Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 68,081 (bp)   Positions: 377
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
--
.124
.546
.004
.0
.001
.0
.002
.0
.011
.001
.024
.01
.0
.013
.009
.0
.001
.047
.0
.0
.001
.007
.001
.0
.024
.006
.001
.1
.006
.324
.137
.019
.0
.001
.004
.013
.155
.112
.0
.015
.001
.0
.01
.0
.001
.314
.103
.035
.439
.0
.0
.0
.002
.003
.041
.001
.955
.115
.011
.0
.001
.034
.001
.228
.038
.0
.0
.001
.002
.001
.007
.0
.014
.033
.044
.015
.002
.0
.001
.009
.005
.001
.017
.049
.248
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.003
.035
.27
.064
.014
.001
.005
.015
.0
.0
.075
.031
.002
.001
.002
.006
.0
.003
.003
.004
.009
.058
.001
.0
.04
.041
.04
.007
.0
.001
.002
.001
.038
.032
.092
.001
.0
.0
.002
.0
.001
.017
.007
.0
.014
.002
.641
.412
.002
.03
.086
.05
.022
.003
.004
.001
.008
.007
.003
.013
.075
.019
.019
.001
.001
.023
.004
.0
.001
.001
.001
.002
.005
.003
.002
.001
.002
.099
.001
.0
.003
.003
.015
.0
.025
.029
.069
.019
.001
.0
.012
.001
.014
.001
.0
.001
.001
.001
.001
.084
.002
.0
.0
.0
.002
.004
.001
.001
.048
.009
.014
.001
.216
.15
.383
.0
.001
.009
.032
.094
.239
.0
.0
.037
.001
.001
.006
.002
.025
.0
.002
.0
.005
.002
.015
.061
.007
.001
.011
.002
.0
.001
.002
.0
.006
.001
.006
.0
.0
.002
.007
.047
.049
.02
.178
.058
.319
.012
.0
.2
--
--
.005
.101
.011
.31
.005
.194
.297
.0
.017
.01
.002
.017
.0
.025
.009
.12
.082
.0
.0
.002
.308
.0
.003
.001
.0
.006
.001
.001
.002
.008
.483
.001
.002
.009
.212
.0
.015
.0
.001
.001
.0
.0
.008
.0
.061
.207
.752
.0
.194
.0
.002
.0
.003
.617
.0
.0
.0
.0
.007
.0
.218
.006
.001
.0
.0
.0
.021
.002
.0
.001
.0
.047
.008
.001
.018
.046
1.0
.989
.991
.992
1.0
1.0
1.0
.472
.996
.997
.963
.995
.768
.004
Poc1a
Poc1a
Poc1a
Poc1a
Poc1a
Poc1a
Poc1a
Poc1a
Poc1a
Poc1a
Poc1a
Poc1a
Poc1a
Poc1a
Poc1a
Poc1a
Poc1a
Poc1a
Poc1a
Poc1a
Poc1a
Poc1a
Poc1a
Poc1a
Poc1a
Poc1a
Poc1a
Poc1a
Poc1a
Poc1a
Poc1a
Poc1a
Poc1a
Poc1a
Poc1a
Poc1a
Poc1a
Poc1a
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
T
G
-
G
T
G
A
A
A
G
-
T
G
T
T
A
T
C
G
T
C
C
C
A
G
G
C
T
A
2
A
A
A
C
A
C
T
C
C
G
G
C
G
G
G
C
T
T
C
A
C
G
G
A
C
T
C
A
A
A
C
21
A
-
G
G
-
A
G
G
-
-
-
-
-
-
-
C
A
G
-
2
C
A
T
A
G
-
C
T
-
C
C
C
-
T
-
-
G
A
-
A
T
T
T
T
T
A
T
-
C
C
-
-
-
2
A
2
G
G
T
A
C
C
-
-
-
-
T
C
-
A
-
-
T
G
A
-
A
-
T
-
2
T
G
G
A
C
-
-
-
-
G
A
-
-
-
-
T
-
-
C
C
T
-
-
G
2
-
G
-
-
-
-
-
-
C
C
T
T
G
-
A
C
G
2
-
A
-
C
-
-
A
T
T
-
C
-
G
A
-
G
C
-
G
-
-
-
-
G
-
-
T
-
-
A
G
-
-
-
G
T
A
-
-
-
T
-
C
-
-
G
G
-
-
-
T
-
-
-
T
-
-
-
-
-
T
C
T
T
-
T
-
-
-
G
A
-
-
G
-
A
G
A
-
-
-
A
G
-
G
-
G
G
C
-
-
-
C
-
-
C
C
T
T
2
4
G
T
A
C
T
T
A
C
T
T
C
A
C
G
-
C
C
-
T
T
G
T
C
C
G
G
A
C
C
A
T
T
-
T
89
2
G
A
G
G
A
G
T
-
3
A
C
20
A
A
A
T
-
-
G
A
T
A
T
C
19
-
A
A
G
G
-
A
2
-
T
2
-
-
-
A
-
6
-
C
-
C
-
T
-
G
T
C
C
C
  114,984,576
  114,985,154
  114,985,481
  114,985,623
  114,986,269
  114,986,626
  114,986,643
  114,986,672
  114,986,705
  114,986,749
  114,987,185
  114,987,336
  114,987,936
  114,988,040
  114,988,175
  114,988,405
  114,988,772
  114,989,025
  114,989,442
  114,990,215
  114,990,364
  114,991,417
  114,992,458
  114,992,519
  114,992,524
  114,992,873
  114,992,912
  114,993,066
  114,993,307
  114,993,500
  114,993,525
  114,994,023
  114,994,107
  114,994,333
  114,995,140
  114,995,236
  114,995,595
  114,996,045
  114,996,049
  114,996,510
  114,996,764
  114,997,803
  114,997,847
  114,998,020
  114,998,326
  114,998,448
  114,998,650
  114,999,215
  114,999,255
  114,999,298
  114,999,528
  114,999,530
  115,000,061
  115,000,927
  115,000,963
  115,001,129
  115,001,762
  115,002,283
  115,006,037
  115,007,038
  115,007,800
  115,007,961
  115,009,150
  115,009,315
  115,010,129
  115,011,417
  115,012,335
  115,012,336
  115,012,586
  115,012,588
  115,012,597
  115,012,634
  115,012,672
  115,012,704
  115,012,705
  115,012,719
  115,012,758
  115,012,891
  115,012,914
  115,012,929
  115,012,959
  115,012,979
  115,013,714
  115,014,561
  115,014,707
  115,015,087
  115,015,323
  115,015,336
  115,015,349
  115,015,355
  115,015,364
  115,015,372
  115,015,386
  115,015,390
  115,015,419
  115,015,424
  115,015,438
  115,015,452
  115,015,478
  115,015,483
  115,015,503
  115,015,509
  115,015,510
  115,015,520
  115,015,537
  115,015,542
  115,015,555
  115,015,562
  115,015,571
  115,015,584
  115,015,586
  115,015,605
  115,015,642
  115,015,645
  115,015,650
  115,015,653
  115,015,659
  115,015,698
  115,015,706
  115,015,719
  115,015,728
  115,015,747
  115,015,768
  115,015,772
  115,015,786
  115,015,942
  115,015,951
  115,015,967
  115,015,971
  115,015,974
  115,015,989
  115,015,993
  115,016,007
  115,016,063
  115,016,068
  115,016,087
  115,016,090
  115,016,102
  115,016,106
  115,016,110
  115,016,126
  115,016,131
  115,016,143
  115,016,150
  115,016,155
  115,016,161
  115,016,170
  115,016,192
  115,016,201
  115,016,208
  115,016,214
  115,016,217
  115,016,250
  115,016,265
  115,016,279
  115,016,280
  115,016,303
  115,016,322
  115,016,327
  115,016,342
  115,016,357
  115,016,364
  115,016,374
  115,016,380
  115,016,382
  115,016,385
  115,016,392
  115,016,399
  115,016,410
  115,016,421
  115,016,433
  115,016,463
  115,016,471
  115,016,482
  115,016,490
  115,016,497
  115,016,504
  115,016,509
  115,016,520
  115,016,529
  115,016,530
  115,016,541
  115,016,543
  115,016,624
  115,016,635
  115,016,647
  115,016,655
  115,016,662
  115,016,672
  115,016,676
  115,016,685
  115,016,688
  115,016,691
  115,016,692
  115,016,697
  115,016,701
  115,016,713
  115,016,725
  115,016,731
  115,016,732
  115,016,740
  115,016,768
  115,016,773
  115,016,795
  115,016,797
  115,016,808
  115,016,815
  115,016,825
  115,016,839
  115,016,872
  115,016,878
  115,016,889
  115,016,894
  115,016,901
  115,016,905
  115,016,931
  115,016,936
  115,016,945
  115,016,949
  115,016,953
  115,016,994
  115,016,995
  115,017,003
  115,017,030
  115,017,055
  115,017,062
  115,017,092
  115,017,096
  115,017,097
  115,017,111
  115,017,124
  115,017,128
  115,017,158
  115,017,201
  115,017,230
  115,017,248
  115,017,260
  115,017,271
  115,017,278
  115,017,341
  115,017,385
  115,017,392
  115,017,401
  115,017,446
  115,017,448
  115,017,459
  115,017,487
  115,017,488
  115,017,531
  115,017,555
  115,017,587
  115,017,594
  115,017,598
  115,017,607
  115,017,627
  115,017,642
  115,017,646
  115,017,670
  115,017,682
  115,017,701
  115,017,712
  115,017,722
  115,017,762
  115,017,798
  115,017,837
  115,017,844
  115,017,845
  115,017,847
  115,017,859
  115,017,865
  115,017,874
  115,017,876
  115,017,879
  115,017,887
  115,017,893
  115,017,918
  115,017,953
  115,017,961
  115,017,991
  115,018,000
  115,018,008
  115,018,783
  115,019,710
  115,019,771
  115,021,220
  115,021,385
  115,021,389
  115,021,528
  115,022,118
  115,023,001
  115,023,919
  115,023,931
  115,025,114
  115,026,029
  115,027,661
  115,027,784
  115,028,272
  115,029,589
  115,030,109
  115,030,129
  115,030,222
  115,030,727
  115,031,539
  115,032,034
  115,033,014
  115,033,282
  115,033,290
  115,033,567
  115,034,861
  115,035,379
  115,035,408
  115,035,660
  115,036,139
  115,036,913
  115,037,336
  115,037,348
  115,037,935
  115,038,955
  115,039,071
  115,039,242
  115,040,371
  115,042,039
  115,042,891
  115,042,951
  115,043,280
  115,043,307
  115,043,426
  115,043,430
  115,043,753
  115,043,788
  115,043,857
  115,044,110
  115,044,144
  115,044,850
  115,045,511
  115,045,710
  115,045,868
  115,046,095
  115,046,214
  115,047,200
  115,047,625
  115,047,790
  115,047,902
  115,048,418
  115,049,111
  115,049,591
  115,049,663
  115,049,674
  115,050,468
  115,050,476
  115,050,484
  115,050,485
  115,050,487
  115,050,500
  115,050,514
  115,050,516
  115,050,524
  115,050,561
  115,050,577
  115,050,589
  115,050,598
  115,050,607
  115,050,612
  115,050,638
  115,050,663
  115,050,671
  115,050,672
  115,050,677
  115,050,695
  115,050,708
  115,050,728
  115,050,736
  115,050,747
  115,050,754
  115,050,777
  115,050,811
  115,050,843
C
T
3
C
C
C
G
G
G
A
2
C
A
C
C
G
C
T
A
C
T
T
T
G
A
A
T
C
T
-
G
G
T
T
G
T
A
T
T
T
A
T
A
C
A
T
C
C
-
G
T
A
T
G
T
C
A
G
G
G
T
-
T
T
T
T
G
C
-
A
C
A
2
A
A
G
G
-
-
-
T
-
T
G
C
G
-
G
-
-
G
-
-
-
2
-
G
C
-
-
C
C
A
-
-
C
-
-
-
A
-
-
C
C
G
-
-
-
-
-
-
-
A
-
G
G
C
T
C
T
T
C
T
G
-
T
G
A
-
T
-
A
-
C
-
T
-
-
G
G
T
A
-
G
T
C
T
T
G
2
C
-
-
G
T
G
-
-
G
-
G
G
T
T
C
C
-
T
-
G
T
A
-
-
-
-
C
G
A
-
G
G
T
G
-
C
-
T
A
G
G
C
A
G
A
A
G
G
T
T
G
T
-
C
T
-
T
T
G
T
A
G
G
C
C
T
A
T
T
2
T
-
-
T
T
A
-
G
G
C
-
C
G
T
C
T
C
G
C
-
T
C
C
T
T
T
-
G
G
-
T
-
-
-
A
A
A
T
T/T
T
T
G
T
-
-
T
C
G
A
T
T
A
T
C
C
2/-
4/-
A
C
G
T
C
C
G
G
C
A
T
G
G
T
7
T
T
16
G
C
A
C
A
A
C
A
G
T
T
G
C
C
G
C
-
-
A
G
A
A
G
A
A
A
-
G
G
-
G
G
G
C
2
2
A
C
C
G
C
A
-
A
-
C
A
A
C
-
-
2
C
-
G
2
2
-
C
-
2
A
G
-
A
-
G
-
-
-
T
-