Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 1,189,984 (bp)   Positions: 451
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.002
--
.513
.147
.03
.005
.033
.003
--
--
--
.008
.002
.003
.001
.012
.002
.008
.003
.019
.0
.001
.002
.053
.086
.001
--
--
--
.006
.032
.291
.003
.012
.011
.001
.996
.987
.982
.965
.61
.729
.501
.502
.208
.027
.028
.0
.0
.0
.015
.024
.08
.09
.099
.114
.129
.133
.141
.125
.01
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
.031
.047
.035
.01
.014
.015
.096
.003
.0
.0
.052
.005
.0
.0
.0
.006
.967
.997
1.0
.968
--
.001
.146
.062
.009
.008
.089
.125
.068
.021
.278
.072
.012
.005
.004
.001
.001
.001
.0
.0
.001
.001
.001
.001
.0
.001
.0
.001
.001
.006
.013
.029
.017
.223
.363
.004
.012
--
--
--
--
.001
.001
.0
.012
.001
.007
.948
.0
.0
.003
.113
.111
.451
.542
.766
.124
.02
.006
.001
.035
.004
.003
.001
.001
.0
.001
.0
.001
.004
.005
.012
.036
.008
.006
.01
.01
.019
.001
.433
.49
.385
.378
.001
.001
.002
.001
.033
.012
.369
.966
.998
.56
.007
.007
.004
.001
.12
.265
.048
.006
.007
.004
.009
.009
.01
.005
.001
.001
.003
.002
.012
.019
.024
.008
.003
.001
.003
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.335
--
--
.008
--
.171
.002
.006
.002
.0
.001
.0
.0
.019
.012
.003
.101
.1
.039
.032
--
--
--
.003
.006
.129
.016
.07
.041
.003
.055
.003
.0
.002
.003
.0
.0
.0
.001
.001
.004
.003
.004
.0
.0
.0
.0
.001
.0
.001
.008
.0
.006
.005
.001
.0
.0
.0
.005
.004
.01
.001
.002
.0
.001
.0
.0
.008
.001
.001
.025
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.004
.018
.011
.001
.028
.085
.001
.001
.006
.001
.0
.0
.001
.002
.012
.006
.005
.001
.013
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.008
.008
--
--
--
.022
.015
.006
.051
.057
.033
.026
--
--
--
--
.001
.058
.253
.318
.581
.576
.257
.016
.014
.12
.101
.04
.107
.45
--
.99
1.0
.975
.979
.98
.989
.999
.986
.998
.973
1.0
.999
.999
.999
.889
.97
.996
.999
.998
.978
.978
.344
.512
.993
.999
.482
1.0
1.0
.997
.971
.932
.966
1.0
.993
.997
.976
.98
.715
.779
.969
.827
.996
.814
.29
.255
.663
.975
.41
.255
--
--
--
--
.003
.0
.073
.198
--
.0
.011
.015
.0
.001
.001
.0
.005
.033
.297
.023
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.021
.066
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
T
G
-
T
-
6
-
2
T
C
G
-
-
2
-
2
-
-
-
A
A
G
C
G
T
T
C
C
T
A
2
-
T
T
G
-
T
A
T
T
T
C
C
-
-
-
-
-
A
C
G
C
T
T
3
4
G
4
19
19
-
-
-
-
-
T
G
-
-
-
-
T
-
C
-
T
-
T
G
-
-
G
C
T
G
G
G
G
G
A
G
C
-
-
-
G
A
A
T
-
-
C
C
G
A
G
A
2
C
-
G
T
C
3
G
C
-
-
C
-
-
2
2
T
G
G
3
C
-
G
-
G
-
-
T
T
T
A
-
-
-
-
-
C
A
-
-
A
T
G
C
T
A
T
G
C
T
T
C
C
C
C
6
-
4
G
T
G
C
C
C
A
A
G
C
G
-
A
A
G
A
G
A
3
-
-
2
-
G
G
G
C
G
G
-
C
3
G
-
3
-
T
G
G
2
C
-
A
A
G
C
C
C
T
C
G
C
G
A
A
G
G
G
A
G
C
-
G
C
-
-
-
-
G
C
-
3
-
-
T
2
C
A
T
-
2
G
T
G
T
C
G
-
-
-
C
C
C
C
-
5
C
C
C
C
C
C
T
-
-
-
G
G
A
7
-
C
2
-
3
-
G
-
C
C
-
2
-
-
-
-
G
C
-
-
T
-
-
2
-
A
-
C
A
-
-
-
A
-
-
T
A
C
G
-
A
A
-
-
G
-
-
-
G
A
-
A
C
-
-
-
-
-
T
-
-
-
C
-
C
G
G
C
-
T
A
C
A
A
C
-
C
C
T
T
-
T
A
-
8
-
C
-
-
G
C
47
G
G
5
C
T
C
C
G
C
-
C
C
C
-
C
-
-
G
C
C
-
C
C
-
T
A
C
T
T
C
-
2
-
-
C
-
T
2
T
G
-
-
C
A
A
G
C
G
C
A
G
G
C
A
T
G
C
G
G
C
A
A
T
C
-
C
-
-
60
3
C
C
C
A
T
G
G
C
C
C
A
-
-
G
  48,880,607
  48,906,492
  49,009,139
  49,009,141
  49,009,148
  49,009,169
  49,009,177
  49,009,189
  49,053,009
  49,053,261
  49,053,270
  49,056,599
  49,056,706
  49,056,710
  49,056,740
  49,056,755
  49,056,761
  49,056,767
  49,056,811
  49,056,861
  49,072,559
  49,072,560
  49,072,578
  49,072,584
  49,072,590
  49,072,601
  49,101,844
  49,101,869
  49,101,877
  49,104,527
  49,110,610
  49,122,808
  49,122,837
  49,122,862
  49,122,876
  49,122,899
  49,123,370
  49,123,373
  49,123,378
  49,123,385
  49,123,395
  49,123,409
  49,123,415
  49,123,422
  49,123,441
  49,123,457
  49,128,552
  49,128,557
  49,128,560
  49,128,562
  49,128,567
  49,128,570
  49,128,583
  49,128,585
  49,128,587
  49,128,591
  49,128,596
  49,128,598
  49,128,603
  49,128,624
  49,128,646
  49,134,037
  49,134,056
  49,134,069
  49,134,073
  49,134,075
  49,134,076
  49,134,090
  49,134,103
  49,134,105
  49,134,145
  49,134,160
  49,134,172
  49,134,174
  49,134,178
  49,134,194
  49,134,216
  49,134,226
  49,134,236
  49,134,259
  49,134,265
  49,134,276
  49,134,285
  49,134,288
  49,134,297
  49,134,305
  49,134,312
  49,134,333
  49,134,344
  49,134,352
  49,134,369
  49,159,185
  49,165,895
  49,185,651
  49,185,656
  49,185,787
  49,185,790
  49,185,833
  49,185,843
  49,185,869
  49,185,874
  49,185,897
  49,186,414
  49,186,422
  49,186,433
  49,186,476
  49,186,548
  49,186,594
  49,186,617
  49,186,637
  49,186,641
  49,186,667
  49,186,679
  49,186,682
  49,186,687
  49,186,690
  49,186,701
  49,186,706
  49,186,711
  49,186,728
  49,186,729
  49,186,730
  49,186,745
  49,186,753
  49,186,789
  49,186,794
  49,200,920
  49,200,929
  49,200,969
  49,201,234
  49,201,294
  49,201,360
  49,203,844
  49,223,601
  49,223,605
  49,223,658
  49,223,696
  49,223,716
  49,223,745
  49,266,530
  49,266,531
  49,281,081
  49,288,392
  49,288,393
  49,291,881
  49,291,892
  49,291,910
  49,291,995
  49,292,042
  49,292,084
  49,292,177
  49,292,214
  49,292,218
  49,292,240
  49,292,249
  49,292,254
  49,292,259
  49,295,560
  49,297,463
  49,297,464
  49,297,719
  49,297,722
  49,297,729
  49,297,739
  49,297,752
  49,297,760
  49,297,762
  49,297,764
  49,297,768
  49,343,594
  49,343,637
  49,343,638
  49,343,643
  49,343,644
  49,343,658
  49,343,667
  49,343,670
  49,343,672
  49,343,688
  49,343,689
  49,343,693
  49,343,702
  49,343,717
  49,343,729
  49,435,958
  49,435,961
  49,435,964
  49,435,974
  49,435,997
  49,436,001
  49,436,009
  49,436,018
  49,436,019
  49,436,024
  49,436,043
  49,436,046
  49,436,049
  49,436,058
  49,436,063
  49,436,069
  49,436,078
  49,436,080
  49,436,085
  49,436,091
  49,436,107
  49,436,112
  49,467,703
  49,479,158
  49,499,536
  49,548,510
  49,565,449
  49,565,457
  49,565,458
  49,565,481
  49,565,759
  49,566,810
  49,566,901
  49,566,907
  49,566,975
  49,566,978
  49,567,008
  49,567,030
  49,567,044
  49,567,060
  49,568,477
  49,568,828
  49,592,099
  49,629,066
  49,629,116
  49,640,723
  49,654,997
  49,666,609
  49,670,715
  49,672,898
  49,676,359
  49,676,363
  49,676,425
  49,676,431
  49,676,432
  49,677,529
  49,677,532
  49,677,566
  49,677,606
  49,677,607
  49,677,641
  49,677,680
  49,677,716
  49,677,740
  49,677,793
  49,677,797
  49,677,803
  49,677,851
  49,683,157
  49,683,838
  49,683,854
  49,700,977
  49,701,022
  49,701,030
  49,701,038
  49,701,042
  49,701,044
  49,701,050
  49,701,052
  49,701,054
  49,701,056
  49,701,060
  49,701,064
  49,701,071
  49,751,597
  49,751,608
  49,751,610
  49,751,613
  49,751,616
  49,751,620
  49,751,623
  49,751,638
  49,751,658
  49,751,663
  49,751,667
  49,751,671
  49,751,685
  49,751,688
  49,751,690
  49,751,692
  49,751,723
  49,751,726
  49,751,732
  49,751,744
  49,751,745
  49,751,752
  49,751,762
  49,751,765
  49,751,766
  49,751,784
  49,751,786
  49,764,001
  49,789,490
  49,789,504
  49,789,509
  49,789,533
  49,789,537
  49,789,549
  49,789,557
  49,789,561
  49,789,579
  49,789,582
  49,789,586
  49,789,590
  49,789,597
  49,789,665
  49,789,700
  49,789,747
  49,789,766
  49,789,778
  49,789,805
  49,789,808
  49,789,824
  49,796,364
  49,800,286
  49,800,454
  49,800,519
  49,800,566
  49,800,625
  49,800,633
  49,800,737
  49,800,746
  49,800,761
  49,800,780
  49,800,787
  49,800,822
  49,800,828
  49,800,850
  49,801,347
  49,801,378
  49,801,382
  49,801,421
  49,801,441
  49,801,534
  49,801,589
  49,801,633
  49,801,645
  49,821,033
  49,821,036
  49,821,063
  49,821,087
  49,821,088
  49,821,160
  49,821,185
  49,821,246
  49,821,262
  49,821,311
  49,821,552
  49,822,773
  49,822,799
  49,822,825
  49,822,920
  49,822,944
  49,822,945
  49,822,982
  49,823,008
  49,825,928
  49,825,965
  49,825,993
  49,826,005
  49,832,885
  49,866,771
  49,885,016
  49,889,218
  49,889,225
  49,889,242
  49,889,249
  49,889,253
  49,889,343
  49,889,354
  49,889,357
  49,889,363
  49,889,367
  49,889,374
  49,889,384
  49,889,407
  49,889,414
  49,889,434
  49,889,437
  49,889,467
  49,889,479
  49,889,484
  49,889,513
  49,889,523
  49,889,594
  49,889,597
  49,889,654
  49,889,668
  49,889,687
  49,889,701
  49,889,702
  49,889,736
  49,889,739
  49,889,745
  49,889,761
  49,889,767
  49,889,984
  49,890,007
  49,890,017
  49,890,027
  49,890,121
  49,890,126
  49,890,138
  49,890,242
  49,890,255
  49,890,317
  49,890,326
  49,890,328
  49,890,367
  49,890,372
  49,890,395
  49,890,396
  49,890,400
  49,890,402
  49,890,421
  49,890,424
  49,895,756
  49,895,757
  49,896,175
  49,896,178
  49,915,364
  49,945,017
  49,945,024
  49,945,028
  49,945,033
  49,945,039
  49,945,040
  49,945,046
  49,952,304
  49,956,076
  49,956,081
  49,995,227
  50,009,417
  50,009,423
  50,038,056
  50,038,076
  50,038,083
  50,038,095
  50,038,096
  50,038,123
  50,038,132
  50,038,135
  50,038,148
  50,038,149
  50,040,422
  50,052,335
  50,061,007
-
A
6
-
C
-
C
-
T/C
C/T
G/T
T
C
-
G
-
A
G
G
-
-
C
A
A
A
A
C/G
C/A
T/G
A/-
2/-
A
-
A
-
A
-
-
-
-
-
-
-
A
A
C
A
2
-
T
T
T
C
C
-
-
C
-
-
-
4
6
G
G
T
G
T
T
T
G
T
-
G
-
G
-
G
-
-
C
G
T
T
G
-
-
T
-
-
-
-
G
A
A
G
A
C
-
-
C
C
-
-
-
-
-
-
-
-
C
C
-
-
-
C
-
T
A
-
T
A
-
-
-
-
-
-
-
A
-
A
-
C
T
-
-
G
-
T
3
G
C
-/A
C/A
-
A
C
-
G
-
-
-
-
-
-
-
-
A
G
A
T
-
-
C
-
T
G
T
-
-
G
C
G
T
A
-
G
T
C
A
-
-
-
-
C
T
-
G
A
-
-
-
T
-
T
T
-
-
2
-
G
C
C
T
-
-
T
G
A/-
T
C/T
C/A
C/T
T/A
C/G
A
A
A
A/G
A/G
G/T
G/A
G/C
A/G
G/A
C/T
2
-
-
21
C
6
9
-
-
A/T
-
T
2
-
-
-
T
C
A
-
-
-
-
G
-
-
T
T
2
A
A
T
G
5
-
G
A
T
A
T
G
A
A
7
C
-
-
-
-
G
-
-
2
-
2
A
C
-
-
A
-
C
2
2
2
A
A
A
A
-
4
A
-
2
-
G
-
G
G
G
3
-
G
T
-
-
-
-
C
-
-
2
C
-
C
G
A
-
-
G
-
A
A
C
G
C
A
A
4
3
C
A
C
A
-
-
-
T
-
C
T
-
-
-
G
-
G
-
-
T
-
C
T
-
T
T
G
G
-
T
-
-
T
-
T
-
-
-
T
-
T
-
-
-
T
-
T
G
T
-
-
T
-
-
T
-
-
T
C
G
T
C
-
5
2
-
C
-
-
-
-
T
T
A
-
-
-
-
A
G
-
T
-
-
T
A
-
T
G/A
T
T
T/G
-
C
T
A
T
A
A
-
-
-
C/T
C/T
A/C
T/A
G/A
G/C
C/T
C/A
C/A
A/G
2
4
-