Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 81,239 (bp)   Positions: 234
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.0
.027
.0
.0
.003
.002
.0
.002
.0
.0
.008
.005
.053
.015
.001
.0
.022
.665
.027
.003
.019
.062
.0
.004
.008
.015
.008
.0
.004
.0
.004
.439
.357
.003
.201
.007
.033
.011
.006
.0
.0
.0
.0
.0
.005
.008
.003
.001
.001
.003
.025
.007
.001
.0
.0
.005
.002
.0
.0
.009
.001
.0
.0
.028
.0
.0
.001
.009
.002
.001
.001
.001
.002
.015
.0
.0
.001
.0
.002
.949
.0
.019
.077
.015
.009
--
--
--
--
.029
.348
.06
.003
.0
.012
.016
.025
.928
.79
.643
.0
.015
.006
.0
.008
.001
.0
.003
.052
.057
.012
.005
.0
.001
.001
.001
.001
.0
.006
.007
.006
.006
.002
.041
.01
.006
.005
.001
.003
.005
.002
.008
.019
.025
.09
.051
.035
.02
.035
.024
.003
.002
.005
.026
.006
.003
.002
.109
.01
.003
.122
.126
.04
.021
.037
.012
.018
.038
.196
--
--
--
--
--
--
.793
.007
.998
.0
.007
.003
.001
.0
.004
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.005
.008
.0
.0
.002
.004
.002
.0
.241
.0
.077
.108
.009
.01
.002
.003
.001
.003
.006
.007
.003
.002
.0
.0
.0
.0
.0
.005
.0
.0
.0
.0
.001
.002
.001
.0
.003
.001
.0
.0
.002
.0
.0
.001
.001
.0
.001
.0
.285
.001
.004
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Prmt8
Prmt8
Prmt8
Prmt8
Prmt8
Prmt8
Prmt8
Prmt8
Prmt8
Prmt8
Prmt8
Prmt8
Prmt8
Prmt8
Prmt8
Prmt8
Prmt8
Prmt8
Prmt8
Prmt8
Prmt8
Prmt8
Prmt8
Prmt8
T
T
C
G
A
10
A
G
C
7
C
T
-
-
G
G
A
A
T
C
A
G
A
C
C
T
A
G
A
C
-
2
T
A
T
G
G
C
G
A
G
T
4
C
C
T
T
A
-
A
T
C
4
A
T
C
T
C
G
G
G
A
A
G
-
G
T
G
G
G
2
T
8
C
G
A
A
G
2
-
T
T
A
-
G
C
C
A
G
T
-
A
T
T
C
C
4
C
-
G
C
G
5
G
G
A
G
G
C
C
G
G
-
T
-
G
G
C
G
3
G
T
A
T
C
-
T
C
A
A
T
-
-
-
A
-
-
C
A
G
G
A
-
-
2
T
A
A
T
C
A
T
2
2
2
-
G
C
3
-
-
G
-
-
16
2
28
G
C
T
T
A
G
8
G
G
-
-
-
C
-
A
C
2
2
-
-
7
G
G
3
A
G
A
T
A
C
C
3
G
-
4
G
T
A
-
A
G
2
G
T
A
-
C
C
A
A
T
T
C
G
G
C
C
-
C
C
A
-
-
2
T
A
T
  160,254,693
  160,255,600
  160,256,066
  160,256,282
  160,256,660
  160,262,786
  160,263,850
  160,263,997
  160,264,371
  160,264,450
  160,264,549
  160,264,862
  160,266,736
  160,266,780
  160,267,596
  160,268,893
  160,269,917
  160,270,010
  160,270,223
  160,271,211
  160,271,763
  160,273,869
  160,274,007
  160,277,676
  160,278,634
  160,279,030
  160,279,104
  160,279,197
  160,279,203
  160,279,380
  160,279,663
  160,279,934
  160,279,939
  160,280,196
  160,280,483
  160,280,704
  160,281,439
  160,282,354
  160,282,390
  160,282,414
  160,282,438
  160,282,455
  160,283,515
  160,283,846
  160,284,338
  160,285,597
  160,287,173
  160,289,007
  160,289,527
  160,291,505
  160,291,708
  160,291,715
  160,291,721
  160,292,839
  160,293,816
  160,295,575
  160,296,127
  160,297,504
  160,297,828
  160,298,875
  160,300,586
  160,301,322
  160,303,020
  160,307,397
  160,307,410
  160,307,411
  160,307,414
  160,307,424
  160,307,426
  160,307,427
  160,307,433
  160,307,436
  160,307,439
  160,307,448
  160,307,454
  160,307,455
  160,307,458
  160,307,460
  160,308,544
  160,308,818
  160,308,912
  160,308,964
  160,310,559
  160,310,623
  160,310,810
  160,311,039
  160,311,203
  160,311,301
  160,311,705
  160,312,160
  160,312,197
  160,312,321
  160,313,370
  160,313,446
  160,314,729
  160,315,150
  160,315,720
  160,315,757
  160,315,870
  160,316,152
  160,316,261
  160,316,317
  160,316,714
  160,317,486
  160,317,559
  160,317,811
  160,319,452
  160,320,263
  160,320,690
  160,320,691
  160,321,846
  160,322,150
  160,322,564
  160,323,538
  160,323,559
  160,323,605
  160,324,501
  160,324,553
  160,324,674
  160,325,020
  160,325,030
  160,325,031
  160,325,179
  160,325,189
  160,325,202
  160,325,207
  160,325,212
  160,325,218
  160,325,222
  160,325,227
  160,325,241
  160,325,246
  160,325,251
  160,325,255
  160,325,276
  160,325,285
  160,325,287
  160,325,293
  160,325,299
  160,325,305
  160,325,310
  160,325,323
  160,325,327
  160,325,337
  160,325,342
  160,325,351
  160,325,353
  160,325,385
  160,325,419
  160,325,425
  160,325,443
  160,325,447
  160,325,457
  160,325,466
  160,325,471
  160,325,505
  160,325,522
  160,325,590
  160,325,628
  160,326,112
  160,326,114
  160,326,123
  160,326,200
  160,326,224
  160,326,261
  160,328,569
  160,329,019
  160,329,793
  160,330,836
  160,330,940
  160,331,143
  160,331,184
  160,331,356
  160,331,531
  160,331,548
  160,331,554
  160,331,557
  160,331,566
  160,331,569
  160,331,575
  160,331,608
  160,331,611
  160,331,613
  160,331,622
  160,331,628
  160,331,634
  160,331,644
  160,331,648
  160,331,677
  160,331,683
  160,331,687
  160,331,697
  160,331,717
  160,331,723
  160,331,725
  160,331,734
  160,331,741
  160,331,745
  160,331,748
  160,331,755
  160,331,759
  160,331,762
  160,331,769
  160,331,773
  160,331,775
  160,331,783
  160,332,008
  160,332,009
  160,332,016
  160,332,025
  160,332,035
  160,332,049
  160,332,058
  160,332,068
  160,332,075
  160,332,088
  160,332,095
  160,332,106
  160,332,111
  160,332,118
  160,332,120
  160,332,124
  160,332,136
  160,332,141
  160,332,144
  160,332,156
  160,332,163
  160,332,164
  160,332,399
  160,332,400
  160,332,415
  160,333,827
  160,333,954
  160,334,379
C
C
-
A
G
-
C
A
G
-
G
G
T
8
-
A
-
G
C
T
C
A
G
T
T
C
G
C
C
T
2
-
G
C
C
T
A
T
A
G
A
A
-
T
T
C
C
C
119
C
-
-
-
G
C
C/-
C
T
A
A
A
G
C
T
2
A
-
A
-
A
-
A
-
A
A
T
T
T
-
2
C
A
G
G
A
T
G
-
A
G
A
G
A
C
T
T
-
T
4
C
T
A
-
C
T
G
-
A
T
T
A
A
4
C
AT/G
C
A
G
A
-
T
G
C
-
-
A
-
-
-
-
-
C
G
A
-
G
G
T
-
A
-
-
A
G
-
A
G
-
-
-
-
-
-
-
-
T
-
-
-
-/2
-/2
C
2
4
-
-
-
A
A
A
C
G
C
-
-
-
C
T
A/C
A
T/G
T
-
-
-
3
T
-
-
-
-
-
T
G
A
-
G
-
-
-
A
-
-
A
G
G
C
A
-
-
-
-
G
-
-
-
-
-
-
-
-
C
A
-
2
-
A
T
A
T
-
A
G
C