
.002
.002
.0
.001
.858
.328
.001
.0
.0
.0
.014
.004
.0
--
--
--
--
--
.114
.003
.0
.001
.001
.001
--
.066
.002
.0
.002
.001
.009
.004
.005
.0
.0
.007
.002
.001
.001
.236
.197
.116
--
--
.001
.021
.019
.0
.0
.002
.003
.001
.0
.001
.003
.0
.001
.004
.022
.001
.028
.002
.009
.002
.01
.002
.033
.006
.001
.017
.137
.052
.001
.003
.066
.207
.067
.061
.003
.007
.035
.004
.044
.001
.001
.661
.001
.01
.0
.008
.0
.025
.029
.004
.001
.011
.004
.436
.0
.002
.015
.181
.094
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Scn7a
Scn7a
Scn7a
Scn7a
Scn7a
Scn7a
Scn7a
Scn7a
Scn7a
Scn7a
Scn7a
Scn7a
Scn7a
Scn7a
Scn7a
Scn7a
Scn7a
Scn7a
Scn7a
Scn7a
Scn7a
Scn7a
Scn7a
Scn7a
Scn7a
Scn7a
Scn7a
Scn7a
Scn7a
A
G
T
G
G
T
C
A
T
C
G
A
G
A
C
A
G
C
T
C
T
A
T
A
A
A
G
A
C
A
G
G
G
G
C
G
G
C
A
C
A
T
T
G
T
A
C
G
T
A
C
C
T
A
T
A
G
G
A
C
A
T
A
T
C
A
T
C
C
A
A
A
C
C
A
C
T
A
A
T
T
C
T
G
A
C
A
A
C
A
C
G
G
G
T
G
G
T
G
G
G
A
T
T
T
T
T
T
G
T
A
A
A
A
G
A
C
T
G
A
T
G
C
T
T
A
C
C
C
C
G
T
T
C
G
A
G
C
A
T
C
A
T
G
G
C
C
G
G
C
G
T
A
T
G
G
G
G
A
C
T
G
A
C
C
C
C
A
T
G
T
A
G
T
G
T
A
C
C
G
C
C
G
T
T
C
C
T
A
G
A
T
C
T
C
A
C
G
C
A
G
T
G
T
G
C
C
A
G
A
C
C
T
C
T
G
C
T
C
G
C
C
G
T
G
G
A
A
G
G
A
G
G
A
T
T
A
C
C
T
C
A
C
C
T
C
C
A
C
T
C
G
G
A
G
T
T
C
C
G
T
G
G
C
A
A
C
C
G
G
A
T
A
A
C
A
A
G
T
G
A
G
C
G
G
C
C
  52,775,857
  52,777,212
  52,778,045
  52,778,109
  52,778,581
  52,778,809
  52,779,108
  52,779,208
  52,779,226
  52,779,338
  52,780,352
  52,783,846
  52,784,180
  52,784,219
  52,784,500
  52,793,864
  52,794,672
  52,795,428
  52,795,643
  52,796,513
  52,797,243
  52,799,425
  52,799,493
  52,799,603
  52,805,438
  52,805,840
  52,807,335
  52,812,304
  52,813,856
  52,816,110
  52,818,124
  52,829,419
  52,831,188
  52,832,643
  52,835,276
  52,836,760
  52,837,240
  52,837,583
  52,838,110
  52,838,503
  52,838,645
  52,838,656
  52,839,461
  52,840,369
  52,840,967
  52,841,586
  52,842,865
  52,843,089
  52,843,336
  52,843,687
  52,843,957
  52,843,983
  52,844,578
  52,844,906
  52,845,616
  52,845,641
  52,846,057
  52,846,066
  52,846,227
  52,846,891
  52,846,975
  52,847,490
  52,847,557
  52,848,037
  52,848,385
  52,848,798
  52,848,888
  52,848,946
  52,848,983
  52,849,050
  52,849,129
  52,849,183
  52,849,207
  52,849,218
  52,849,287
  52,849,418
  52,849,458
  52,849,477
  52,849,487
  52,849,495
  52,849,547
  52,849,556
  52,849,604
  52,849,621
  52,849,627
  52,849,633
  52,849,662
  52,849,663
  52,849,780
  52,849,784
  52,849,883
  52,849,947
  52,849,978
  52,850,017
  52,850,023
  52,850,074
  52,850,091
  52,850,101
  52,850,111
  52,850,140
  52,850,176
  52,850,196
  52,850,285
  52,850,287
  52,850,320
  52,850,815
  52,850,829
  52,850,881
  52,850,941
  52,850,970
  52,851,003
  52,851,023
  52,851,070
  52,851,097
  52,851,107
  52,851,210
  52,851,335
  52,851,364
  52,851,377
  52,851,467
  52,851,495
  52,851,572
  52,851,584
  52,851,724
  52,851,744
  52,851,829
  52,851,851
  52,851,867
  52,851,893
  52,851,914
  52,851,936
  52,851,960
  52,851,993
  52,852,006
  52,852,106
  52,852,122
  52,852,137
  52,853,047
  52,853,057
  52,853,064
  52,853,137
  52,853,146
  52,853,192
  52,853,193
  52,853,202
  52,853,227
  52,853,233
  52,853,254
  52,853,256
  52,853,273
  52,853,306
  52,853,334
  52,853,414
  52,853,418
  52,853,429
  52,853,445
  52,853,473
  52,853,502
  52,853,693
  52,853,883
  52,853,943
  52,853,971
  52,853,998
  52,854,105
  52,854,173
  52,854,183
  52,854,186
  52,854,191
  52,854,445
  52,854,460
  52,854,523
  52,854,567
  52,854,739
  52,855,213
  52,855,363
  52,855,424
  52,856,057
  52,856,131
  52,856,409
  52,856,707
  52,857,070
  52,857,392
  52,857,616
  52,858,125
  52,858,436
  52,858,444
  52,858,840
  52,859,052
  52,859,112
  52,859,327
  52,859,410
  52,859,458
  52,859,565
  52,859,787
  52,859,816
  52,860,222
  52,860,520
  52,860,639
  52,860,661
  52,860,678
  52,860,774
  52,860,934
  52,861,421
  52,861,439
  52,861,554
  52,861,637
  52,862,389
  52,862,602
  52,863,009
  52,863,501
  52,863,996
  52,864,023
  52,864,103
  52,864,313
  52,864,602
  52,864,859
  52,864,959
  52,864,960
  52,865,294
  52,865,331
  52,865,520
  52,866,158
  52,866,796
  52,866,802
  52,867,005
  52,867,173
  52,867,235
  52,867,413
  52,867,787
  52,867,947
  52,868,039
  52,868,047
  52,868,268
  52,868,379
  52,868,783
  52,868,938
  52,869,480
  52,869,733
  52,869,877
  52,870,273
  52,870,639
  52,870,782
  52,870,882
  52,870,960
  52,871,311
  52,871,323
  52,871,379
  52,871,646
  52,871,693
  52,871,737
  52,871,759
  52,871,803
  52,871,955
  52,872,050
  52,872,127
  52,872,132
  52,872,314
  52,872,418
  52,872,450
  52,872,504
  52,872,523
  52,872,546
  52,872,885
  52,873,053
  52,873,169
  52,873,223
  52,873,323
  52,873,330
  52,873,441
  52,873,488
  52,873,958
  52,874,265
  52,874,408
  52,874,614
  52,875,302
  52,875,545
  52,875,709
  52,875,733
  52,875,741
  52,875,981
  52,876,957
  52,877,021
  52,877,082
  52,877,093
  52,877,111
  52,877,142
  52,877,270
T
C
C
C
C
C
T
T
C
T
T
C
A
G
A
G
A
T
C
T
C
C
C
G
G
G
T
G
T
T
A
A
A
T
G
T
T
T
G
T
G
A
A
T
A
G
G
A
G
G
T
T
C
G
A
G
A
A
G
G
G
A
C
G
T
C
C
G
A
G
G
C
T
T
G
A
C
T
G
C
A
T
C
A
G
A
G
T
T
G
A
T
A
A
C
C
A
C
A
A
A
G
C
A
C
G
C
A
T
G
C
G
C
G
A
G
T
C
C
G
G
C
T
C
A
T
T
T
T
T
A
A
G
T
T
G
T
T
G
A
T
T
A
A
A
T
T
A
C
T
A
C
G
C
C
T
C
T
T
T
G
A
G
T
A
T
G
T
G
C
G
G
C
C
C
C
G
T
T
A
A
G
A
C
G
T
T
G
G
T
G
C
T
C
T
G
G
A
T
C
A
A
A
C
A
A
T
G
T
G
T
T
G
T
C
A
G
C
T
A
A
T
T
C
A
A
G
G
T
A
T
A
A
T
C
C
T
T
T
C
A
G
T
T
C
T
T
G
G
C
T
A
A
T
T
A
G
T
T
C
A
A
T
G
G
G
T
A
T
A
G
C
T
T
G
G
C
A
C
T
G
A
G
A
A
T
A