Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 748,270 (bp)   Positions: 419
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.051
.001
.021
.023
--
.028
.132
.019
.013
.012
.038
.11
.12
.19
.183
.047
.038
.018
.007
.005
.0
.0
.004
.031
.162
.059
--
.058
.006
.141
.046
.044
.023
.005
.005
.002
.006
.307
.014
.075
.031
.021
.001
.163
.148
.096
.057
.005
.022
.106
.099
.09
.039
.035
.066
.002
.002
.001
.001
.007
.001
.001
.004
.058
.134
.075
.022
.011
.013
.014
.045
.277
.073
.064
.214
.043
.007
.001
.001
.0
.002
.0
.0
.001
.006
.007
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.002
.037
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.166
.265
.336
.324
.328
.44
.465
.534
.269
.001
--
--
--
--
--
--
.098
.822
.001
.002
.0
--
.004
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.003
.0
.0
.001
.0
.0
.001
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.325
.051
.04
.043
.025
.039
.009
.001
.004
.001
.009
.002
.001
.0
.041
.045
.151
.077
.051
--
--
--
--
--
.002
.135
.003
.0
.012
.014
.001
.0
.0
.0
.003
.017
.017
.013
.019
.011
.002
.001
.001
.005
.005
.028
.014
.0
.001
.001
.001
.0
.001
.0
.002
.013
.049
.007
.016
.026
.013
.072
.042
.015
.014
.019
.049
.031
.069
.103
.055
.024
.003
.0
.0
.016
.02
.017
.019
.05
.305
.267
.001
.001
.001
.004
.031
.053
.14
.164
.049
.007
.001
.001
.004
.005
.006
.007
.05
.083
.055
.001
.001
.0
.001
.004
.005
.005
.0
.0
.002
.002
.002
.001
.005
.007
.006
.002
.002
.041
.045
.032
.063
.041
.021
.066
.067
.15
.015
.001
.0
.0
.005
.002
.001
.002
.003
.031
.02
.009
.065
.002
1.0
1.0
.998
1.0
.996
.007
.003
.001
.002
.026
.007
.004
.013
.0
.0
.003
.171
.002
.002
.027
.018
.979
.017
.004
.002
.008
.003
.011
.003
.006
.15
.039
.002
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.017
.104
.084
.48
.063
.097
.01
.006
.321
.005
.002
.04
.22
.091
.067
.062
.001
.0
.01
.013
.006
.006
.006
.001
.009
.001
.003
.013
.004
.026
.102
.097
.819
.631
Ptprn2
Ptprn2
Ptprn2
Ptprn2
Ptprn2
Ptprn2
Ptprn2
Ptprn2
Ptprn2
Ptprn2
Ptprn2
Ptprn2
Ptprn2
Ptprn2
Ptprn2
Ptprn2
Ptprn2
Ptprn2
Ptprn2
Ptprn2
Ptprn2
Ptprn2
Ptprn2
Ptprn2
Ptprn2
Ptprn2
Ptprn2
Ptprn2
Ptprn2
Ptprn2
Ptprn2
Ptprn2
Ptprn2
Ptprn2
Ptprn2
Ptprn2
Ptprn2
Ptprn2
Ptprn2
Ptprn2
Ptprn2
Ptprn2
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
-
-
-
-
T
A
C
T
A
C
A
A
A
C
C
C
C
A
A
G
T
T
A
G
T
G
9
-
A
C
A
-
-
-
-
-
-
-
C
2
G
T
-
-
-
G
G
G
-
-
C
T
G
-
-
A
-
C
G
-
-
-
C
-
A
G
T
C
-
-
C
2
-
C
C
3
G
G
G
C
C
-
T
G
-
-
-
-
-
-
-
-
T
-
-
-
-
C
C
G
T
A
T
T
C
G
-
A
C
C
T
C
T
C
T
G
A
T
G
A
C
C
A
G
G
A
G
A
G
C
C
G
15
2
G
-
2
-
-
-
2
C
A
-
-
A
A
A
A
-
G
C
T
C
T
-
-
T
C
T
G
G
G
A
-
G
-
G
A
2
C
G
G
G
G
C
C
C
C
C
C
C
T
C
G
C
C
C
G
G
T
A
T
G
A
G
G
C
G
T
2
A
T
2
-
A
-
C
-
4
T
A
G
C
-
-
G
A
C
G
-
A
-
C
A
-
C
C
A
C
-
C
G
G
C
T
G
C
C
2
C
3
2
4
C
T
A
T
T
A
-
3
T
-
2
2
4
3
G
C
C
T
3
-
-
C
G
2
4
A
T
2
A
C
2
-
-
-
G
-
C
A
C
-
-
G
3
C
G
C
A
T
C
2
T
-
-
-
C
T
G
G
C
C
T
-
C
T
C
C
C
3
-
T
A
T
T
A
C
A
T
G
G
2
2
-
C
T
T
A
T
-
A
C
-
-
T
-
-
T
G
-
C
C
T
A
-
-
-
-
-
-
G
A
A
4
-
G
C
41
A
G
G
G
G
G
C
C
G
C
A
-
A
2
A
T
G
C
A
T
G
A
G
T
C
G
A
C
T
C
G
A
G
-
-
-
G
T
T
T
C
A
G
T
C
3
C
C
C
-
C
C
10
G
C
5
-
-
G
  144,387,147
  144,392,251
  144,397,875
  144,397,880
  144,397,896
  144,414,212
  144,414,242
  144,414,277
  144,414,284
  144,414,301
  144,414,305
  144,414,311
  144,414,319
  144,414,325
  144,414,332
  144,414,338
  144,414,340
  144,414,384
  144,414,397
  144,429,280
  144,429,406
  144,429,668
  144,429,867
  144,430,374
  144,431,145
  144,431,277
  144,448,470
  144,465,070
  144,468,046
  144,468,068
  144,468,098
  144,470,970
  144,471,034
  144,471,147
  144,471,149
  144,471,172
  144,471,189
  144,471,230
  144,471,344
  144,471,348
  144,471,365
  144,471,367
  144,471,376
  144,471,386
  144,471,425
  144,471,448
  144,471,450
  144,471,477
  144,471,481
  144,471,506
  144,471,510
  144,471,514
  144,471,537
  144,471,576
  144,471,599
  144,471,664
  144,471,668
  144,471,686
  144,471,688
  144,471,697
  144,471,711
  144,471,712
  144,471,718
  144,471,800
  144,471,812
  144,471,833
  144,471,841
  144,471,856
  144,471,863
  144,471,865
  144,471,902
  144,471,924
  144,501,695
  144,508,381
  144,534,305
  144,534,408
  144,537,011
  144,537,022
  144,537,024
  144,537,035
  144,537,038
  144,573,026
  144,573,028
  144,573,031
  144,598,764
  144,598,771
  144,598,783
  144,598,794
  144,598,796
  144,598,807
  144,598,816
  144,598,819
  144,598,825
  144,598,877
  144,598,902
  144,598,909
  144,598,913
  144,598,929
  144,599,110
  144,599,181
  144,599,259
  144,599,270
  144,599,290
  144,599,457
  144,599,647
  144,605,702
  144,605,705
  144,605,742
  144,605,744
  144,605,765
  144,637,976
  144,638,373
  144,681,507
  144,681,516
  144,681,523
  144,681,530
  144,681,535
  144,681,543
  144,681,546
  144,681,552
  144,681,584
  144,761,459
  144,762,854
  144,762,912
  144,763,079
  144,763,260
  144,763,353
  144,763,354
  144,767,833
  144,767,838
  144,767,968
  144,768,156
  144,768,162
  144,768,325
  144,796,532
  144,799,559
  144,799,567
  144,799,573
  144,799,581
  144,799,584
  144,799,617
  144,799,656
  144,799,769
  144,799,784
  144,799,797
  144,799,805
  144,813,467
  144,813,582
  144,813,584
  144,813,586
  144,813,846
  144,813,849
  144,846,278
  144,846,282
  144,848,179
  144,848,205
  144,849,008
  144,849,032
  144,849,045
  144,849,067
  144,849,086
  144,849,153
  144,849,162
  144,849,192
  144,849,205
  144,849,238
  144,849,266
  144,849,270
  144,849,290
  144,849,294
  144,849,296
  144,849,299
  144,855,231
  144,855,233
  144,855,261
  144,855,340
  144,855,350
  144,855,392
  144,855,545
  144,855,550
  144,855,808
  144,855,816
  144,855,817
  144,855,819
  144,855,887
  144,855,889
  144,855,910
  144,855,916
  144,856,186
  144,856,189
  144,856,194
  144,856,198
  144,856,244
  144,856,248
  144,856,273
  144,856,276
  144,856,298
  144,858,386
  144,858,554
  144,858,558
  144,858,562
  144,858,569
  144,858,572
  144,866,365
  144,875,715
  144,875,727
  144,875,735
  144,875,749
  144,875,784
  144,875,800
  144,878,644
  144,912,013
  144,912,487
  144,929,516
  144,929,660
  144,929,691
  144,929,716
  144,929,736
  144,929,740
  144,929,764
  144,929,775
  144,936,661
  144,964,420
  144,970,487
  144,970,494
  144,970,497
  144,970,506
  144,970,509
  144,970,519
  144,970,520
  144,970,525
  144,970,532
  144,970,559
  144,970,565
  144,970,569
  144,970,572
  144,970,576
  144,970,580
  144,970,586
  144,970,589
  144,970,596
  144,970,605
  144,970,624
  144,970,635
  144,970,651
  144,970,658
  144,970,660
  144,970,670
  144,970,674
  144,970,677
  144,970,682
  144,970,698
  144,970,703
  144,970,718
  144,970,730
  144,970,734
  144,970,744
  144,970,752
  144,970,761
  144,970,767
  144,970,771
  144,970,776
  144,970,786
  144,970,794
  144,970,797
  144,970,809
  144,970,811
  144,970,825
  144,970,831
  144,970,853
  144,970,858
  144,970,862
  144,970,868
  144,970,872
  144,970,876
  144,971,150
  144,971,152
  144,971,160
  144,971,166
  144,971,182
  144,971,197
  144,971,198
  144,971,200
  144,971,204
  144,971,209
  144,971,218
  144,971,224
  144,971,235
  144,971,248
  144,971,267
  144,971,273
  144,971,280
  144,971,281
  144,971,288
  144,971,292
  144,971,312
  144,971,316
  144,971,318
  144,971,331
  144,971,341
  144,971,342
  144,971,349
  144,971,358
  144,971,361
  144,971,368
  144,971,381
  144,971,386
  144,971,393
  144,971,396
  144,971,417
  144,971,422
  144,971,434
  144,971,451
  144,971,481
  144,971,488
  144,971,489
  144,971,493
  144,971,508
  144,971,509
  144,971,519
  144,971,524
  144,971,549
  144,971,555
  144,971,558
  144,971,570
  144,971,583
  144,971,589
  144,971,591
  144,971,593
  144,971,599
  144,971,602
  144,971,616
  144,971,624
  144,971,625
  144,971,634
  144,971,639
  144,971,645
  144,977,548
  144,980,040
  145,002,734
  145,002,742
  145,002,750
  145,002,754
  145,002,795
  145,002,829
  145,007,129
  145,007,148
  145,014,360
  145,014,373
  145,014,381
  145,014,391
  145,027,367
  145,051,462
  145,052,268
  145,052,617
  145,053,610
  145,053,984
  145,053,987
  145,054,354
  145,055,047
  145,055,162
  145,055,688
  145,056,115
  145,056,454
  145,057,007
  145,057,013
  145,057,308
  145,057,810
  145,057,945
  145,058,008
  145,058,413
  145,058,793
  145,059,030
  145,059,037
  145,059,046
  145,059,153
  145,059,339
  145,059,663
  145,060,497
  145,060,896
  145,061,201
  145,061,224
  145,061,485
  145,061,588
  145,061,742
  145,061,774
  145,061,880
  145,062,518
  145,062,573
  145,062,631
  145,062,755
  145,062,857
  145,075,185
  145,075,197
  145,075,238
  145,075,239
  145,075,246
  145,075,252
  145,075,262
  145,075,264
  145,075,265
  145,075,280
  145,075,283
  145,079,796
  145,079,797
  145,079,808
  145,079,812
  145,079,814
  145,079,823
  145,079,833
  145,079,838
  145,079,840
  145,079,845
  145,079,856
  145,087,220
  145,090,942
  145,090,989
  145,101,182
  145,101,185
80
A/G
6
A
G
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
T
A
G
C
G
A
C
A
-
A
C
T
T
A
G
A
T
A
C
C
-
-
T
G
G
G
T
-
T
-
T
G
-
-
-
G
G
-
2
-
-
A
T
C
-
C
-
-
-
-
A
C
-
-
A
T
-
3/-
A
T
A
T
G
G
C
-
T
T
C
T
C
C
G
T
T/A
G
G
A
2
C/T
A
-
-
-
C
-
-
T
2
-
A
-
T/A
C/A
T/C
C/T
T/C
G/A
A/G
T/C
G/A
A/G
C/T
G
A/T
G/A
G/A
A/G
G/A
A/G
A
T
T
C
-
-
A
T
-
C
G
G
-
T
C
G
G
-
C
-
G
G
C
T
-
G
-
T
A
-
-
-
C
-
-
-
T
-
T
-
-
-
T
-
G/T
G/T
G/A
C/A
C/T
C/T
C/T
C/T
C/T
C/A
T/C
C/T
G/A
C/T
C/-
C/G
G/A
G/A
T/A
A/C
T/C
G/A
A/C
G/A
G/A
-
-
-
-
T
-
-
C
-
C
-
C
-
C
C
-
T
A
G
-
-
-
-
C
T
74
-
-
2
-
A
-
G
C
-
-
-
T
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
A
-
A
-
-
T
-
-
-
-
-
-
T
A
-
A
G
T
T
-
-
G
A
-
-
-
-
G
T
A
-
2
A
G
A
A
G
-
-
T
A
-
-
-
A
-
A
C/C
T
2
-
G
T
C
-
-
-
T
-
-
-
-
-
-
C
-
C
A
G/A
G
A
-
-
T
-
-
-
A
A
-
-
-
-
G
G
A
2
G
G
4
T
C
A
C
-
G
G
C
A
14
A
G
G
G
A
G
C
-
G
C
T
-
G
A
A
A
A
A
T
G
C
A
G
T
T
-
G
C
A
G
G
C
A
T
A
C
T
A
G
T
C
G
T
G
-
A
C
C
-
-
C
C
A
-
-
A
T
-
A
-
A
2
-
A
-
A
T
-
G
4
A