Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 547,845 (bp)   Positions: 404
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.009
.0
.001
.013
.2
.12
--
--
--
--
--
--
.166
.0
.014
.003
.019
.009
.001
.004
.001
.038
.138
.045
.0
.019
.251
.365
.004
.0
.0
.001
.005
.006
.015
.009
.053
.021
.03
--
--
--
.039
.009
.001
.072
.892
.0
.007
.004
.004
.0
.043
.001
.003
.001
.002
.003
.002
.029
.006
.0
.227
.469
.366
.0
.0
.0
.006
.8
.009
.009
.041
.001
.003
.0
.001
.0
.452
.001
.467
.678
.287
.087
.001
.039
.004
.001
.004
.003
.025
.016
.0
.001
.001
.018
.006
.001
.025
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
.222
.45
.003
.001
.001
.006
.002
.01
.003
.006
.001
1.0
.001
.002
.001
.001
.0
.092
.123
.002
.0
.002
.018
--
--
.001
.076
.018
.041
.038
.003
.005
.006
.043
.005
.006
.045
.056
.028
.01
.001
.112
.086
.039
.001
.0
.002
.007
.006
.004
.193
.002
.0
.011
.001
.0
.005
.009
.0
.0
.001
.996
1.0
.001
.0
.0
.0
.003
.002
.0
.007
.0
.0
.001
.01
.013
.001
.0
.0
.0
.002
.161
.266
.187
.001
.006
.069
.0
.001
.001
.001
.007
.001
.002
.0
.0
.046
.001
.002
.0
.004
.005
.006
.016
.026
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.01
.003
.015
.001
.003
.015
.066
.165
.774
.55
.108
.096
.058
.992
.999
1.0
.998
1.0
.999
.962
1.0
1.0
.998
.997
.994
1.0
.985
.982
.005
--
--
--
--
--
--
.0
.001
.003
.009
.004
.001
.002
.001
.0
.001
.001
.002
.001
.002
.012
.0
.001
.008
--
.209
.001
.003
.07
.072
.066
.062
.033
.028
.0
.022
.001
.004
.003
.0
.005
.001
.001
.001
.515
.835
.003
.171
.002
.005
.039
.015
.031
.001
.001
.003
.007
.007
.001
--
--
--
--
--
--
.182
.069
.0
.002
.003
.022
.006
.004
.198
.005
.016
.003
.0
.04
.026
.012
.017
.017
.002
.077
.02
.001
.045
.076
.071
.033
.016
.001
.003
.022
.007
.005
.003
.005
.0
.0
.001
.004
.0
.028
.002
.001
.002
.001
.002
.004
.001
.01
.031
.019
.57
.016
.001
.026
.089
.08
.004
.0
.0
.001
.0
.0
.139
.488
.513
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
LOC108350585
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Ryr3
Ryr3
Ryr3
Ryr3
Ryr3
Ryr3
Ryr3
Ryr3
Ryr3
Ryr3
Ryr3
Ryr3
Ryr3
Ryr3
Ryr3
Ryr3
Ryr3
Ryr3
Ryr3
Ryr3
Ryr3
Ryr3
Ryr3
Ryr3
Ryr3
Ryr3
Ryr3
Ryr3
Ryr3
Ryr3
Ryr3
Ryr3
Ryr3
Ryr3
Ryr3
Ryr3
Ryr3
Ryr3
Ryr3
Ryr3
Ryr3
A
2
A
T
-
G
G
T
-
T
A
A
50
T
T
-
C
G
G
-
G
A
A
C
A
A
-
A
A
A
A
G
4
G
A
A
-
C
-
A
-
C
A
-
A
A
G
T
T
C
A
G
T
T
T
A
A
A
5
-
C
T
T
A
T
A
C
A
T
T
A
C
T
G
C
A
G
A
T
C
-
-
A
C
A
C
A
T
C
C
2
T
C
T
C
C
A
T
C
A
G
-
A
C
-
G
C
-
2
A
C
C
A
-
-
-
T
T
-
2
-
T
G
-
T
-
A
G
A
T
-
T
T
A
T
T
A
G
C
G
G
G
T
C
T
G
2
-
-
2
G
A
T
A
-
G
T
G
-
2
-
A
2
-
-
A
A
A
A
A
T
T
A
G
T
C
C
-
G
C
C
G
2
G
-
A
-
C
-
A
C
G
-
G
T
C
A
19
A
2
C
2
A
C
T
-
-
2
C
-
G
T
T
C
2
G
-
G
C
G
T
A
G
G
C
G
C
-
A
C
-
T
-
G
-
-
G
C
C
-
G
G
-
T
-
-
G
G
C
2
G
-
8
T
23
G
A
G
2
T
-
T
G
3
A
T
G
A
C
C
A
C
2
2
A
T
A
T
G
T
C
44
A
-
-
-
-
2
-
-
C
C
3
-
-
A
T
T
-
2
-
-
C
-
T
C
A
C
2
C
T
G
A
3
-
C
-
T
-
-
-
A
-
G
-
-
C
-
C
A
-
G
-
T
G
T
G
2
T
T
C
-
C
A
-
C
-
-
-
-
G
G
G
C
-
-
-
-
-
G
-
C
-
A
-
-
C
C
G
-
A
A
T
G
C
4
G
A
T
C
C
C
-
T
2
G
2
C
C
A
C
T
C
A
A
-
2
-
-
G
A
G
G
C
  104,166,572
  104,173,460
  104,177,803
  104,178,745
  104,178,880
  104,179,143
  104,179,759
  104,180,216
  104,180,382
  104,180,412
  104,181,063
  104,181,113
  104,182,455
  104,182,930
  104,183,244
  104,183,868
  104,184,356
  104,184,455
  104,184,623
  104,184,836
  104,184,844
  104,186,888
  104,186,918
  104,187,442
  104,187,931
  104,188,618
  104,189,199
  104,189,965
  104,189,975
  104,190,296
  104,190,297
  104,190,584
  104,191,863
  104,191,874
  104,191,886
  104,191,899
  104,191,914
  104,191,925
  104,191,937
  104,192,266
  104,192,290
  104,192,322
  104,202,230
  104,202,313
  104,202,999
  104,203,970
  104,204,131
  104,205,569
  104,205,919
  104,206,013
  104,206,022
  104,206,339
  104,206,521
  104,207,965
  104,208,535
  104,208,625
  104,209,169
  104,209,171
  104,209,173
  104,209,182
  104,209,340
  104,209,416
  104,209,637
  104,209,720
  104,209,961
  104,210,047
  104,210,389
  104,210,917
  104,211,052
  104,211,477
  104,211,761
  104,211,901
  104,211,916
  104,212,293
  104,212,303
  104,212,532
  104,212,570
  104,213,038
  104,213,395
  104,213,903
  104,214,706
  104,215,015
  104,215,112
  104,215,729
  104,215,869
  104,216,470
  104,216,556
  104,216,914
  104,217,744
  104,217,759
  104,219,215
  104,220,703
  104,221,566
  104,223,260
  104,223,396
  104,223,724
  104,225,786
  104,225,922
  104,226,106
  104,226,624
  104,226,832
  104,227,025
  104,227,247
  104,227,403
  104,228,539
  104,229,001
  104,229,069
  104,229,101
  104,229,109
  104,229,127
  104,229,128
  104,229,132
  104,229,164
  104,229,182
  104,229,190
  104,229,194
  104,229,198
  104,229,200
  104,229,215
  104,229,226
  104,229,247
  104,231,727
  104,231,971
  104,232,460
  104,235,018
  104,235,129
  104,235,401
  104,238,167
  104,239,204
  104,240,494
  104,243,986
  104,244,600
  104,245,335
  104,245,707
  104,246,017
  104,246,018
  104,246,686
  104,246,727
  104,247,216
  104,247,292
  104,248,006
  104,248,060
  104,248,354
  104,248,382
  104,249,278
  104,249,389
  104,249,396
  104,267,072
  104,280,126
  104,280,158
  104,280,164
  104,280,166
  104,280,183
  104,280,190
  104,280,195
  104,280,213
  104,280,223
  104,280,226
  104,280,234
  104,280,248
  104,280,279
  104,280,310
  104,280,331
  104,281,228
  104,282,446
  104,282,462
  104,282,475
  104,282,489
  104,282,500
  104,282,503
  104,282,506
  104,282,508
  104,283,524
  104,283,581
  104,283,588
  104,283,632
  104,283,647
  104,283,651
  104,283,686
  104,283,894
  104,283,959
  104,284,009
  104,284,019
  104,284,094
  104,284,114
  104,284,319
  104,284,333
  104,284,364
  104,284,372
  104,284,599
  104,284,605
  104,284,610
  104,284,622
  104,284,625
  104,284,627
  104,284,630
  104,284,636
  104,284,640
  104,284,662
  104,284,669
  104,284,677
  104,284,683
  104,284,689
  104,284,705
  104,284,713
  104,284,720
  104,284,747
  104,284,753
  104,284,764
  104,284,770
  104,284,774
  104,284,775
  104,284,781
  104,284,796
  104,285,096
  104,285,102
  104,285,107
  104,285,112
  104,285,175
  104,285,184
  104,285,185
  104,285,951
  104,285,953
  104,285,956
  104,285,958
  104,285,963
  104,285,989
  104,286,222
  104,286,228
  104,286,235
  104,286,239
  104,286,250
  104,286,264
  104,286,270
  104,286,293
  104,286,297
  104,286,307
  104,286,321
  104,286,331
  104,286,346
  104,286,358
  104,286,371
  104,286,392
  104,286,428
  104,286,440
  104,286,480
  104,286,494
  104,286,510
  104,286,521
  104,286,525
  104,286,533
  104,286,544
  104,286,555
  104,286,564
  104,286,571
  104,286,598
  104,286,599
  104,286,602
  104,286,736
  104,286,748
  104,286,752
  104,286,760
  104,286,763
  104,286,772
  104,286,778
  104,286,784
  104,286,804
  104,286,806
  104,286,817
  104,286,820
  104,286,827
  104,286,830
  104,286,835
  104,286,845
  104,292,622
  104,292,628
  104,307,417
  104,307,660
  104,307,661
  104,308,010
  104,309,928
  104,312,339
  104,322,950
  104,322,952
  104,322,955
  104,322,960
  104,322,962
  104,322,964
  104,322,968
  104,322,972
  104,322,976
  104,322,977
  104,322,980
  104,322,984
  104,334,447
  104,346,965
  104,346,969
  104,367,864
  104,381,840
  104,393,456
  104,432,189
  104,432,194
  104,432,206
  104,432,211
  104,432,217
  104,432,219
  104,432,227
  104,432,228
  104,432,236
  104,432,251
  104,432,269
  104,432,281
  104,432,284
  104,432,309
  104,432,314
  104,432,316
  104,432,321
  104,432,347
  104,432,404
  104,432,408
  104,432,479
  104,432,530
  104,432,548
  104,432,556
  104,432,619
  104,432,630
  104,432,666
  104,432,669
  104,453,426
  104,514,512
  104,526,455
  104,526,465
  104,526,479
  104,547,777
  104,547,832
  104,547,870
  104,547,876
  104,547,913
  104,547,926
  104,553,048
  104,553,061
  104,553,108
  104,553,110
  104,553,140
  104,553,143
  104,553,162
  104,553,168
  104,553,209
  104,558,455
  104,561,685
  104,596,972
  104,596,978
  104,596,985
  104,603,198
  104,603,206
  104,603,213
  104,603,217
  104,603,233
  104,603,244
  104,603,250
  104,603,274
  104,603,283
  104,603,287
  104,603,299
  104,603,310
  104,603,313
  104,603,326
  104,603,334
  104,603,340
  104,603,357
  104,603,366
  104,603,388
  104,603,392
  104,603,397
  104,603,398
  104,603,404
  104,603,413
  104,603,417
  104,603,429
  104,603,444
  104,603,464
  104,603,467
  104,603,476
  104,603,507
  104,603,511
  104,603,526
  104,603,546
  104,603,558
  104,603,561
  104,603,576
  104,603,587
  104,603,592
  104,603,604
  104,603,617
  104,603,619
  104,604,807
  104,604,813
  104,604,830
  104,604,833
  104,622,958
  104,622,959
  104,625,777
  104,625,799
  104,625,803
G
2/-
G
C
2
A
A
-
T
-
-
G
-
G
C
A
T
T
A
T
A
G
G
T
G
G
T
T
T
T
T
A
-
-
G
-
2
-
G
G
G
T
A/-
C
C
G
A
C
C
T
C
T
C
C
C
T
-
G
-
G/G
T
-
C
G
G
G
T
G
A
C
-
T
A
A
T
T
C
T
C
A
A
A
-
T
G
A
G
G
T
T
-
A
T
-
T
T
G
G
T
T
A
G
G
T
3
A
A
4
-
G
A
-
T
C
A
G
-
-
G
-
3
C
A
C
C
A
G
T
G
C
C
-
C
G
C
C
G
A
T
A
A
T
G
T
C
-
-
5
2
-
A
-
-
-
T
-
A
T
G
-
2
C
-
T
C
-
C
C
C
C
C
C
-
-
-
G
-
A
-
-
-
-
-
-
G
-
T
-
A
-
-
T
T
-
A
-
T
-
-
-
-
-
-
-
-
T
A
-
-
T
-
A
-
-
-
-
G
-
-
T
G
-
T
-
T
-
-
C
C
-
C
-
A
-
C
G
-
-
-
C
-
-
C
G
A
A
-
-
-
-
-
C
-
G
-
T
G
T
-
-
C
-
T
-
-
-
T
G
-
-
-
-
-
-
A/T
T/A
A/T
T/C
G/T
T/A
-
-
A/C
-/14
-/17
-/11
-/A
2/-
-/4
-/8
C/T
C/T
3/-
3/A
A
C
C
T/C
A
2/-
G
A
-
G
-
A
G
A
-
A
G
C
-
-
2
A
G
-
T
A
A
-
C
-
A
C
-
A
A
G
G
-
C
-
-
-
-
-
-
-
-
G
-
-
C
-
T
G
2
A
-
-
-
-
G
2
G
T
T
T
G
-
2
C
A
T
-
-
-
G
-
-
-
C
A
-
-
-
-
-
T
-
T
-
-
-
-
-
T
-
-
-
-
-
T
C
-
C
A
A
G
T
A
A