Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 197,437 (bp)   Positions: 482
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.074
.023
.024
.004
.0
.002
.001
.001
.014
.001
.01
.074
.248
.1
.141
.129
.0
.001
.007
.127
.067
.088
.101
.011
.188
.047
.079
--
.016
.0
.02
.0
.008
.086
.002
.001
.0
.006
.003
.001
.008
.0
.003
.0
.031
--
--
.001
.001
.002
.012
.003
.007
.01
.002
.238
.106
.001
.0
.024
.008
--
.048
.079
.285
.27
.242
.022
.16
.0
.002
.001
.017
.01
.001
.004
.014
.0
.001
.0
.005
.0
.001
--
.002
.0
.0
.001
.08
.044
.005
.025
--
--
--
--
--
.064
.033
.018
.031
.012
.025
.001
.004
.064
.001
.001
.001
.454
.033
.008
.029
.002
.002
.003
.001
.001
.0
.001
.0
.0
.479
.419
.417
.122
.195
.0
.022
.735
.0
.0
.005
.0
.993
.226
.786
.0
.002
.0
.001
.028
.0
.123
.665
.01
.0
.512
.147
.115
.038
.005
.004
.001
.001
.001
.0
.423
.002
.048
.0
.0
.006
.004
.0
.0
.001
.003
.0
.0
.0
.001
.011
.005
.076
.148
.0
.001
.003
.0
.002
.01
.008
.049
.025
.03
.007
.02
.004
.0
.0
.03
.347
.0
.005
.101
.002
.001
.001
.008
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.012
.011
.003
.477
--
.038
.039
.007
.01
.009
.039
.001
.098
.0
.001
.0
.011
.006
.002
.001
.149
.001
.001
.039
.002
.02
.005
.0
.001
.048
.0
.0
.796
.0
.0
.002
.0
.001
.031
.017
.022
.006
.0
.0
.006
.019
.039
.002
.018
.022
.034
.0
.014
.024
.003
.208
.002
.071
.067
.001
.0
.0
.014
.052
.006
.001
.001
.001
.0
.012
.0
.001
.0
.208
.089
.015
.012
.012
.005
.465
.0
.003
.0
.95
.015
.0
.006
.006
.802
1.0
.977
.001
.005
.012
.001
.001
.022
.002
.001
.0
.0
.001
.005
.001
.041
.011
.0
.015
.001
.06
.0
.0
.009
.001
.0
.0
.028
.0
.0
.0
.0
.0
.001
.001
.0
.06
.0
.002
.965
.0
.004
.678
.008
.017
.006
.002
.009
.018
.012
.0
.002
.0
.001
.001
.016
.076
.011
.0
.014
.002
.094
.0
.034
.008
.0
.015
.001
.003
.001
.001
.001
.0
.005
.105
.137
.04
.008
.059
.017
.0
.0
.0
.0
.003
.005
.002
.363
.006
.0
.019
.015
.075
.005
.005
.001
.001
.022
.003
.226
.002
.27
.988
.608
.024
.013
.001
.087
.001
.0
.002
.002
.0
.01
.75
.001
.006
.001
.0
.012
.347
.0
.033
.0
.051
.023
.0
.013
.005
.017
.006
--
--
.039
.021
.0
.0
.053
.001
.001
.003
.0
.011
.054
.765
.012
.051
.401
.135
.239
.026
.0
.142
.102
.199
.003
.002
--
.014
.022
.012
.005
.024
.017
.006
.002
.001
.002
.007
.001
.001
.005
.002
.012
.011
.002
.0
Pld1
Pld1
Pld1
Pld1
Pld1
Pld1
Pld1
Pld1
Pld1
Pld1
Pld1
Pld1
Pld1
Pld1
Pld1
Pld1
Pld1
Pld1
Pld1
Pld1
Pld1
Pld1
Pld1
Pld1
Pld1
Pld1
Pld1
Pld1
Pld1
Pld1
Pld1
Pld1
Pld1
Pld1
Pld1
Pld1
Pld1
Pld1
Pld1
Pld1
Pld1
Pld1
Pld1
Pld1
Pld1
Pld1
Pld1
Pld1
Pld1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
C
A
C
T
A
T
G
T
T
A
C
C
C
A
T
A
G
A
A
T
T
C
C
G
A
C
G
C
T
C
G
A
T
T
A
G
A
A
C
C
C
G
T
G
C
T
T
T
A
A
T
T
C
C
C
T
C
T
C
T
C
T
C
T
G
A
T
T
G
C
C
C
G
G
G
T
G
T
G
C
A
C
G
T
T
T
C
A
C
T
T
T
C
A
G
C
T
T
T
G
G
G
C
G
G
G
C
G
T
A
G
C
G
A
T
C
T
A
G
G
T
G
G
G
G
T
T
T
A
T
G
G
G
A
T
A
A
G
C
C
C
C
G
C
T
A
T
G
T
T
T
T
A
A
C
G
T
A
A
C
A
G
A
G
C
C
C
G
C
T
T
T
G
C
T
C
T
A
T
T
C
C
C
A
A
T
T
C
C
G
C
T
T
T
T
T
G
G
C
C
C
A
A
A
C
G
A
G
A
C
A
G
C
G
C
G
A
C
T
A
G
T
G
T
T
C
A
A
T
G
C
T
A
A
C
A
T
A
T
A
A
G
A
C
C
T
T
C
G
G
A
G
C
T
A
A
A
T
G
T
T
T
A
A
C
T
G
C
G
C
G
G
G
G
T
G
T
A
C
C
T
A
C
C
G
T
G
C
A
T
G
C
T
C
A
A
A
A
C
A
C
A
C
T
A
T
T
G
G
T
C
A
A
A
T
C
T
T
G
T
G
C
C
T
G
A
A
A
A
C
C
C
A
T
G
C
C
G
C
T
C
C
T
A
A
T
C
C
C
G
T
G
T
G
G
T
A
T
A
C
T
G
T
A
T
C
G
T
G
T
C
A
T
T
A
T
C
T
A
T
A
G
A
A
A
A
G
A
T
T
A
C
C
T
C
C
T
G
C
C
A
G
T
C
G
G
T
T
G
A
T
A
T
T
T
A
C
A
A
A
T
A
G
C
C
G
C
G
C
C
A
C
C
C
C
A
G
G
T
G
T
G
G
C
C
C
A
C
C
A
C
A
G
C
G
C
C
T
T
A
G
T
T
G
C
C
G
C
A
C
A
C
G
A
C
G
A
A
C
A
C
G
  113,652,121
  113,652,599
  113,652,728
  113,653,377
  113,653,380
  113,653,571
  113,654,010
  113,654,244
  113,654,308
  113,654,438
  113,654,793
  113,654,879
  113,654,934
  113,655,058
  113,655,146
  113,655,181
  113,655,315
  113,657,851
  113,658,021
  113,658,037
  113,658,084
  113,658,142
  113,659,023
  113,659,257
  113,659,469
  113,659,513
  113,659,829
  113,660,128
  113,660,447
  113,660,622
  113,660,856
  113,661,152
  113,661,162
  113,662,767
  113,663,134
  113,665,077
  113,666,315
  113,667,409
  113,668,107
  113,668,185
  113,669,078
  113,670,037
  113,670,083
  113,670,453
  113,670,807
  113,671,516
  113,672,209
  113,672,440
  113,672,962
  113,674,090
  113,674,362
  113,674,723
  113,674,817
  113,674,982
  113,675,361
  113,675,901
  113,675,970
  113,677,282
  113,678,281
  113,679,480
  113,679,879
  113,679,942
  113,680,621
  113,683,270
  113,683,927
  113,684,282
  113,685,805
  113,686,095
  113,687,139
  113,687,356
  113,687,452
  113,687,586
  113,687,591
  113,687,757
  113,688,696
  113,688,996
  113,689,214
  113,689,368
  113,691,651
  113,692,099
  113,692,528
  113,692,933
  113,693,037
  113,693,859
  113,694,743
  113,696,476
  113,696,534
  113,696,614
  113,696,976
  113,698,062
  113,701,507
  113,705,361
  113,705,482
  113,705,782
  113,706,116
  113,706,550
  113,707,395
  113,707,419
  113,707,600
  113,708,086
  113,708,670
  113,708,856
  113,710,017
  113,712,757
  113,712,762
  113,712,770
  113,712,793
  113,716,708
  113,716,772
  113,716,946
  113,717,285
  113,717,868
  113,718,027
  113,718,347
  113,719,079
  113,719,700
  113,720,356
  113,720,618
  113,720,723
  113,724,906
  113,725,991
  113,726,292
  113,727,147
  113,727,769
  113,730,561
  113,730,615
  113,730,663
  113,730,829
  113,731,325
  113,731,345
  113,731,346
  113,732,067
  113,732,425
  113,732,989
  113,733,528
  113,733,594
  113,733,943
  113,737,440
  113,737,899
  113,738,359
  113,739,821
  113,740,287
  113,740,827
  113,740,888
  113,741,128
  113,742,359
  113,742,808
  113,743,127
  113,745,529
  113,745,943
  113,745,951
  113,746,084
  113,746,092
  113,746,509
  113,746,576
  113,746,606
  113,746,662
  113,746,804
  113,746,886
  113,746,930
  113,747,121
  113,747,722
  113,747,950
  113,747,992
  113,748,228
  113,748,471
  113,748,578
  113,748,622
  113,748,667
  113,748,682
  113,748,773
  113,749,146
  113,749,221
  113,749,366
  113,749,594
  113,749,785
  113,749,786
  113,749,791
  113,749,908
  113,749,918
  113,750,006
  113,750,373
  113,750,604
  113,750,723
  113,750,857
  113,750,950
  113,751,185
  113,751,563
  113,751,776
  113,751,941
  113,752,093
  113,752,138
  113,752,162
  113,752,464
  113,752,567
  113,752,668
  113,752,702
  113,752,759
  113,752,897
  113,753,017
  113,753,039
  113,753,090
  113,753,762
  113,753,811
  113,753,848
  113,753,869
  113,753,883
  113,753,886
  113,753,892
  113,753,933
  113,754,022
  113,754,084
  113,754,115
  113,754,235
  113,754,309
  113,754,421
  113,754,806
  113,754,889
  113,754,942
  113,754,964
  113,755,174
  113,755,243
  113,755,244
  113,755,421
  113,755,525
  113,756,086
  113,756,433
  113,757,443
  113,757,480
  113,757,599
  113,757,615
  113,758,022
  113,758,725
  113,759,177
  113,759,262
  113,759,534
  113,759,690
  113,759,775
  113,760,154
  113,760,225
  113,760,230
  113,760,310
  113,760,409
  113,760,419
  113,760,562
  113,760,787
  113,760,826
  113,761,046
  113,761,302
  113,761,375
  113,761,467
  113,761,544
  113,762,718
  113,762,769
  113,762,825
  113,762,864
  113,762,910
  113,763,148
  113,763,239
  113,763,405
  113,764,086
  113,764,108
  113,764,233
  113,764,298
  113,765,006
  113,765,080
  113,765,096
  113,765,590
  113,765,684
  113,765,715
  113,765,744
  113,766,072
  113,766,177
  113,766,487
  113,766,597
  113,768,116
  113,768,131
  113,768,557
  113,769,984
  113,770,010
  113,770,344
  113,770,645
  113,771,055
  113,771,607
  113,771,676
  113,771,942
  113,772,245
  113,772,294
  113,772,435
  113,772,533
  113,772,951
  113,773,556
  113,773,565
  113,774,294
  113,775,069
  113,777,012
  113,778,714
  113,778,764
  113,778,996
  113,779,515
  113,779,651
  113,780,009
  113,780,213
  113,780,547
  113,780,754
  113,780,861
  113,780,879
  113,781,890
  113,781,991
  113,782,921
  113,782,928
  113,784,049
  113,784,712
  113,784,833
  113,785,443
  113,785,882
  113,786,125
  113,786,141
  113,786,375
  113,786,521
  113,786,944
  113,786,993
  113,787,047
  113,787,668
  113,788,525
  113,788,762
  113,789,083
  113,789,174
  113,789,235
  113,789,347
  113,789,451
  113,789,456
  113,789,708
  113,789,798
  113,789,862
  113,789,864
  113,789,898
  113,789,933
  113,790,085
  113,790,259
  113,790,383
  113,790,515
  113,790,719
  113,790,722
  113,791,107
  113,791,285
  113,791,681
  113,792,336
  113,792,485
  113,792,523
  113,792,589
  113,792,617
  113,793,036
  113,793,569
  113,793,634
  113,794,669
  113,794,732
  113,795,137
  113,795,782
  113,796,281
  113,797,043
  113,797,136
  113,797,567
  113,797,749
  113,797,959
  113,798,025
  113,798,324
  113,798,696
  113,798,736
  113,798,743
  113,798,915
  113,798,926
  113,798,966
  113,799,123
  113,799,146
  113,799,285
  113,799,312
  113,800,450
  113,801,108
  113,801,333
  113,801,368
  113,801,444
  113,801,502
  113,801,622
  113,801,638
  113,802,836
  113,802,838
  113,803,180
  113,803,272
  113,803,410
  113,803,780
  113,804,643
  113,804,853
  113,805,374
  113,805,827
  113,806,808
  113,806,810
  113,806,836
  113,807,004
  113,807,414
  113,807,471
  113,807,722
  113,808,416
  113,808,570
  113,809,061
  113,810,079
  113,810,604
  113,810,705
  113,811,091
  113,811,429
  113,811,653
  113,812,055
  113,812,206
  113,812,464
  113,812,527
  113,813,643
  113,813,705
  113,813,746
  113,813,976
  113,814,033
  113,814,181
  113,814,490
  113,814,516
  113,815,700
  113,820,277
  113,820,806
  113,820,885
  113,822,319
  113,823,366
  113,824,249
  113,824,440
  113,824,794
  113,825,052
  113,825,119
  113,825,780
  113,830,383
  113,831,550
  113,831,738
  113,832,375
  113,832,954
  113,833,268
  113,833,293
  113,833,321
  113,833,573
  113,833,700
  113,833,725
  113,833,871
  113,834,067
  113,834,070
  113,834,203
  113,834,400
  113,834,403
  113,834,449
  113,834,500
  113,834,505
  113,834,689
  113,834,818
  113,835,133
  113,835,151
  113,835,199
  113,835,234
  113,835,349
  113,835,882
  113,836,041
  113,836,585
  113,837,575
  113,838,127
  113,838,201
  113,838,234
  113,839,566
  113,840,557
  113,840,591
  113,840,826
  113,840,880
  113,842,012
  113,842,766
  113,844,958
  113,847,972
  113,848,707
  113,848,743
  113,848,762
  113,848,984
A
G
T
C
C
C
A
C
A
G
T
C/T
T
G
G
A/G
A
G
C
C
T/G
T
T
C
G
T
T
T
G
G
A
G
C
C
G
A
G
G
A
T
A
A
C
A
T
C
C
C
G
G
C
C
A
A
G
C
A
C
T
T/G
T
T/G
T
C
T
G
C
C
A
T
T
T
A
A
A
C
A
C
A
G
G
T
A
C
A
C
T
G
T
G
C
C
T
C
A
T
C
T/C
C
A
G/A
C
T
A
C
C
A
A
C
G
A
T
A
G
A
T
C
G
G/A
T
G
C
C
A
C
C
C
G
A/G
C
A
A
A
T
C
A/G
G
A
T
G
T
T
A
T
G
G
A
T
C
C
C
A
G
G
T
A
C
G
G
G
T
C
G
A
T
G
T
A
T
C
C
C
T
A
C
A
C
G
C
C
G
G
T
G
G
G
A
T
C/G
A
G
C
G
C
G
C
A
A
T
A
T
G
C
C
A
A
G
A
G
C/T
T
A
G
A
T
A
G
T
C
G
A
C
A
C
C
T
G
G
G
A
T
C
G
G
G
T
A
G
C
G
T
A
G
T
A
C
C
A
A
C
C
A
T
C
G
G
G
C
A
C
C
C
G
G
T
C
A
T
T
T
T
A
A
A
C
T
C
G
A
A
C
G
T
T
A
C
A
T
C
A
T
T
C
A
G
G
G
G
A
G
T
C
T
A
G
C
C
T
G/A
G
A
G
G
C
T/C
T
G
C
A
A
A
T
T
C
A
G
G
G
G
T
T
T
G
C
A
A
T
A
T
C
G
T
C
G
G
A
T
T
T
A
A
A
C
T
A
C
G
C
G
G
C
A
G
G
C
A
A
G
A
G
A
G
C
A
G
C
C/A
C
T
C
G
A
G
C
C
G
T
G
C
C
T
C/A
T
T/C
T
T
C
A
A
T
G
A
C
G
A
T
T/G
C
A
G
C
C
G
C
C
C
T
T
T
G
C
T
T
T
T
A
T
T
T
T
G
T
A
C/T
T
A/G
A
A
C
T
G
C
A
T
T
T
G
A
T
G
T
G
A
T
G/A
G
T
G
C
C
A
C
G
A
A
T
A
C/T
A/G
T
C
G
A
C
T
T
T
G
G
T
T
T