Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 257,936 (bp)   Positions: 329
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.004
.0
.001
.003
.025
.054
.01
.001
.0
.002
.002
.002
.001
.0
.001
--
--
--
--
.226
.505
.562
.596
.815
.88
.494
.235
.001
.002
.044
.017
.014
.028
.016
.024
.01
.026
.06
.221
.251
.252
.381
.359
.655
.023
.008
.014
.018
.015
.016
.127
.123
--
--
--
--
--
--
--
--
.011
.061
--
--
--
--
--
.069
.001
.001
.191
.006
.029
.0
.001
.001
.0
.01
.004
.002
.0
.097
.104
.001
.0
.017
.006
.002
.001
.046
.05
--
--
--
--
.057
--
--
--
--
--
--
.003
.005
.001
.001
.001
.029
.027
.048
.039
.026
.038
.044
.005
.003
.007
.003
.006
.005
.001
.001
.001
.004
.001
.02
.0
.001
.006
.006
.032
.029
.028
.036
.059
.007
.009
.414
.703
.011
.007
.013
.018
.003
.001
.124
.142
.101
.061
.066
.261
.384
.326
.06
.04
.023
.065
.032
.017
.001
.001
.001
.0
.015
.027
.004
.012
.062
.081
.044
.018
.008
.023
.014
.004
.008
.012
.013
.008
.02
.044
.06
.074
.054
.056
.056
.053
.345
.005
.001
.002
.001
.002
.006
.006
.019
.012
.012
.026
.043
.015
.011
.003
.003
.005
.005
.012
.018
.181
.057
.04
.421
.001
.009
.016
.006
.001
.001
.006
.002
.021
.066
.419
.221
.513
.621
.037
.011
.016
.054
.059
.029
.007
.082
.558
.639
.599
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.011
--
.002
.001
.002
.006
.007
.004
.006
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.002
.092
.028
.001
.637
1.0
.002
.012
.033
.009
.001
Phex
Phex
Phex
Phex
Phex
Phex
Phex
Phex
Phex
Phex
Phex
Phex
Phex
Phex
Phex
Phex
Phex
Phex
Phex
Phex
Phex
Phex
Phex
Phex
Phex
Phex
Phex
Phex
Phex
Phex
Phex
Phex
Phex
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
A
C
G
G
G
C
-
G
T
T
G
C
T
C
A
A
T
G
G
C
T
T
T
-
T
T
C
-
C
G
C
T
-
A
G
2
T
C
T
A
A
T
G
G
G
A
C
-
-
T
A
-
G
-
T
C
G
T
G
-
-
A
-
C
-
4
-
A
T
-
-
G
C
-
C
-
-
A
-
G
C
-
-
-
C
A
-
T
-
A
A
G
C
C
G
-
G
C
G
A
T
A
G
C
G
T
A
2
C
C
G
C
C
C
C
4
G
G
2
-
A
T
2
C
C
3
G
C
3
-
C
2
2
A
4
A
T
T
C
C
2
6
2
C
C
G
C
T
2
G
14
G
C
G
C
3
G
G
C
C
2
-
C
A
C
2
3
15
9
3
C
G
2
2
G
G
G
5
4
G
2
G
C
G
C
G
4
A
2
T
G
C
G
-
3
A
G
C
C
G
A
C
T
C
C
2
-
C
C
C
A
-
T
-
3
G
A
G
T
2
2
C
G
-
5
C
-
A
-
-
A
A
-
-
C
2
C
G
A
C
C
-
A
-
T
A
-
C
T
-
-
G
A
-
A
A
A
C
T
A
C
C
C
-
2
C
T
2
T
T
C
C
T
-
-
A
2
C
C
T
A
T
-
T
G
G
T
A
-
-
C
T
-
C
T
-
A
2
G
4
C
-
2
G
C
A
-
-
-
A
C
T
C
G
A
C
A
-
G
G
-
4
-
C
G
A
A
G
-
  40,463,131
  40,463,134
  40,463,139
  40,463,140
  40,463,144
  40,463,148
  40,463,153
  40,463,174
  40,463,183
  40,463,191
  40,463,202
  40,463,204
  40,463,211
  40,463,231
  40,463,728
  40,469,903
  40,478,766
  40,481,392
  40,481,394
  40,506,800
  40,506,813
  40,506,824
  40,506,827
  40,506,834
  40,506,850
  40,506,861
  40,506,870
  40,506,883
  40,506,888
  40,506,922
  40,506,927
  40,506,929
  40,506,942
  40,506,950
  40,506,954
  40,506,961
  40,506,968
  40,506,975
  40,506,993
  40,507,010
  40,507,017
  40,507,041
  40,507,045
  40,507,060
  40,507,116
  40,507,119
  40,507,128
  40,507,140
  40,507,144
  40,507,145
  40,507,162
  40,507,174
  40,507,184
  40,507,202
  40,507,205
  40,507,207
  40,507,215
  40,507,239
  40,507,243
  40,507,265
  40,507,297
  40,507,319
  40,509,636
  40,509,640
  40,509,642
  40,509,653
  40,509,679
  40,509,766
  40,509,800
  40,509,802
  40,509,823
  40,509,881
  40,509,886
  40,509,938
  40,509,963
  40,509,968
  40,509,984
  40,509,987
  40,510,006
  40,510,032
  40,510,047
  40,510,125
  40,510,133
  40,510,159
  40,510,166
  40,510,184
  40,510,192
  40,510,202
  40,510,211
  40,526,333
  40,526,335
  40,531,238
  40,531,242
  40,531,474
  40,531,791
  40,544,167
  40,546,059
  40,546,072
  40,546,077
  40,546,079
  40,546,093
  40,546,100
  40,566,382
  40,566,384
  40,566,505
  40,566,513
  40,566,515
  40,567,797
  40,567,802
  40,567,805
  40,567,817
  40,567,822
  40,567,824
  40,567,826
  40,567,840
  40,567,845
  40,567,920
  40,567,928
  40,567,932
  40,567,939
  40,567,941
  40,567,942
  40,567,949
  40,567,974
  40,567,977
  40,567,986
  40,567,992
  40,567,999
  40,568,009
  40,568,018
  40,568,026
  40,568,034
  40,568,038
  40,568,040
  40,568,047
  40,568,063
  40,568,064
  40,568,072
  40,568,102
  40,568,118
  40,568,122
  40,568,135
  40,568,147
  40,568,165
  40,568,167
  40,568,178
  40,568,191
  40,568,193
  40,568,208
  40,568,217
  40,568,229
  40,568,254
  40,568,265
  40,568,275
  40,568,278
  40,568,281
  40,568,298
  40,568,302
  40,568,308
  40,568,329
  40,568,332
  40,568,335
  40,568,339
  40,568,345
  40,568,349
  40,568,361
  40,568,367
  40,568,455
  40,568,477
  40,568,488
  40,568,497
  40,568,502
  40,568,523
  40,568,528
  40,568,535
  40,568,545
  40,568,550
  40,568,552
  40,568,564
  40,568,570
  40,568,577
  40,568,581
  40,568,586
  40,568,591
  40,568,593
  40,568,596
  40,568,599
  40,593,959
  40,595,801
  40,595,808
  40,595,816
  40,595,818
  40,595,824
  40,595,827
  40,595,831
  40,595,841
  40,595,843
  40,595,845
  40,595,852
  40,595,861
  40,595,864
  40,595,865
  40,595,870
  40,595,871
  40,595,891
  40,595,897
  40,595,907
  40,595,911
  40,610,970
  40,617,207
  40,617,208
  40,622,550
  40,631,666
  40,631,674
  40,631,890
  40,631,905
  40,631,917
  40,631,918
  40,631,926
  40,631,930
  40,631,936
  40,631,942
  40,631,953
  40,631,971
  40,632,012
  40,632,025
  40,632,059
  40,632,069
  40,632,076
  40,632,079
  40,632,090
  40,632,098
  40,632,108
  40,632,111
  40,632,130
  40,632,137
  40,632,143
  40,638,877
  40,638,884
  40,638,888
  40,638,901
  40,638,908
  40,646,624
  40,646,633
  40,646,643
  40,646,647
  40,646,654
  40,646,655
  40,646,664
  40,646,667
  40,646,684
  40,646,688
  40,646,693
  40,646,713
  40,646,740
  40,646,763
  40,646,773
  40,646,776
  40,646,801
  40,646,828
  40,646,829
  40,659,285
  40,659,300
  40,659,305
  40,659,316
  40,659,326
  40,659,328
  40,661,235
  40,667,287
  40,671,699
  40,684,932
  40,684,935
  40,687,317
  40,687,323
  40,687,328
  40,687,351
  40,687,391
  40,689,634
  40,689,643
  40,689,671
  40,689,674
  40,689,681
  40,689,703
  40,689,711
  40,689,723
  40,689,735
  40,689,751
  40,689,773
  40,689,782
  40,689,784
  40,689,788
  40,689,816
  40,689,854
  40,689,866
  40,689,873
  40,689,882
  40,689,895
  40,689,918
  40,689,941
  40,689,946
  40,689,951
  40,689,969
  40,689,973
  40,689,998
  40,690,009
  40,690,017
  40,690,048
  40,690,056
  40,690,062
  40,690,077
  40,690,080
  40,690,090
  40,690,094
  40,690,108
  40,690,127
  40,690,146
  40,690,157
  40,690,167
  40,703,458
  40,703,482
  40,703,484
  40,703,487
  40,703,507
  40,703,541
  40,717,950
  40,717,951
  40,717,962
  40,717,966
  40,717,976
A/G
C/G
G/C
G/A
G/T
C/T
C/A
G/T
T/C
T/A
G/A
C/T
T/C
C/A
T
G
T/C
G/A
G/T
-
-
-
-
G
-
-
-
T
-
-
T
C
A
G
-
-
-
T
-
-
-
-
-
-
-
-
-
T
2
G
-
G
-
G
-
G
T
-
-
T
T
-
A
G
G
-
G
-
A
T
A
T
A
A
-
T
A
-
C
-
G
A
T
G
-
-
T
-
G
T
C
G/T
C/G
T
G/A
C
G/T
C/G
G/A
A/G
T/A
A/C
T
-
A
A
T
-
-
-
-
-
G
-
-
-
-
-
-
C
C
A
-
-
-
-
-
-
-
A
-
-
-
T
-
T
G
-
-
-
-
-
-
-
G
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
2
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
G
T
G
T
G
-
G
A
A
-
-
T
A
C
A
-
-
T
T
T
C/A
A/G
3
C
C
-
-
G
A
-
-
-
-
-
G
-
A
C
-
A
A
-
-
G
T
-
-
-
C
-
-
-
A
C
T
-
-
A
A
C
2
T
-
-
C
-
-
-
-
-
T
A
T
-
T
-
-
-
-
C
-
T
T
G
A
A
-
-
-
-
A
T
-
A
-
-
-
-
-
C
A
-
-
A
-
-
T
-
-
-
-
T
A
-
-
-
-
T
A
C
-
-
-
-
-
-
-
-
A
T
T
4
-
T
-
A
T
-
-
T/T