Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 308,072 (bp)   Positions: 448
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.004
.024
.481
.004
.038
.001
.671
.047
.004
.001
.004
.005
.001
.002
.31
.168
.146
--
.007
.0
.35
.068
.094
.21
.405
.004
.983
.995
.006
.001
.007
.006
.002
--
.012
.023
.077
.003
.598
.008
.003
.084
--
.041
--
.49
.003
.001
.007
.016
.978
.0
.0
.002
.013
.122
--
.007
.014
.004
.002
.233
.214
.084
.396
.394
.073
.057
.0
.004
.001
.831
.016
.029
.036
.056
.064
.0
.687
.021
.036
.031
.167
.02
.048
.0
.001
--
.0
.01
.204
.113
.035
.049
.011
.014
.01
.0
.006
.002
.002
.012
.01
.526
.0
.45
.212
.018
.005
.144
.062
.045
.005
.064
.027
.004
.14
.044
.004
.04
.008
.003
.033
.038
.021
.001
.001
.001
.001
.002
.001
.127
.126
.002
.507
.005
.068
.002
.0
.048
.036
.118
.137
.006
.108
.017
.255
.0
.016
.001
.0
.0
.001
--
.0
.001
.0
.787
.0
.381
.056
.024
.041
.034
.015
.0
.153
.053
.006
.0
.003
.001
.125
.001
--
--
--
--
--
.002
--
.002
.005
.005
.006
.411
.658
.085
.604
.149
.0
.01
.042
.008
.001
.003
.0
.001
.0
.012
.981
.0
.005
.046
--
.004
.004
.007
.001
.0
.005
.039
.118
.404
.024
.006
.063
.0
.001
.008
.001
.59
.012
.001
.104
.0
.028
.001
.003
.561
.407
.0
.093
.003
.0
.0
.0
.942
.009
.014
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.007
.009
.001
.024
.003
.367
.0
.001
.241
.005
.006
.009
.01
.001
.01
.001
.001
.013
.06
.008
.003
.002
.0
.009
.006
.03
.992
.003
.146
--
.003
.02
.001
.068
.0
.0
.002
.001
.0
.0
.0
.12
.011
.011
.002
--
--
.007
.391
.028
.105
.001
.013
.882
.013
.004
.245
.519
.005
.003
.009
.001
.119
.009
.006
.002
.0
.0
.042
.022
.023
.003
.095
.144
.175
.001
.001
.045
.002
.0
.877
--
.002
.094
.009
.005
.0
.033
.035
.017
.007
.005
.007
.057
.004
.041
.107
.007
.013
.033
.029
.034
.033
.037
.072
.075
.07
.079
.234
.002
.001
.247
.034
.023
.118
.117
.006
.009
.024
.096
.018
.226
.321
.084
.001
.003
.001
.0
.001
--
--
.069
.006
.007
.031
.028
.083
.085
.001
.0
.0
.0
.0
.001
.963
.0
.0
.043
.005
.004
.0
.793
.0
.016
.001
.025
.027
.073
.057
.001
.0
.0
.0
.001
.392
.002
.04
.007
.013
.004
.001
.004
.0
.277
.278
.282
.268
.207
.071
.027
.001
.037
.063
.071
.036
.011
.005
.017
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
T
G
T
-
2
T
A
C
T
A
T
T
T
T
T
T
6
C
A
T
C
G
G
A
A
T
G
16
A
C
C
C
G
-
C
C
G
G
C
3
2
C
T
C
C
A
G
A
G
5
-
A
A
-
G
C
9
C
G
T
A
G
T
T
T
A
A
T
T
C
T
G
C
C
A
T
C
A
T
A
-
-
2
-
-
T
A
A
A
T
G
C
G
-
C
T
A
T
G
-
T
T
5
C
G
C
T
G
-
4
-
-
A
C
C
G
-
-
-
A
-
-
-
C
G
T
T
T
T
T
T
2
-
G
C
G
G
29
G
C
C
C
A
G
2
118
C
C
G
G
G
T
A
A
G
3
3
G
-
G
T
G
T
T
4
T
T
A
3
T
T
-
T
-
A
C
-
-
-
-
-
T
C
-
-
T
-
C
-
T
A
C
T
G
A
G
G
22
G
T
A
2
G
2
T
C
C
T
C
T
G
C
C
G
C
C
T
G
A
C
T
17
C
G
C
A
A
T
A
-
G
C
C
T
T
-
A
-
T
C
G
T
2
G
G
5
A
T
G
A
C
T
T
-
-
-
C
T
-
A
-
C
-
C
G
A
C
G
G
C
T
T
A
A
T
C
T
C
A
C
T
C
T
2
-
G
A
C
T
A
C
G
A
G
A
A
T
T
A
C
T
C
G
T
C
G
G
G
A
T
A
A
A
A
G
A
C
T
T
G
T
A
C
G
T
A
A
A
A
T
T
T
T
G
G
-
T
T
A
T
34
A
G
A
A
-
G
G
T
-
G
A
G
2
-
-
-
-
C
A
-
T
T
T
-
-
G
A
T
2
C
A
C
G
-
-
-
-
C
-
C
A
G
-
C
T
C
C
5
A
A
G
G
T
A
-
C
T
T
A
A
T
A
C
A
A
-
C
A
T
T
A
A
G
C
T
A
G
G
T
-
G
A
A
-
A
C
G
C
C
T
G
A
2
A
A
T
G
G
G
A
G
C
G
G
C
C
G
  108,751,715
  108,751,724
  108,751,732
  108,752,045
  108,752,067
  108,752,074
  108,752,126
  108,752,351
  108,752,548
  108,752,684
  108,753,095
  108,753,096
  108,753,128
  108,753,139
  108,753,518
  108,754,934
  108,754,951
  108,755,387
  108,755,719
  108,756,199
  108,757,733
  108,759,969
  108,760,268
  108,761,415
  108,761,801
  108,762,484
  108,763,552
  108,763,565
  108,763,696
  108,764,262
  108,764,798
  108,765,025
  108,766,469
  108,767,974
  108,768,509
  108,768,698
  108,769,860
  108,770,160
  108,770,377
  108,770,681
  108,771,991
  108,772,875
  108,774,051
  108,774,405
  108,775,090
  108,775,977
  108,776,733
  108,777,356
  108,778,801
  108,779,099
  108,779,419
  108,780,482
  108,781,230
  108,782,035
  108,782,263
  108,782,435
  108,783,113
  108,783,831
  108,784,042
  108,784,186
  108,784,415
  108,785,060
  108,786,728
  108,786,906
  108,787,354
  108,787,355
  108,792,285
  108,792,565
  108,792,605
  108,792,740
  108,793,689
  108,794,013
  108,794,794
  108,794,910
  108,795,291
  108,795,786
  108,796,515
  108,797,372
  108,798,409
  108,799,206
  108,800,474
  108,800,477
  108,800,845
  108,801,697
  108,802,587
  108,803,998
  108,804,802
  108,805,799
  108,806,408
  108,807,181
  108,808,161
  108,808,858
  108,808,988
  108,808,991
  108,809,447
  108,809,697
  108,810,172
  108,811,565
  108,811,779
  108,811,856
  108,812,683
  108,812,911
  108,813,863
  108,814,710
  108,815,028
  108,815,215
  108,816,894
  108,817,368
  108,817,393
  108,821,012
  108,821,026
  108,821,049
  108,821,110
  108,821,174
  108,821,209
  108,821,297
  108,821,368
  108,821,405
  108,821,432
  108,821,465
  108,821,474
  108,821,482
  108,821,511
  108,821,515
  108,822,379
  108,825,798
  108,825,800
  108,825,802
  108,825,806
  108,825,808
  108,825,810
  108,827,474
  108,830,407
  108,830,743
  108,831,603
  108,831,817
  108,835,026
  108,835,565
  108,836,401
  108,837,493
  108,837,603
  108,838,090
  108,838,137
  108,839,043
  108,842,508
  108,844,038
  108,844,419
  108,844,767
  108,845,507
  108,846,238
  108,847,687
  108,847,833
  108,849,514
  108,850,325
  108,852,743
  108,852,919
  108,852,923
  108,853,345
  108,858,034
  108,858,433
  108,858,443
  108,858,551
  108,858,557
  108,859,166
  108,859,935
  108,861,082
  108,864,889
  108,865,753
  108,866,751
  108,866,963
  108,868,292
  108,868,295
  108,870,743
  108,873,011
  108,873,799
  108,873,807
  108,873,818
  108,873,830
  108,873,834
  108,873,860
  108,873,934
  108,873,943
  108,873,964
  108,873,990
  108,874,000
  108,874,039
  108,874,064
  108,874,109
  108,874,184
  108,877,653
  108,879,773
  108,882,701
  108,886,233
  108,887,403
  108,887,465
  108,888,605
  108,890,489
  108,893,261
  108,893,710
  108,894,597
  108,895,211
  108,895,877
  108,895,882
  108,895,887
  108,897,928
  108,902,796
  108,904,727
  108,905,380
  108,907,681
  108,908,472
  108,908,951
  108,909,758
  108,912,642
  108,916,553
  108,917,131
  108,917,746
  108,918,024
  108,919,551
  108,920,489
  108,921,260
  108,921,915
  108,923,285
  108,923,625
  108,924,083
  108,924,958
  108,926,544
  108,927,897
  108,928,678
  108,928,812
  108,929,869
  108,930,662
  108,931,629
  108,934,522
  108,935,051
  108,936,015
  108,939,536
  108,939,538
  108,939,739
  108,942,272
  108,942,379
  108,943,709
  108,947,449
  108,948,664
  108,948,667
  108,948,687
  108,948,693
  108,948,701
  108,948,707
  108,948,719
  108,948,724
  108,948,733
  108,948,738
  108,948,747
  108,948,766
  108,948,816
  108,948,824
  108,948,845
  108,948,846
  108,948,873
  108,948,880
  108,948,964
  108,948,968
  108,949,027
  108,952,407
  108,953,626
  108,955,431
  108,956,280
  108,956,357
  108,957,806
  108,959,731
  108,960,404
  108,960,405
  108,961,086
  108,962,850
  108,965,108
  108,966,004
  108,967,080
  108,970,660
  108,972,286
  108,974,039
  108,974,783
  108,974,824
  108,975,592
  108,979,070
  108,980,074
  108,980,727
  108,980,830
  108,980,978
  108,981,397
  108,981,695
  108,981,777
  108,982,409
  108,983,297
  108,984,696
  108,985,302
  108,985,751
  108,985,806
  108,987,172
  108,987,640
  108,987,726
  108,987,908
  108,989,327
  108,990,261
  108,990,609
  108,990,757
  108,991,024
  108,991,030
  108,991,081
  108,991,105
  108,991,131
  108,991,421
  108,993,725
  108,993,992
  108,994,668
  108,995,296
  108,996,004
  108,996,258
  108,996,799
  108,997,169
  108,997,170
  108,998,137
  108,998,815
  108,999,564
  108,999,759
  109,000,032
  109,001,343
  109,001,589
  109,001,900
  109,002,287
  109,002,691
  109,002,737
  109,002,891
  109,005,032
  109,005,173
  109,006,174
  109,006,259
  109,006,262
  109,006,404
  109,006,947
  109,008,571
  109,009,296
  109,009,531
  109,009,770
  109,009,915
  109,010,132
  109,010,151
  109,010,159
  109,010,181
  109,010,202
  109,010,205
  109,010,215
  109,010,217
  109,010,218
  109,010,225
  109,010,447
  109,010,454
  109,010,464
  109,010,493
  109,010,554
  109,010,592
  109,010,603
  109,010,608
  109,010,611
  109,010,613
  109,010,621
  109,010,634
  109,010,638
  109,010,640
  109,010,656
  109,010,705
  109,010,711
  109,010,735
  109,011,074
  109,011,077
  109,011,122
  109,011,163
  109,011,182
  109,011,189
  109,011,251
  109,011,269
  109,011,306
  109,011,350
  109,011,454
  109,012,100
  109,012,473
  109,012,729
  109,013,477
  109,013,497
  109,013,525
  109,014,480
  109,014,512
  109,015,243
  109,015,489
  109,015,657
  109,015,753
  109,015,816
  109,016,478
  109,016,556
  109,017,094
  109,017,518
  109,018,399
  109,018,654
  109,019,475
  109,019,513
  109,020,461
  109,020,477
  109,020,577
  109,021,598
  109,021,951
  109,021,960
  109,022,406
  109,022,699
  109,023,995
  109,024,161
  109,024,209
  109,024,349
  109,024,466
  109,024,741
  109,025,144
  109,025,647
  109,025,834
  109,026,852
  109,027,237
  109,027,314
  109,027,359
  109,027,692
  109,028,739
  109,029,156
  109,029,525
  109,029,530
  109,035,374
  109,042,255
  109,042,294
  109,047,503
  109,047,533
  109,047,537
  109,047,545
  109,047,558
  109,047,565
  109,047,569
  109,047,581
  109,047,604
  109,047,607
  109,047,620
  109,047,629
  109,047,636
  109,047,639
  109,047,675
C
C
G
G
-
G
T
T
C
T
C
C
C
-
-
G
-
-
G
A
C/-
A
T
T
G
C
A
-
G
T
T
T
A
3
A
T
T
A
G
-
-
G
C
T
T
G
A
G
A
-
31
G
G
T
A
T
-
T
C
C
G
A
C
C
C
G
G
C
A
T
C
T
T
T
G
C
T
G
C
G
3
6
-
38
C
G
T
T
G
A
A
T
A
T
T
C
C
G
T
2
C
C
-
G
A
G
-
-
G
-
T
T
-
T
-
T
T
A
A
-
C
C
A
-
A
A
A
A
A
A
A
-
12
A
A
A
-
-
A
G
T
A
G
A
-
-
T
G
A
A
T
C
G
C
A
-
-
A
A
A
C
A
C
C
-
C
C
G
-
C
C
A
-
A
G
-
C
2
C
C
4
C
T
C
2
-
C
-
A
-
C
A
C
A
G
T
A
-
A
-
G
2/-
G/C
2/-
C
T
T
C
T
C
A
A
T
A
G
A
C
A
G
T
C
-
T
A
-
G
C
C
T
T
C
A
C/T
C
G
T/T
T
19
C
T
A
C
-
C
-
-
-
-
-
C
-
-
-
T
T
C
G
C
G
-
T
-
A
T
C
-
T
A
A
G
G
A
G
G
A
T
C
T
G
T
C
T
C
-
2
A
C
T
A
T
A
A
-
A
G
G
C
G
C
T
C
T
A
C
T
T
T
A
G
G
G
G
G
C
A
G
T
G
-
C
-
G
T
T
C
G
T
G
T
C
C
-
C
A
A
11
C
C
G
C
34/-
G
A
C
G
G
-
T
G
T
A
C
A
-
C
A
C
G
-
-
G
-
C
C
G
T
A
-
-
-
-
-
-
-
C
T
G
2
-
C
-
G
-
10
T
C
T
T
-
G
T
A
A
-
T
5
T
C
G
G
T
C
G
T
G
G
8
T
G
C
C
C
T
A
T
-
G
C
A
C
2
A
G
G
-/36
G
T
A
T
T
A
A
G
-
-
-
-
-
-
T
G
A
-
-
A
-
A
-