Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 117,803 (bp)   Positions: 536
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.0
.998
.008
.326
.352
.028
.01
.059
.045
.006
.001
.001
.012
.004
.0
.0
.0
.001
.001
.0
.112
.001
.0
.998
.0
.14
.004
.779
.0
.003
--
--
.003
.06
.479
.018
.062
.048
.563
.596
.0
.003
.011
.007
--
.035
.0
.0
.001
.0
.091
.003
.001
.005
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.006
.013
.001
.01
.047
--
.04
.006
.0
.001
.01
.009
--
.909
.006
.007
--
--
--
.0
.0
.001
.003
.0
.0
.003
.455
.006
.005
.047
.004
.026
.006
.338
.548
.484
.021
.499
.021
.11
.007
.005
.046
.047
.07
.013
.181
.183
.012
.148
.181
.013
.055
.065
.065
.006
.179
.183
.008
.011
.248
.049
.01
.05
.008
.19
.819
.625
.011
.011
.002
.041
.063
.004
.002
.009
.057
.045
.136
.676
.652
.024
.141
.381
.213
.006
.001
.151
.071
.006
.033
.151
.139
.001
.011
.03
.058
--
.12
.004
.002
.002
.133
.089
.0
.027
.017
.001
.002
.0
.0
.009
.259
.003
.012
.022
.0
.0
.001
.095
.127
.001
.001
.0
.0
.0
.0
.058
.0
.122
.007
.001
.002
.005
.146
.797
.01
.001
.003
.187
.015
.043
.04
.074
.0
.0
.001
.135
.016
.017
.0
.009
.002
.001
.051
.068
.064
.02
.001
.056
.003
.064
.014
.038
.136
.371
.041
--
.414
.03
.021
.005
.005
.0
.007
.004
.0
.001
.005
.008
.001
.017
.009
.0
.0
.005
.012
.008
.001
.011
.001
.0
.553
.042
.02
.002
.06
.039
.0
.004
.02
.0
.001
.002
.01
.026
.405
.007
.152
.005
.111
.011
.0
.0
.026
.008
.014
.084
.002
.015
.008
.023
--
--
--
--
.095
.092
.074
.032
.088
.003
.032
.055
.042
.027
.007
.001
.758
.003
.01
.005
.036
.013
.046
.001
.041
.009
.0
.001
.001
.002
.002
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.091
.124
.047
.073
.001
.003
.001
.0
.01
.0
--
--
--
--
.042
.014
.002
.008
.002
.003
.001
.012
.089
.024
.047
.091
--
--
.058
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.07
.055
.223
.038
.012
.002
.036
.047
.005
.009
.015
.01
.02
.042
.045
.098
.009
.009
.007
.001
.004
.009
.018
.027
.008
.005
.004
.271
.45
.001
.0
.003
.0
.002
.059
.001
.003
.008
--
--
--
--
.181
.153
.049
.015
.095
--
--
--
--
--
.053
--
--
.005
.002
.014
.377
.004
.02
.063
--
--
--
.001
.008
.036
.003
.0
.006
.003
.108
.033
.014
.192
.393
.004
.013
.85
.008
.0
.038
.0
.005
.002
.007
.074
.001
.001
.0
.001
.0
.0
.002
.002
.0
.041
.473
.001
.001
.037
.0
.0
.001
.0
.0
.002
.001
.007
.001
.0
.001
.167
.0
.0
.034
.001
.017
.005
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
C
C
T
A
A
C
A
G
C
C
T
G
C
C
T
C
C
C
C
C
-
A
T
A
G
4
A
C
A
T
A
C
C
C
C
T
G
A
A
A
A
T
C
A
T
-
C
C
G
T
T
A
C
A
A
4
-
C
C
A
C
A
C
G
T
T
C
2
-
A
C
C
T
A
A
T
T
T
G
T
C
T
G
T
A
C
A
C
A
C
C
4
T
G
C
A
2
C
G
G
C
C
T
T
C
G
A
A
A
T
G
C
G
T
C
T
C
-
C
T
C
T
A
C
A
A
T
G
-
G
T
T
T
-
T
4
C
T
A
A
C
T
T
C
G
G
-
C
11
C
T
A
C
6
3
6
C
3
G
G
C
6
T
A
G
C
C
G
A
C
G
T
T
G
C
C
G
C
T
G
4
G
C
A
T
G
A
T
G
T
C
A
T
A
A
T
A
C
T
G
C
C
G
C
A
C
A
T
C
T
C
C
G
T
C
G
C
C
C
T
T
-
G
C
G
A
A
G
C
C
C
C
C
T
T
A
C
G
-
T
T
A
A
T
G
-
G
A
C
T
T
A
C
G
T
A
T
T
T
T
10
T
G
A
A
C
A
G
C
T
T
T
T
G
2
A
T
C
C
5
C
C
C
A
G
T
T
C
G
T
T
A
-
A
C
T
A
C
T
G
T
G
C
C
2
T
G
C
T
A
T
G
G
A
G
T
G
-
C
T
T
C
T
G
C
T
A
-
G
C
C
T
T
T
C
-
C
C
A
T
A
T
A
T
G
A
T
G
G
T
A
C
G
C
A
A
G
T
G
G
-
A
C
C
A
T
G
C
C
T
A
G
T
G
C
T
A
G
G
C
C
C
T
G
C
A
A
C
C
G
A
T
T
C
4
A
G
A
C
G
C
G
G
A
T
G
-
14
G
-
G
T
4
A
16
G
-
A
C
C
G
C
C
C
G
G
C
G
C
G
-
C
C
-
T
G
G
T
2
-
T
C
T
-
8
G
G
A
C
T
T
-
C
A
5
C
T
A
G
T
C
A
T
-
G
-
C
G
T
A
T
G
G
G
T
C
C
T
C
G
A
A
T
T
C
A
A
C
T
T
T
T
G
C
G
T
A
G
C
T
T
C
A
T
A
T
C
-
T
A
G
C
C
-
-
-
G
T
A
C
C
G
A
C
C
C
C
A
T
T
T
G
-
T
A
A
  178,402,721
  178,403,043
  178,403,337
  178,403,395
  178,403,949
  178,404,023
  178,404,196
  178,404,279
  178,404,450
  178,404,789
  178,404,954
  178,404,986
  178,405,199
  178,405,408
  178,405,845
  178,405,870
  178,406,288
  178,406,324
  178,406,339
  178,406,664
  178,407,098
  178,408,016
  178,409,426
  178,409,538
  178,409,785
  178,409,795
  178,409,994
  178,410,351
  178,410,660
  178,410,693
  178,411,129
  178,411,140
  178,411,993
  178,412,940
  178,412,997
  178,413,126
  178,413,393
  178,413,485
  178,413,894
  178,413,920
  178,414,221
  178,415,424
  178,416,367
  178,416,429
  178,416,504
  178,419,748
  178,419,923
  178,420,312
  178,420,317
  178,420,504
  178,421,100
  178,421,114
  178,422,167
  178,423,598
  178,423,910
  178,424,602
  178,424,855
  178,425,423
  178,425,529
  178,425,574
  178,426,022
  178,426,919
  178,427,162
  178,427,650
  178,427,851
  178,428,168
  178,428,429
  178,429,510
  178,429,959
  178,431,515
  178,431,613
  178,431,645
  178,431,684
  178,431,815
  178,432,608
  178,433,149
  178,433,153
  178,433,448
  178,433,482
  178,433,619
  178,433,627
  178,435,155
  178,435,357
  178,435,456
  178,435,748
  178,436,742
  178,437,200
  178,437,893
  178,438,062
  178,438,345
  178,438,360
  178,438,428
  178,438,662
  178,438,663
  178,438,745
  178,439,176
  178,439,186
  178,439,216
  178,439,413
  178,439,469
  178,439,484
  178,439,660
  178,439,700
  178,439,852
  178,439,941
  178,439,973
  178,439,980
  178,440,005
  178,440,009
  178,440,058
  178,440,089
  178,440,122
  178,440,270
  178,440,299
  178,440,325
  178,440,331
  178,440,362
  178,440,443
  178,440,458
  178,440,502
  178,440,585
  178,440,634
  178,440,636
  178,440,759
  178,440,760
  178,440,829
  178,440,838
  178,440,868
  178,440,891
  178,440,988
  178,441,161
  178,441,232
  178,441,320
  178,441,601
  178,441,620
  178,441,642
  178,441,695
  178,441,719
  178,441,819
  178,441,959
  178,441,988
  178,442,011
  178,442,371
  178,442,380
  178,442,470
  178,442,476
  178,442,527
  178,442,596
  178,442,658
  178,442,730
  178,442,764
  178,442,770
  178,442,885
  178,442,907
  178,442,924
  178,442,941
  178,442,967
  178,442,997
  178,443,030
  178,443,114
  178,443,125
  178,443,143
  178,443,182
  178,443,310
  178,443,480
  178,443,490
  178,443,777
  178,444,020
  178,444,590
  178,444,604
  178,444,701
  178,446,115
  178,446,833
  178,446,835
  178,446,887
  178,446,940
  178,446,983
  178,447,123
  178,448,189
  178,448,661
  178,448,830
  178,450,004
  178,450,079
  178,450,291
  178,450,332
  178,450,347
  178,450,885
  178,451,457
  178,451,838
  178,451,907
  178,452,191
  178,452,259
  178,452,309
  178,452,314
  178,452,567
  178,452,885
  178,453,157
  178,453,358
  178,453,674
  178,454,609
  178,455,041
  178,455,399
  178,455,603
  178,455,938
  178,456,616
  178,456,925
  178,457,020
  178,457,041
  178,457,043
  178,457,223
  178,457,224
  178,457,262
  178,457,282
  178,457,771
  178,457,877
  178,457,916
  178,457,949
  178,458,150
  178,458,152
  178,458,174
  178,458,210
  178,458,214
  178,458,229
  178,458,250
  178,458,373
  178,458,531
  178,459,638
  178,459,705
  178,459,717
  178,459,902
  178,460,150
  178,460,292
  178,460,470
  178,460,892
  178,461,541
  178,461,546
  178,461,553
  178,461,556
  178,461,900
  178,462,002
  178,462,419
  178,462,695
  178,462,740
  178,462,771
  178,462,900
  178,463,130
  178,463,154
  178,463,802
  178,463,815
  178,464,278
  178,464,301
  178,464,371
  178,464,372
  178,464,641
  178,464,682
  178,464,845
  178,464,862
  178,464,898
  178,464,991
  178,465,077
  178,465,095
  178,465,348
  178,465,646
  178,465,844
  178,466,104
  178,466,132
  178,466,267
  178,466,522
  178,466,571
  178,466,622
  178,466,708
  178,466,791
  178,466,880
  178,467,073
  178,467,132
  178,467,200
  178,467,325
  178,467,667
  178,467,683
  178,467,965
  178,468,029
  178,468,129
  178,468,204
  178,468,233
  178,468,304
  178,468,483
  178,468,514
  178,468,689
  178,468,977
  178,468,992
  178,469,013
  178,469,166
  178,469,323
  178,469,381
  178,469,516
  178,469,525
  178,469,639
  178,469,695
  178,469,744
  178,469,747
  178,469,943
  178,469,966
  178,470,050
  178,470,169
  178,470,526
  178,470,591
  178,470,623
  178,470,680
  178,470,789
  178,471,050
  178,471,214
  178,471,229
  178,471,641
  178,471,683
  178,471,746
  178,471,866
  178,471,878
  178,472,000
  178,472,062
  178,472,118
  178,472,127
  178,472,180
  178,472,253
  178,472,254
  178,472,258
  178,472,332
  178,472,346
  178,472,356
  178,472,992
  178,473,204
  178,473,271
  178,473,285
  178,473,358
  178,473,362
  178,473,369
  178,473,633
  178,473,851
  178,474,126
  178,474,146
  178,474,284
  178,474,417
  178,474,556
  178,474,572
  178,474,633
  178,474,704
  178,474,707
  178,474,736
  178,474,753
  178,474,794
  178,474,967
  178,475,016
  178,475,071
  178,475,176
  178,475,607
  178,475,629
  178,475,749
  178,476,161
  178,476,239
  178,476,402
  178,476,461
  178,476,581
  178,476,628
  178,476,721
  178,477,235
  178,477,280
  178,477,368
  178,477,713
  178,477,795
  178,477,855
  178,477,974
  178,477,999
  178,478,066
  178,478,096
  178,478,157
  178,478,169
  178,478,218
  178,478,484
  178,478,550
  178,478,835
  178,478,884
  178,478,885
  178,479,153
  178,479,160
  178,479,175
  178,479,183
  178,479,996
  178,482,142
  178,486,460
  178,487,649
  178,487,875
  178,487,878
  178,488,517
  178,489,264
  178,489,523
  178,490,140
  178,490,793
  178,490,948
  178,490,987
  178,491,464
  178,491,506
  178,491,544
  178,491,599
  178,491,772
  178,492,742
  178,493,061
  178,494,172
  178,494,435
  178,494,455
  178,494,576
  178,494,900
  178,495,367
  178,495,921
  178,496,118
  178,496,158
  178,496,166
  178,496,217
  178,496,488
  178,496,501
  178,496,661
  178,496,703
  178,496,752
  178,496,767
  178,496,794
  178,496,826
  178,496,952
  178,496,966
  178,496,970
  178,497,006
  178,497,007
  178,497,019
  178,497,024
  178,497,035
  178,497,117
  178,497,121
  178,497,130
  178,497,306
  178,497,309
  178,497,311
  178,497,396
  178,497,399
  178,497,473
  178,497,482
  178,497,486
  178,497,510
  178,497,900
  178,498,158
  178,498,243
  178,498,505
  178,498,658
  178,498,721
  178,498,743
  178,498,810
  178,500,152
  178,500,243
  178,500,328
  178,500,355
  178,500,359
  178,500,386
  178,500,507
  178,500,578
  178,500,582
  178,500,760
  178,500,855
  178,500,929
  178,500,933
  178,500,943
  178,501,025
  178,501,441
  178,501,651
  178,502,273
  178,502,850
  178,502,958
  178,502,960
  178,502,972
  178,502,983
  178,503,196
  178,503,481
  178,503,967
  178,504,558
  178,504,617
  178,504,708
  178,505,186
  178,505,209
  178,505,498
  178,505,791
  178,506,057
  178,506,272
  178,506,342
  178,506,751
  178,506,870
  178,506,988
  178,507,809
  178,508,068
  178,508,233
  178,508,369
  178,508,554
  178,508,638
  178,508,678
  178,509,282
  178,509,395
  178,509,471
  178,509,568
  178,509,706
  178,510,230
  178,510,261
  178,510,265
  178,511,794
  178,512,034
  178,512,229
  178,512,687
  178,512,754
  178,512,782
  178,512,791
  178,513,135
  178,513,257
  178,513,646
  178,514,337
  178,514,413
  178,515,023
  178,516,601
  178,516,607
  178,516,640
  178,516,816
  178,516,886
  178,516,887
  178,516,928
  178,517,075
  178,517,076
  178,517,133
  178,517,693
  178,517,955
  178,518,225
  178,518,292
  178,518,316
  178,518,566
  178,519,944
T
T
C
T
G
A
G
T
T
A
C
C
T
T
A
T
T
T
T
T
2
G
-
-
A
-
T
G
G
C
G
A
T
A
T
G
A
G
C
G
G
A
T
G
-
-/A
T
T
A
C
-
-
T
G
G
-
G
T
T
G
T
G
T
T
C
C
G
-
CG/G
-
A
A
A
G
T
C
C
C
-
A
A
A
A
C
G
T
T
A
C
T
T
-
C
A
A
-
-
A
A
T
A
T
C
A
T
A
G
G
G
C
A
A
T
C
T
C
T
A
A
C
T
A
G
T
G
T
C
A
3
A
G
-
A
2
G
-
T
G
G
T
G
C
C
T
G/T
G/A
T
T
-
A
C
G
T
-
-
-
T
-
A
A
T
-
C
C
C
A
T
A
T
T
T
C
C
A
A
T
A
T
C
A
-
A
T
G
C
C
G
A
A
A
T
G
C
G
-
A
G
T
C
T
T
T
A
T
G
T
C
C
A
C
T
T
C
G
G
A
T
T
T
C
C
G
A
G/G
A
G
-
A
A
T
T
T
G
-
C
C
G
A
A
C
C
G
C
C
A
T
C
G
T
C
C
G
T
C
C
T
C
C
G
C
-
G
C
G
G
A
G
T
T
C
A
C
C
A
-
T
C
T
T
-
T
T
T
G
A
C
C
T
A
C
A
G
C
G
T
C
T
T
C
A
C
A
T
T
-
C
A
T
A
-
C
A
A
G
A
C
T
T
T
C
C
T
C
A
T
A
G
A
T
G
T
C
C
C
T
A
T
T
G
C
G
G
G
C
T
G
C
A
A
G
G
T
C
T
G
-
A
C
A
A
A
T
T
T
G
C
T
A
T
C
T
T
C
A
T
C
C
A
A
G
T
G
C
C
T
G
A/-
T
G
A
G
C
C
T
-
G
A
G
T
A
T
C
A
C
C
C
2
-
A
7
A
A
-
T
-
A
3
G
T
T
A
T
T
T
A
A
T
A
G
C
2
T
T
A
C
A
A
G
-
4
-
G
A
G
-
T
T
C
T
C
G
12
T
G
-
T
C
G
A
C
A
G
C
T
T
2
G
A
A
G
C
A
A
A
C
T
T
C
T
C
G
G
C
C
T
T
G
T
G
C
C
C
A
A
C
C
G
A
T
C
C
T
G
C
G
C
T
4
C
G
C
T
T
2
77
5
C
C
G
G
T
A
C
T
G
T
T
G
C
C
C
-
T
G
G
G