Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 348,934 (bp)   Positions: 435
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.0
.028
--
--
--
.049
.0
.0
.021
.001
.001
.002
.001
.053
.074
.001
.003
.002
.002
.001
.0
.0
.612
.035
.005
.032
.077
.0
.002
.0
.0
.0
.001
.005
.0
.013
.014
.004
.102
.002
.0
.0
.0
.0
.0
.023
.002
.195
.119
.027
.387
.069
.0
.0
.052
.0
.0
.0
.001
.0
.026
.038
.998
.171
.002
.0
.0
.0
.025
.001
.008
.006
.005
.002
.001
.065
.003
.001
.006
.211
.56
.109
.001
.0
.012
.162
.0
.025
.043
.022
.001
.0
.003
.024
.156
.03
.04
.0
.0
.267
.01
.001
.001
.001
.001
.262
.0
.0
.182
.001
.006
.0
.002
.002
.001
--
.0
--
--
--
--
.001
.959
.017
.006
.009
.008
.001
.002
.002
.001
.004
.239
.257
.039
.0
.001
.006
.315
.041
.0
.004
.013
.01
.047
.001
.0
.0
.0
.02
.008
.01
.001
.881
.008
.183
.001
.014
.009
.015
.033
.032
.005
.0
.0
.001
.001
.056
.025
.061
.099
.0
.003
.0
.0
.0
.002
.0
.0
.0
.002
.979
.977
.018
.246
.019
.008
.835
.004
.113
.033
.289
.002
.003
.038
.001
.001
.0
.003
.847
.004
.0
.0
.003
.001
.001
.001
.131
.004
.001
.0
.006
.001
.006
.051
.001
.0
.0
.001
.016
.0
.093
.166
.0
.006
.0
.001
.0
.001
.003
.0
.002
.001
.0
.001
.011
.25
.259
.0
.003
.0
.016
.0
.002
.001
.161
1.0
.14
.266
.056
.0
.0
.001
.003
.0
.006
.0
.022
.006
.0
.008
.0
.0
.001
.009
.025
.001
.102
.124
.144
.0
.006
.141
.251
.03
.003
.106
.0
.021
.46
.009
.005
.001
.036
.001
.038
.048
.001
.014
.016
.0
.076
.0
.022
.005
.377
.0
.0
.001
.0
.0
.0
.0
.0
.059
.0
.0
.0
.003
.0
.0
.001
.0
.0
.0
.007
.002
.001
.034
.207
.052
.0
.0
.0
.001
.0
.003
.016
--
.478
.023
.004
.003
.003
.011
.032
.008
.104
.118
.0
.0
.008
.004
.0
.0
.0
.007
.102
.032
.007
.0
.0
.0
.001
.805
.102
.07
.74
.144
.174
.036
.118
.002
.0
.0
.002
.006
.0
.016
.024
.077
.004
.019
.018
.0
.0
.0
.004
.0
.001
.002
.001
.038
.001
.003
.0
.0
.0
.0
.019
.007
.001
.006
.021
.001
.004
.011
.002
.003
.029
.001
.0
.317
.082
.0
.024
.029
.001
.0
.0
.007
.0
.004
.003
.0
--
--
.001
.015
.088
.024
.004
.0
.014
.004
.0
.453
.0
.0
.014
.001
.002
.051
.05
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
LOC102551729
LOC102551729
LOC102551729
LOC102551729
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Ppil1
Ppil1
Ppil1
Ppil1
Ppil1
Ppil1
Ppil1
Ppil1
Ppil1
Ppil1
Ppil1
Ppil1
Ppil1
Ppil1
Ppil1
Ppil1
Ppil1
Ppil1
Ppil1
Ppil1
Ppil1
Ppil1
Ppil1
Ppil1
Ppil1
Ppil1
Ppil1
Ppil1
Ppil1
Ppil1
Ppil1
Ppil1
Ppil1
Ppil1
Ppil1
Ppil1
Ppil1
Ppil1
Ppil1
Ppil1
Ppil1
Ppil1
Ppil1
Ppil1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
A
A
A
A
T
C
A
C
T
G
T
T
T
C
T
A
T
G
A
C
T
A
A
G
C
G
C
G
C
C
T
C
G
G
G
G
A
A
A
C
T
C
C
A
G
G
C
G
T
A
C
A
G
C
C
T
A
C
C
C
G
T
C
T
C
G
A
C
G
G
T
T
C
T
G
A
A
C
A
C
C
C
G
T
C
A
T
A
C
C
A
C
T
T
T
C
C
T
A
T
C
A
A
C
G
G
T
C
G
T
A
T
A
C
C
A
A
A
G
C
T
T
T
C
A
C
C
G
G
A
A
G
C
A
A
C
G
T
C
C
C
C
T
T
C
G
A
G
G
G
A
G
C
G
C
C
C
T
T
T
T
T
T
A
A
G
T
C
G
A
G
A
G
C
T
C
C
T
T
T
C
T
G
A
G
T
C
T
G
A
G
T
G
A
T
T
C
T
T
G
C
C
A
A
C
T
G
G
G
A
C
A
A
C
C
A
T
T
C
C
A
A
T
C
G
C
A
G
A
G
G
C
G
A
C
C
A
A
C
A
C
G
A
A
G
T
T
T
A
T
G
G
T
G
T
C
T
G
A
T
T
C
C
C
C
G
A
G
G
G
A
C
C
G
G
C
G
A
C
A
G
G
G
G
T
T
G
C
C
C
C
A
C
A
T
T
C
C
A
T
A
C
C
G
A
G
C
G
G
T
G
A
A
C
G
T
A
C
T
G
C
A
G
T
G
G
C
T
C
A
T
C
A
A
T
G
T
G
T
G
C
G
A
T
C
G
A
T
G
G
T
A
T
A
A
G
A
C
C
A
C
A
T
G
A
C
A
C
A
T
C
T
A
A
G
C
A
A
A
T
G
C
T
G
A
T
C
C
G
C
A
T
C
G
C
G
G
G
C
T
A
G
G
T
A
C
C
A
T
T
C
C
G
A
C
T
T
G
G
A
C
T
T
A
T
T
G
G
A
T
A
G
T
A
A
  6,517,007
  6,518,047
  6,518,212
  6,518,263
  6,518,361
  6,519,099
  6,521,488
  6,521,489
  6,521,709
  6,522,174
  6,522,291
  6,522,403
  6,522,573
  6,522,625
  6,523,129
  6,523,350
  6,524,642
  6,526,151
  6,526,152
  6,554,237
  6,554,332
  6,554,791
  6,555,145
  6,555,221
  6,557,231
  6,557,329
  6,557,371
  6,557,427
  6,557,923
  6,558,665
  6,558,916
  6,558,936
  6,559,587
  6,559,942
  6,559,953
  6,561,596
  6,562,948
  6,563,238
  6,563,335
  6,565,815
  6,566,362
  6,566,391
  6,566,392
  6,566,879
  6,571,062
  6,573,169
  6,573,603
  6,575,302
  6,576,499
  6,576,965
  6,577,402
  6,577,760
  6,579,519
  6,580,680
  6,580,705
  6,580,795
  6,581,063
  6,581,236
  6,581,251
  6,581,339
  6,581,549
  6,581,559
  6,581,729
  6,581,963
  6,582,290
  6,582,432
  6,582,491
  6,582,988
  6,583,136
  6,583,312
  6,583,417
  6,583,779
  6,583,956
  6,584,101
  6,584,102
  6,584,673
  6,584,975
  6,585,253
  6,585,713
  6,585,834
  6,585,836
  6,586,143
  6,587,866
  6,587,877
  6,588,697
  6,588,838
  6,588,977
  6,589,005
  6,589,014
  6,589,068
  6,589,246
  6,589,845
  6,590,939
  6,591,026
  6,591,196
  6,591,564
  6,592,471
  6,593,164
  6,593,439
  6,593,906
  6,594,342
  6,594,992
  6,595,047
  6,596,294
  6,596,709
  6,597,093
  6,597,940
  6,599,143
  6,599,918
  6,600,573
  6,601,129
  6,601,361
  6,601,814
  6,601,953
  6,602,024
  6,602,854
  6,603,801
  6,604,959
  6,604,972
  6,605,393
  6,605,957
  6,606,917
  6,607,881
  6,609,019
  6,609,470
  6,609,676
  6,609,677
  6,609,869
  6,609,988
  6,611,335
  6,611,466
  6,611,747
  6,612,060
  6,612,684
  6,612,930
  6,613,320
  6,613,455
  6,614,737
  6,614,998
  6,615,103
  6,616,132
  6,617,964
  6,617,977
  6,617,980
  6,618,166
  6,618,525
  6,619,101
  6,619,102
  6,619,616
  6,620,281
  6,621,362
  6,621,687
  6,622,365
  6,622,536
  6,623,342
  6,623,521
  6,623,576
  6,623,832
  6,624,374
  6,625,004
  6,625,875
  6,626,426
  6,627,060
  6,627,826
  6,627,993
  6,628,332
  6,628,507
  6,630,997
  6,632,213
  6,632,215
  6,632,503
  6,634,389
  6,634,488
  6,635,153
  6,636,114
  6,637,255
  6,638,694
  6,639,849
  6,645,800
  6,646,538
  6,647,030
  6,647,701
  6,647,703
  6,647,901
  6,649,268
  6,649,592
  6,649,597
  6,649,887
  6,650,376
  6,650,652
  6,650,802
  6,650,983
  6,651,340
  6,651,406
  6,651,488
  6,651,524
  6,651,551
  6,651,700
  6,652,058
  6,652,128
  6,652,149
  6,652,379
  6,652,398
  6,653,626
  6,653,648
  6,653,792
  6,654,647
  6,654,959
  6,655,157
  6,655,342
  6,655,379
  6,655,402
  6,656,471
  6,656,528
  6,656,749
  6,656,993
  6,656,994
  6,656,996
  6,657,039
  6,657,085
  6,657,109
  6,658,680
  6,659,724
  6,660,951
  6,661,154
  6,661,633
  6,663,409
  6,663,578
  6,663,962
  6,664,294
  6,665,229
  6,666,483
  6,666,787
  6,667,072
  6,667,115
  6,667,166
  6,668,172
  6,668,173
  6,673,574
  6,673,803
  6,674,014
  6,674,369
  6,677,008
  6,677,482
  6,677,510
  6,682,934
  6,683,080
  6,689,301
  6,689,317
  6,690,256
  6,690,280
  6,690,652
  6,699,012
  6,700,083
  6,700,190
  6,701,327
  6,702,573
  6,703,134
  6,703,486
  6,704,913
  6,705,044
  6,705,472
  6,705,485
  6,706,373
  6,706,959
  6,707,346
  6,707,489
  6,707,728
  6,707,732
  6,707,736
  6,708,376
  6,708,917
  6,710,607
  6,710,697
  6,712,402
  6,717,211
  6,718,669
  6,719,290
  6,719,359
  6,721,666
  6,722,483
  6,723,009
  6,723,064
  6,723,075
  6,723,281
  6,723,806
  6,725,873
  6,727,743
  6,728,210
  6,728,508
  6,729,507
  6,729,772
  6,737,517
  6,738,610
  6,738,931
  6,739,303
  6,747,996
  6,748,291
  6,748,618
  6,748,878
  6,749,335
  6,749,361
  6,749,597
  6,749,798
  6,750,081
  6,750,145
  6,750,275
  6,750,277
  6,750,701
  6,750,747
  6,751,559
  6,751,592
  6,752,236
  6,752,237
  6,752,255
  6,752,263
  6,752,273
  6,752,326
  6,752,343
  6,752,369
  6,752,607
  6,753,205
  6,753,536
  6,753,749
  6,753,774
  6,754,123
  6,754,244
  6,756,177
  6,757,370
  6,758,655
  6,759,299
  6,759,995
  6,759,996
  6,760,021
  6,760,140
  6,760,188
  6,760,356
  6,760,461
  6,760,891
  6,761,067
  6,761,109
  6,761,227
  6,761,289
  6,761,385
  6,761,432
  6,761,609
  6,761,898
  6,762,077
  6,762,232
  6,762,326
  6,762,484
  6,762,820
  6,763,230
  6,763,763
  6,764,137
  6,764,878
  6,765,019
  6,765,032
  6,765,082
  6,765,148
  6,765,193
  6,765,909
  6,765,950
  6,766,354
  6,766,666
  6,767,306
  6,767,407
  6,767,589
  6,768,079
  6,768,534
  6,769,058
  6,769,128
  6,769,696
  6,769,698
  6,769,931
  6,769,994
  6,770,684
  6,771,171
  6,773,002
  6,774,018
  6,774,060
  6,774,438
  6,774,651
  6,783,237
  6,783,782
  6,784,337
  6,786,009
  6,787,867
  6,788,124
  6,792,118
  6,792,706
  6,793,682
  6,793,868
  6,794,207
  6,794,325
  6,794,350
  6,794,771
  6,795,177
  6,795,435
  6,796,957
  6,797,388
  6,798,768
  6,799,425
  6,799,451
  6,800,364
  6,804,750
  6,805,294
  6,805,524
  6,805,529
  6,805,636
  6,807,421
  6,811,155
  6,811,813
  6,812,881
  6,812,897
  6,814,673
  6,814,725
  6,815,293
  6,815,432
  6,815,964
  6,816,234
  6,816,531
  6,817,114
  6,817,174
  6,819,143
  6,819,825
  6,822,179
  6,822,196
  6,822,197
  6,822,267
  6,860,684
  6,860,905
  6,862,108
  6,863,220
  6,863,844
G
G
G
G
C
T
C
A
G
A
C
C
C
T
C
G
C
A
G
T
A
C
G
A
G
C
G
A
G
A
G
A
A
T
A
C
G
G
G
G
C
A
A
G
A
C
T
A
C
G
T
G
A
T
T
C
G
A
G
G
A
C
T
G
T
A
T
T
T
A
C
C
T
C
A
C
G
T
G
T
T
T
A
C
T
C
G
G
T
T
T
A
G
A
C
T
T
C
G
G
A
G
T
A
A
A
G
T
A
C
G
C
G
T
A
G
G
G
A
A
C
C
C
A
G
T
G
A
A
C
G
T
T
G
G
T
A
C
T
T
T
G
C
C
T
A
G
A
C
T
G
A
T
A
G
T
T
C
A
C
C
C
C
G
T
A
C
T
A
C
A
G
A
A
C
T
A
C
C
C
T
G
A
G
A
A
G
C
A
C
A
C
A
G
C
C
A
C
C
A
T
T
G
G
T
C
A
A
A
T
T
G
G
A
T
G
G
A
T
T
G
G
C
G
C
T
G
A
G
A
A
T
A
G
T
T
C
G
T
G
G
A
G
G
T
C
C
C
G
G
C
A
C
A
C
T
C
A
G
C
C
T
T
T
A
A
G
T
T
G/T
G
T
T
T
A
T
A
G
T
C
A
A
T
A
C
C
C
T
T
G
A
G
A
G
C
C
A
A
G
A
G
T
G
A
G
T
T
C
A
C
A
G
G
G
C
G
G
T
C
C
T
G
A
A
A
A
T
C
A
G
C
A
T
C
C
A
C
A
C
A
T
A
G
C
A
A
G
C
A
A
C
G
C
C
G
T
G
T
A
G
T
T
C
A
G
T
G
T
C
C
G
C
C
C
T
T
T
G
G
G
A
T
C
A
G
G
G
T
A
T
G
C
T
A
A
A
A
A
G
C
G
A
A
G
G
T
G
G
C
C
A
G
C
C
T
C
C
A
A
G
T
C
G
G
C
C
C
A
G
C
G
A
C
G
T