Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 118,304 (bp)   Positions: 280
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.473
.002
1.0
.988
.0
.001
.159
.008
.019
.747
.001
.005
.019
.029
.004
.001
1.0
.996
.0
.023
.0
.0
.002
.0
.001
.0
.041
.053
.002
.004
.005
.333
.706
.005
.003
.0
.0
.008
.008
.001
.005
.061
.012
.977
.537
.0
.002
.97
.0
.0
.001
.423
.018
.998
.525
.133
.001
.0
.028
.0
.024
.005
.004
.0
.0
.0
.0
.002
.001
.0
--
.008
.005
.064
.004
.096
.054
.007
--
--
--
.007
.0
.002
--
--
--
--
--
--
--
.0
.0
.018
.001
.002
.013
.051
.093
.086
.06
.034
.019
.001
.01
.001
.002
.002
.001
.015
.007
.935
.003
.0
.002
.049
.001
.001
.011
.001
.0
.001
.0
.001
.001
.0
.0
.002
.008
.001
.008
.001
.0
.001
.0
.0
.0
.0
.0
.002
.002
.0
.0
.028
.0
.004
.0
.0
.002
.003
.027
.024
.0
.014
.003
.0
.003
.017
.011
.006
.003
.0
.003
.017
.0
.005
.002
.003
.036
.034
.002
.007
.054
.018
.008
.044
.068
.004
.001
.31
.0
.0
.0
.004
.013
.002
.002
.006
.005
.004
.0
.002
.0
.0
.001
.0
.0
.0
.0
.0
.001
.008
.162
.149
.976
.018
.0
.0
.0
.0
.0
.001
.013
.014
.015
.047
.018
.021
.003
.018
.003
.001
.0
.001
.001
.006
.0
.0
.0
.0
.02
.003
.0
.005
.018
.004
.002
.075
.0
.01
.035
.011
.001
.0
.002
.229
.034
.03
.175
.037
.036
.031
.0
.789
.0
.0
.898
.915
.0
.044
.001
.03
.005
.233
.032
.069
.004
.174
.002
.0
.0
.176
.034
.049
.021
.025
.007
.014
.013
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
LOC108351811
LOC108351811
LOC108351811
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Scn10a
Scn10a
Scn10a
Scn10a
Scn10a
Scn10a
Scn10a
Scn10a
Scn10a
Scn10a
Scn10a
Scn10a
Scn10a
Scn10a
Scn10a
Scn10a
Scn10a
Scn10a
Scn10a
Scn10a
Scn10a
Scn10a
Scn10a
Scn10a
Scn10a
Scn10a
Scn10a
Scn10a
A
A
A
T
T
T
C
C
2
G
G
A
C
A
C
T
G
-
C
T
G
G
A
T
C
T
A
A
A
C
G
T
-
-
G
A
A
C
G
C
C
G
G
A
G
G
C
A
C
T
C
A
C
-
A
C
C
A
C
C
G
G
T
C
T
A
T
T
A
G
G
-
A
A
A
-
C
32
A
G
-
T
A
A
G
C
T
C
C
-
G
G
T
G
-
C
G
G
G
C
-
-
T
G
-
-
G
G
G
G
G
C
G
C
C
-
T
C
T
19
T
A
C
T
T
C
G
T
T
C
G
T
-
T
-
C
G
G
T
T
T
C
A
A
T
T
-
2
T
C
G
G
A
T
G
G
T
C
G
A
A
A
A
T
C
A
A
C
-
G
C
T
G
C
T
A
-
C
T
G
C
G
G
T
2
A
G
G
G
G
G
T
A
C
A
T
T
C
T
T
G
A
G
A
G
C
G
T
-
C
C
C
C
C
A
C
G
C
C
G
-
C
A
C
C
T
T
T
A
A
-
A
T
G
A
A
C
10
A
A
27
A
T
C
T
G
G
9
C
T
T
C
-
G
A
A
A
C
G
T
C
T
G
C
A
C
T
-
G
C
T
-
-
A
C
A
G
A
C
G
  128,299,119
  128,299,212
  128,299,767
  128,300,175
  128,300,462
  128,300,501
  128,300,560
  128,300,686
  128,301,211
  128,301,287
  128,301,836
  128,301,924
  128,302,799
  128,303,318
  128,304,765
  128,306,356
  128,306,537
  128,306,844
  128,307,251
  128,307,622
  128,308,141
  128,308,890
  128,308,929
  128,308,943
  128,309,189
  128,309,207
  128,309,377
  128,310,154
  128,310,616
  128,310,622
  128,310,902
  128,311,796
  128,311,843
  128,311,884
  128,312,001
  128,312,312
  128,312,429
  128,312,971
  128,313,229
  128,314,100
  128,314,302
  128,315,153
  128,315,192
  128,315,588
  128,315,922
  128,317,187
  128,317,272
  128,317,415
  128,317,925
  128,317,992
  128,318,198
  128,318,600
  128,318,610
  128,318,675
  128,318,713
  128,318,812
  128,319,012
  128,319,305
  128,319,352
  128,319,635
  128,319,712
  128,319,726
  128,322,556
  128,323,609
  128,323,942
  128,323,962
  128,324,497
  128,325,277
  128,325,287
  128,325,933
  128,326,196
  128,326,480
  128,327,525
  128,328,206
  128,329,410
  128,329,882
  128,330,776
  128,331,081
  128,331,331
  128,331,351
  128,331,364
  128,331,456
  128,331,640
  128,332,026
  128,339,462
  128,339,499
  128,339,506
  128,339,537
  128,339,543
  128,339,557
  128,339,578
  128,340,823
  128,340,824
  128,340,835
  128,340,844
  128,340,847
  128,340,852
  128,340,855
  128,340,864
  128,340,867
  128,340,885
  128,340,888
  128,340,890
  128,340,911
  128,340,919
  128,340,946
  128,340,949
  128,341,923
  128,344,026
  128,344,328
  128,344,795
  128,345,560
  128,345,602
  128,345,744
  128,348,045
  128,348,425
  128,348,446
  128,351,508
  128,351,791
  128,352,595
  128,352,755
  128,352,845
  128,353,474
  128,353,541
  128,353,797
  128,354,066
  128,354,140
  128,354,222
  128,354,254
  128,354,262
  128,354,316
  128,354,330
  128,354,333
  128,354,341
  128,354,403
  128,354,404
  128,354,427
  128,354,488
  128,354,508
  128,354,512
  128,354,665
  128,354,694
  128,354,730
  128,354,785
  128,354,796
  128,354,814
  128,354,822
  128,354,824
  128,354,855
  128,354,868
  128,354,915
  128,354,926
  128,355,151
  128,355,332
  128,355,374
  128,355,422
  128,355,544
  128,355,553
  128,355,566
  128,355,639
  128,355,646
  128,355,750
  128,355,985
  128,356,033
  128,356,039
  128,356,041
  128,356,176
  128,356,181
  128,356,249
  128,356,291
  128,356,388
  128,356,392
  128,356,534
  128,356,659
  128,356,740
  128,356,885
  128,356,894
  128,356,942
  128,357,034
  128,357,283
  128,357,322
  128,357,473
  128,357,479
  128,357,593
  128,357,598
  128,357,700
  128,357,751
  128,357,764
  128,357,793
  128,357,842
  128,357,888
  128,357,914
  128,358,016
  128,358,042
  128,358,115
  128,358,188
  128,358,192
  128,358,201
  128,358,786
  128,358,843
  128,358,953
  128,359,029
  128,359,095
  128,359,119
  128,359,233
  128,359,391
  128,359,396
  128,359,398
  128,359,409
  128,359,486
  128,359,548
  128,359,595
  128,359,786
  128,359,788
  128,359,789
  128,359,796
  128,359,802
  128,359,819
  128,359,857
  128,359,885
  128,359,892
  128,359,900
  128,360,220
  128,360,230
  128,360,285
  128,360,292
  128,360,396
  128,360,556
  128,360,803
  128,360,842
  128,361,018
  128,361,073
  128,361,105
  128,361,124
  128,361,127
  128,361,142
  128,361,148
  128,361,230
  128,361,268
  128,361,462
  128,361,466
  128,361,510
  128,361,551
  128,361,803
  128,362,462
  128,363,406
  128,363,944
  128,364,287
  128,364,471
  128,365,159
  128,365,173
  128,365,988
  128,366,273
  128,366,773
  128,368,018
  128,368,605
  128,368,877
  128,368,938
  128,369,933
  128,370,299
  128,370,595
  128,370,765
  128,371,859
  128,372,430
  128,372,611
  128,373,579
  128,375,222
  128,376,121
  128,376,566
  128,377,757
  128,378,252
  128,378,576
  128,379,593
  128,379,885
  128,380,451
  128,381,295
  128,391,164
  128,391,206
  128,396,333
  128,412,283
G
G
G
C
A
C
T
G
-
C
A
T
A
G
T
C
C
2
T
A
A
A
G
C
T
C
G
G
G
G
A
C
C
44
A
G
G
T
T
T
T
T
-
G
C
T
T
T
T
C
T
G
T
3
-
T
T
G
T
T
A
A
C
T
G
T
C
C
G
A
T
C
G
G
G
C
T
-
-
A
-/6
C
G
G
-
T
-
T
-
C
-
T
G
-
T
-
T
-
-
G
A
G
-
-
A
G
-
A
T
A
-
T
C
-
T
-/T
C
G
C
-
C
G
T
C
C
T
A
G
C
T
A
C
10
C
T
G
A
C
G
C
C
A
G
T
C
A
2
-
C
G
A
T
G
C
A
A
C
T
A
G
G
G
G
C
T
G
G
T
3
A
T
C
T
A
C
G
2
T
C
A
A
C
C
C
-
G
A
A
A
C
A
C
G
T
G
C
C
-
C
C
A
G
T
G
A
T
A
C
T
T
T
T
G
T
G
T
A
T
T
T
3
A
T
T
T
C
C
C
C
T
2
G
C
A
G
G
T
-
G
C
-
C
C
T
C
A
C
-
-
C
C
T
A
A
C
G
G
T
A
C
T
C
-
T
G
G
-
3
A
T
C
3
2
T
T
C
A
C
T
T