Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 134,535 (bp)   Positions: 492
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.803
.001
.0
.012
.003
.0
.009
.0
.001
.0
.001
.001
.0
.0
.001
.164
.075
.05
.219
.005
.58
.002
.001
.002
.004
.005
.001
.011
.0
.003
.002
.002
.001
.001
.036
.043
.035
.475
.001
.0
.003
.0
.007
.022
.0
.003
.0
.0
.0
.003
.001
.004
.001
.0
.001
.001
.032
.001
.0
.002
.052
.002
.011
.373
.017
--
.004
.945
.949
.996
.998
.01
.01
--
.015
.147
.001
.004
.229
--
.008
.015
.0
.007
.002
.019
.001
--
.005
--
.004
.0
.001
.002
.002
.05
.001
.395
.0
.038
.039
.093
.003
.007
.125
.041
.014
.0
.997
.007
.969
.125
.07
.49
.0
.001
.0
.001
.001
.001
.013
.001
.0
.0
.003
.006
.0
.0
.001
.0
.0
.002
.0
.0
.014
.002
.014
.03
.035
.026
.0
.003
.005
.0
.005
.0
.001
.0
.018
.018
.398
.004
.12
.159
.171
.007
.053
.001
.031
.012
.001
.002
.0
.001
.0
.176
.005
.001
.001
.03
.019
.0
.031
.001
.009
.005
.001
.001
.0
.048
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.003
.001
.001
.009
.0
.0
.0
.0
.0
.014
.003
.032
.002
.003
.004
.001
.005
.001
.0
.002
.003
.003
.042
.099
.026
.001
.0
.019
.003
.019
.049
.001
.0
.0
.0
.0
.005
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.052
.069
.455
.081
.041
.034
.002
.001
.001
.107
.331
.002
.005
.004
.084
--
--
.028
.133
.009
.0
.066
.747
.342
.008
.054
.058
.024
.168
.06
.057
.001
.02
.08
.003
.57
.001
.011
.023
.145
.004
.007
.007
.004
.001
--
--
--
.013
.065
.018
.037
.049
.426
.002
.053
.003
.017
.024
--
--
--
--
.01
.021
.001
.002
.001
.004
.406
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.001
.004
.021
.001
.308
.005
.097
.111
.207
.005
.012
.048
--
--
--
.054
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.007
.036
--
--
.003
.0
.0
.554
.001
.043
.0
.175
.128
.161
.012
.027
.081
.103
--
--
--
--
--
--
--
.107
.005
.003
.003
.039
.017
.042
.039
.073
.09
.018
.002
.001
.01
.005
.0
.174
.005
.681
.001
.122
--
--
.023
.083
--
.001
.001
.0
.0
.068
.002
.0
.004
.001
.001
.0
.32
.043
.0
.0
.0
.032
.032
--
--
--
--
--
--
.002
.003
.998
.05
.005
.004
.006
.026
.0
.004
.0
.001
.014
.087
.033
.202
.002
.001
.005
.183
.004
.006
.0
.002
.007
.035
.006
.028
.021
--
.003
.011
.084
.001
.01
.003
.117
--
.001
.004
.001
.002
.014
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
T
C
A
A
A
A
A
C
A
C
A
C
A
T
A
-
T
G
T
G
A
T
A
12
A
G
T
G
C
G
C
C
C
A
T
C
G
G
T
T
A
G
A
A
G
G
G
C
C
G
C
T
A
T
A
C
G
G
A
C
G
A
C
3
C
A
C
T
G
G
G
12
A
A
A
T
A
C
A
A
A
C
G
C
C
-
-
G
-
6
G
T
G
T
A
T
A
A
A
C
A
T
C
A
-
C
C
A
A
G
A
107
A
A
A
G
G
G
C
G
G
G
C
C
A
A
A
-
A
T
C
T
T
G
8
A
2
C
3
3
-
-
C
-
G
G
G
G
C
G
-
A
3
T
4
-
A
T
G
-
T
-
G
T
T
A
-
T
C
T
A
T
A
T
T
C
C
4
G
G
G
2
-
A
G
G
A
C
T
T
A
T
G
T
T
T
T
T
G
T
G
A
G
A
A
C
G
C
A
C
T
T
A
12
A
T
C
G
G
A
A
C
G
T
T
G
T
G
A
G
A
C
A
A
A
T
4
-
G
G
A
5
A
T
C
A
C
A
-
A
G
-
G
A
C
A
4
T
G
2
A
C
C
G
A
T
G
A
T
C
C
A
C
C
C
A
G
T
T
G
-
-
G
G
G
C
C
T
T
T
T
G
C
A
A
G
G
C
-
G
2
T
-
A
G
G
G
A
T
A
C
G
G
C
A
T
A
T
C
A
A
T
C
T
2
T
C
G
C
C
T
G
T
A
G
A
T
T
T
G
A
G
G
A
A
C
A
A
A
G
A
A
G
G
C
C
G
G
G
-
G
G
6
G
A
G
G
G
G
A
G
A
G
C
-
C
T
A
G
T
C
G
C
-
-
A
A
A
A
G
C
-
G
T
T
C
G
G
-
G
T
T
C
T
A
T
C
-
-
C
G
G
G
T
2
A
T
3
G
T
C
A
A
A
53
G
C
A
T
C
A
C
-
G
-
A
C
G
A
T
G
-
-
C
T
A
A
A
C
G
C
G
T
2
C
A
A
A
G
C
C
A
C
C
G
A
A
12
-
G
T
A
A
C
G
T
C
G
A
A
T
A
T
G
T
-
C
C
G
A
A
A
  113,370,130
  113,370,187
  113,370,407
  113,370,586
  113,370,857
  113,371,053
  113,371,273
  113,371,603
  113,371,624
  113,371,661
  113,371,818
  113,371,993
  113,372,108
  113,373,235
  113,373,424
  113,375,225
  113,375,472
  113,375,599
  113,375,719
  113,376,069
  113,376,639
  113,376,933
  113,377,732
  113,377,836
  113,378,010
  113,378,091
  113,378,295
  113,378,728
  113,378,887
  113,379,422
  113,379,598
  113,380,173
  113,380,195
  113,380,204
  113,380,434
  113,380,782
  113,380,864
  113,380,987
  113,381,680
  113,381,695
  113,382,222
  113,382,649
  113,382,801
  113,382,874
  113,382,942
  113,383,274
  113,383,359
  113,383,808
  113,384,004
  113,384,044
  113,384,061
  113,384,072
  113,384,598
  113,384,611
  113,384,626
  113,384,733
  113,384,767
  113,385,060
  113,385,242
  113,385,418
  113,385,612
  113,386,431
  113,386,461
  113,386,568
  113,386,746
  113,386,915
  113,387,015
  113,387,533
  113,387,534
  113,387,805
  113,387,868
  113,388,432
  113,388,667
  113,390,324
  113,390,591
  113,391,110
  113,391,486
  113,391,602
  113,392,092
  113,392,809
  113,393,829
  113,393,908
  113,394,348
  113,395,188
  113,395,298
  113,395,395
  113,396,578
  113,396,719
  113,397,039
  113,397,319
  113,398,740
  113,398,984
  113,399,012
  113,399,179
  113,399,301
  113,399,702
  113,400,420
  113,400,578
  113,401,066
  113,401,356
  113,401,357
  113,401,389
  113,401,530
  113,401,538
  113,401,792
  113,401,840
  113,401,841
  113,401,949
  113,402,214
  113,402,373
  113,402,585
  113,402,613
  113,402,873
  113,402,941
  113,403,081
  113,403,090
  113,403,096
  113,403,431
  113,403,471
  113,403,486
  113,403,495
  113,403,577
  113,403,623
  113,403,694
  113,403,865
  113,403,923
  113,404,017
  113,404,184
  113,404,394
  113,404,492
  113,404,493
  113,404,793
  113,405,265
  113,405,496
  113,405,801
  113,406,192
  113,406,222
  113,406,228
  113,406,237
  113,406,242
  113,406,279
  113,406,282
  113,406,303
  113,406,308
  113,406,450
  113,407,016
  113,407,018
  113,407,020
  113,408,252
  113,408,281
  113,409,171
  113,409,278
  113,410,589
  113,410,592
  113,411,842
  113,413,697
  113,413,832
  113,413,957
  113,414,094
  113,415,139
  113,416,388
  113,416,395
  113,416,435
  113,416,547
  113,416,552
  113,416,660
  113,416,909
  113,417,020
  113,417,081
  113,417,176
  113,417,261
  113,417,289
  113,417,334
  113,417,870
  113,418,055
  113,418,097
  113,419,784
  113,419,787
  113,419,796
  113,420,087
  113,420,548
  113,420,558
  113,420,571
  113,420,579
  113,420,792
  113,420,835
  113,420,980
  113,421,017
  113,421,179
  113,421,281
  113,421,479
  113,421,616
  113,421,869
  113,421,915
  113,421,917
  113,421,919
  113,421,921
  113,421,923
  113,423,430
  113,423,442
  113,423,678
  113,423,765
  113,423,774
  113,423,786
  113,424,010
  113,424,231
  113,424,346
  113,424,347
  113,424,386
  113,424,435
  113,424,543
  113,424,670
  113,424,788
  113,424,867
  113,424,988
  113,425,075
  113,425,081
  113,425,100
  113,425,280
  113,425,304
  113,425,354
  113,425,398
  113,425,406
  113,425,414
  113,425,446
  113,425,678
  113,425,811
  113,425,984
  113,426,105
  113,426,499
  113,426,500
  113,426,544
  113,426,557
  113,426,559
  113,426,564
  113,426,568
  113,426,625
  113,426,722
  113,426,798
  113,426,811
  113,426,850
  113,426,927
  113,427,117
  113,427,142
  113,427,542
  113,428,198
  113,428,331
  113,428,464
  113,428,668
  113,428,755
  113,428,842
  113,428,934
  113,429,017
  113,429,082
  113,429,311
  113,429,336
  113,429,552
  113,429,797
  113,429,877
  113,430,123
  113,430,172
  113,430,218
  113,430,450
  113,430,877
  113,430,901
  113,431,128
  113,431,156
  113,431,160
  113,431,176
  113,431,365
  113,431,459
  113,431,598
  113,431,665
  113,432,164
  113,432,284
  113,432,407
  113,432,520
  113,432,641
  113,432,722
  113,432,723
  113,432,725
  113,432,948
  113,433,153
  113,433,316
  113,433,398
  113,433,569
  113,433,623
  113,433,676
  113,433,718
  113,434,054
  113,434,149
  113,434,312
  113,434,383
  113,434,465
  113,434,566
  113,434,683
  113,434,781
  113,434,889
  113,434,999
  113,435,022
  113,435,198
  113,435,258
  113,435,384
  113,435,594
  113,435,598
  113,435,652
  113,435,692
  113,435,842
  113,435,856
  113,436,057
  113,436,175
  113,436,390
  113,436,671
  113,436,685
  113,436,698
  113,436,799
  113,436,968
  113,437,153
  113,437,248
  113,437,306
  113,437,481
  113,437,692
  113,437,712
  113,437,806
  113,438,082
  113,438,226
  113,438,331
  113,438,340
  113,438,441
  113,438,502
  113,438,767
  113,439,911
  113,439,947
  113,440,464
  113,440,571
  113,440,715
  113,440,855
  113,440,998
  113,441,031
  113,441,073
  113,441,082
  113,441,154
  113,441,165
  113,441,193
  113,441,243
  113,441,396
  113,441,799
  113,441,818
  113,441,923
  113,442,015
  113,442,102
  113,442,138
  113,442,418
  113,442,420
  113,442,443
  113,442,592
  113,442,595
  113,442,858
  113,442,933
  113,443,008
  113,443,658
  113,443,671
  113,443,890
  113,443,945
  113,443,963
  113,443,964
  113,444,024
  113,444,039
  113,444,260
  113,444,272
  113,444,328
  113,444,465
  113,444,466
  113,445,126
  113,448,439
  113,448,797
  113,449,030
  113,451,072
  113,452,043
  113,452,236
  113,453,398
  113,454,586
  113,455,785
  113,456,322
  113,459,963
  113,460,843
  113,460,890
  113,460,901
  113,462,995
  113,463,666
  113,464,084
  113,464,763
  113,465,783
  113,465,797
  113,465,802
  113,465,807
  113,465,826
  113,466,275
  113,466,395
  113,466,533
  113,466,626
  113,466,635
  113,466,734
  113,466,751
  113,466,799
  113,466,871
  113,466,886
  113,466,899
  113,466,903
  113,467,115
  113,467,208
  113,467,303
  113,467,432
  113,467,475
  113,467,647
  113,467,996
  113,468,018
  113,468,051
  113,468,157
  113,468,318
  113,468,448
  113,468,458
  113,468,616
  113,468,773
  113,468,877
  113,469,096
  113,469,187
  113,469,272
  113,469,379
  113,469,413
  113,469,538
  113,469,639
  113,469,642
  113,469,735
  113,469,798
  113,470,057
  113,470,163
  113,470,191
  113,470,404
  113,470,448
  113,470,479
  113,470,576
  113,470,578
  113,471,558
  113,471,736
  113,472,177
  113,473,099
  113,473,191
  113,473,199
  113,473,811
  113,473,900
  113,474,644
  113,474,787
  113,475,165
  113,475,563
  113,476,291
  113,477,491
  113,477,519
  113,477,811
  113,478,426
  113,478,904
  113,479,266
  113,479,473
  113,479,499
  113,480,490
  113,480,744
  113,480,749
  113,480,754
  113,481,301
  113,481,985
  113,482,134
  113,482,205
  113,482,246
  113,482,680
  113,483,349
  113,483,454
  113,483,758
  113,484,228
  113,484,738
  113,486,075
  113,487,325
  113,488,517
  113,489,950
  113,493,932
  113,494,116
  113,495,542
  113,497,085
  113,497,342
  113,500,052
  113,500,621
  113,501,681
  113,503,322
G
T
C
-
G
G
G
T
-
T
G
T
G
C
G
2
C
A
C
A
-
C
G
-
T
A
C
A
T
A
T
T
T
C
C
A
A
A
-
C
C
A
G
C
A
A
A
-
T
A
T
G
G
C
G
T
A
A
G
T
A
C
T
-
T
C
T
A
T
A
A
-
G
T
G
A
G
G
-
G
G
T
A
T
G
6
T
A
2
6/-
A
C
A
C
G
A
G
T
G
T
G
C
T
G
15
T
A
G
G
A
G
-
G
G
G
A
C
A
T
A
A
A
T
G
G
C
G
A
G
C
T
C
C
T
-
T
-
T
-
-
T
G
-
T
A
G/C
G/C
G/C
G
A
10
G
-
C
-
A
G
G
A
23
C
G
A
C
C
G
12/C
C
T
C
G
C
G
C
C
G
G
4/-
G/C
A
A
-
A
G
A
A
G
A
C
G
G
C
A
A
A
A
A
A
A
T/-
A
G
A
G
G
T
A
A
T
T
C
C
G
-
G
C
A
A
A
G
G
T
A
C
C
A
C
A
G
C
C
A
G
G
G
A
-
14
C
A
G
-
C
C
A
-
T
C
4
T
A
G
A
G
T
G
-
C
A
-
G
A
T
A
G
A
A
T
C
T
T
G
T
G
T
T
A
C
A
A
7/A
-/2
A
A
A
T
T
C
C
C
C
A
G
G
G
C
A
T
A
A
-
C
3
A/T
G/T
T
A
G
C
T
T
T
A
A
G
C
G
C
T
T
G
C
A
C
-
A
T
A
T
A
C
G/T
T/C
A/G
G/A
A/G
T/C
T/C
T/C
G/A
A/G
G/A
G/A
T
A/G
C/T
G
G
G
G/A
A/G
A/G
A
A
C/T
C/T
G/A
G/A
G/A
-/5
G/A
A
6/-
G/A
A/G
G/A
G/A
A
G/A
A/G
A
G
A
T
2
T
C
G
A
-
T
A
A
T
3
G
T
T
G
A
A
41
A
C
C
T
A
A
T
A
C
C
G
C
G
A
G
A
A
T
C
A
A
C
-
G
C
-
A
G
T
C
C
T
-
A
T
G
C
A
G
T
C
C
2
G
T
C
C
C
A
-/4
183
T
C
G
G
T
G
C
T
A
C
-
G
G
-
C
A
T
G
G
T
T
A
G
G
-
G
-
C
G
G
G
A
C
T
T
G
G
C
G
C
C
C
G
-
G
-
G
G
G