Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 547,845 (bp)   Positions: 289
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
--
.251
.005
.006
.015
.009
.053
.021
.03
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.006
--
--
.001
.076
.018
.041
.038
.003
.005
.006
.043
.005
.006
.045
.056
.028
.01
.001
.112
.193
.002
.0
.011
.001
.0
.005
.009
.0
.0
.001
.996
1.0
.001
.0
.0
.0
.0
.0
.004
.001
.0
.008
.002
.002
.003
.004
.13
.16
.107
.012
.001
.002
.003
.002
.0
.007
.0
.0
.001
.01
.001
.0
.0
.0
.002
.161
.266
.187
.001
.006
.069
.0
.001
.001
.001
.007
.003
.002
.0
.0
.015
.001
.0
.016
.001
.002
.0
.0
.046
.001
.002
.0
.004
.005
.006
.016
.026
.018
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.01
.003
.015
.001
.003
.015
.066
.165
.774
.55
.108
.096
.058
--
--
.0
.001
.003
.009
.004
.001
.002
.001
.0
.001
.001
.002
.001
.002
.012
.0
.001
.001
.001
.001
.0
--
.001
.003
.07
.072
.066
.062
.033
.028
.0
.022
.001
.004
.003
.0
.005
.001
.001
.001
.515
.835
.003
.171
.002
.005
.039
.015
.031
.001
--
.001
.003
--
--
--
--
--
--
.182
.069
.0
.002
.003
.022
.006
.004
.198
.005
.016
.003
.0
.04
.026
.012
.017
.017
.002
.077
.02
.001
.045
.076
.071
.033
.016
.001
.003
.022
.007
.005
.003
.005
.0
.0
.001
.004
.0
.028
.002
.001
.002
.001
.002
.004
.001
.01
.031
.019
.57
.016
.001
.026
.089
.08
.071
.002
.002
.0
.001
.003
.004
.0
.0
.001
.0
.0
.139
.488
.513
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
LOC108350585
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Ryr3
Ryr3
Ryr3
Ryr3
Ryr3
Ryr3
Ryr3
Ryr3
Ryr3
Ryr3
Ryr3
Ryr3
Ryr3
Ryr3
Ryr3
Ryr3
Ryr3
Ryr3
Ryr3
Ryr3
Ryr3
Ryr3
Ryr3
Ryr3
Ryr3
Ryr3
Ryr3
Ryr3
Ryr3
-
-
4
G
A
A
-
C
-
A
-
-
2
A
C
C
A
-
-
-
T
T
-
2
-
G
G
2
-
-
2
G
A
T
A
-
G
T
G
-
2
-
A
2
-
A
G
T
C
C
-
G
C
C
G
2
G
-
A
-
C
-
-
C
-
-
G
G
G
C
G
2
-
-
2
T
C
-
A
C
G
-
G
T
C
A
A
2
C
2
A
C
T
-
-
2
C
-
G
T
T
C
C
C
C
G
-
-
C
-
2
G
-
G
C
G
T
A
G
G
C
G
C
T
G
-
-
A
C
-
T
-
G
-
-
G
C
C
-
G
G
-
T
-
-
G
G
C
2
G
-
8
T
23
G
A
G
T
G
C
44
A
-
-
-
-
2
-
-
C
C
3
G
-
A
T
A
A
A
2
-
-
-
C
-
T
C
A
C
2
C
T
G
A
3
-
C
-
T
-
-
-
A
-
G
-
-
C
-
G
C
A
T
G
T
G
2
T
T
C
-
C
A
-
C
-
-
-
-
G
G
G
C
-
-
-
-
-
G
-
C
-
A
-
-
C
C
G
-
A
A
T
G
C
4
G
A
T
C
C
C
-
T
2
G
2
C
C
A
C
T
C
A
A
T
C
T
G
-
-
-
2
-
-
G
A
G
G
C
  104,180,382
  104,189,199
  104,191,863
  104,191,874
  104,191,886
  104,191,899
  104,191,914
  104,191,925
  104,191,937
  104,192,266
  104,192,290
  104,229,101
  104,229,109
  104,229,127
  104,229,128
  104,229,132
  104,229,164
  104,229,182
  104,229,190
  104,229,194
  104,229,198
  104,229,200
  104,229,215
  104,229,226
  104,229,247
  104,238,167
  104,249,389
  104,249,396
  104,267,072
  104,280,126
  104,280,158
  104,280,164
  104,280,166
  104,280,183
  104,280,190
  104,280,195
  104,280,213
  104,280,223
  104,280,226
  104,280,234
  104,280,248
  104,280,279
  104,280,310
  104,280,331
  104,281,228
  104,283,524
  104,283,581
  104,283,588
  104,283,632
  104,283,647
  104,283,651
  104,283,686
  104,283,894
  104,283,959
  104,284,009
  104,284,019
  104,284,094
  104,284,114
  104,284,319
  104,284,333
  104,284,364
  104,284,372
  104,284,433
  104,284,451
  104,284,470
  104,284,482
  104,284,493
  104,284,505
  104,284,527
  104,284,530
  104,284,531
  104,284,549
  104,284,557
  104,284,560
  104,284,565
  104,284,576
  104,284,577
  104,284,589
  104,284,599
  104,284,605
  104,284,610
  104,284,622
  104,284,625
  104,284,627
  104,284,630
  104,284,636
  104,284,662
  104,284,669
  104,284,677
  104,284,683
  104,284,689
  104,284,705
  104,284,713
  104,284,720
  104,284,747
  104,284,753
  104,284,764
  104,284,770
  104,284,774
  104,284,775
  104,284,781
  104,284,796
  104,284,810
  104,284,814
  104,284,822
  104,284,825
  104,284,829
  104,284,843
  104,284,844
  104,284,856
  104,285,096
  104,285,102
  104,285,107
  104,285,112
  104,285,175
  104,285,184
  104,285,185
  104,285,951
  104,285,953
  104,285,956
  104,285,958
  104,285,963
  104,285,989
  104,286,160
  104,286,165
  104,286,175
  104,286,222
  104,286,228
  104,286,235
  104,286,239
  104,286,250
  104,286,264
  104,286,270
  104,286,293
  104,286,297
  104,286,307
  104,286,321
  104,286,331
  104,286,346
  104,286,358
  104,286,371
  104,286,392
  104,286,428
  104,286,440
  104,286,480
  104,286,494
  104,286,510
  104,286,521
  104,286,525
  104,286,533
  104,286,544
  104,286,555
  104,286,564
  104,286,571
  104,286,598
  104,286,599
  104,286,602
  104,306,896
  104,306,897
  104,309,928
  104,312,339
  104,322,950
  104,322,952
  104,322,955
  104,322,960
  104,322,962
  104,322,964
  104,322,968
  104,322,972
  104,322,976
  104,322,977
  104,322,980
  104,322,984
  104,334,447
  104,346,965
  104,346,969
  104,346,973
  104,346,977
  104,346,981
  104,349,213
  104,381,840
  104,432,189
  104,432,194
  104,432,206
  104,432,211
  104,432,217
  104,432,219
  104,432,227
  104,432,228
  104,432,236
  104,432,251
  104,432,269
  104,432,281
  104,432,284
  104,432,309
  104,432,314
  104,432,316
  104,432,321
  104,432,347
  104,432,404
  104,432,408
  104,432,479
  104,432,530
  104,432,548
  104,432,556
  104,432,619
  104,432,630
  104,432,666
  104,432,669
  104,436,227
  104,453,426
  104,514,512
  104,547,777
  104,547,832
  104,547,870
  104,547,876
  104,547,913
  104,547,926
  104,553,048
  104,553,061
  104,553,108
  104,553,110
  104,553,140
  104,553,143
  104,553,162
  104,553,168
  104,553,209
  104,558,455
  104,561,685
  104,596,972
  104,596,978
  104,596,985
  104,603,198
  104,603,206
  104,603,213
  104,603,217
  104,603,233
  104,603,244
  104,603,250
  104,603,274
  104,603,283
  104,603,287
  104,603,299
  104,603,310
  104,603,313
  104,603,326
  104,603,334
  104,603,340
  104,603,357
  104,603,366
  104,603,388
  104,603,392
  104,603,397
  104,603,398
  104,603,404
  104,603,413
  104,603,417
  104,603,429
  104,603,444
  104,603,464
  104,603,467
  104,603,476
  104,603,507
  104,603,511
  104,603,526
  104,603,546
  104,603,558
  104,603,561
  104,603,576
  104,603,587
  104,603,592
  104,603,604
  104,603,617
  104,603,619
  104,603,629
  104,603,669
  104,603,670
  104,603,675
  104,603,680
  104,603,683
  104,604,807
  104,604,813
  104,604,830
  104,604,833
  104,622,958
  104,622,959
  104,625,777
  104,625,799
  104,625,803
T
T
-
-
G
-
2
-
G
G
G
4
-
G
A
-
T
C
A
G
-
-
G
-
3
T
-
-
5
-/2
-
A
-
-
-
T
-
A
T
G
-
2
C
-
T
-
-
-
G
-
A
-
-
-
-
-
-
G
-
T
-
A
T
-
G
T
-
-
-
-
A
-
T
A
-
A
T
2
-
-
T
T
-
A
-
T
-
-
-
-
-
-
-
T
A
-
-
T
-
A
-
-
-
-
-
T
T
T
G
T
-
-
G
-
-
T
G
-
T
-
T
-
-
-
-
G
C
C
-
C
-
A
-
C
G
-
-
-
C
-
-
C
G
A
A
-
-
-
-
-
C
-
G
-
T
G
T
T/-
G/A
-
-
A/C
-/14
-/17
-/11
-/A
2/-
-/4
-/8
C/T
C/T
3/-
A/3
A
C
C
C
C
C
2/-
A
G
A
-
G
-
A
G
A
-
A
G
C
-
-
2
A
G
-
T
A
A
-
C
-
A
C
-
A
A
A
G
-
-
-
-
-
-
-
-
G
-
-
C
-
T
G
2
A
-
-
-
-
G
2
G
T
T
T
G
-
2
C
A
T
-
-
-
G
-
-
-
C
A
-
-
-
-
-
T
-
T
-
-
-
-
-
T
-
-
-
-
-
T
-
-
G
-
C
T
C
-
C
A
A
G
T
A
A