Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 250,449 (bp)   Positions: 432
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
--
.0
.0
.0
.052
.006
.002
.001
.001
.001
.0
.001
.034
.009
.026
.025
.139
.115
.061
.008
.042
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.277
.224
.498
.52
.246
.013
.002
.01
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.039
.375
.023
.125
.005
.002
.001
.092
.069
.006
.002
.004
.004
.002
.003
.148
.014
.101
.055
.046
.028
.001
.23
.001
.22
.725
.666
.044
.001
.948
.0
.001
.0
.0
.005
.014
.853
.977
.99
.0
.001
.0
.001
.001
.009
.003
.002
.005
.0
.01
.001
.001
.011
.001
.0
.016
.008
.007
.001
.279
.132
.001
.002
.01
.0
.0
.085
.002
.0
.001
.0
.003
.0
.0
.005
.0
.0
.0
.001
.002
.004
.0
.0
.041
.001
.038
.005
.027
.006
.045
.039
.046
.045
.04
.05
.001
.017
.005
.0
.0
.005
.011
.004
.0
.0
.221
.927
.917
.131
.006
.008
.0
.035
.001
.002
.0
.0
.009
.006
.001
.0
.001
.001
.001
.008
.001
.0
.001
.0
.0
.004
.0
.0
.0
.002
.0
.0
.001
.001
.001
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.001
.001
.001
.015
.004
.004
.026
.121
.04
.0
.001
.002
.002
.994
.986
.048
.059
.968
1.0
.831
.004
.002
.001
.001
.0
.947
.001
.0
.13
.072
.732
.972
.984
.0
.001
.719
.0
.0
.001
.004
.0
.0
.0
.0
.003
.0
.0
.0
.0
.007
.001
--
--
--
--
--
--
.009
.067
.409
.352
.081
.034
.051
.113
.04
.004
.007
.012
.014
.059
.069
.095
.101
.002
.126
.081
.05
.029
.034
.023
.015
.008
.005
.005
.005
.01
.004
.143
.288
.343
.313
.519
.206
.009
.006
.005
.026
.018
.001
.006
.762
.0
.001
.001
.009
.0
.639
.759
.179
.046
.063
.993
.941
.057
.0
.001
.015
.0
.001
.187
.004
.288
.992
1.0
.998
.001
.001
.004
.003
.018
.0
.0
.001
.034
.008
.006
.172
.106
.043
.023
.278
.234
.028
.113
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Angel2
Angel2
Angel2
Angel2
Angel2
Angel2
Angel2
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Rps6kc1
Rps6kc1
Rps6kc1
Rps6kc1
Rps6kc1
Rps6kc1
Rps6kc1
Rps6kc1
Rps6kc1
Rps6kc1
Rps6kc1
Rps6kc1
Rps6kc1
Rps6kc1
Rps6kc1
Rps6kc1
Rps6kc1
Rps6kc1
Rps6kc1
Rps6kc1
Rps6kc1
Rps6kc1
Rps6kc1
Rps6kc1
Rps6kc1
Rps6kc1
Rps6kc1
Rps6kc1
Rps6kc1
Rps6kc1
Rps6kc1
Rps6kc1
Rps6kc1
Rps6kc1
Rps6kc1
Rps6kc1
Rps6kc1
Rps6kc1
Rps6kc1
Rps6kc1
Rps6kc1
Rps6kc1
Rps6kc1
Rps6kc1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
A
T
T
C
T
T
C
T
G
C
A
-
-
A
-
-
-
-
-
T
-
-
T
T
T
G
G
T
G
A
T
G
C
A
A
A
G
T
A
T
G
A
G
G
T
A
T
A
C
C
G
C
G
C
G
C
G
G
G
19
T
A
G
A
C
-
108
-
G
A
C
-
G
C
G
C
3
C
T
A
T
G
4
7
G
12
T
2
A
G
G
G
T
C
G
A
G
A
G
-
G
A
C
G
T
T
C
2
C
G
C
T
A
C
G
G
A
C
C
T
A
G
G
A
-
G
C
T
C
C
G
A
C
T
G
2
A
A
T
T
G
2
C
C
C
-
-
3
-
-
G
G
-
C
G
T
A
A
T
C
T
-
-
T
A
A
G
-
T
2
T
C
-
T
G
-
T
G
C
T
T
-
2
-
G
C
A
2
-
-
-
-
-
-
T
-
A
-
G
-
G
T
-
-
-
G
-
-
A
G
G
A
T
-
G
T
G
T
G
G
-
-
-
T
-
-
G
6
-
-
T
-
G
-
-
T
-
G
-
G
-
A
C
G
-
-
2
-
-
-
-
-
2
-
C
-
-
-
-
-
T
A
C
G
G
A
A
C
T
C
T
C
C
A
-
C
G
-
T
G
G
A
C
T
G
G
-
T
3
-
-
-
C
T
T
C
T
T
T
G
A
G
C
C
G
C
-
C
G
-
A
-
A
-
T
-
C
G
G
G
-
-
-
-
G
T
A
A
-
G
A
T
T
C
G
T
C
-
-
G
T
-
C
-
T
C
-
T
T
G
-
-
T
-
-
T
-
C
-
-
-
C
C
G
G
G
T
-
-
T
T
2
C
C
T
C
2
A
2
-
G
T
-
-
T
2
T
A
C
A
T
A
-
G
G
G
2
-
-
A
-
2
-
T
G
C
C
G
-
-
G
2
T
C
C
C
T
T
C
-
-
-
T
T
G
3
2
-
A
A
C
-
  109,353,697
  109,354,938
  109,354,949
  109,354,950
  109,354,970
  109,368,284
  109,368,292
  109,368,301
  109,368,302
  109,368,307
  109,368,311
  109,368,313
  109,368,332
  109,368,350
  109,368,356
  109,368,373
  109,368,386
  109,368,390
  109,368,399
  109,368,407
  109,368,441
  109,385,355
  109,390,236
  109,391,608
  109,392,945
  109,393,075
  109,393,079
  109,393,112
  109,393,155
  109,393,217
  109,393,232
  109,393,588
  109,393,598
  109,393,738
  109,393,746
  109,393,792
  109,393,794
  109,393,841
  109,394,045
  109,394,048
  109,394,063
  109,394,082
  109,394,106
  109,394,243
  109,394,272
  109,394,694
  109,394,720
  109,394,898
  109,395,158
  109,395,165
  109,395,202
  109,395,225
  109,395,240
  109,395,243
  109,395,279
  109,395,297
  109,395,347
  109,395,502
  109,395,655
  109,395,661
  109,395,692
  109,395,704
  109,395,776
  109,395,792
  109,395,800
  109,396,378
  109,405,098
  109,405,297
  109,405,312
  109,418,950
  109,418,963
  109,418,974
  109,419,073
  109,419,091
  109,419,098
  109,419,110
  109,419,117
  109,419,126
  109,419,132
  109,419,135
  109,419,160
  109,420,155
  109,420,168
  109,420,181
  109,420,215
  109,420,238
  109,423,087
  109,423,107
  109,426,271
  109,428,300
  109,428,324
  109,428,365
  109,428,426
  109,428,435
  109,428,496
  109,428,659
  109,428,673
  109,428,711
  109,428,730
  109,428,739
  109,428,766
  109,428,778
  109,428,800
  109,428,808
  109,428,839
  109,428,993
  109,429,001
  109,429,026
  109,429,032
  109,429,131
  109,429,218
  109,429,245
  109,429,285
  109,429,318
  109,429,334
  109,429,484
  109,429,486
  109,429,493
  109,429,505
  109,429,529
  109,429,530
  109,429,533
  109,429,594
  109,429,692
  109,429,788
  109,429,843
  109,429,865
  109,429,945
  109,429,954
  109,429,985
  109,430,041
  109,430,079
  109,430,084
  109,430,088
  109,430,308
  109,430,313
  109,430,417
  109,430,433
  109,430,459
  109,430,464
  109,430,581
  109,430,637
  109,450,773
  109,450,774
  109,450,775
  109,454,562
  109,454,571
  109,472,996
  109,473,002
  109,473,006
  109,473,098
  109,473,105
  109,473,125
  109,473,260
  109,473,413
  109,473,422
  109,473,462
  109,473,466
  109,473,470
  109,473,486
  109,478,506
  109,504,140
  109,504,142
  109,504,160
  109,504,161
  109,504,170
  109,504,174
  109,504,180
  109,504,192
  109,504,195
  109,504,208
  109,504,209
  109,504,215
  109,504,239
  109,504,267
  109,504,274
  109,504,277
  109,506,773
  109,508,830
  109,508,838
  109,508,855
  109,508,867
  109,508,892
  109,508,901
  109,508,912
  109,508,913
  109,508,920
  109,508,928
  109,508,942
  109,508,974
  109,509,023
  109,509,027
  109,509,030
  109,509,050
  109,509,063
  109,509,075
  109,509,088
  109,509,103
  109,509,118
  109,509,136
  109,509,154
  109,509,185
  109,509,194
  109,509,195
  109,509,215
  109,509,223
  109,509,227
  109,509,243
  109,509,281
  109,509,309
  109,509,331
  109,509,332
  109,509,349
  109,509,354
  109,509,401
  109,509,403
  109,509,437
  109,509,463
  109,509,479
  109,509,526
  109,509,530
  109,509,537
  109,509,572
  109,509,602
  109,509,633
  109,509,661
  109,509,680
  109,509,710
  109,509,735
  109,509,742
  109,509,744
  109,509,748
  109,509,755
  109,509,876
  109,509,882
  109,509,884
  109,509,888
  109,509,891
  109,516,340
  109,528,492
  109,528,540
  109,528,547
  109,528,548
  109,537,794
  109,540,832
  109,540,834
  109,540,840
  109,540,844
  109,540,847
  109,540,865
  109,540,895
  109,540,901
  109,540,907
  109,540,925
  109,540,929
  109,540,945
  109,541,064
  109,541,086
  109,541,093
  109,541,158
  109,541,239
  109,545,030
  109,545,036
  109,545,055
  109,545,059
  109,545,079
  109,545,082
  109,545,093
  109,545,102
  109,545,135
  109,545,138
  109,545,141
  109,545,228
  109,545,235
  109,545,238
  109,545,253
  109,545,255
  109,545,258
  109,545,265
  109,545,266
  109,545,272
  109,545,279
  109,545,286
  109,545,377
  109,545,378
  109,545,384
  109,545,387
  109,545,388
  109,546,716
  109,546,726
  109,549,912
  109,549,936
  109,549,961
  109,549,978
  109,549,983
  109,549,997
  109,549,998
  109,550,035
  109,550,055
  109,552,595
  109,552,597
  109,552,633
  109,552,639
  109,552,649
  109,552,661
  109,552,669
  109,552,675
  109,552,684
  109,552,689
  109,552,691
  109,552,707
  109,552,720
  109,552,726
  109,552,729
  109,552,733
  109,552,753
  109,552,763
  109,552,770
  109,552,773
  109,552,789
  109,552,794
  109,552,802
  109,552,818
  109,552,823
  109,552,838
  109,552,839
  109,552,875
  109,552,876
  109,552,883
  109,552,885
  109,552,893
  109,552,898
  109,552,905
  109,552,906
  109,552,913
  109,552,918
  109,552,921
  109,556,112
  109,556,113
  109,556,133
  109,556,141
  109,556,147
  109,556,187
  109,560,262
  109,560,272
  109,560,288
  109,560,296
  109,560,311
  109,560,329
  109,560,332
  109,560,360
  109,560,369
  109,560,375
  109,560,379
  109,560,387
  109,560,405
  109,560,418
  109,560,444
  109,560,455
  109,560,458
  109,560,475
  109,561,123
  109,561,132
  109,561,138
  109,561,147
  109,561,169
  109,561,205
  109,561,208
  109,561,213
  109,561,217
  109,561,254
  109,561,262
  109,561,284
  109,561,287
  109,561,296
  109,561,301
  109,561,324
  109,561,333
  109,561,369
  109,561,380
  109,561,395
  109,561,396
  109,561,463
  109,561,495
  109,577,940
  109,577,966
  109,577,971
  109,577,984
  109,577,998
  109,578,002
  109,578,012
  109,578,041
  109,578,059
  109,578,071
  109,578,097
  109,578,100
  109,578,118
  109,578,129
  109,578,135
  109,578,147
  109,578,156
  109,578,176
  109,578,179
  109,578,234
  109,578,248
  109,578,254
  109,578,301
  109,578,306
  109,578,315
  109,578,322
  109,578,331
  109,578,360
  109,578,396
  109,578,399
  109,578,429
  109,578,431
  109,578,440
  109,582,140
  109,582,142
  109,582,174
  109,582,395
  109,582,425
  109,582,439
  109,582,518
  109,582,522
  109,582,536
  109,582,548
  109,582,574
  109,582,600
  109,582,628
  109,582,629
  109,588,972
-
A
C
A
A
-
-
A
T
-
C
T
C
-
G
G
G
G
G
G
5
A
C
T/A
T/A
G/A
G/A
T/C
G/A
A/G
T/C
G/T
C/G
A/G
A/T
A/-
G/T
T/C
A/C
T/A
G/A
A/G
G/A
G/A
T/C
A/T
T/G
A/G
C/T
C/A
G/A
C/T
G/A
C/G
G/A
C/T
G/A
G/A
G/A
19/-
T/G
A/C
G/T
A/C
C/T
19
-
G
-
-
-
A
-
-
-
G
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
A
-
-
G/C
G/A
G/A
T/-
C/A
G/A
A/G
G/C
A/T
G/A
2
G/C
A/G
C/T
G/A
T/C
T/A
C/T
2/-
C/T
G/A
C/G
T/C
A/C
C/T
G/T
G/A
A/G
C/T
C/G
T/C
A/G
G/A
G/A
A/C
A
G/C
C/T
T/C
C/T
C/A
G/A
A/G
C/A
T/C
-
-
-
-
-
-
-
-
G
A
T
A
C
-
T
A
-
-
A
-
-
-
-
-
-
-
-
G
C
-
G
-
C
G
-
-
G
T
2
-
-
C
-
-
-
-
-
T
-
T
C
T
-
-
C
T
2
G
2
4
G
T
-
C
-
C
-
-
C
T
T
-
G
A
-
-
A
T
-
C
-
G
-
-
-
C
T
T
A
-
A
C
-
-
2
T
C
C
-
C
A
G
2
-
A
A
C
C
A
A
A
A
-
T
A
2
G
3
-
A
-
A
G
T
G
T
G
G
G
T
T
G
C
G
G
G
C
G
G
-
C
G
C
C/A
G
C
T
C
T
C
A
A
C
A
-
T
A
A
-
-
-
-
G
-
-
-
-
A
-
-
A
G
2
-
A
A
-
T
G
C
-
2
-
-
C
-
T
C
G
C
A
G
-
G
G
T
-
-
G
T
-
-
-
2
C
C
-
C
-
C
-
-
C
-
C
C
A
A
-
G
T
-
C
-
C
A
C
-
-
-
-
-
-
C
2
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
C
A
G
A
A
-
-
-
-
-
-
-
-
G
T
A
C
-
G
A
-
T
-
C
C
-
-
-
-
G
T
-
-
-
-
-
-
-
C
T
C
G
G
-
-
-
-
-
2
-
C
A
A