Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 308,072 (bp)   Positions: 528
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.004
.072
.004
.013
.047
.001
.0
.004
.005
.001
.195
.168
.146
.022
--
.007
.0
.0
.0
.006
.002
--
.21
.405
.033
.004
.983
.995
.006
.896
.0
.016
.002
.001
.116
.041
.023
.174
.008
.512
.014
.082
.109
--
.49
.016
.001
.264
.978
.001
.0
.0
.299
.0
.002
.706
.122
.229
.014
.004
.002
.214
.0
.029
.035
.002
.239
.004
.073
.057
.0
.0
.001
.001
.831
.001
.003
.002
.022
.064
.001
.0
.721
.709
.687
.021
.783
.036
.031
.02
.048
.001
.0
.513
.0
.049
.011
.014
.013
.01
.001
.002
.041
.002
.45
.003
.005
.002
.018
.005
.029
.033
.027
.014
.003
.144
.062
.045
.005
.027
.004
.14
.044
.004
.04
.008
.003
.021
.018
.047
.081
.63
.126
.507
.068
.001
.0
.004
.012
.0
.003
.381
.004
.011
.108
.98
.98
.421
.007
.0
.002
.001
.002
.071
.002
.0
.091
.091
.001
.305
.052
.068
.001
.0
.036
.001
.043
.008
.0
.057
.001
.0
.053
.056
.0
.014
.024
.041
.001
.001
.017
.001
.034
.051
.0
.015
.0
.0
.006
.011
.016
.004
.0
.002
.001
.0
.153
.41
.081
.053
.048
.007
.006
.0
.059
.001
.003
.001
.002
.002
.001
.125
.001
.002
.001
--
.002
.003
.005
.006
.411
.658
.085
.604
.007
.01
.001
.019
.001
.003
.149
.001
.004
.018
.006
.042
.005
.019
.008
.001
.003
.0
.001
.006
.003
.003
.002
.0
.001
.108
.981
.001
.003
.001
--
.205
.0
.006
.002
.034
.001
.0
.001
.001
.007
.007
.001
.0
.0
.001
.008
.0
.216
.001
.0
.012
.011
.095
--
--
.076
.159
.118
.05
.002
.103
.0
.006
.006
.02
.024
.002
.001
.014
.003
.007
.006
.004
.001
.0
.001
.012
.001
.018
.0
.001
.012
.023
.001
.073
.02
.001
.029
.038
.03
.002
.0
.0
.013
.042
.007
.028
.001
.003
.002
.0
.561
.017
.42
.0
.04
.001
.002
.003
.033
.0
.1
.024
.0
.0
.0
.0
.0
.942
.004
.009
.009
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.007
.009
.001
.001
.0
.037
.003
--
.0
.001
.0
.003
.005
.006
.006
.009
.005
.001
.01
.001
.071
.001
.0
.742
.005
.06
.089
--
--
--
--
.008
.003
.0
.0
.006
.001
.006
.006
.992
--
.005
--
.0
.003
.0
.001
.0
.001
.0
.002
.0
.006
.077
--
.105
.004
.009
.001
.039
.428
.0
.003
.042
.102
--
.0
.005
.0
.033
.035
.017
.005
.007
.057
.007
.013
.033
.029
.034
.033
.037
.072
.075
.07
.079
.234
.002
.001
.247
.034
.023
.118
.117
.006
.009
.024
.096
.018
.321
.032
--
.001
.0
.0
.0
.013
.005
.004
.793
.0
.006
.001
.032
.0
.001
.002
--
--
--
--
--
--
.0
.0
.002
.0
.0
.027
.0
.001
.011
.006
.277
.278
.282
.268
.207
.071
.027
.001
.037
.063
.071
.036
.011
.005
.017
.0
.006
.136
.007
.048
.064
.01
.004
.0
.002
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
Rptor
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
T
C
-
-
C
A
C
T
T
T
C
T
6
G
C
A
C
G
T
C
-
T
A
A
T
T
G
16
A
C
G
A
G
T
G
A
C
T
3
3
T
A
G
T
A
5
A
G
-
-
A
C
C
A
-
A
C
C
G
T
A
T
C
G
G
G
T
T
A
T
T
A
T
G
G
T
G
C
A
C
-
C
G
G
T
A
G
-
-
-
-
T
T
A
A
-
C
T
C
A
G
-
G
T
C
A
G
T
G
-
-
-
T
2
-
4
-
-
A
C
G
-
-
-
A
-
-
G
C
20
2
40
-
C
G
G
G
T
-
C
C
G
C
-
2
T
C
48
G
C
-
G
18
C
G
T
C
G
A
C
A
C
3
3
G
T
-
4
C
C
C
-
A
T
C
-
G
T
G
G
-
C
T
A
-
4
T
T
C
C
C
4
T
4
G
A
T
20
C
A
G
A
3
T
C
T
T
-
G
A
C
T
T
C
-
-
T
C
-
-
T
-
C
-
-
T
G
T
G
11
T
A
G
G
C
T
C
T
G
A
G
G
A
T
C
28
C
C
12
A
A
A
A
C
G
G
T
T
G
A
2
A
C
C
T
C
C
G
T
T
7
A
C
G
G
G
T
T
-
C
G
G
C
T
G
C
G
G
T
C
3
C
16
4
G
G
C
A
C
G
A
G
C
T
T
T
G
10
24
C
T
G
C
7
G
C
C
A
G
G
G
A
T
A
G
T
-
G
G
A
A
T
G
T
8
T
12
A
G
T
G
A
C
-
C
T
2
G
T
-
T
C
T
2
G
G
5
A
T
G
A
C
T
T
-
-
C
T
-
A
-
C
-
A
G
A
G
-
T
T
T
G
T
G
T
T
-
G
A
A
T
A
G
A
A
A
2
G
C
T
C
C
T
C
T
-
A
G
-
A
A
A
G
8
A
C
T
A
G
A
T
T
G
C
G
A
A
T
A
A
C
A
C
A
-
-
G
-
G
G
T
-
A
G
2
-
C
A
-
T
T
T
-
-
G
A
T
2
C
A
C
G
-
-
-
-
C
-
C
G
G
A
T
G
T
A
G
A
T
A
A
G
C
5
A
A
A
2
A
-
-
6
-
G
G
C
G
6
G
A
T
G
C
2
A
A
T
G
G
G
A
G
C
G
G
C
C
G
C
T
G
T
G
C
A
C
A
A
  108,751,715
  108,751,727
  108,752,045
  108,752,072
  108,752,351
  108,752,684
  108,752,781
  108,753,095
  108,753,096
  108,753,128
  108,753,527
  108,754,934
  108,754,951
  108,755,239
  108,755,387
  108,755,719
  108,755,747
  108,755,836
  108,756,199
  108,756,335
  108,756,862
  108,758,371
  108,761,415
  108,761,801
  108,762,249
  108,762,484
  108,763,552
  108,763,565
  108,763,696
  108,763,772
  108,765,833
  108,765,880
  108,766,469
  108,766,540
  108,767,272
  108,767,406
  108,768,698
  108,768,993
  108,770,681
  108,772,079
  108,772,680
  108,772,762
  108,772,764
  108,774,051
  108,775,977
  108,779,099
  108,779,251
  108,779,348
  108,779,419
  108,779,964
  108,780,482
  108,780,805
  108,781,180
  108,781,230
  108,782,035
  108,782,335
  108,782,435
  108,783,289
  108,784,042
  108,784,186
  108,784,415
  108,786,728
  108,787,993
  108,788,327
  108,789,295
  108,790,208
  108,791,032
  108,791,039
  108,792,285
  108,792,565
  108,792,605
  108,793,392
  108,793,689
  108,793,766
  108,794,013
  108,794,264
  108,794,312
  108,795,846
  108,796,313
  108,796,515
  108,796,938
  108,796,988
  108,798,380
  108,798,382
  108,798,409
  108,799,206
  108,800,348
  108,800,474
  108,800,477
  108,801,697
  108,802,587
  108,803,990
  108,803,998
  108,806,146
  108,806,408
  108,808,991
  108,809,447
  108,809,697
  108,810,052
  108,810,172
  108,810,869
  108,811,856
  108,811,985
  108,812,683
  108,815,215
  108,817,303
  108,817,304
  108,817,311
  108,817,368
  108,817,393
  108,817,506
  108,817,512
  108,817,535
  108,817,541
  108,817,556
  108,821,012
  108,821,026
  108,821,049
  108,821,110
  108,821,209
  108,821,297
  108,821,368
  108,821,405
  108,821,432
  108,821,465
  108,821,474
  108,821,482
  108,822,379
  108,822,414
  108,826,922
  108,827,452
  108,828,248
  108,830,407
  108,831,603
  108,835,026
  108,836,227
  108,836,401
  108,837,331
  108,839,017
  108,840,188
  108,840,606
  108,840,927
  108,841,991
  108,842,383
  108,842,508
  108,843,893
  108,843,895
  108,843,938
  108,844,666
  108,844,767
  108,845,934
  108,846,238
  108,846,573
  108,847,004
  108,847,685
  108,847,833
  108,849,080
  108,849,295
  108,849,514
  108,851,135
  108,851,459
  108,852,065
  108,852,919
  108,852,923
  108,854,109
  108,854,773
  108,855,029
  108,855,898
  108,856,571
  108,856,777
  108,857,103
  108,858,034
  108,858,348
  108,858,443
  108,858,483
  108,858,540
  108,858,551
  108,858,557
  108,858,590
  108,858,607
  108,858,633
  108,858,652
  108,859,166
  108,859,284
  108,859,921
  108,859,935
  108,860,291
  108,860,502
  108,860,613
  108,860,767
  108,860,956
  108,860,967
  108,861,082
  108,861,562
  108,861,758
  108,862,768
  108,864,889
  108,865,171
  108,865,493
  108,865,753
  108,865,824
  108,866,592
  108,866,751
  108,866,963
  108,867,266
  108,867,441
  108,868,292
  108,868,295
  108,869,144
  108,870,446
  108,870,473
  108,870,743
  108,872,274
  108,872,760
  108,873,011
  108,873,934
  108,873,943
  108,873,982
  108,873,990
  108,874,000
  108,874,039
  108,874,064
  108,874,109
  108,874,184
  108,874,426
  108,874,914
  108,875,291
  108,875,611
  108,876,727
  108,877,157
  108,877,653
  108,880,143
  108,880,928
  108,883,448
  108,883,485
  108,886,233
  108,886,548
  108,887,145
  108,887,403
  108,887,465
  108,888,605
  108,888,784
  108,889,511
  108,891,436
  108,892,180
  108,894,376
  108,894,416
  108,894,646
  108,894,767
  108,894,780
  108,895,211
  108,895,355
  108,895,436
  108,896,455
  108,898,026
  108,898,406
  108,898,881
  108,899,309
  108,899,638
  108,900,334
  108,900,843
  108,904,117
  108,904,539
  108,904,806
  108,905,380
  108,906,744
  108,907,820
  108,908,432
  108,908,472
  108,909,307
  108,909,342
  108,909,366
  108,909,589
  108,910,308
  108,910,338
  108,911,036
  108,911,091
  108,912,112
  108,912,169
  108,912,216
  108,912,531
  108,912,628
  108,912,642
  108,912,999
  108,913,564
  108,914,197
  108,914,222
  108,914,278
  108,914,967
  108,916,149
  108,916,944
  108,917,258
  108,918,185
  108,918,227
  108,918,433
  108,918,438
  108,918,502
  108,919,355
  108,919,467
  108,919,551
  108,920,489
  108,921,095
  108,921,252
  108,921,346
  108,921,831
  108,921,915
  108,922,405
  108,922,938
  108,922,949
  108,922,978
  108,923,405
  108,924,083
  108,924,683
  108,924,830
  108,924,872
  108,924,923
  108,925,831
  108,926,544
  108,926,734
  108,927,499
  108,927,633
  108,927,897
  108,928,678
  108,928,812
  108,929,168
  108,929,587
  108,929,869
  108,930,270
  108,930,658
  108,932,579
  108,933,700
  108,934,910
  108,935,016
  108,935,051
  108,935,304
  108,936,015
  108,937,131
  108,937,497
  108,938,626
  108,939,305
  108,939,536
  108,939,538
  108,939,592
  108,939,739
  108,941,582
  108,942,272
  108,943,637
  108,943,709
  108,945,756
  108,946,232
  108,946,972
  108,947,096
  108,947,449
  108,948,664
  108,948,667
  108,948,687
  108,948,693
  108,948,701
  108,948,707
  108,948,719
  108,948,724
  108,948,733
  108,948,738
  108,948,747
  108,948,816
  108,948,824
  108,948,845
  108,948,846
  108,948,873
  108,948,880
  108,948,964
  108,948,968
  108,949,027
  108,950,228
  108,950,238
  108,952,813
  108,953,626
  108,953,943
  108,955,792
  108,955,887
  108,956,339
  108,957,380
  108,957,381
  108,959,678
  108,960,404
  108,960,405
  108,960,608
  108,960,916
  108,961,086
  108,961,924
  108,964,491
  108,964,728
  108,965,996
  108,966,594
  108,968,911
  108,972,286
  108,972,295
  108,972,754
  108,973,301
  108,973,326
  108,973,680
  108,974,039
  108,974,783
  108,975,199
  108,975,592
  108,975,748
  108,978,096
  108,979,229
  108,980,074
  108,980,830
  108,981,704
  108,981,762
  108,981,871
  108,983,746
  108,983,959
  108,984,394
  108,984,811
  108,985,302
  108,985,989
  108,987,640
  108,987,890
  108,987,908
  108,988,486
  108,988,858
  108,991,024
  108,991,421
  108,996,004
  108,998,137
  108,998,815
  109,000,019
  109,000,325
  109,001,900
  109,002,236
  109,002,287
  109,004,298
  109,004,922
  109,007,198
  109,010,151
  109,010,159
  109,010,181
  109,010,202
  109,010,205
  109,010,217
  109,010,218
  109,010,225
  109,010,493
  109,010,554
  109,010,592
  109,010,603
  109,010,608
  109,010,611
  109,010,613
  109,010,621
  109,010,634
  109,010,638
  109,010,640
  109,010,656
  109,010,705
  109,010,711
  109,010,735
  109,011,074
  109,011,077
  109,011,122
  109,011,163
  109,011,182
  109,011,189
  109,011,251
  109,011,269
  109,011,306
  109,011,454
  109,013,907
  109,014,480
  109,017,094
  109,017,967
  109,018,654
  109,019,475
  109,019,771
  109,021,951
  109,021,960
  109,022,699
  109,022,876
  109,022,896
  109,024,209
  109,025,079
  109,027,237
  109,027,314
  109,027,692
  109,031,168
  109,031,310
  109,031,391
  109,031,501
  109,031,599
  109,031,630
  109,032,704
  109,034,213
  109,034,500
  109,034,721
  109,034,747
  109,039,369
  109,042,294
  109,042,412
  109,045,624
  109,046,170
  109,047,503
  109,047,533
  109,047,537
  109,047,545
  109,047,558
  109,047,565
  109,047,569
  109,047,581
  109,047,604
  109,047,607
  109,047,620
  109,047,629
  109,047,636
  109,047,639
  109,047,675
  109,047,961
  109,048,682
  109,049,569
  109,050,294
  109,050,756
  109,052,911
  109,053,259
  109,055,678
  109,057,466
  109,058,020
C
-
G
3
T
T
T
C
C
C
T
G
-
A
-
G
T
A
A
T
110
C
T
G
A
C
A
-
G
G
A
T
A
C
A
G
T
-
-
-
G
A/T
G/T
C
G
-
T
T
31
2
G
T
T
G
T
G
T
T
C
C
G
C
T
A
A
A
-
A
G
C
A
G
C
A
T
C
A
T
G
T
3
A
A
G/A
C
G
A
3
6
38
C
G
G
C
G
T
T
C
T
C
A
2
A
C
G
G
C
-
-
G
G
G
-
-
T
-
T
T
-
-
T
T
A
A
-
C
C
A
T
-
-
-
12
A
-
A
A
C
4
T
T
A
T
8
-
C
A
-
A
G
5
A
-
T
A
C
T
A
G
T
G
T
-
-
A
C
3
-
T
T
T
A
G
C
T
A
A
C
A
A
4
G
C
G
T
-
-
C
T
T
T
-
C
-
A
G
C
-
T
G
A
-
-
C
T
A
C
A
T
G
T
-
G
T
A
4
C
T
C
2
-
C
-
A
3
C
A
C
A
-
-
T
A
A
T
C
-
C
A
G
T
A
C
C
G
-
G
A
-
G
G
G
G
T
A
-
G
A
C
T
-
-
T
T
C
A
T
A
C
C
-
G
A
A
A
A
C
T/-
T
T
T
A
T
C
C
T
C
A
C
T
-
T
-
-
T
T
A
-
T
A
G
A
G
C
C
C
A
-
-
G
C
A
T
-
-
T
T
G
T
A
T
C
C
T
A
C
T
A
A
G
T
C
A
C
-
G
-
T
A
C
T/T
T
T
19
T
C
-
A
C
-/23
A
T
C
-
C
-
-
-
-
-
C
-
-
-
T
C
G
C
G
-
T
-
A
G
A
C
C
4
C
C
A
C
C
A
G
A
4
A
G
G
C
G
A
G
G
G
-
C
T
C
G
T
C
T
C
5
-
A
2
C
T
G
C
-
A/G
T
G
G
A
C
C
C
T
G
T
G
G
-
G
G
T
G
T
T
2
2
A
G
-
T
G
T
C
A
-
G
-
-
G
-
C
C
G
T
A
-
-
-
-
-
-
-
C
T
G
2
-
C
-
-
A
G
G
A
C
G
A
G
C
C
G
A
T
-
G
G
G
-
T
2
2
-
4
T
A
T
C
-
A
G
C
A
T
-
-
-
-
-
-
T
G
A
-
-
A
-
A
-
A
C
A
C
A
T
T
T
G
T