Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 464,459 (bp)   Positions: 575
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.007
.0
.008
.097
.0
.041
.104
.006
.027
.002
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.706
.143
.019
.017
.022
.0
.993
.187
.18
.156
.126
.068
.007
.138
.073
.039
.032
.016
.0
.003
.001
.005
.008
.011
.019
.018
.009
.01
.048
.106
.195
.162
.056
.032
.012
.132
.072
.04
.038
.028
.067
.667
.979
.993
.997
.997
.998
.983
.003
.011
.01
.024
.003
.029
.179
.005
.713
.459
.185
.017
.029
.016
.065
.204
.458
.996
.694
.122
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
1.0
.997
.998
.017
.0
.0
.001
.001
.001
.007
.009
.021
.019
.004
.004
.001
.003
.045
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.996
.996
.954
.942
.923
.746
.835
.888
.871
.955
.979
.989
.948
.905
.919
.012
.008
.001
.006
.003
.003
.005
.002
.004
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.452
.552
.453
.188
.007
.054
.222
.213
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.002
.007
.011
.04
.157
.125
.001
.001
.001
.001
.002
.004
.16
.444
.529
.001
.156
.377
.126
.042
.001
.001
.015
.001
.003
.221
.539
.014
.011
.019
.007
.016
.015
.058
.472
.45
.047
.063
.029
.016
.382
.434
.816
.849
.869
.522
.277
.111
.97
.5
.477
.582
.879
.639
.473
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.006
.001
.001
.0
.001
.46
.016
.016
.137
.142
.129
.083
.0
.006
.019
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.031
.02
.0
Pepd
Pepd
Pepd
Pepd
Pepd
Pepd
Pepd
Pepd
Pepd
Pepd
Pepd
Pepd
Pepd
Pepd
Pepd
Pepd
Pepd
Pepd
Pepd
Pepd
Pepd
Pepd
Pepd
Pepd
Pepd
Pepd
Pepd
Pepd
Pepd
Pepd
Pepd
Pepd
Pepd
Pepd
Pepd
Pepd
Pepd
Pepd
Pepd
Pepd
Pepd
Pepd
Pepd
Pepd
Pepd
Pepd
Pepd
Pepd
Pepd
Pepd
Pepd
Pepd
Pepd
Pepd
Pepd
Pepd
Pepd
Pepd
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Cox7a1
Cox7a1
Cox7a1
Cox7a1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Pdcd5
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
-
G
A
C
A
G
G
C
T
C
A
A
C
T
G
G
T
C
A
A
G
C
G
C
C
A
G
A
G
T
C
C
A
T
T
A
T
T
G
C
-
A
C
G
A
A
A
A
A
A
G
G
T
T
T
C
C
A
-
T
T
-
-
T
2
-
C
-
A
T
T
-
-
-
A
C
A
-
G
C
T
C
-
2
G
C
G
T
T
G
-
C
T
-
C
T
A
-
C
T
-
-
C
T
T
A
C
G
T
A
G
G
C
A
G
G
G
G
2
C
2
-
2
G
G
2
T
C
3
G
T
G
T
A
-
T
-
2
C
C
-
3
-
-
C
C
T
-
T
T
-
A
-
-
-
-
-
-
-
G
T
G
T
-
-
C
T
T
-
G
2
-
-
T
-
G
C
G
2
T
G
G
G
G
C
2
G
G
G
2
-
A
G
G
T
T
T
G
G
G
A
A
A
T
G
T
T
T
T
G
2
C
G
-
C
A
A
C
-
A
T
-
C
A
C
A
C
-
-
T
T
A
-
A
A
2
A
C
C
C
T
G
G
G
C
C
C
G
A
-
C
A
A
-
2
C
G
C
A
C
G
G
-
-
-
-
G
A
G
A
C
G
C
G
-
G
G
G
T
G
-
C
G
G
C
-
T
-
G
C
2
C
-
-
C
G
-
-
G
2
C
T
-
G
G
G
A
-
-
G
C
A
C
-
-
-
6
C
G
-
-
G
G
T
C
G
-
2
T
G
A
A
T
G
-
-
-
A
-
C
T
C
C
G
G
A
T
C
2
C
G
2
G
C
3
-
-
-
C
-
A
G
C
C
C
-
-
-
-
A
C
T
C
T
C
G
2
A
T
-
-
C
T
C
2
G
T
C
-
T
-
A
C
G
T
-
-
T
T
C
C
A
G
T
T
A
C
2
A
C
A
C
G
2
T
-
-
T
-
C
A
T
C
T
A
2
-
T
C
T
T
-
T
C
-
-
-
-
-
3
3
-
T
A
3
G
T
-
-
C
-
-
-
A
T
2
G
T
G
T
C
T
-
T
C
-
T
T
-
2
-
G
T
A
G
-
-
A
T
C
T
-
-
A
T
2
2
3
G
-
G
-
T
G
-
-
-
-
T
A
-
A
A
C
G
-
A
T
C
C
A
T
-
-
A
-
T
T
2
C
-
T
-
T
-
G
A
T
A
C
G
G
2
T
T
A
G
A
-
-
-
2
-
-
T
C
G
C
C
C
A
T
A
C
C
C
T
A
G
C
A
T
C
-
C
G
G
C
G
A
C
T
A
A
G
  90,832,161
  90,837,484
  90,837,486
  90,837,539
  90,837,600
  90,837,746
  90,837,761
  90,838,029
  90,838,057
  90,838,084
  90,838,104
  90,838,129
  90,838,268
  90,838,273
  90,838,547
  90,838,550
  90,838,560
  90,838,689
  90,839,101
  90,839,108
  90,839,709
  90,839,720
  90,839,769
  90,840,201
  90,840,610
  90,840,611
  90,840,642
  90,840,806
  90,840,825
  90,840,836
  90,841,016
  90,841,124
  90,869,548
  90,870,543
  90,870,568
  90,871,264
  90,871,292
  90,871,317
  90,875,203
  90,875,256
  90,875,260
  90,878,910
  90,883,105
  90,883,168
  90,886,303
  90,886,305
  90,886,307
  90,886,309
  90,886,311
  90,886,318
  90,886,320
  90,886,321
  90,886,326
  90,886,332
  90,886,334
  90,891,747
  90,891,763
  90,891,764
  90,891,766
  90,895,108
  90,910,648
  90,923,996
  90,923,999
  90,924,007
  90,924,014
  90,924,024
  90,924,038
  90,924,053
  90,924,059
  90,924,061
  90,924,069
  90,924,094
  90,924,109
  90,924,111
  90,924,125
  90,924,129
  90,924,138
  90,924,149
  90,924,177
  90,924,183
  90,924,186
  90,924,194
  90,924,219
  90,924,228
  90,924,260
  90,924,275
  90,924,281
  90,924,285
  90,924,294
  90,924,301
  90,924,319
  90,924,324
  90,924,325
  90,924,336
  90,924,341
  90,924,349
  90,924,356
  90,924,397
  90,924,423
  90,924,425
  90,924,432
  90,924,446
  90,974,775
  90,974,807
  91,057,923
  91,057,929
  91,057,999
  91,058,003
  91,058,042
  91,058,048
  91,069,647
  91,069,653
  91,069,659
  91,069,668
  91,069,671
  91,069,676
  91,069,696
  91,069,723
  91,069,725
  91,069,760
  91,069,799
  91,069,808
  91,069,819
  91,069,826
  91,069,829
  91,069,836
  91,069,849
  91,069,853
  91,069,872
  91,069,879
  91,069,886
  91,069,890
  91,069,903
  91,069,904
  91,070,320
  91,070,326
  91,070,336
  91,070,378
  91,070,389
  91,070,393
  91,070,401
  91,076,963
  91,076,972
  91,077,021
  91,077,049
  91,077,124
  91,077,138
  91,077,142
  91,077,148
  91,077,162
  91,077,165
  91,077,232
  91,077,292
  91,077,365
  91,077,430
  91,077,441
  91,077,495
  91,077,517
  91,077,526
  91,077,537
  91,077,544
  91,077,552
  91,077,563
  91,077,570
  91,077,578
  91,077,606
  91,077,893
  91,077,894
  91,078,006
  91,078,013
  91,078,022
  91,078,035
  91,078,055
  91,078,075
  91,078,079
  91,078,094
  91,078,097
  91,078,120
  91,078,131
  91,078,146
  91,078,150
  91,099,064
  91,099,076
  91,099,083
  91,099,088
  91,099,094
  91,099,097
  91,099,105
  91,099,112
  91,099,117
  91,159,188
  91,160,635
  91,160,636
  91,160,648
  91,160,662
  91,160,669
  91,160,673
  91,160,674
  91,160,675
  91,160,677
  91,160,680
  91,160,686
  91,160,687
  91,160,695
  91,160,750
  91,160,758
  91,160,761
  91,160,766
  91,160,785
  91,160,797
  91,160,868
  91,160,873
  91,161,020
  91,161,027
  91,161,032
  91,161,056
  91,161,061
  91,161,065
  91,161,074
  91,161,093
  91,161,104
  91,161,118
  91,161,335
  91,161,339
  91,161,380
  91,161,381
  91,161,662
  91,161,688
  91,161,692
  91,161,695
  91,161,708
  91,161,717
  91,161,719
  91,161,725
  91,161,892
  91,161,900
  91,161,911
  91,161,927
  91,161,948
  91,161,955
  91,161,961
  91,161,977
  91,161,982
  91,162,014
  91,162,017
  91,162,019
  91,162,040
  91,162,054
  91,162,058
  91,162,089
  91,162,102
  91,162,113
  91,162,121
  91,162,129
  91,162,141
  91,162,148
  91,162,154
  91,162,178
  91,162,182
  91,162,184
  91,162,190
  91,162,203
  91,162,224
  91,162,227
  91,162,251
  91,162,264
  91,162,276
  91,162,295
  91,162,296
  91,162,300
  91,162,316
  91,162,345
  91,162,360
  91,162,366
  91,162,373
  91,162,423
  91,162,427
  91,162,440
  91,162,447
  91,162,489
  91,162,498
  91,162,512
  91,162,513
  91,162,515
  91,162,530
  91,162,599
  91,162,601
  91,162,609
  91,162,646
  91,162,658
  91,162,664
  91,162,670
  91,162,691
  91,162,716
  91,162,740
  91,162,753
  91,162,765
  91,162,773
  91,162,780
  91,162,784
  91,162,795
  91,162,805
  91,162,811
  91,162,815
  91,162,823
  91,162,827
  91,162,829
  91,162,843
  91,162,850
  91,162,856
  91,162,860
  91,162,861
  91,162,870
  91,162,876
  91,162,879
  91,162,883
  91,162,909
  91,162,937
  91,162,957
  91,162,968
  91,162,969
  91,162,974
  91,162,977
  91,162,985
  91,162,990
  91,163,015
  91,163,021
  91,163,035
  91,163,047
  91,163,051
  91,163,057
  91,163,071
  91,163,076
  91,163,080
  91,163,090
  91,163,103
  91,163,113
  91,163,123
  91,163,129
  91,163,142
  91,163,144
  91,163,152
  91,163,171
  91,163,173
  91,163,179
  91,163,189
  91,163,201
  91,163,204
  91,163,210
  91,163,247
  91,163,263
  91,163,269
  91,163,279
  91,163,280
  91,163,285
  91,163,304
  91,163,312
  91,163,315
  91,163,319
  91,163,326
  91,163,330
  91,163,352
  91,163,353
  91,163,356
  91,163,361
  91,163,370
  91,163,373
  91,163,382
  91,163,386
  91,163,394
  91,163,399
  91,163,404
  91,163,405
  91,163,411
  91,163,415
  91,163,419
  91,163,426
  91,163,453
  91,163,464
  91,163,469
  91,163,474
  91,163,485
  91,163,486
  91,163,494
  91,163,508
  91,163,523
  91,163,526
  91,163,536
  91,163,542
  91,163,549
  91,163,553
  91,163,579
  91,163,588
  91,163,599
  91,163,602
  91,163,618
  91,163,624
  91,163,625
  91,163,634
  91,163,635
  91,163,655
  91,163,681
  91,163,706
  91,163,707
  91,163,719
  91,163,726
  91,163,732
  91,163,739
  91,163,763
  91,163,771
  91,163,793
  91,163,802
  91,163,810
  91,163,813
  91,163,818
  91,163,828
  91,163,830
  91,163,862
  91,163,875
  91,163,879
  91,163,916
  91,163,928
  91,163,930
  91,163,937
  91,163,940
  91,163,949
  91,163,969
  91,163,977
  91,163,983
  91,163,991
  91,163,995
  91,164,008
  91,164,014
  91,164,043
  91,164,048
  91,164,051
  91,164,066
  91,164,076
  91,164,077
  91,164,092
  91,164,108
  91,164,141
  91,164,147
  91,164,155
  91,164,175
  91,164,192
  91,164,212
  91,164,224
  91,164,229
  91,164,231
  91,164,236
  91,164,238
  91,164,239
  91,164,240
  91,164,277
  91,164,303
  91,164,365
  91,164,370
  91,164,375
  91,164,384
  91,164,386
  91,164,392
  91,164,411
  91,164,414
  91,164,425
  91,164,471
  91,164,492
  91,164,493
  91,164,502
  91,164,524
  91,164,545
  91,164,573
  91,164,576
  91,164,587
  91,164,588
  91,164,594
  91,164,599
  91,164,605
  91,164,617
  91,164,630
  91,164,652
  91,164,667
  91,164,677
  91,164,680
  91,164,683
  91,164,688
  91,164,703
  91,164,731
  91,164,738
  91,164,749
  91,164,752
  91,164,771
  91,164,793
  91,164,794
  91,164,800
  91,164,809
  91,164,811
  91,164,812
  91,164,818
  91,164,837
  91,164,847
  91,164,855
  91,164,858
  91,164,871
  91,164,872
  91,164,881
  91,164,882
  91,164,905
  91,164,915
  91,164,918
  91,164,941
  91,164,946
  91,164,965
  91,164,997
  91,165,016
  91,165,021
  91,165,025
  91,165,032
  91,165,047
  91,165,051
  91,165,067
  91,165,080
  91,165,091
  91,165,098
  91,165,108
  91,165,270
  91,165,281
  91,165,291
  91,165,294
  91,165,316
  91,168,372
  91,168,436
  91,169,311
  91,174,659
  91,174,661
  91,188,585
  91,215,224
  91,215,225
  91,215,237
  91,215,247
  91,215,249
  91,215,261
  91,215,304
  91,215,338
  91,228,468
  91,251,124
  91,251,154
  91,251,714
  91,251,775
  91,251,924
  91,251,967
  91,251,984
  91,252,106
  91,252,199
  91,252,252
  91,252,297
  91,252,961
  91,252,986
  91,253,261
  91,253,370
  91,253,371
  91,254,126
  91,254,158
  91,254,538
  91,254,829
  91,254,922
  91,254,957
  91,255,127
  91,255,135
  91,255,213
  91,255,567
  91,255,736
  91,268,123
  91,268,128
  91,268,134
G
G/A
A/G
C/T
A/G
G/A
G/A
C/A
T/C
C/A
A/G
A/G
C/A
T/A
G/T
G/A
T/A
C/A
A/T
A/G
G/T
C/-
G/T
C/T
C/T
A/G
G/-
G
-
C
C/G
T
-
-
-
-
-
-
-
-
T
A/-
G
-
C
C
C
C
C
T
C
C
G
G
C
-
A
G
G
C
T/-
A
A
A
-
G
-
T
-
-
-
C
A
G
-
-
-
G
-
-
-
-
G
-
-
-
-
-
A
-
A
T
C
G
-
C
-
4
-
-
C
T
G
C
G
G
A
A
G
G
-
T
G
-
-
-
-
-
-
-
-
G
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
A
G
G
-
A
-
-
-
C
-
G
A
-
-
-
G
-
-
G
-
G
T
G
C
G
A
C
-
-
-
-
C
-/A
-
-
G
A
-
-
G
A
-
G
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
A
-
C
-
7
C
A
C
C
C
C
C
A
A
C
C
C
C
C
A
C
A
C
A
-
-
-
A
-
-
-
-
C
-
-
C
-
-
A
C
T
A
A
-
-
-
2
G
C
-
-
-
-
-
-
-
-
-
T
-
-
-
-
T
G
-
-
A
-
-
-
T
-
-
T
A
T
T
T
T
-
G
C
-
-
-
-
-
T
-
-
-
-
T
G
T
C
-
-
T
A
A
-
-
-
-
T
T
-
-
A
T
-
-
-
G
T
A
-
-
-
G
G
-
-
G
-
T
T
G
-
-
T
C
C
C
-
-
-
-
A
-
-
-
-
-
A
-
C
C
C
-
A
A
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
T
G
-
A
C
2
-
C
G
T
G
-
-
G
G
2
C
-
-
C
T
-
-
-
-
-
-
2
C
T
G
-
-
-
-
-
T
G
G
-
-
-
-
C
A
G
G
T
T
-
T
C
G
-
G
-
C
-
-
-
T
-
-
3
G
-
2
-
-
-
G
G
T
-
G
-
-
G
-
A
-
-
C
C
G
C
G
-
3/-
A
-
G
-
-
-
A
A
-
T
A
3
T
-
-
A
-
A
G
T
-
A
-
-
A
-
G
C
-
2
T
G
G
A
A
G
-
-
-
-
T
G
G
-
-
-
-
A
T
-
T
G
A
C
C
C
C
-
-
A
-
-
G
T
C
C
G
-
-
-
-
C
3
C
C
-
-
-
-
T
-
G
-
C
A
-
A
-
-
-
C
2/-
C
G
-
A
G
2
C
C
-
T
4
C
C/T
G/A
C/T
C/T
C/T
A/T
T/C
A/G
C/T
C/T
C/T
T/G
A/G
G/A
C/T
A/T
T/G
C/T
-/7
C/T
G/T
G/A
C/T
G/A
A/G
C/T
T/A
A/C
A/C
G/C