Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 237,915 (bp)   Positions: 422
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.0
.001
.0
.175
.298
.001
.002
.012
.014
.014
.014
.001
.001
.009
.0
.0
.0
.005
.0
.001
.0
.028
.003
.627
.0
.0
.006
.001
.01
.0
.924
.148
.0
.001
.0
.001
.022
.0
.013
.006
.01
.0
.0
.001
.997
.0
.011
.0
.0
.0
.0
.001
.002
.002
.001
.0
.0
.0
.0
.097
.0
.372
.001
.001
.002
.0
.004
.011
.011
.0
.0
.107
.0
.012
.004
.002
.001
.0
.002
.0
.004
.731
.0
--
--
--
--
.003
.0
.002
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.001
.126
.108
.001
.0
.038
.044
.002
.259
--
.0
.001
.957
.002
.001
.01
.0
.001
.0
.0
.009
.005
.0
.001
.003
.0
.001
.129
.0
.0
.005
.008
.015
.0
.0
.0
.0
.001
.001
.005
.0
.006
.063
.0
.002
.003
.008
.001
.002
.003
.009
.011
.463
.011
.002
.0
.202
.006
.001
.0
.003
.0
.0
.004
.001
.0
.0
.001
.408
.433
.921
.984
.04
.002
.019
.0
.003
.007
.0
.588
.228
--
--
.001
.003
.032
.006
.296
.046
.004
.007
.0
.001
.001
.006
.005
.001
.032
.011
.005
.0
.0
.002
.0
.114
.127
.002
.0
.0
.03
.001
.085
.977
.009
.514
.0
.002
.003
.001
.0
.0
.0
.002
.317
.0
.002
.002
.001
.0
.002
.016
.0
.0
.002
.001
.0
.0
.001
.0
.0
.001
.05
.53
.001
.0
.01
.01
.011
.013
.021
.011
1.0
.001
.0
.0
.0
.286
.085
.0
.011
.007
.0
.0
.0
.005
.953
.308
.0
.0
.113
.159
.009
.293
.009
.055
.043
.001
.001
.0
.001
.003
.0
.014
.0
.009
.001
.453
.0
.101
.005
.003
.0
.031
.006
.989
1.0
.021
.027
.042
.013
.0
.003
.005
.0
.003
--
--
.003
.0
.041
.0
.0
.013
.0
.007
.001
.001
.006
.024
.002
.0
.006
.0
.0
.024
.031
.002
.0
.001
.053
.113
--
.0
.0
.0
.0
.009
.135
.014
.0
.0
.002
.998
.077
.001
.0
.004
.002
.002
.0
.0
.006
.013
.025
.012
.001
.0
.0
.001
.0
.007
.0
.017
.002
.0
.0
.002
1.0
.0
.0
.001
.013
.068
.024
.002
.0
.003
.266
.097
.0
.01
.002
.0
.005
.983
.981
.004
.009
.002
.002
.014
.002
.0
--
--
.004
.005
.02
.0
.0
.22
.002
.001
.003
.0
.594
.008
.003
.0
.001
.011
.018
.032
.0
.007
.044
.0
.004
.001
.0
.0
.0
.0
.0
.001
.142
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Runx1
Runx1
Runx1
Runx1
Runx1
Runx1
Runx1
Runx1
Runx1
Runx1
Runx1
Runx1
Runx1
Runx1
Runx1
Runx1
Runx1
Runx1
Runx1
Runx1
Runx1
Runx1
Runx1
Runx1
Runx1
Runx1
Runx1
Runx1
Runx1
Runx1
Runx1
Runx1
Runx1
Runx1
Runx1
Runx1
Runx1
Runx1
Runx1
Runx1
Runx1
Runx1
Runx1
C
T
A
A
G
T
A
G
T
C
C
C
C
A
T
G
T
T
G
T
T
A
C
G
G
T
T
T
A
C
A
A
T
T
T
A
G
G
G
T
T
G
T
C
T
T
G
C
C
G
T
C
T
T
C
T
G
T
C
A
T
G
C
G
T
G
A
A
G
G
G
C
T
A
C
A
G
T
A
C
A
T
G
T
T
A
A
A
T
A
G
C
C
T
A
C
T
A
C
G
C
G
C
G
G
A
T
A
G
A
C
C
G
T
C
T
G
C
T
T
G
T
T
G
T
G
T
G
A
A
C
T
C
C
C
G
T
G
T
G
A
A
G
A
G
G
A
C
C
A
C
G
A
A
C
C
C
G
T
C
T
T
T
T
A
G
A
G
A
G
C
T
T
C
T
G
G
A
G
G
C
T
C
C
A
C
C
A
A
A
C
A
G
G
G
G
G
G
G
T
A
A
C
A
A
T
C
A
G
A
G
T
A
G
G
T
A
G
G
G
T
C
G
A
C
T
G
G
C
G
T
T
T
T
G
A
C
T
G
T
A
T
G
C
A
G
T
A
G
C
A
T
C
T
T
T
T
C
C
T
G
G
C
C
A
G
C
C
C
A
A
C
C
C
C
C
C
G
G
T
A
C
A
C
A
G
T
T
A
C
T
T
T
T
G
C
T
C
A
T
G
T
C
C
G
C
C
C
G
C
G
A
T
T
A
G
A
T
C
C
C
A
A
T
G
G
C
C
G
G
T
C
T
G
T
G
T
T
A
G
G
A
G
T
G
A
A
C
C
G
T
T
A
T
T
A
T
C
T
A
T
T
A
G
T
G
G
A
T
C
T
T
G
C
G
A
A
T
T
G
G
C
T
A
A
G
G
G
T
A
C
T
T
A
T
T
T
G
T
C
T
C
C
T
G
G
T
C
G
C
C
T
A
G
A
G
C
A
T
T
C
C
  32,766,785
  32,766,797
  32,770,247
  32,771,589
  32,774,390
  32,776,275
  32,776,333
  32,779,702
  32,779,909
  32,780,151
  32,780,418
  32,781,457
  32,781,462
  32,781,500
  32,786,850
  32,787,114
  32,787,245
  32,787,627
  32,788,849
  32,789,833
  32,790,631
  32,790,669
  32,791,512
  32,791,590
  32,792,217
  32,792,624
  32,793,458
  32,793,923
  32,794,027
  32,794,037
  32,794,492
  32,794,740
  32,795,422
  32,795,999
  32,796,454
  32,796,487
  32,797,037
  32,797,139
  32,797,262
  32,797,770
  32,798,055
  32,798,096
  32,798,292
  32,798,650
  32,800,137
  32,800,681
  32,800,871
  32,801,190
  32,801,384
  32,801,464
  32,802,814
  32,803,263
  32,803,430
  32,803,922
  32,804,038
  32,805,835
  32,806,426
  32,807,203
  32,808,385
  32,809,202
  32,809,435
  32,809,590
  32,810,305
  32,810,307
  32,810,917
  32,811,910
  32,812,751
  32,812,845
  32,812,853
  32,813,474
  32,813,625
  32,813,984
  32,814,263
  32,814,273
  32,814,524
  32,814,608
  32,814,786
  32,815,461
  32,815,742
  32,816,120
  32,816,161
  32,816,221
  32,816,476
  32,816,563
  32,816,599
  32,816,729
  32,817,198
  32,819,885
  32,819,909
  32,819,920
  32,820,217
  32,820,270
  32,820,311
  32,821,230
  32,821,364
  32,821,688
  32,821,912
  32,822,242
  32,823,137
  32,823,397
  32,823,739
  32,824,624
  32,825,282
  32,825,418
  32,825,676
  32,827,052
  32,828,673
  32,830,085
  32,832,883
  32,833,843
  32,833,903
  32,834,004
  32,834,390
  32,834,408
  32,834,442
  32,834,622
  32,834,830
  32,835,137
  32,835,799
  32,835,878
  32,836,067
  32,836,387
  32,836,982
  32,837,482
  32,837,601
  32,838,218
  32,838,299
  32,838,741
  32,839,123
  32,839,316
  32,839,330
  32,839,774
  32,840,370
  32,841,672
  32,843,591
  32,843,593
  32,845,969
  32,846,969
  32,846,994
  32,849,007
  32,849,073
  32,850,257
  32,851,348
  32,852,538
  32,852,947
  32,853,681
  32,853,790
  32,854,245
  32,854,804
  32,856,286
  32,856,374
  32,856,569
  32,857,897
  32,858,807
  32,860,275
  32,860,276
  32,860,314
  32,861,640
  32,862,023
  32,862,416
  32,862,419
  32,862,477
  32,863,399
  32,864,299
  32,865,067
  32,865,073
  32,865,159
  32,865,426
  32,865,530
  32,865,780
  32,866,175
  32,866,208
  32,866,553
  32,866,988
  32,867,687
  32,867,800
  32,867,830
  32,867,936
  32,868,106
  32,868,181
  32,868,273
  32,869,360
  32,869,791
  32,870,294
  32,870,482
  32,870,582
  32,870,691
  32,871,048
  32,871,764
  32,871,769
  32,871,920
  32,872,552
  32,872,662
  32,872,936
  32,872,940
  32,872,944
  32,873,129
  32,874,852
  32,875,238
  32,875,386
  32,875,522
  32,875,523
  32,875,944
  32,876,924
  32,876,994
  32,877,589
  32,877,697
  32,877,814
  32,878,357
  32,878,620
  32,878,901
  32,878,962
  32,879,098
  32,880,082
  32,880,160
  32,880,394
  32,880,500
  32,880,819
  32,881,062
  32,882,081
  32,882,533
  32,882,599
  32,882,975
  32,883,141
  32,883,849
  32,884,180
  32,884,432
  32,884,623
  32,884,739
  32,885,405
  32,886,186
  32,886,519
  32,886,556
  32,889,583
  32,890,142
  32,890,408
  32,890,506
  32,890,871
  32,891,450
  32,892,563
  32,894,845
  32,895,454
  32,895,773
  32,896,365
  32,897,618
  32,898,451
  32,898,715
  32,899,121
  32,899,646
  32,899,749
  32,900,900
  32,900,914
  32,901,967
  32,902,307
  32,902,966
  32,903,214
  32,903,521
  32,903,796
  32,904,421
  32,904,839
  32,904,947
  32,904,987
  32,905,129
  32,905,600
  32,905,696
  32,906,572
  32,906,688
  32,907,119
  32,907,286
  32,907,638
  32,909,018
  32,909,989
  32,911,066
  32,911,498
  32,911,614
  32,911,763
  32,911,847
  32,911,869
  32,912,094
  32,918,053
  32,918,976
  32,919,421
  32,919,960
  32,920,801
  32,922,023
  32,922,727
  32,923,549
  32,923,847
  32,923,918
  32,923,922
  32,924,304
  32,924,325
  32,924,890
  32,925,957
  32,926,474
  32,926,999
  32,927,057
  32,927,184
  32,927,621
  32,927,817
  32,933,434
  32,934,991
  32,935,178
  32,935,506
  32,939,881
  32,943,308
  32,944,566
  32,944,918
  32,945,618
  32,945,974
  32,946,270
  32,946,979
  32,947,267
  32,947,402
  32,948,641
  32,949,926
  32,950,935
  32,951,210
  32,951,812
  32,951,903
  32,952,178
  32,952,228
  32,952,553
  32,952,623
  32,952,746
  32,952,853
  32,952,884
  32,953,105
  32,953,661
  32,953,848
  32,954,029
  32,954,210
  32,954,292
  32,954,862
  32,955,159
  32,955,177
  32,956,141
  32,956,152
  32,957,043
  32,957,059
  32,957,600
  32,957,605
  32,959,237
  32,959,287
  32,961,167
  32,961,629
  32,962,845
  32,963,009
  32,963,066
  32,963,317
  32,963,384
  32,964,276
  32,964,294
  32,965,335
  32,965,499
  32,965,740
  32,965,921
  32,965,997
  32,966,722
  32,967,790
  32,968,308
  32,968,670
  32,968,675
  32,968,818
  32,969,306
  32,969,738
  32,969,970
  32,970,044
  32,970,490
  32,970,528
  32,971,080
  32,971,189
  32,972,181
  32,972,390
  32,973,059
  32,973,146
  32,973,360
  32,973,477
  32,973,489
  32,974,355
  32,975,556
  32,976,172
  32,976,792
  32,976,909
  32,976,913
  32,977,475
  32,980,785
  32,984,436
  32,985,036
  32,987,345
  32,987,362
  32,987,622
  32,987,764
  32,987,958
  32,988,070
  32,988,071
  32,988,388
  32,989,245
  32,989,261
  32,989,502
  32,989,552
  32,989,671
  32,989,878
  32,990,236
  32,990,350
  32,991,135
  32,991,443
  32,991,492
  32,994,466
  32,994,731
  32,996,465
  32,996,703
  32,997,551
  32,997,946
  32,998,065
  32,998,083
  32,998,243
  32,998,928
  32,998,948
  32,999,469
  32,999,472
  33,000,143
G
A
G
C
A
C
G
A
T/C
T
T
A
A
A/C
C
A
C
C
A
A
C
G
T
G/A
A
C
C
C
G
G
G
G
G
C
G
G
A
A
A
C
C
A
C
T
C
C
A
T
T
A
C
G
C
C
T
C
A
C
A
G
C
A
T
A
C
C
G
G
C
A
T
G
C
G
T
G
A
C
G
T
G
A
A
G
A
A/T
G
G
C
T
C
T
T
C
T
T
A
C
T
A
T
C
T
A
A
G
C
G
A
T
T
T
A
C
T
C
A
T
C
C
A
C
G
A
C
C
G
A
G
G
T
C
T
A
T
A
C
A
G
A
G
G
T
G
A
A
G
T
T
T
C/G
A
C
A/C
A
A
T
A
G
G
A
C
C
C
G
A
A/G
A
T
C
G
A
C
T
A
A
A
A/G
A
T
T
A
G
T
G
T
G
T
G
C
A
T
A
C
C
C
A
C
A
C
G
T
T
G
G
C
A
G
G/A
C
A
C
G
A
T
C
C
A
A
A
C
T
G/T
G
G
C
A
A
T
A
A
C
C
C
A
G
T
C
A
G
G
A
A
T
G
T
G
G
A
T
G
C
T
C
C
C
C
T
T
C
A
A
T
T
C
T
A
T
A
G
G
T
T
T
T
T
T
C
T
A
T
T
C
T
G
A
C
C
C
G
C
C
C
C
C
G
C
T
G
C
G/C
G
T
T
A
T
T
T
A
G
A
C
C
C
G
A
G
C
T
T
T
G
G
C
A
T
C/G
T
A
A
C
T
C
C
C
A
A
A
G
A
C
C
C
A
A
C
C
A
T
A
G
C
G
C
C
G
C
T
C
T
C
G
C
A
C
A
A
G
C
T
C
C
A
A
T
G
G
C
C
A
A
T
C
T
C
T
C
A
C
A/G
C/T
C
C
G
C
C
G
A
C
G
C
A
T
C
A
A
C
T
A
T
G
C
G
A
G
A
T
C
C
C
G
A