Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 79,511 (bp)   Positions: 313
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.022
.092
.005
.002
.0
.001
.0
.036
.0
.0
.001
.001
.267
.001
.011
.0
.0
.001
.0
.0
.0
.002
.005
.033
.578
.044
.002
.458
.0
.0
.027
.072
.001
.002
.003
.0
.003
.0
.0
.11
.0
.597
.023
.005
.0
.001
.111
.0
.0
.0
1.0
.0
.001
.011
.035
.084
.072
.017
.004
.001
.0
.0
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.712
.005
.008
.129
.011
.001
.039
.001
.136
.108
.326
.15
.0
.014
.592
.096
.358
.165
.009
.209
.225
.008
.174
.011
.0
.285
.001
.0
.02
.51
1.0
.016
.0
.0
--
.019
.0
.002
.082
.0
.001
.001
.0
.002
.021
.0
.005
.002
.001
.119
.0
.001
1.0
1.0
.004
.974
.0
.0
.0
.001
.002
.201
.011
.413
.368
.078
.0
.035
.007
.001
.007
.001
.012
.067
.006
.16
.019
.01
.14
.316
.001
.144
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.913
.001
.017
.001
.105
.166
.007
.016
.375
1.0
1.0
1.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.15
.657
.107
.046
.049
.016
.987
.996
.585
.992
1.0
.114
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.414
.015
.18
.111
.87
.822
.401
.048
.226
.524
.133
.034
.017
.293
.105
.007
.599
.148
.004
.402
.536
.201
--
--
--
--
--
--
--
--
.004
.001
.445
.181
.009
.023
.0
.072
.0
.002
.001
.0
.034
.009
.001
.493
.003
.0
.001
.025
.001
.019
.039
.0
.028
.007
.162
.019
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Rasa1
Rasa1
Rasa1
Rasa1
Rasa1
Rasa1
Rasa1
Rasa1
Rasa1
Rasa1
Rasa1
Rasa1
Rasa1
Rasa1
Rasa1
Rasa1
Rasa1
Rasa1
Rasa1
Rasa1
Rasa1
Rasa1
Rasa1
Rasa1
Rasa1
Rasa1
Rasa1
Rasa1
Rasa1
Rasa1
Rasa1
Rasa1
G
T
T
C
C
A
-
C
C
G
G
G
G
A
G
A
A
A
A
T
A
C
2
G
G
G
4
A
G
C
C
A
G
-
C
C
G
A
G
C
T
A
-
C
A
G
T
G
C
C
2
T
G
A
G
2
T
A
T
T
-
G
16
A
C
-
G
-
T
A
13
A
G
A
C
T
G
A
G
C
T
G
A
C
9
-
-
A
C
-
C
C
5
C
-
T
A
-
A
G
G
T
G
C
G
-
C
G
T
C
C
C
A
G
C
G
G
A
C
G
-
3
C
A
C
A
C
G
T
G
2
A
T
T
A
A
T
C
G
A
T
A
G
G
-
A
C
-
G
T
A
G
A
C
A
3
T
G
C
T
T
C
A
T
T
-
A
T
T
G
G
-
A
C
T
C
C
G
G
G
-
T
G
T
C
T
C
A
C
G
T
A
T
T
G
G
A
G
C
C
T
G
G
G
A
C
A
G
C
A
G
A
T
C
A
C
T
C
C
3
C
T
G
G
T
A
C
A
C
C
T
2
G
G
A
C
T
-
-
A
C
T
G
-
C
T
T
G
A
C
T
G
G
G
A
C
A
G
A
A
T
C
A
G
C
T
G
A
C
C
A
A
A
-
4
2
-
A
A
G
G
C
G
C
G
G
A
A
G
A
A
2
T
T
A
G
T
A
G
A
A
G
3
C
A
C
A
A
G
T
T
A
T
  13,617,131
  13,617,385
  13,617,941
  13,618,448
  13,618,472
  13,618,552
  13,618,729
  13,619,063
  13,619,282
  13,619,683
  13,619,684
  13,619,778
  13,619,881
  13,620,003
  13,620,113
  13,620,132
  13,620,344
  13,620,382
  13,620,502
  13,620,797
  13,620,868
  13,620,952
  13,621,399
  13,621,478
  13,621,673
  13,622,314
  13,622,458
  13,622,991
  13,623,133
  13,624,462
  13,624,488
  13,624,730
  13,625,039
  13,626,404
  13,626,985
  13,627,197
  13,627,227
  13,627,357
  13,627,665
  13,627,704
  13,627,808
  13,628,044
  13,628,902
  13,628,969
  13,629,363
  13,629,678
  13,630,749
  13,631,100
  13,631,136
  13,631,230
  13,631,509
  13,631,932
  13,633,322
  13,634,058
  13,634,347
  13,634,493
  13,634,496
  13,634,874
  13,635,184
  13,636,885
  13,636,902
  13,637,034
  13,637,359
  13,638,033
  13,638,090
  13,638,159
  13,638,170
  13,638,559
  13,639,037
  13,639,462
  13,639,544
  13,639,589
  13,639,617
  13,639,871
  13,639,927
  13,639,936
  13,639,988
  13,639,990
  13,640,059
  13,640,456
  13,640,462
  13,640,511
  13,640,888
  13,640,902
  13,640,905
  13,640,935
  13,641,844
  13,642,128
  13,642,412
  13,642,706
  13,642,989
  13,643,073
  13,643,274
  13,643,459
  13,643,691
  13,643,889
  13,643,954
  13,643,978
  13,644,706
  13,644,838
  13,645,294
  13,645,393
  13,645,675
  13,646,189
  13,646,387
  13,646,415
  13,646,417
  13,646,464
  13,646,642
  13,646,894
  13,647,122
  13,647,462
  13,647,656
  13,647,699
  13,647,709
  13,647,737
  13,647,864
  13,648,261
  13,648,269
  13,648,398
  13,648,606
  13,648,679
  13,649,031
  13,649,033
  13,649,056
  13,649,567
  13,649,872
  13,649,970
  13,650,863
  13,651,525
  13,651,978
  13,652,538
  13,652,726
  13,652,855
  13,653,172
  13,653,461
  13,653,928
  13,653,929
  13,654,348
  13,654,386
  13,654,844
  13,654,877
  13,654,980
  13,655,211
  13,655,655
  13,655,806
  13,655,865
  13,656,195
  13,656,427
  13,656,519
  13,657,195
  13,657,988
  13,658,369
  13,658,410
  13,658,769
  13,659,031
  13,659,042
  13,659,313
  13,659,394
  13,659,441
  13,659,519
  13,659,760
  13,660,286
  13,660,589
  13,660,732
  13,660,814
  13,661,105
  13,661,364
  13,661,628
  13,661,702
  13,662,077
  13,662,221
  13,662,601
  13,662,616
  13,662,633
  13,662,727
  13,662,733
  13,662,764
  13,662,778
  13,662,844
  13,662,860
  13,662,995
  13,663,503
  13,663,616
  13,663,993
  13,664,839
  13,664,967
  13,665,053
  13,665,392
  13,665,684
  13,665,809
  13,666,051
  13,666,215
  13,666,456
  13,666,459
  13,666,516
  13,666,822
  13,667,045
  13,667,241
  13,667,268
  13,667,301
  13,667,309
  13,667,339
  13,667,340
  13,667,355
  13,667,419
  13,667,450
  13,667,469
  13,667,491
  13,667,506
  13,667,540
  13,667,547
  13,667,606
  13,667,634
  13,667,669
  13,667,689
  13,667,728
  13,667,750
  13,667,780
  13,667,835
  13,670,774
  13,670,775
  13,670,801
  13,670,870
  13,674,058
  13,674,653
  13,675,070
  13,675,266
  13,675,723
  13,675,984
  13,676,411
  13,676,423
  13,676,690
  13,676,886
  13,676,897
  13,677,428
  13,678,341
  13,678,417
  13,678,421
  13,678,615
  13,678,802
  13,678,944
  13,679,088
  13,679,094
  13,679,101
  13,679,102
  13,679,114
  13,679,115
  13,679,124
  13,679,129
  13,679,132
  13,679,133
  13,679,139
  13,679,213
  13,679,640
  13,680,177
  13,680,311
  13,680,330
  13,680,723
  13,680,745
  13,680,870
  13,681,177
  13,681,436
  13,681,452
  13,681,565
  13,682,058
  13,682,312
  13,682,405
  13,682,555
  13,682,907
  13,683,075
  13,683,298
  13,683,324
  13,683,516
  13,683,930
  13,684,447
  13,684,782
  13,685,473
  13,685,668
  13,686,539
  13,686,842
  13,686,859
  13,687,435
  13,687,608
  13,689,090
  13,689,219
  13,689,495
  13,689,527
  13,689,675
  13,690,075
  13,691,015
  13,691,095
  13,691,479
  13,692,011
  13,692,548
  13,692,549
  13,692,703
  13,692,756
  13,692,844
  13,693,143
  13,693,754
  13,693,857
  13,693,863
  13,694,003
  13,694,102
  13,694,116
  13,694,220
  13,694,693
  13,695,246
  13,695,511
  13,695,983
  13,696,209
  13,696,444
A
-
C
T
G
T
T
T
T
A
A
T
A
G
A
G
G
T
T
A
G
T
-
A
T
A
-
G
C
G
A
G
A
5
A
G
A
G
A
T
C
G
T
T
G
A
C
A
T
T
-
A
A
-
A
2/-
T/C
G
A
C
92
A
-
C
T
A
A
3
C
G
13/-
G
A
G
G
C
C
T
A
T
C
A
C
T
-
G
A
G
T
G
A
T
-
A
10
-
G
A
T
A
A
C
A
G
C
G
T
A
C
T
T
T
G
A
T
A
A
-
A
T
G
3/-
T
G
T
-
T
C
C
A
-
T
G
A
G
T
C
A
A
G
C
G
A
C
4
T
A
3
A
C
G
A
T
T
G
-
C
T
T
C
G
T
G
G
C
3
G
C
G
A
C
4
-
T
A
T
T
A
T
C
T
C
A
A
A
A
T
G
T
A
G
G
C
C
C
A
T
C
G
A
C
A
C
A
C
A
T
C
T
G
A
C
G
T
C
G
G
G
T
-
T
A
A
A
A
G
T
G
G
T
C
-
C
T
-
T
G
T
A
G
T
C
-
C
A
A
C
A
G
T
C
A
A
A
G
T
C
C
G
G
C
T
G
T
A
A
A
G
T
T
-
C
G
6
-
-
-/C
C
-
C
A
T
A
T
A
A
G
C
A
G
G
-
C
C
G
C
C
C
A
-
G
A
-
T
G
A
G
G
A
C
C
G
G