Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 274,560 (bp)   Positions: 513
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.995
.017
1.0
.001
.017
.056
.645
.078
.549
.238
.067
.099
.001
.491
.038
.002
.004
.037
1.0
.477
.006
.024
.001
.007
.062
.088
.002
.232
.003
.001
.041
.524
--
--
.002
.001
.01
.031
.073
.005
.093
.046
.084
.001
.0
--
.052
.004
.012
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.003
.666
.0
--
.008
.033
.0
.011
.02
.011
.997
.012
.038
.113
.084
.067
.001
.005
.053
.01
.024
.003
.115
--
.822
.272
.051
.473
.323
.732
.057
.006
.001
.003
.622
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.016
.152
.071
.016
.339
.01
.007
.035
.025
.02
.006
.006
.016
.011
.012
--
--
--
--
.003
.008
.004
.082
.0
.083
.076
.093
.057
.141
.002
--
--
.195
.338
.003
.01
.018
.019
.005
.035
.041
.038
.013
.002
.012
.054
.009
.024
.103
.002
.002
1.0
.999
.984
.989
1.0
1.0
1.0
.998
1.0
.998
1.0
1.0
1.0
.997
.913
.998
1.0
.521
.001
.001
.002
.003
.001
.039
.06
.006
.178
.17
.567
.366
.002
.005
.159
.04
.043
.01
.049
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.088
.004
--
--
--
.21
.057
.327
.001
.104
.003
.016
.188
.0
.021
--
--
--
.058
.321
.209
.001
.001
.002
.001
.025
.099
.015
.013
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.0
.0
.011
.078
.0
.04
.0
.237
.004
.001
.0
.003
--
--
--
--
--
--
--
.052
.012
.03
.002
.339
.064
.406
.803
.457
.567
.0
.267
.146
.004
.098
.221
.001
.001
.001
.018
.152
.02
.008
--
.118
.0
.001
.501
.166
.01
.01
.082
.068
.007
.137
.83
.032
.845
.005
.008
.046
.719
.829
.81
.594
.03
.013
--
.005
--
--
--
.213
.008
.003
.001
--
.132
.004
.012
.0
.004
.021
.025
.001
--
.111
.296
.575
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.044
.007
--
--
.001
.013
.013
.014
.106
.03
.119
.11
.127
.003
.572
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
.014
.0
.004
.011
.003
.99
.007
.504
.09
.006
.977
.006
.026
--
--
--
--
.109
.005
--
.005
.0
.001
--
.008
.003
.062
.254
.214
.235
.0
.0
.009
.221
.035
.989
.775
.009
.001
.001
.014
.012
.002
.012
.202
.023
.242
--
--
--
--
--
--
.983
--
--
--
--
--
--
.202
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Ralgapa1
Ralgapa1
Ralgapa1
Ralgapa1
Ralgapa1
Ralgapa1
Ralgapa1
Ralgapa1
Ralgapa1
Ralgapa1
Ralgapa1
Ralgapa1
Ralgapa1
Ralgapa1
Ralgapa1
Ralgapa1
Ralgapa1
Ralgapa1
Ralgapa1
Ralgapa1
Ralgapa1
Ralgapa1
Ralgapa1
Ralgapa1
Ralgapa1
Ralgapa1
Ralgapa1
Ralgapa1
Ralgapa1
Ralgapa1
Ralgapa1
Ralgapa1
Ralgapa1
Ralgapa1
Ralgapa1
Ralgapa1
Ralgapa1
Ralgapa1
Ralgapa1
Ralgapa1
Ralgapa1
Ralgapa1
Ralgapa1
Ralgapa1
Ralgapa1
Ralgapa1
Ralgapa1
Ralgapa1
Ralgapa1
Ralgapa1
Ralgapa1
Ralgapa1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
-
T
G
A
-
C
2
2
C
A
G
T
C
C
G
-
5
-
C
T
G
A
A
A
C
T
C
A
-
-
A
T
-
C
-
G
2
C
G
A
T
T
G
C
-
A
36
4
A
C
-
A
A
A
C
G
A
T
T
C
G
T
G
-
C
-
G
C
G
-
T
C
G
T
C
G
-
T
A
A
G
T
C
C
A
4
C
C
G
T
A
G
A
-
T
-
G
C
T
-
G
T
C
T
T
G
T
T
C
C
C
G
A
C
A
T
G
C
3
T
T
C
G
A
C
G
A
G
C
A
A
C
T
C
A
A
A
G
C
23
T
T
-
A
C
A
T
T
T
C
-
C
G
T
C
-
A
A
G
C
T
T
T
-
A
C
G
T
T
G
-
-
-
-
-
-
-
G
G
T
T
T
-
A
T
-
-
T
G
-
-
-
C
-
A
T
-
G
C
A
-
-
T
-
C
-
A
A
T
G
C
T
T
T
C
T
T
T
-
T
-
-
T
G
2
-
2
G
C
T
C
C
A
T
G
A
C
C
T
G
T
2
2
C
A
G
C
A
C
A
-
-
A
C
-
-
G
C
G
A
T
G
T
C
C
T
C
C
T
G
A
-
-
2
G
G
T
C
T
C
C
C
T
C
C
5
C
G
A
A
C
A
G
G
C
A
T
-
G
T
G
C
A
-
A
T
A
2
-
-
-
G
G
-
G
-
-
-
T
-
-
-
-
T
C
-
A
C
A
-
A
C
T
G
A
T
G
G
A
A
G
C
-
-
C
C
T
G
G
G
2
G
2
-
T
A
T
-
-
G
C
C
T
-
G
-
T
G
A
C
T
2
T
C
A
A
A
T
C
G
T
T
A
G
A
A
A
G
A
T
A
A
T
T
C
T
20
A
A
C
-
2
T
G
A
C
A
A
C
T
T
C
C
G
C
T
A
-
-
-
A
T
-
-
G
G
A
G
-
G
G
T
A
T
G
G
T
T
C
C
C
C
A
C
G
-
C
C
T
T
T
T
A
C
A
A
A
G
C
T
A
-
T
16
C
G
C
G
A
G
A
-
-
4
-
T
G
12
C
C
3
C
C
C
T
C
T
A
A
T
G
A
G
-
G
T
C
T
G
T
-
-
A
G
G
T
-
-
-
-
A
G
T
  76,387,307
  76,387,676
  76,389,541
  76,390,240
  76,391,103
  76,391,255
  76,391,607
  76,392,493
  76,394,301
  76,395,720
  76,395,910
  76,396,922
  76,397,031
  76,397,945
  76,400,230
  76,401,683
  76,401,920
  76,403,277
  76,405,801
  76,407,649
  76,408,331
  76,408,332
  76,408,405
  76,408,590
  76,409,646
  76,409,731
  76,411,618
  76,412,048
  76,414,099
  76,414,294
  76,414,620
  76,414,660
  76,414,804
  76,414,834
  76,417,683
  76,417,686
  76,417,691
  76,417,700
  76,417,705
  76,422,041
  76,422,128
  76,423,403
  76,425,737
  76,426,579
  76,429,244
  76,430,475
  76,433,519
  76,433,598
  76,433,794
  76,434,752
  76,434,798
  76,434,915
  76,434,956
  76,435,147
  76,435,441
  76,440,388
  76,440,807
  76,440,813
  76,440,957
  76,441,050
  76,441,128
  76,441,131
  76,441,497
  76,442,121
  76,442,672
  76,444,997
  76,445,013
  76,446,011
  76,446,860
  76,447,346
  76,448,411
  76,448,955
  76,449,831
  76,450,963
  76,451,031
  76,451,733
  76,452,248
  76,454,774
  76,455,064
  76,455,529
  76,455,847
  76,456,354
  76,456,404
  76,457,151
  76,458,325
  76,458,454
  76,458,741
  76,459,405
  76,460,617
  76,460,972
  76,460,990
  76,461,571
  76,461,697
  76,467,043
  76,467,445
  76,467,485
  76,468,043
  76,468,235
  76,468,759
  76,469,475
  76,469,685
  76,469,799
  76,470,114
  76,470,204
  76,470,801
  76,471,242
  76,471,243
  76,471,289
  76,471,301
  76,471,310
  76,471,313
  76,471,320
  76,471,343
  76,471,604
  76,471,690
  76,471,699
  76,471,712
  76,471,740
  76,471,773
  76,472,356
  76,472,367
  76,472,389
  76,472,407
  76,472,420
  76,472,545
  76,472,836
  76,472,879
  76,473,052
  76,473,100
  76,473,232
  76,473,425
  76,473,437
  76,473,539
  76,473,565
  76,474,022
  76,474,293
  76,474,417
  76,475,022
  76,475,069
  76,476,156
  76,477,164
  76,477,230
  76,478,200
  76,480,753
  76,480,955
  76,480,960
  76,481,418
  76,481,420
  76,481,423
  76,481,444
  76,481,503
  76,481,666
  76,482,215
  76,482,589
  76,483,780
  76,483,837
  76,484,288
  76,484,763
  76,486,330
  76,487,236
  76,490,199
  76,490,783
  76,491,303
  76,494,473
  76,494,868
  76,495,312
  76,495,313
  76,495,406
  76,495,952
  76,496,480
  76,496,826
  76,496,854
  76,496,858
  76,496,872
  76,496,891
  76,496,948
  76,496,961
  76,496,978
  76,497,017
  76,497,020
  76,497,022
  76,497,045
  76,497,084
  76,497,167
  76,497,168
  76,497,202
  76,497,235
  76,497,274
  76,497,379
  76,497,383
  76,497,410
  76,497,422
  76,497,465
  76,497,492
  76,497,501
  76,497,534
  76,497,549
  76,497,568
  76,497,569
  76,497,626
  76,497,629
  76,497,649
  76,497,717
  76,497,740
  76,497,746
  76,497,756
  76,497,926
  76,498,126
  76,498,682
  76,499,800
  76,503,005
  76,503,279
  76,503,684
  76,503,989
  76,504,244
  76,504,272
  76,504,289
  76,504,291
  76,504,310
  76,504,321
  76,504,340
  76,504,344
  76,504,403
  76,504,456
  76,504,466
  76,504,491
  76,504,497
  76,504,828
  76,504,893
  76,504,895
  76,504,920
  76,504,992
  76,505,013
  76,505,041
  76,505,050
  76,505,055
  76,505,066
  76,505,074
  76,505,086
  76,505,097
  76,505,098
  76,505,101
  76,505,146
  76,505,183
  76,505,189
  76,505,203
  76,505,232
  76,505,272
  76,505,320
  76,505,322
  76,505,332
  76,505,351
  76,505,402
  76,507,606
  76,508,363
  76,508,554
  76,508,697
  76,508,698
  76,509,595
  76,510,466
  76,510,897
  76,511,502
  76,511,562
  76,512,477
  76,512,785
  76,512,927
  76,513,189
  76,513,378
  76,513,867
  76,514,492
  76,515,124
  76,516,973
  76,517,663
  76,517,673
  76,517,758
  76,517,804
  76,518,363
  76,519,654
  76,520,103
  76,520,226
  76,520,279
  76,520,280
  76,521,038
  76,521,148
  76,521,187
  76,521,349
  76,521,469
  76,521,470
  76,521,504
  76,521,507
  76,521,518
  76,521,525
  76,521,526
  76,521,540
  76,521,542
  76,521,622
  76,524,737
  76,524,767
  76,524,788
  76,524,792
  76,526,533
  76,527,264
  76,527,267
  76,527,277
  76,527,287
  76,527,292
  76,527,298
  76,527,314
  76,527,329
  76,527,332
  76,527,341
  76,527,349
  76,527,359
  76,527,367
  76,527,416
  76,527,420
  76,527,428
  76,527,434
  76,527,441
  76,527,449
  76,527,451
  76,527,473
  76,527,480
  76,527,485
  76,527,491
  76,527,509
  76,527,510
  76,531,962
  76,531,970
  76,531,976
  76,534,126
  76,535,954
  76,538,831
  76,539,101
  76,539,443
  76,540,507
  76,541,275
  76,542,066
  76,542,503
  76,543,547
  76,543,701
  76,544,227
  76,545,949
  76,545,962
  76,546,227
  76,546,361
  76,547,090
  76,547,662
  76,547,789
  76,548,413
  76,548,609
  76,548,784
  76,548,790
  76,548,956
  76,549,899
  76,550,457
  76,550,575
  76,552,839
  76,552,864
  76,553,170
  76,553,963
  76,555,018
  76,555,203
  76,556,945
  76,557,677
  76,558,932
  76,559,185
  76,559,740
  76,560,170
  76,561,188
  76,562,287
  76,564,612
  76,565,025
  76,565,578
  76,567,505
  76,568,736
  76,569,294
  76,569,363
  76,570,726
  76,571,111
  76,571,695
  76,572,212
  76,572,683
  76,573,553
  76,573,604
  76,573,634
  76,574,189
  76,574,391
  76,574,582
  76,574,930
  76,575,000
  76,575,010
  76,575,027
  76,575,052
  76,575,060
  76,575,063
  76,576,572
  76,576,752
  76,576,782
  76,577,185
  76,577,615
  76,577,927
  76,578,894
  76,579,348
  76,579,436
  76,580,051
  76,580,791
  76,581,007
  76,581,292
  76,581,644
  76,581,682
  76,581,957
  76,581,974
  76,582,067
  76,582,145
  76,582,488
  76,582,789
  76,582,910
  76,583,195
  76,589,897
  76,589,944
  76,589,965
  76,590,160
  76,590,181
  76,590,210
  76,590,226
  76,590,276
  76,590,374
  76,591,448
  76,591,456
  76,591,478
  76,591,504
  76,592,031
  76,593,129
  76,593,725
  76,594,574
  76,594,890
  76,594,898
  76,595,057
  76,595,061
  76,595,065
  76,598,262
  76,599,545
  76,599,768
  76,600,259
  76,600,694
  76,600,759
  76,605,141
  76,605,518
  76,605,608
  76,605,759
  76,607,789
  76,608,315
  76,608,511
  76,610,711
  76,611,604
  76,613,258
  76,613,376
  76,616,656
  76,618,390
  76,620,018
  76,621,501
  76,621,679
  76,621,919
  76,622,432
  76,623,514
  76,623,585
  76,623,917
  76,624,099
  76,624,737
  76,625,833
  76,628,497
  76,628,675
  76,630,469
  76,630,474
  76,630,866
  76,631,836
  76,632,190
  76,632,383
  76,632,841
  76,632,859
  76,633,495
  76,635,451
  76,636,141
  76,636,382
  76,636,683
  76,636,991
  76,637,597
  76,637,795
  76,638,034
  76,638,325
  76,644,287
  76,644,301
  76,644,491
  76,646,963
  76,647,054
  76,648,321
  76,648,796
  76,649,379
  76,649,917
  76,649,956
  76,650,138
  76,650,258
  76,650,535
  76,650,557
  76,652,392
  76,655,279
  76,655,313
  76,655,341
  76,656,047
  76,656,054
  76,656,168
  76,659,983
A
C
A
G
4
T
-
-
A
G
A
C
T
A
T
7
-
T
T
G
T
C
C
-
T
C
A
G
2
A
G
C
A
-
G
C
-
G
-
G
C
-
A
A
4
C
-
-
T
G
T
C
C
G
A
T
G
C
T/C
C/T
G/C
T/C
A
2
G
8
A
T
A
4
G
A
A
C
T
A
G
C
G
-
A
G
T
T
G
4/-
T
A
T
A
G
A
G
3
A
A
C
A
C
C
C
A
T
C
A
G/A
T/A
T/C
C/A
C/T
C/T
G/A
A/T
T
A/C
T/G
G/-
C/A
3/-
T/C
T/A
C/T
G/A
A/T
G
A
C
A
T
T
A/C
G
C
C/A
G
G
T
A
T
-
C
C
T
G
A
G
C
A
G
T
2
A
G/T
C
A
2
G
G
A
T
C
C
-
2
G
A
A
-
C
A
A
A
C
C
C
G
A
-
A
-
G
-
C
T
A
T
C
-
A
A
A
A
-
A
C
A
A
C
A
-
C
A
-
T
-
A
G
G
-
A
T
-
C
C
-
-
A
-
G
-
G
A
-
-
-
A
-
-
T
G
-
-
-
-
A
G
-
-
-
T
G
-
-
-
-
C
-
C
A
-
G
G
G
-
C
G
T
G
G/T
-
-
C
G
T
T
A
T
-
C
A
G
T
2
-
A
A
C
G
A
G
T
G
T/C
C/G
C/T
5/-
T
C
A/G
A/G
C/T
A/G
G/A
A
T
G
A
-/A
A
A
A
A
T
3
G
G
-
-
A
G
T
-
C
C
-
G
2
T
-
T
G
T
A
-
-
A
T
-
-
C
T
T
C
A
-
C
T
T
T
G
A
T
C
2
T
T
C
A
A
A
-
A
-
3
-
G
-
T
A
A
G
T
G
2
A
-/C
A
A
G
T
C
-
G
T
-
G
G
A
A
A
A
C
-
A
-
C
-
A
G
C
A/C
A/-
T/G
C
C/T
T/C
20/-
G
T
T
A
-
A
C
G
T
G
G
G
C
C
G
T
C
G
C
-
2
G
A
-
C
G
C
-
-
-
-
A
A
A
C
-
C
C
A
G
C
G
G
G
T
-
T
A
2
T
G
C
C
C
-
-
T
G
G
C
A
T
C
G
4
C
-
T
A
A
A
C
A
G
7
4
-
4
C
A
-
G
G
-
T
-
T
-
T
A
C
-
C
A
G
A
T
A
C
A
A
A
G
A
A
-
-
A
A
C
A
C
C
C
A
A