Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 199,719 (bp)   Positions: 550
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.023
.0
.085
.0
.0
.004
.0
.0
.001
.0
.005
.002
.002
.815
.007
.028
.002
.003
1.0
.002
.003
.0
.008
.012
.001
.005
.0
.116
.01
.01
.011
.025
.0
.011
.0
.036
.006
.027
.0
.0
.0
.008
.001
.002
.224
.185
--
--
--
.032
.307
.0
.768
.007
.006
.0
.272
.0
.01
.0
.0
.003
.009
.015
.02
.007
.001
.0
.001
.007
.0
.0
.005
.017
.055
.001
.001
.177
.046
.028
.145
--
--
--
--
.009
.013
.02
.019
.012
.012
.01
.001
.452
--
--
.011
--
.004
.0
.205
.104
.001
.0
.0
.004
.008
.001
.006
.002
.0
.884
.043
.001
.0
.993
.595
.984
.751
.799
.003
.0
.0
.001
.0
.001
--
--
--
--
--
--
.0
.006
.023
.006
.005
.008
.002
.0
.004
.012
.0
.012
--
--
--
--
--
--
--
--
.005
.014
.0
.123
.736
.0
.0
.0
.024
--
--
.001
.006
.001
.0
.0
.003
.011
.683
.002
.013
.997
.616
.0
.041
.003
.004
.037
.658
.106
.01
.0
.0
.018
.001
.001
.001
.0
.004
.0
.0
.006
.0
.004
.001
.003
.001
.001
.004
.008
.002
.001
.079
.014
.002
.885
.0
.002
.0
.001
.0
.002
.002
.013
.0
.0
.402
.016
.001
.003
.0
.003
.0
.005
.006
.0
.0
.007
.001
.004
.017
.007
.01
.0
.001
.002
.001
.002
.0
.0
.004
.001
.0
.001
.003
.011
.036
.001
.0
.128
.003
.008
.072
.002
.007
.001
.066
.004
.406
.0
.0
.001
.007
.0
.005
.032
.004
.006
.012
.013
.772
.735
.86
.35
.0
.003
.0
.002
.002
.076
.0
.001
.0
.02
.0
.0
.0
.0
.138
.0
.001
.0
.046
.01
.012
.008
.001
.278
.15
.052
.006
.068
.005
.081
.002
.0
.0
.001
.001
.001
.0
.733
.001
.0
.033
.095
--
--
--
--
--
--
--
--
.284
.001
.0
.077
.0
.0
.002
.004
.025
.003
.0
.0
.001
.0
.0
.0
.0
.0
.003
.045
.001
.205
.024
.029
.018
.352
.036
.025
.027
.029
.027
.028
.001
.001
.0
.0
.0
.001
.011
.072
.001
.036
.055
.004
.0
.002
.0
.0
.001
.001
.0
.0
.001
.001
.022
.198
.021
.022
.0
.0
.0
.013
.002
.0
.064
.019
.0
.006
.001
.0
.0
.001
.032
.008
.0
.0
.001
.001
.085
.065
.018
.0
.0
.013
.0
.0
.0
.0
.012
.001
.054
.0
.006
.006
.002
.001
.007
.077
.003
.103
.001
.004
.991
.119
.008
.137
.965
.953
1.0
.989
.877
.987
.987
.992
.891
.946
.023
.0
.0
.298
.134
.156
.0
.002
.01
.017
.004
.0
.005
.005
.092
.008
--
--
--
--
--
--
.003
.011
.091
.31
.016
.0
.518
.189
.049
.795
.986
.0
.0
.0
.0
.0
.003
.002
.0
.0
.003
.0
.001
.982
.028
.002
.005
.007
.013
.009
.044
.467
.048
.297
.281
.999
.999
.005
.004
.002
.993
.0
.0
.002
.147
.15
.002
.03
.0
.008
.085
.99
.0
.307
.01
.375
.09
.0
.0
--
.001
.003
.018
.009
.016
.001
.002
.001
--
--
--
--
--
--
--
.015
.003
.056
.0
.0
.002
.004
.001
.0
.0
.951
Ptprz1
Ptprz1
Ptprz1
Ptprz1
Ptprz1
Ptprz1
Ptprz1
Ptprz1
Ptprz1
Ptprz1
Ptprz1
Ptprz1
Ptprz1
Ptprz1
Ptprz1
Ptprz1
Ptprz1
Ptprz1
Ptprz1
Ptprz1
Ptprz1
Ptprz1
Ptprz1
Ptprz1
Ptprz1
Ptprz1
Ptprz1
Ptprz1
Ptprz1
Ptprz1
Ptprz1
Ptprz1
Ptprz1
Ptprz1
Ptprz1
Ptprz1
Ptprz1
Ptprz1
Ptprz1
Ptprz1
Ptprz1
Ptprz1
Ptprz1
Ptprz1
Ptprz1
Ptprz1
Ptprz1
Ptprz1
Ptprz1
Ptprz1
Ptprz1
Ptprz1
Ptprz1
Ptprz1
Ptprz1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
G
2
C
G
G
C
C
C
G
G
T
A
A
T
G
T
T
T
-
A
T
A
T
G
T
T
-
G
A
T
G
G
C
T
G
T
87
2
G
G
C
G
A
A
A
T
T
T
A
A
A
C
A
T
T
T
A
C
C
T
G
4
T
6
T
A
T
T
2
A
T
2
G
T
3
-
-
-
-
-
-
-
T
T
T
T
T
T
G
A
G
G
C
A
-
T
T
T
T
A
T
C
T
G
C
G
A
G
C
G
A
C
G
4
-
T
A
A
G
A
A
T
C
G
G
A
T
C
G
T
A
-
C
T
T
C
G
G
A
5
32
C
A
A
-
3
C
-
T
G
T
-
C
T
10
-
G
T
G
G
G
4
T
A
T
C
T
T
G
-
A
A
A
C
A
T
2
C
G
A
T
-
T
C
A
A
C
A
A
T
T
G
C
T
6
T
T
A
C
T
A
C
G
G
C
T
C
G
T
G
T
A
G
T
G
T
G
C
T
-
C
A
A
C
A
C
A
T
A
A
A
A
C
C
T
G
C
A
C
G
A
T
T
G
G
G
C
T
T
G
G
A
G
T
A
T
A
A
C
A
C
G
A
T
A
A
G
G
-
T
C
A
C
C
C
A
A
-
A
T
A
A
G
T
G
T
C
C
A
A
-
A
G
T
G
C
T
A
A
T
T
G
T
4
C
G
A
G
A
G
A
A
G
T
T
T
C
2
-
-
-
-
-
-
-
A
T
A
A
A
A
A
A
G
-
G
C
T
A
A
A
T
A
A
T
T
G
A
A
A
A
C
-
T
T
G
-
-
C
C
T
C
-
C
G
A
-
C
4
-
G
C
C
6
C
C
T
T
T
T
C
C
-
23
G
C
T
G
G
C
A
G
A
T
G
T
T
T
G
A
C
T
G
T
T
T
G
C
G
C
A
G
A
A
7
C
A
A
G
T
T
T
A
111
T
A
2
C
G
A
G
A
T
C
A
A
T
T
G
T
A
G
G
G
-
C
G
C
C
G
T
T
G
G
C
14
A
C
A
G
G
G
A
C
T
A
C
C
G
G
G
T
G
T
A
G
A
G
-
A
C
G
A
C
C
G
G
A
C
G
-
T
G
T
G
G
A
5
92
A
T
-
C
G
-
C
C
8
-
G
G
C
G
C
C
5
G
G
T
A
G
G
A
C
G
-
-
-
C
C
2
T
T
C
-
-
G
A
2
A
-
G
-
T
T
C
A
G
G
T
  49,941,814
  49,944,418
  49,945,850
  49,946,571
  49,946,928
  49,947,326
  49,947,328
  49,947,330
  49,947,355
  49,949,225
  49,951,665
  49,953,817
  49,953,956
  49,954,603
  49,954,732
  49,955,189
  49,955,421
  49,955,527
  49,956,152
  49,956,389
  49,956,432
  49,956,552
  49,956,609
  49,956,647
  49,958,599
  49,960,068
  49,965,199
  49,968,316
  49,968,914
  49,969,004
  49,970,617
  49,970,661
  49,970,805
  49,970,844
  49,972,207
  49,972,389
  49,972,470
  49,972,905
  49,973,109
  49,973,363
  49,974,172
  49,974,350
  49,974,386
  49,974,503
  49,974,656
  49,974,670
  49,974,697
  49,974,698
  49,974,745
  49,974,805
  49,974,856
  49,975,051
  49,976,562
  49,977,356
  49,977,835
  49,977,995
  49,978,050
  49,978,601
  49,978,608
  49,978,749
  49,978,825
  49,978,834
  49,978,841
  49,978,843
  49,978,851
  49,978,856
  49,978,866
  49,978,868
  49,978,871
  49,978,876
  49,978,885
  49,978,892
  49,978,897
  49,978,914
  49,978,919
  49,978,924
  49,978,928
  49,978,963
  49,978,994
  49,979,001
  49,979,008
  49,979,067
  49,980,803
  49,980,807
  49,980,811
  49,980,830
  49,980,835
  49,980,842
  49,980,846
  49,980,850
  49,980,852
  49,981,074
  49,981,216
  49,981,646
  49,996,720
  49,996,741
  49,996,816
  49,998,339
  49,999,951
  50,000,755
  50,001,856
  50,002,532
  50,003,178
  50,003,241
  50,003,245
  50,004,207
  50,004,357
  50,004,533
  50,004,588
  50,004,600
  50,004,655
  50,004,877
  50,004,983
  50,005,009
  50,005,015
  50,005,241
  50,005,320
  50,005,400
  50,005,446
  50,005,453
  50,006,285
  50,006,764
  50,007,032
  50,007,725
  50,008,359
  50,008,398
  50,008,566
  50,008,608
  50,008,699
  50,008,890
  50,008,896
  50,008,903
  50,009,018
  50,009,046
  50,009,094
  50,009,191
  50,009,616
  50,009,826
  50,010,309
  50,010,333
  50,010,348
  50,010,956
  50,011,652
  50,011,937
  50,013,130
  50,013,132
  50,013,142
  50,013,162
  50,013,167
  50,013,176
  50,013,177
  50,013,220
  50,014,553
  50,014,587
  50,015,094
  50,015,529
  50,016,143
  50,017,432
  50,018,000
  50,019,436
  50,020,673
  50,021,249
  50,021,344
  50,021,912
  50,022,372
  50,022,529
  50,022,689
  50,024,534
  50,024,901
  50,025,478
  50,025,695
  50,026,259
  50,026,424
  50,027,062
  50,027,100
  50,027,420
  50,028,490
  50,028,542
  50,028,550
  50,028,751
  50,028,895
  50,029,199
  50,029,455
  50,029,488
  50,029,504
  50,029,574
  50,029,606
  50,029,613
  50,029,619
  50,029,636
  50,029,639
  50,029,725
  50,029,759
  50,029,768
  50,029,778
  50,029,795
  50,029,820
  50,029,824
  50,029,827
  50,029,847
  50,029,900
  50,029,902
  50,029,937
  50,029,953
  50,030,004
  50,030,012
  50,030,074
  50,030,143
  50,030,235
  50,030,250
  50,030,291
  50,030,309
  50,030,329
  50,030,339
  50,030,340
  50,030,454
  50,030,614
  50,030,615
  50,030,716
  50,030,735
  50,030,903
  50,031,006
  50,031,037
  50,031,068
  50,031,085
  50,031,089
  50,031,091
  50,031,094
  50,031,107
  50,031,140
  50,031,152
  50,031,179
  50,031,484
  50,031,486
  50,031,537
  50,031,543
  50,031,573
  50,031,574
  50,031,576
  50,031,593
  50,031,813
  50,031,823
  50,031,852
  50,031,861
  50,031,960
  50,031,961
  50,031,974
  50,032,001
  50,032,107
  50,032,109
  50,032,133
  50,032,141
  50,032,602
  50,032,705
  50,032,732
  50,032,789
  50,032,801
  50,032,825
  50,032,927
  50,032,958
  50,033,055
  50,033,301
  50,033,302
  50,033,358
  50,033,393
  50,033,572
  50,033,580
  50,033,626
  50,034,278
  50,034,453
  50,034,984
  50,034,985
  50,035,254
  50,035,260
  50,035,293
  50,035,429
  50,035,685
  50,035,794
  50,035,885
  50,035,935
  50,036,002
  50,036,042
  50,036,056
  50,036,068
  50,036,230
  50,036,324
  50,036,463
  50,036,579
  50,036,678
  50,037,540
  50,037,591
  50,037,747
  50,037,766
  50,038,018
  50,038,073
  50,038,264
  50,038,269
  50,038,374
  50,038,438
  50,038,455
  50,038,488
  50,038,622
  50,038,805
  50,038,882
  50,041,288
  50,041,717
  50,041,892
  50,042,440
  50,042,947
  50,042,948
  50,042,980
  50,043,015
  50,043,027
  50,043,487
  50,043,998
  50,047,168
  50,049,786
  50,049,793
  50,050,468
  50,050,493
  50,050,499
  50,051,286
  50,051,293
  50,051,314
  50,051,318
  50,051,358
  50,055,186
  50,056,924
  50,057,496
  50,058,665
  50,062,455
  50,063,352
  50,064,082
  50,064,258
  50,064,392
  50,064,767
  50,065,733
  50,065,781
  50,066,815
  50,067,281
  50,067,592
  50,067,936
  50,068,250
  50,068,552
  50,068,558
  50,068,866
  50,068,964
  50,069,334
  50,069,686
  50,069,687
  50,069,714
  50,069,906
  50,069,995
  50,070,110
  50,070,206
  50,070,207
  50,070,624
  50,070,634
  50,070,761
  50,070,873
  50,070,993
  50,070,995
  50,070,997
  50,071,066
  50,071,228
  50,071,287
  50,071,462
  50,072,213
  50,072,221
  50,072,227
  50,072,900
  50,073,024
  50,073,026
  50,073,185
  50,074,067
  50,074,075
  50,074,547
  50,074,552
  50,074,569
  50,074,690
  50,075,035
  50,075,079
  50,075,094
  50,075,212
  50,075,389
  50,075,560
  50,075,612
  50,076,569
  50,076,571
  50,076,812
  50,077,204
  50,077,258
  50,077,774
  50,077,979
  50,078,112
  50,078,612
  50,078,796
  50,078,931
  50,078,961
  50,079,957
  50,080,900
  50,080,964
  50,081,288
  50,081,553
  50,081,655
  50,081,657
  50,081,747
  50,082,116
  50,082,392
  50,083,023
  50,083,128
  50,083,241
  50,083,409
  50,083,601
  50,083,783
  50,083,958
  50,084,203
  50,084,259
  50,084,304
  50,084,440
  50,084,467
  50,084,481
  50,084,516
  50,084,529
  50,084,855
  50,084,877
  50,085,266
  50,085,308
  50,085,539
  50,085,699
  50,086,045
  50,086,093
  50,086,105
  50,086,442
  50,086,459
  50,087,129
  50,087,131
  50,087,425
  50,087,578
  50,087,751
  50,087,930
  50,087,932
  50,088,227
  50,088,252
  50,090,430
  50,092,198
  50,092,205
  50,092,210
  50,092,216
  50,092,223
  50,094,546
  50,094,769
  50,095,841
  50,095,944
  50,096,190
  50,096,208
  50,096,539
  50,096,740
  50,096,873
  50,096,876
  50,097,020
  50,097,113
  50,097,135
  50,097,178
  50,097,448
  50,097,456
  50,097,627
  50,097,832
  50,098,291
  50,098,416
  50,098,425
  50,098,438
  50,098,639
  50,098,677
  50,098,912
  50,099,074
  50,099,181
  50,099,205
  50,099,225
  50,099,233
  50,099,380
  50,100,251
  50,100,967
  50,101,190
  50,101,302
  50,101,792
  50,102,742
  50,102,840
  50,102,962
  50,102,994
  50,103,467
  50,103,536
  50,103,996
  50,105,152
  50,105,916
  50,106,014
  50,106,328
  50,106,681
  50,106,687
  50,108,207
  50,108,341
  50,108,500
  50,108,790
  50,110,202
  50,111,559
  50,112,334
  50,112,672
  50,113,282
  50,115,662
  50,115,704
  50,115,951
  50,115,991
  50,116,121
  50,117,072
  50,118,160
  50,119,284
  50,119,874
  50,119,935
  50,120,742
  50,122,051
  50,122,846
  50,122,872
  50,125,997
  50,127,858
  50,128,789
  50,129,012
  50,129,017
  50,129,129
  50,130,685
  50,130,688
  50,130,693
  50,130,703
  50,130,775
  50,130,797
  50,130,805
  50,130,812
  50,131,728
  50,131,781
  50,131,787
  50,132,512
  50,132,518
  50,133,383
  50,135,318
  50,135,787
  50,136,872
  50,136,873
  50,136,941
  50,138,989
  50,139,700
  50,140,580
A
-
T
A
A
T
T
T
A
A
C
G
G
C
A
G
C
C
6
-
-
T
A
A
C
C
4
T
C
A
A
A
T
C
A
C
-
-
A
A
T
A
G
G
G
C
C
C
G
G
G
A
-
C
-
C
G
T
T
-
-
-
A
-
-
T
-
G
-
-
-
-
-
-
-
G
2
G
A
T
T
G
A
-
-
A
-
-
-
-
T
T
G
G
2
G
C
-
C
C
G
T
C
A
T
A
-
A
T
A
G
T
C
-
G
G
G
G
A
G
G
A
T
T
C
T
C
T
A
A
G
A
T
C
C
T
A
A
G
-
-
T
G
G
2
-
A
A
-
T
G
C
A
-
-
2
A
C
C
A
A
-
C
G
C
T
C
C
A
G
G
C
G
G
G
C
-
T
A
-
-
10
C
T
G
G
A
G
G
C
C
A
T
C
-
C
C
G
T
G
G
T
T
T
T
C
T
A
C
A
C
-
A
C
A
G
C
A
C
2
T
T
G
T
G
T
C
G
G
G
G
G
T
T
C
C
G
G
T
T
G
C
G
A
A
A
T
C
-
A
T
G
T
G
G
A
G
-
T
G
T
C
G
C
G
G
A
T
8
C
T
G
C/T
C/T
C/T
G
C
T
G
C
T
G
C
C
A
A
T
T
G
C
22
T
C
-
A
T
C
-
G
C
C
A
A
-
T
A
G
T
C
A
T
G
A
G
-
C
G
-
C
C
C
G
G
A
G
-
A
G
T
T
T
C
G
T
C
A
T
A
C
G
G
C
C
C
A
C
T
G
G
G
G
T
A
A
A
T
G
G
T
T
-
T
3
T
A
G
G
-
-
T
T
T
T
-
A
T
C
C
C
C
T
A
2
-
A
A
C
T
A
G
G
A
G
C
A
C
C
G
A
G
A
C
C
C
C
C
A
A
A
T
G
T
G
-
-
T
G
T
A
C
C
G
T
-
A
C
-
G
A
G
A
G
C
T
G
G
C
C
T
C
G
A
A
A
G
T
A
T
T
A
G
C
A
A
A
-
-
T
T
A
A
A
G
T
C
G
T
T
A
C
A
C
A
G
T
T
G
A
A
G
G
A
T
T
T
A
A
T
T
A
A
C
-
C
A
T
G
-
-
G
C
3
T
A
T
T
-
-
C
T
A
A
A
T
A
-
C
C
-
G
-
A
G
G
A
G
T
G
G
-
-
-
-
-
C
C
-
-
-
G
T
T
T
A
A
T
T
A
A
C