Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 197,206 (bp)   Positions: 595
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.003
.002
.0
.998
.0
.016
.022
.0
.0
.326
.0
.005
.0
.004
.0
.002
.002
1.0
.0
.0
.013
.0
.002
.0
.02
.004
.0
.0
.063
.001
.001
.0
.004
.004
.001
.0
.002
.0
.0
.001
1.0
.0
.001
.004
.0
.001
.001
.003
.001
.56
.642
.091
.037
.898
1.0
.0
.002
.0
.006
.002
.001
.015
.002
.0
.0
.002
.152
.01
.11
.029
.051
.002
.0
.0
.17
.001
.98
.0
.003
.998
.0
.001
.005
.18
.94
.0
.0
.0
.004
.001
.0
.009
.003
.003
.009
.0
.0
.001
.0
.001
.016
.003
.02
.0
.0
.0
.006
.003
.0
.063
.0
1.0
.793
.004
.036
.06
.006
.02
.001
.006
.0
.004
.0
.001
.0
.001
.002
.863
.224
.247
.0
.002
.009
.0
.024
.0
.005
.0
1.0
.0
.205
.271
.0
.0
.005
.998
.003
.0
.007
.005
.042
--
.016
--
--
--
--
--
--
--
.073
.069
.0
.053
.001
.001
.001
.0
.001
.001
.0
.0
.0
.0
.0
.023
.0
.001
.987
.153
.462
.708
.0
.959
.0
.029
.002
.008
.008
.002
.0
.0
.997
.0
.001
.004
.002
.347
.002
.027
.0
.0
.002
.0
.001
.01
.0
.002
.002
.0
.0
.0
.921
.694
.327
.001
.0
.148
.001
.025
.001
.0
.76
.812
.001
.0
.001
.005
.0
.098
.005
1.0
.001
.001
.0
.001
.0
.022
.009
.001
.161
.833
.033
.0
.0
.001
.0
.001
.0
.001
.0
.001
.0
.905
.193
.024
.0
.002
.0
.0
.003
.136
.282
.289
.258
.004
.07
.036
.043
.021
.085
.015
.013
.078
.024
.058
.031
.004
.006
.003
.001
.003
.004
.013
.001
.001
.998
1.0
1.0
.999
1.0
1.0
.955
.996
1.0
.062
.0
.0
.001
.0
.0
.088
.001
.009
.003
.013
.001
.0
.001
.003
.0
.0
.001
.002
.004
.0
.0
.001
.013
.004
.055
.13
.217
.004
.999
.992
.0
.154
.472
.471
.257
.426
.002
.015
.005
.0
.001
.012
.003
.002
.023
.113
.001
.0
.003
.074
.008
.002
.0
.001
.0
.0
.0
.018
.004
.015
.0
.321
.016
.894
.998
.989
.79
.789
.099
.029
.702
.938
.999
1.0
.992
.379
.054
.003
.022
.07
.004
.015
.064
.064
.0
.002
.001
.101
.001
.0
.001
.012
.296
1.0
.999
.0
.895
.982
.604
.997
.999
.006
.001
.002
.0
.004
.0
.002
.018
.0
.004
.0
.0
.0
.002
.001
.001
.002
.0
.008
.0
.005
.0
.0
.022
.051
.378
.001
.0
.007
.035
.001
.001
.04
.0
.0
.0
.022
.27
.961
.008
.0
.046
.0
.001
.041
.758
.178
.0
.0
.006
.002
.001
.063
.004
.023
.0
.304
.007
.0
.154
.0
.0
.001
.002
.001
.007
.483
.01
.013
.228
.0
.344
.082
.0
.01
.95
.003
.0
.0
.0
.01
.007
.039
.029
.029
.091
.001
.0
.001
.975
.157
.042
.155
.867
.0
.0
.0
.993
.004
1.0
.01
.001
.0
.978
.0
.001
.001
.253
.008
.001
.0
.0
1.0
.003
.0
.024
.585
.001
.0
.003
.063
.324
.0
.0
.0
.0
.215
.001
.799
.0
.0
.001
.0
.946
.003
.002
.005
.002
.0
.06
.094
.0
.001
.0
.0
.0
.0
.005
.0
.894
1.0
.988
.021
.0
.006
.002
.001
.0
.001
.19
.001
.001
.002
.028
--
--
--
.001
.061
.0
.001
.015
.021
.872
1.0
.001
.158
.005
.007
.001
.999
.116
.0
.002
.001
.0
.0
.001
.003
.0
.0
.018
.01
.0
.0
.248
.003
.0
Plxna2
Plxna2
Plxna2
Plxna2
Plxna2
Plxna2
Plxna2
Plxna2
Plxna2
Plxna2
Plxna2
Plxna2
Plxna2
Plxna2
Plxna2
Plxna2
Plxna2
Plxna2
Plxna2
Plxna2
Plxna2
Plxna2
Plxna2
Plxna2
Plxna2
Plxna2
Plxna2
Plxna2
Plxna2
Plxna2
Plxna2
Plxna2
Plxna2
Plxna2
Plxna2
Plxna2
Plxna2
Plxna2
Plxna2
Plxna2
Plxna2
Plxna2
Plxna2
Plxna2
Plxna2
Plxna2
Plxna2
Plxna2
Plxna2
Plxna2
Plxna2
Plxna2
Plxna2
Plxna2
Plxna2
Plxna2
Plxna2
Plxna2
Plxna2
Plxna2
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
A
C
T
A
G
-
-
-
T
A
T
G
C
C
-
G
G
T
C
T
C
G
-
-
A
G
A
C
G
-
2
-
-
2
A
T
-
C
A
A
G
A
T
-
C
A
G
G
A
A
C
A
-
T
C
C
G
G
A
G
A
C
5
T
-
A
C
4
C
C
A
G
A
G
C
C
T
C
G
A
G
C
-
-
-
T
A
-
-
-
A
-
T
C
T
C
A
T
A
G
A
G
T
A
C
T
-
C
T
G
C
T
G
C
6
C
C
G
G
A
C
A
C
C
A
T
T
G
C
A
T
C
A
G
-
A
-
T
A
T
C
A
G
A
T
T
C
C
T
A
T
G
T
T
C
T
T
C
-
T
T
-
A
C
C
A
T
A
G
-
T
A
C
C
A
G
2
T
10
2
2
C
C
C
2
G
A
A
A
G
T
G
-
T
A
G
A
A
G
T
T
C
A
A
G
G
A
G
A
T
-
A
C
A
-
T
C
G
T
-
G
C
T
4
T
T
G
A
C
G
G
A
T
G
-
G
A
A
C
T
A
-
A
C
-
T
C
T
T
-
T
G
A
G
A
T
G
G
C
C
A
-
G
G
T
-
A
15
G
A
-
-
T
-
A
-
G
A
-
2
2
-
21
T
-
-
A
-
A
-
A
C
T
C
-
2
A
G
T
-
C
A
C
C
-
T
-
A
T
6
-
-
G
-
C
T
2
2
C
C
T
2
G
C
G
T
T
2
T
C
T
C
T
T
G
C
T
G
G
C
-
-
G
-
T
-
-
A
G
C
C
A
G
G
-
T
G
-
G
T
G
T
C
G
-
G
G
T
T
T
G
G
-
T
-
2
G
A
-
-
2
A
G
-
T
C
2
-
-
-
C
T
G
-
-
T
T
A
A
T
-
A
G
A
-
-
-
C
A
-
G
G
-
-
G
G
C
T
-
G
A
2
C
-
C
-
2
G
G
-
C
C
G
-
-
A
-
C
C
-
G
-
T
T
T
T
T
C
C
A
2
A
C
G
C
C
T
C
C
-
C
A
T
G
A
T
-
T
10
G
T
G
T
3
T
9
C
25
2
C
C
C
8
C
A
3
-
G
3
C
C
G
A
G
T
T
A
A
C
T
A
C
G
C
A
C
C
C
A
A
T
A
-
T
T
G
2
-
A
C
-
G
T
C
A
T
G
T
T
C
A
T
A
A
T
A
A
A
G
T
A
G
T
T
C
A
G
C
G
A
A
A
G
C
A
C
C
G
4
G
C
C
G
C
-
C
G
21
G
T
A
-
C
-
G
C
C
T
-
G
T
-
C
C
T
A
-
T
T
19
T
T
A
T
G
  113,373,927
  113,374,470
  113,375,677
  113,375,899
  113,377,978
  113,378,597
  113,378,601
  113,380,097
  113,380,101
  113,380,127
  113,380,191
  113,382,357
  113,382,378
  113,382,705
  113,383,280
  113,383,290
  113,384,612
  113,385,501
  113,386,604
  113,387,727
  113,387,959
  113,388,152
  113,388,249
  113,388,255
  113,388,263
  113,388,300
  113,388,326
  113,388,353
  113,388,387
  113,388,395
  113,388,408
  113,388,413
  113,388,426
  113,388,463
  113,388,485
  113,388,514
  113,388,518
  113,388,545
  113,388,546
  113,390,319
  113,391,480
  113,393,010
  113,395,013
  113,396,175
  113,396,184
  113,396,256
  113,396,297
  113,396,302
  113,396,306
  113,396,721
  113,396,837
  113,396,890
  113,396,898
  113,397,267
  113,397,804
  113,398,396
  113,398,495
  113,398,526
  113,398,808
  113,399,349
  113,399,978
  113,400,293
  113,400,625
  113,401,138
  113,401,287
  113,401,364
  113,401,698
  113,401,750
  113,401,888
  113,402,049
  113,402,071
  113,402,299
  113,402,368
  113,402,379
  113,402,510
  113,402,719
  113,402,907
  113,403,189
  113,403,556
  113,403,721
  113,404,602
  113,404,712
  113,404,828
  113,404,835
  113,404,842
  113,404,926
  113,405,027
  113,405,035
  113,405,043
  113,405,055
  113,405,074
  113,405,082
  113,405,094
  113,405,127
  113,405,235
  113,405,853
  113,406,178
  113,406,315
  113,406,521
  113,406,758
  113,406,980
  113,407,055
  113,407,318
  113,407,712
  113,407,715
  113,407,786
  113,407,936
  113,408,756
  113,408,858
  113,409,062
  113,409,107
  113,409,298
  113,409,524
  113,410,008
  113,410,300
  113,410,329
  113,410,400
  113,410,498
  113,410,696
  113,410,787
  113,411,375
  113,411,651
  113,412,014
  113,412,019
  113,412,746
  113,412,947
  113,413,489
  113,413,672
  113,413,771
  113,413,772
  113,414,395
  113,414,482
  113,414,567
  113,415,190
  113,415,665
  113,415,690
  113,416,089
  113,416,171
  113,416,381
  113,416,432
  113,416,576
  113,416,586
  113,416,660
  113,416,739
  113,416,964
  113,417,718
  113,417,981
  113,418,209
  113,418,620
  113,418,752
  113,418,892
  113,419,321
  113,419,473
  113,419,612
  113,419,754
  113,419,845
  113,419,957
  113,420,002
  113,420,063
  113,420,712
  113,421,072
  113,421,859
  113,422,183
  113,422,289
  113,422,734
  113,422,763
  113,422,850
  113,422,909
  113,423,101
  113,423,194
  113,423,286
  113,424,781
  113,424,837
  113,424,936
  113,425,141
  113,425,291
  113,425,403
  113,425,406
  113,426,308
  113,426,436
  113,426,439
  113,426,444
  113,426,816
  113,427,007
  113,427,678
  113,428,051
  113,428,826
  113,428,945
  113,429,425
  113,429,726
  113,431,273
  113,431,288
  113,432,039
  113,433,022
  113,433,332
  113,433,513
  113,433,946
  113,434,485
  113,434,749
  113,434,805
  113,435,095
  113,435,775
  113,435,988
  113,435,992
  113,436,065
  113,436,898
  113,437,055
  113,437,108
  113,439,194
  113,440,109
  113,440,158
  113,440,562
  113,440,934
  113,441,112
  113,441,119
  113,441,343
  113,441,539
  113,441,931
  113,442,143
  113,442,576
  113,443,049
  113,443,069
  113,443,250
  113,443,254
  113,443,737
  113,443,793
  113,443,794
  113,444,263
  113,444,606
  113,445,585
  113,445,718
  113,445,838
  113,446,031
  113,446,058
  113,446,137
  113,446,888
  113,447,312
  113,447,532
  113,447,575
  113,447,634
  113,448,385
  113,448,455
  113,448,687
  113,448,714
  113,448,799
  113,449,074
  113,449,195
  113,450,104
  113,450,107
  113,450,563
  113,451,066
  113,452,328
  113,452,381
  113,452,509
  113,452,535
  113,452,705
  113,452,942
  113,453,794
  113,453,901
  113,454,364
  113,454,765
  113,456,022
  113,456,240
  113,456,256
  113,456,263
  113,456,310
  113,456,343
  113,456,353
  113,456,383
  113,456,400
  113,456,427
  113,456,442
  113,456,501
  113,456,522
  113,456,556
  113,456,636
  113,456,658
  113,456,746
  113,456,748
  113,456,767
  113,456,772
  113,456,776
  113,456,780
  113,456,804
  113,456,812
  113,456,833
  113,456,922
  113,456,961
  113,456,989
  113,457,008
  113,457,011
  113,457,015
  113,457,026
  113,457,055
  113,457,082
  113,457,117
  113,457,139
  113,457,140
  113,457,152
  113,457,160
  113,457,183
  113,457,194
  113,457,222
  113,457,226
  113,457,233
  113,457,255
  113,457,260
  113,457,265
  113,457,266
  113,457,270
  113,457,281
  113,457,289
  113,457,291
  113,457,297
  113,457,300
  113,457,306
  113,457,319
  113,457,323
  113,457,331
  113,457,347
  113,457,360
  113,457,366
  113,457,391
  113,457,406
  113,457,419
  113,457,427
  113,457,459
  113,457,484
  113,457,490
  113,457,506
  113,457,521
  113,457,539
  113,457,552
  113,457,562
  113,457,563
  113,457,567
  113,457,579
  113,457,589
  113,457,605
  113,457,632
  113,457,653
  113,457,660
  113,457,669
  113,457,695
  113,457,705
  113,457,716
  113,457,764
  113,457,773
  113,457,775
  113,457,793
  113,457,801
  113,457,802
  113,457,840
  113,457,890
  113,457,936
  113,457,957
  113,458,002
  113,458,038
  113,458,053
  113,458,127
  113,458,146
  113,458,156
  113,458,244
  113,458,247
  113,458,256
  113,458,259
  113,458,271
  113,458,276
  113,458,288
  113,458,297
  113,458,310
  113,458,342
  113,458,356
  113,458,372
  113,458,409
  113,458,456
  113,458,479
  113,458,490
  113,458,539
  113,458,546
  113,458,850
  113,458,861
  113,458,899
  113,458,918
  113,459,015
  113,459,037
  113,459,091
  113,459,099
  113,459,189
  113,459,202
  113,459,208
  113,459,235
  113,459,257
  113,459,298
  113,459,309
  113,459,327
  113,459,330
  113,459,382
  113,459,404
  113,459,410
  113,459,422
  113,459,426
  113,459,526
  113,459,537
  113,459,579
  113,459,587
  113,459,592
  113,459,676
  113,459,689
  113,459,693
  113,459,703
  113,459,706
  113,459,722
  113,459,728
  113,459,791
  113,459,795
  113,459,806
  113,459,837
  113,459,855
  113,459,858
  113,459,878
  113,459,884
  113,459,912
  113,459,931
  113,459,937
  113,459,941
  113,459,949
  113,459,960
  113,459,964
  113,459,971
  113,459,997
  113,460,028
  113,460,041
  113,460,049
  113,460,070
  113,460,116
  113,460,183
  113,460,191
  113,460,197
  113,460,234
  113,460,268
  113,460,314
  113,460,320
  113,460,331
  113,460,336
  113,460,337
  113,460,353
  113,460,354
  113,461,094
  113,461,243
  113,461,425
  113,463,482
  113,463,885
  113,464,234
  113,464,345
  113,465,097
  113,465,223
  113,465,447
  113,465,629
  113,465,898
  113,466,895
  113,466,896
  113,467,752
  113,468,430
  113,468,564
  113,470,463
  113,470,968
  113,471,932
  113,472,118
  113,472,256
  113,472,758
  113,472,763
  113,473,211
  113,473,761
  113,473,765
  113,474,014
  113,474,073
  113,474,492
  113,474,709
  113,474,732
  113,474,736
  113,474,740
  113,474,756
  113,476,040
  113,476,057
  113,477,811
  113,478,466
  113,478,534
  113,478,967
  113,479,614
  113,480,827
  113,481,721
  113,482,059
  113,482,334
  113,485,754
  113,486,377
  113,488,059
  113,488,312
  113,488,539
  113,490,564
  113,491,849
  113,491,967
  113,492,541
  113,493,299
  113,495,160
  113,498,790
  113,499,385
  113,499,773
  113,501,137
  113,502,934
  113,503,569
  113,504,867
  113,505,481
  113,507,276
  113,508,528
  113,508,529
  113,509,292
  113,509,761
  113,511,231
  113,511,430
  113,511,935
  113,512,742
  113,513,554
  113,513,946
  113,515,323
  113,515,993
  113,516,797
  113,516,818
  113,517,457
  113,518,083
  113,518,649
  113,519,062
  113,520,331
  113,520,335
  113,520,393
  113,521,066
  113,521,874
  113,522,575
  113,522,780
  113,522,858
  113,522,871
  113,524,891
  113,525,094
  113,525,136
  113,525,414
  113,525,584
  113,525,762
  113,525,951
  113,526,053
  113,526,264
  113,526,540
  113,526,648
  113,526,857
  113,527,703
  113,528,050
  113,528,392
  113,528,741
  113,528,942
  113,529,088
  113,530,319
  113,530,432
  113,530,592
  113,530,605
  113,530,611
  113,530,721
  113,531,062
  113,532,007
  113,532,009
  113,532,144
  113,532,149
  113,532,739
  113,533,431
  113,536,236
  113,539,376
  113,539,642
  113,539,957
  113,540,007
  113,541,024
  113,542,647
  113,543,490
  113,544,883
  113,547,426
  113,548,713
  113,550,827
  113,551,870
  113,553,371
  113,555,281
  113,555,664
  113,556,888
  113,556,890
  113,559,416
  113,559,810
  113,566,000
  113,568,750
  113,569,691
G
T
C
G
A
G
18
C
G
G
C
A
T
T
T
-
A
C
T
C
T
A
A
T
-
-
-
-
-
G
-
A
A
-
-
-
G
A
C
G
A
G
-
A
A
-
-
-
-
G
A
T
2
C
T
T
C
A
-
A
-
T
-
A
A
-
G
-
T
T
G
C
G
T
T
G
C
A
A
G
A
A
A
A
T
A
-
G
G
G
-
2
-
-
-
T
G
G
G
T
G
A
G
G
G
C
A
T
A
C
G
C
A
T
-
T
T
-
A
T
T
C
T
G
G
C
A
A
T
G
C
A
G
A
T
C
C
C
T
C
A
G
C
G
C
A
A
T
A
C
A
A
-
C
T
C
C
T
T
C
C
10
G
A
T
G
G
G
A
C
C
G
G
T
C
A
-
G
-
-
-
T
A
A
-
T
G
G
C
C
C
C
A
C
T
T
G
T
A
C
A
A
G
G
A
A
C
A
G
C
T
T
T
T
A
C
A
A
C
6
A
T
G
-
G
C
A
G
T
A
A
G
C
A
T
A
C
G
G
C
-
3
G
T
C
C
A
G
C
2
A
T
G
A
G
-
A
A
G
T
G
G
-
-
-
G
G
-
-
-
G
G
-
A
-
G
-
G
A
-
-
3
-
-
G
G
-
G
-
G
-
-
G
-
A
-
G
A
-
A
-
-
T
T
3
-
C
T
C
-
2
G
-
G
-
-
-
-
G
-
-
-
-
A
-
-
-
-
-
T
G
-
-
G
T
-
C
-
-
-
A
G
-
2
-
T
2
G
A
-
A
C
-
-
A
C
C
C
C
-
-
-
-
T
C
-
-
-
-
-
-
-
A
-
T
-
-
-
A
A
-
-
-
T
C
-
-
C
G
T
-
-
-
G
C
-
-
-
G
C
G
-
-
-
C
G
A
-
-
5
-
-
C
C
T
-
-
-
T
T
-
-
-
T
-
C
-
-
-
C
-
-
-
T
A
-
T
-
-
T
C
T
-
-
-
C
C
T
T
-
-
G
A
A
T
A
C
T
G
G
T
G
A
A
G
C
A
C
-
A
A
A
A
-
C
-
T
-
-
G
G
G
-
A
T
-
A
A
-
T
A
A
G
A
G
-
G
-
T
A
G
-
A
A
T
A
T
T
G
G
-
G
3
G
C
T
-
C
G
T
4
A
C
T
-
A
A
C
C
T
C
C
C
T
G
C
G
G
T
C
G
A
C
C
T
G
T
T
A
G
T
C
A
T
G
T
T
A
-
A
T
G
A
T
6
A
-
-
A
C
G
T
A
4
A
T
T
C
-/8
T
C
A
T
T
C
G
A
C
-
-
C
-
G
C
A